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人WDR70蛋白结构与功能的生物信息学预测
被引量:
1
1
作者
陈慧
陈玉梅
+2 位作者
周怡
谢雨彤
杨潮
《井冈山大学学报(自然科学版)》
2020年第2期32-38,共7页
人WDR70蛋白作为一个衔接蛋白,可介导多蛋白相互作用,参与DNA损伤修复、胚胎发育等生物过程。采用生物信息学软件对人WDR70蛋白的结构和功能进行分析,发现WDR70蛋白的相对分子质量约为73 kD,pI为5.94,半衰期为30h,不含有信号肽和跨膜区...
人WDR70蛋白作为一个衔接蛋白,可介导多蛋白相互作用,参与DNA损伤修复、胚胎发育等生物过程。采用生物信息学软件对人WDR70蛋白的结构和功能进行分析,发现WDR70蛋白的相对分子质量约为73 kD,pI为5.94,半衰期为30h,不含有信号肽和跨膜区结构;同源蛋白的多重序列比对和进化分析显示,人WDR70蛋白与黑猩猩、白枕白眉猴、食蟹猕猴的WDR70蛋白具有高度的同源性,并且在系统发育树上聚为一类;无规则卷曲是WDR70蛋白二级结构主要的结构形式,三级结构的预测结果与之吻合;功能分类预测其为结合蛋白,参与蛋白的泛素化和转运过程。开展WDR70蛋白的生物信息学分析,为了解该蛋白的结构和功能提供信息依据,为后续WDR70功能研究提供新思路。
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关键词
wdr70
生物信息学
衔接蛋白
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职称材料
表达人WDR70基因的质粒构建及鉴定
2
作者
杨潮
叶茂
陈慧
《赣南师范学院学报》
2016年第3期58-60,共3页
WD重复蛋白(WD repeat protein)家族是一类含有多个保守WD基序的蛋白.该家族蛋白广泛存在于真核细胞中,参与细胞发育、增殖和凋亡等生理过程.WDR70隶属于WD重复蛋白家族,其生物学功能目前仍不清楚.本文以人cDNA为模板扩增WDR70基因;然后...
WD重复蛋白(WD repeat protein)家族是一类含有多个保守WD基序的蛋白.该家族蛋白广泛存在于真核细胞中,参与细胞发育、增殖和凋亡等生理过程.WDR70隶属于WD重复蛋白家族,其生物学功能目前仍不清楚.本文以人cDNA为模板扩增WDR70基因;然后以pTag2b为载体,通过同源重组构建重组质粒并进行测序.同时将质粒转染至人肺癌细胞株A549中,进行WDR70蛋白的表达分析.结果显示该重组质粒在A549细胞中能有效表达.质粒pTag2B-WDR70的成功构建为进一步研究WDR70相关生物学功能提供实验基础.
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关键词
wdr70
WD重复蛋白
CDNA克隆
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职称材料
DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能及其在人卵巢癌中的突变研究
被引量:
2
3
作者
郭莲娣
王丹
+11 位作者
杨帆
梁语珈
杨雪琴
覃意扬
任来峰
曾鸣
唐子执
王小军
王思
刘聪
楼江燕
陈杰
《四川大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期501-506,共6页
目的在细胞水平上分析新发现的DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能,确定WDR70基因在人卵巢癌中的突变发生情况,以验证该基因的功能丢失是否与卵巢癌关联。方法在人细胞中用siRNA干扰WDR70基因表达,或用慢病毒和质粒过表达WDR70的野生型...
目的在细胞水平上分析新发现的DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能,确定WDR70基因在人卵巢癌中的突变发生情况,以验证该基因的功能丢失是否与卵巢癌关联。方法在人细胞中用siRNA干扰WDR70基因表达,或用慢病毒和质粒过表达WDR70的野生型和突变体,通过免疫印迹和免疫荧光等方法研究该基因在DNA损伤后的亚细胞定位和DNA损伤信号通路中的作用;此外,抽提1例正常卵巢组织和16例卵巢癌标本的mRNA进行半定量RT-PCR扩增,对这些标本中的WDR70基因进行测序分析。结果 WDR70基因沉默和过表达其突变体导致同源重组功能蛋白——DNA复制蛋白A(RPA32)磷酸化修饰水平降低和重组酶——重组蛋白A(RAD51)向DNA损伤位点招募的能力减低;WDR70的功能障碍还导致染色体的断裂增多;同时,卵巢癌样本中发现多例WDR70突变型别。结论在体外系统中,WDR70参与DNA损伤修复过程,沉默或过表达其突变体将导致同源重组修复缺陷和染色体结构的不稳定;在卵巢癌基因组中,WDR70基因频繁出现突变,可能导致相应的DNA修复缺陷和基因组不稳定性的发生。因此,WDR70是一个潜在的卵巢癌抗癌基因。
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关键词
DNA损伤应答
卵巢癌
wdr70
原文传递
题名
人WDR70蛋白结构与功能的生物信息学预测
被引量:
1
1
作者
陈慧
陈玉梅
周怡
谢雨彤
杨潮
机构
赣南师范大学生命科学学院
出处
《井冈山大学学报(自然科学版)》
2020年第2期32-38,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81860492,81660491)
江西省自然科学基金项目(20161BAB215221)
+1 种基金
赣南师范大学招标课题项目(480030)
赣南师范大学创新创业训练计划项目(CX170086)。
文摘
人WDR70蛋白作为一个衔接蛋白,可介导多蛋白相互作用,参与DNA损伤修复、胚胎发育等生物过程。采用生物信息学软件对人WDR70蛋白的结构和功能进行分析,发现WDR70蛋白的相对分子质量约为73 kD,pI为5.94,半衰期为30h,不含有信号肽和跨膜区结构;同源蛋白的多重序列比对和进化分析显示,人WDR70蛋白与黑猩猩、白枕白眉猴、食蟹猕猴的WDR70蛋白具有高度的同源性,并且在系统发育树上聚为一类;无规则卷曲是WDR70蛋白二级结构主要的结构形式,三级结构的预测结果与之吻合;功能分类预测其为结合蛋白,参与蛋白的泛素化和转运过程。开展WDR70蛋白的生物信息学分析,为了解该蛋白的结构和功能提供信息依据,为后续WDR70功能研究提供新思路。
关键词
wdr70
生物信息学
衔接蛋白
Keywords
wdr70
bioinformatics
adaptor protein
分类号
Q956 [生物学—动物学]
下载PDF
职称材料
题名
表达人WDR70基因的质粒构建及鉴定
2
作者
杨潮
叶茂
陈慧
机构
赣南师范学院生命与环境科学学院
赣南师范学院国家脐橙工程中心
湖南大学生物学院
出处
《赣南师范学院学报》
2016年第3期58-60,共3页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(81402304)
赣南师范学院招标课题(15zb08)
文摘
WD重复蛋白(WD repeat protein)家族是一类含有多个保守WD基序的蛋白.该家族蛋白广泛存在于真核细胞中,参与细胞发育、增殖和凋亡等生理过程.WDR70隶属于WD重复蛋白家族,其生物学功能目前仍不清楚.本文以人cDNA为模板扩增WDR70基因;然后以pTag2b为载体,通过同源重组构建重组质粒并进行测序.同时将质粒转染至人肺癌细胞株A549中,进行WDR70蛋白的表达分析.结果显示该重组质粒在A549细胞中能有效表达.质粒pTag2B-WDR70的成功构建为进一步研究WDR70相关生物学功能提供实验基础.
关键词
wdr70
WD重复蛋白
CDNA克隆
Keywords
wdr70
WD repeat protein
cDNA cloning
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能及其在人卵巢癌中的突变研究
被引量:
2
3
作者
郭莲娣
王丹
杨帆
梁语珈
杨雪琴
覃意扬
任来峰
曾鸣
唐子执
王小军
王思
刘聪
楼江燕
陈杰
机构
西南民族大学
山西医科大学汾阳学院
四川大学华西第二医院妇产科
出处
《四川大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期501-506,共6页
基金
中央高校基本科研业务费专项基金项目(No.2015NZYQN63)
成都市科技局项目(No.2015-HM01-00058-SF)
四川省杰出青年学术技术带头人资助计划(No.2012JQ0005)资助
文摘
目的在细胞水平上分析新发现的DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能,确定WDR70基因在人卵巢癌中的突变发生情况,以验证该基因的功能丢失是否与卵巢癌关联。方法在人细胞中用siRNA干扰WDR70基因表达,或用慢病毒和质粒过表达WDR70的野生型和突变体,通过免疫印迹和免疫荧光等方法研究该基因在DNA损伤后的亚细胞定位和DNA损伤信号通路中的作用;此外,抽提1例正常卵巢组织和16例卵巢癌标本的mRNA进行半定量RT-PCR扩增,对这些标本中的WDR70基因进行测序分析。结果 WDR70基因沉默和过表达其突变体导致同源重组功能蛋白——DNA复制蛋白A(RPA32)磷酸化修饰水平降低和重组酶——重组蛋白A(RAD51)向DNA损伤位点招募的能力减低;WDR70的功能障碍还导致染色体的断裂增多;同时,卵巢癌样本中发现多例WDR70突变型别。结论在体外系统中,WDR70参与DNA损伤修复过程,沉默或过表达其突变体将导致同源重组修复缺陷和染色体结构的不稳定;在卵巢癌基因组中,WDR70基因频繁出现突变,可能导致相应的DNA修复缺陷和基因组不稳定性的发生。因此,WDR70是一个潜在的卵巢癌抗癌基因。
关键词
DNA损伤应答
卵巢癌
wdr70
Keywords
DNA damage responses
Ovarian cancer
wdr70
分类号
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人WDR70蛋白结构与功能的生物信息学预测
陈慧
陈玉梅
周怡
谢雨彤
杨潮
《井冈山大学学报(自然科学版)》
2020
1
下载PDF
职称材料
2
表达人WDR70基因的质粒构建及鉴定
杨潮
叶茂
陈慧
《赣南师范学院学报》
2016
0
下载PDF
职称材料
3
DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能及其在人卵巢癌中的突变研究
郭莲娣
王丹
杨帆
梁语珈
杨雪琴
覃意扬
任来峰
曾鸣
唐子执
王小军
王思
刘聪
楼江燕
陈杰
《四川大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
原文传递
已选择
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