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木薯MeMLO12基因克隆及其CRISPR-Cas9表达载体的构建
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作者 蔡吉苗 李博勋 +3 位作者 黄贵修 李超萍 时涛 王国芬 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1528-1537,共10页
MLO基因是植物中特有的一类抗病性负调控因子,该基因突变导致植物产生广谱抗病性。本研究从木薯全基因组中克隆获得木薯MLO12基因的DNA和cDNA序列,并将其命名为MeMLO12。该基因全长3743 nt、编码区(ORF)全长1728 nt,具有一个完整的开放... MLO基因是植物中特有的一类抗病性负调控因子,该基因突变导致植物产生广谱抗病性。本研究从木薯全基因组中克隆获得木薯MLO12基因的DNA和cDNA序列,并将其命名为MeMLO12。该基因全长3743 nt、编码区(ORF)全长1728 nt,具有一个完整的开放阅读框,含有15个外显子和14个内含子,编码586个氨基酸,蛋白的分子质量为67.2 kDa,等电点为8.85。该基因编码的蛋白定位在内质网膜上,无信号肽,在23~45、74~96、161~183、285~307、312~334、371~393、413~435 aa处形成7次跨膜结构域。qRT-PCR定量分析发现,受木薯黄单胞病菌侵染后,MeMLO12基因在木薯抗、感品种中的表达量存在明显的差异,参与木薯与黄单胞菌之间的互作,表现出负调控作用。选择该基因第11个外显子进行Snap Gene Viewer分析,获得了10 455条sgRNA的种子序列,从中选取3条靶序列约23 nt,碱基组成上3'末端含G结尾,将其构建到CRISPR-Cas9载体上,经验证,确认MeMLO12的3条靶序列已经成功构建到基因编辑载体上,将其命名为pSGR-Cas9-AT-MeMLO12载体。 展开更多
关键词 木薯 MeMLO12基因 克隆 表达分析 crispr-cas9载体 构建
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利用CRISPR-Cas9基因编辑技术敲除HOXA5基因对急性髓系白血病细胞增殖的影响 被引量:1
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作者 满建呈 成娟 赵丽 《中国实验血液学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期52-56,共5页
目的:通过CRISPR-Cas9基因编辑技术构建稳定敲除HOXA5基因的急性髓系白血病(AML)细胞株,明确HOXA5基因敲除对AML细胞增殖的影响,初步探索HOXA5基因在AML发病中的作用。方法:通过荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot技术分别检测血液系... 目的:通过CRISPR-Cas9基因编辑技术构建稳定敲除HOXA5基因的急性髓系白血病(AML)细胞株,明确HOXA5基因敲除对AML细胞增殖的影响,初步探索HOXA5基因在AML发病中的作用。方法:通过荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot技术分别检测血液系统非肿瘤患者与初诊AML患者骨髓单个核细胞(BMMC)中HOXA5的表达;应用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建稳定敲除HOXA5基因的AML细胞株KO-HOXA5-THP-1,通过qRT-PCR和Western blot检测KO-HOXA5-THP-1细胞中HOXA5的表达,并采用CCK-8实验检测细胞增殖情况。结果:与血液系统非肿瘤患者相比,初诊AML患者骨髓单个核细胞中HOXA5基因及蛋白水平均显著升高(P<0.05)。应用CRISPR-Cas9基因编辑技术能够获得稳定敲除HOXA5基因的细胞株,而且敲除HOXA5基因后的THP-1细胞株的增殖能力显著下降(P<0.05)。结论:HOXA5在AML细胞中高表达,敲除HOXA5能够显著影响AML细胞的增殖能力,这为急性髓系白血病的精准治疗提供了一个新的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 HOXA5基因 crispr-cas9
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利用CRISPR-Cas9技术编辑OsBADH2基因改良优质恢复系桂恢852的香味品质
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作者 齐金岗 陈颖 +5 位作者 刘开强 王小姣 李林娟 赵丽冰 李孝琼 郭嗣斌 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2058-2068,共11页
【目的】利用CRISPR-Cas9技术编辑桂恢852的甜菜碱醛脱氢酶基因(OsBADH2),以期快速改良广西优质恢复系桂恢852的香味品质,为广西香稻新种质的创制提供亲本资源及技术参考。【方法】以广西优质非香型水稻桂恢852为材料,对其OsBADH2蛋白... 【目的】利用CRISPR-Cas9技术编辑桂恢852的甜菜碱醛脱氢酶基因(OsBADH2),以期快速改良广西优质恢复系桂恢852的香味品质,为广西香稻新种质的创制提供亲本资源及技术参考。【方法】以广西优质非香型水稻桂恢852为材料,对其OsBADH2蛋白的序列特征、保守结构域、保守基序、系统发育进化等进行分析,再根据CRISPR-GE网站信息挑选合适的靶位点,分别构建OsBADH2基因第1、2外显子的双突载体pLM62和第7外显子的单突载体pLM63。利用CRISPR-Cas9技术和水稻遗传转化技术靶向敲除桂恢852的OsBADH2基因,获取不同类型的osbadh2突变体。以桂恢852为对照,通过咀嚼法鉴定突变体osbadh2是否具有香味。最后,通过农艺性状测定和单因素方差分析,判断OsBADH2基因突变是否影响农艺性状。【结果】OsBADH2基因序列全长为6268 bp,包含15个外显子和14个内含子,其编码区(CDS)为1512 bp,编码503个氨基酸残基,具有1个典型的Aldedh结构域(第16~485位氨基酸),属于醛脱氢酶,其蛋白序列与结构相对保守。通过OsBADH2氨基酸序列的BLAST比对分析,分别获得水稻的3个高相似性蛋白和拟南芥的4个高相似性蛋白,其中水稻OsBADH1、OsBADH2、OsALDH2B2、OsALDH2C1及拟南芥BADH1、BADH2、AL2C4均属于ALDH-SF(Aldehyde dehydrogenase superfamily)超家族成员。OsBADH2与OsBADH1为旁系同源基因,与拟南芥中BADH1和BADH2为直系同源基因。在桂恢852的遗传背景下成功获得4种突变类型且不含T-DNA的纯合突变体株系(osbadh2-1~osbadh2-4)。这4种突变类型均会使OsBADH2基因发生移码突变,导致翻译过程提前终止,破坏OsBADH2蛋白的原有结构和功能,导致4个osbadh2突变体株系的稻米产生香气。4个osbadh2突变体株系的株高、有效穗数、穗长、结实率、千粒重、长宽比与桂恢852野生型间无显著差异(P>0.05),但osbadh2-2突变体与osbadh2-4突变体的结实率存在极显著差异(P<0.01)。【结论】桂恢852的4个osbadh2突变体株系均具有香味品质,且综合农艺性状与野生型无显著差异,表明利用CRISPR-Cas9基因编辑技术能快速定向改变水稻品种的目标性状,极大缩短了育种年限。 展开更多
关键词 水稻 恢复系 香味 OsBADH2 crispr-cas9
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CRISPR-Cas9基因编辑技术在牛、羊生产中的应用研究进展
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作者 潘东霞 王辉 +1 位作者 熊本海 唐湘方 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4880-4889,共10页
近年来,基因编辑技术作为一种基因组修饰工具迅速发展,包括锌指核酸酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)、转录激活因子样效应物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases,TALENs)和成簇规则间隔短回文重复序列相关蛋白(clus... 近年来,基因编辑技术作为一种基因组修饰工具迅速发展,包括锌指核酸酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)、转录激活因子样效应物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases,TALENs)和成簇规则间隔短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats associated protein,CRISPR-Cas)系统在内的基因编辑工具使生物体的基因组DNA靶向修饰成为可能,尤其是CRISPR-Cas9系统的出现,加速了基因编辑技术的发展,成为基础科学和应用科学中的革命性工具。与ZFNs和TALENs技术相比,CRISPR-Cas9系统因其高灵活性、灵敏度、特异性和成本效益而被广泛使用。CRISPR-Cas9基因编辑技术通过靶向特定序列精确地切割DNA,并通过在特定基因组位点产生双链断裂来添加、去除或替换核苷酸等方式在位点引入特异性修饰对畜牧生产的不同方面做出了重大贡献,产生了改善牲畜生产和具有抗病性等多种动物模型,以研究畜禽关键基因功能,加速性状改良。作者主要阐述了CRISPR-Cas9系统的机制与功能及其在牛、羊生产中的应用进展,以期为今后的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 crispr-cas9系统 基因编辑 繁殖 泌乳 抗病
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Generation of double knockout cattle via CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein(RNP)electroporation 被引量:1
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作者 Gyeong-Min Gim Kyeong-Hyeon Eom +10 位作者 Dong-Hyeok Kwon Dae-Jin Jung Dae-Hyun Kim Jun-Koo Yi Jae-Jung Ha Ji-Hyun Lee Seong-Beom Lee Woo-Jae Son Soo-Young Yum Won-Wu Lee Goo Jang 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期456-462,共7页
Background Genome editing has been considered as powerful tool in agricultural fields.However,genome editing progress in cattle has not been fast as in other mammal species,for some disadvantages including long gestat... Background Genome editing has been considered as powerful tool in agricultural fields.However,genome editing progress in cattle has not been fast as in other mammal species,for some disadvantages including long gestational periods,single pregnancy,and high raising cost.Furthermore,technically demanding methods such as microinjection and somatic cell nuclear transfer(SCNT)are needed for gene editing in cattle.In this point of view,electroporation in embryos has been risen as an alternative.Results First,editing efficiency of our electroporation methods were tested for embryos.Presence of mutation on embryo was confirmed by T7E1 assay.With first combination,mutation rates for MSTN and PRNP were 57.6%±13.7%and 54.6%±13.5%,respectively.In case of MSTN/BLG,mutation rates were 83.9%±23.6%for MSTN,84.5%±18.0%for BLG.Afterwards,the double-KO embryos were transferred to surrogates and mutation rate was identified in resultant calves by targeted deep sequencing.Thirteen recipients were transferred for MSTN/PRNP,4 calves were delivered,and one calf underwent an induction for double KO.Ten surrogates were given double-KO embryos for MSTN/BLG,and four of the six calves that were born had mutations in both genes.Conclusions These data demonstrated that production of genome edited cattle via electroporation of RNP could be effectively applied.Finally,MSTN and PRNP from beef cattle and MSTN and BLG from dairy cattle have been born and they will be valuable resources for future precision breeding. 展开更多
关键词 BETA-LACTOGLOBULIN CATTLE crispr-cas9 ELECTROPORATION KNOCKOUT MSTN PRNP
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小白链霉菌中CRISPR-Cas9基因敲除系统的构建与优化
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作者 开朗 杨昊 +1 位作者 朱道君 陈旭升 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第14期10-17,共8页
小白链霉菌(Streptomyces albulus)是工业上生产ε-聚赖氨酸的主要菌株。为提高S.albulus的ε-聚赖氨酸合成能力,基于诱变和抗性筛选的传统育种方法被普遍应用。然而,由于传统育种存在“疲劳效应”,当前S.albulus的育种陷入了瓶颈。为... 小白链霉菌(Streptomyces albulus)是工业上生产ε-聚赖氨酸的主要菌株。为提高S.albulus的ε-聚赖氨酸合成能力,基于诱变和抗性筛选的传统育种方法被普遍应用。然而,由于传统育种存在“疲劳效应”,当前S.albulus的育种陷入了瓶颈。为利用代谢工程方法进一步提高S.albulus的ε-聚赖氨酸合成能力,亟需建立基于CRISPR-Cas9的基因编辑方法。为此,该文以S.albulus GS114为研究对象,以ε-聚赖氨酸合成酶基因pls为靶基因,构建了CRISPR-Cas9基因敲除系统,成功敲除了pls,编辑效率为100%。为进一步提高获得的敲除株数量,对S.albulus GS114结合转移条件进行了系统优化,获得的最优结合转移条件为:供受体比例1∶1,镁离子浓度30 mmol/L,55℃热激孢子10 min,培养20 h后覆盖抗生素。在最优转移条件下,结合转移效率达到2.5×10^(-8),较优化前提高了78%。该研究结果一方面为后续S.albulus的代谢工程改造提供了重要工具,另一方面为其他工业链霉菌构建CRISPR-Cas系统提供了重要参考。 展开更多
关键词 放线菌 小白链霉菌 crispr-cas9系统 基因敲除
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基于CRISPR-Cas9系统构建LEU1基因缺失酿酒酵母用于酿造低醉酒度米酒
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作者 王泽翔 何娇娇 +1 位作者 梁思宇 周世水 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第4期62-67,共6页
为探究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)异丙基苹果酸合成酶基因LEU1的缺失对酿造米酒生成高级醇的影响,该研究构建重组质粒p414-Cas9-BleoR和p426-gRNA.LEU1-kanMX后电转化酿酒酵母XF0,利用成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋... 为探究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)异丙基苹果酸合成酶基因LEU1的缺失对酿造米酒生成高级醇的影响,该研究构建重组质粒p414-Cas9-BleoR和p426-gRNA.LEU1-kanMX后电转化酿酒酵母XF0,利用成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR-Cas9)系统构建LEU1基因缺失的酿酒酵母XF0-L。将出发菌株XF0和重组菌株XF0-L进行培养基模拟发酵和米酒发酵,测定发酵酒的理化指标和高级醇含量。结果表明,菌株XF0-L与XF0模拟发酵酒的理化指标无显著差异(P>0.05),说明LEU1基因的缺失对酿酒酵母发酵性能无影响。相较于出发菌株XF0,重组菌株XF0-L模拟发酵酒中正丙醇(26.27 mg/L)和异丁醇含量(88.64 mg/L)分别提高21.96%和85.25%,异戊醇含量(141.82 mg/L)、异戊醇/正丙醇(5.39)、异戊醇/异丁醇(1.60)分别降低15.53%、30.99%、54.42%;相较于出发菌株XF0,重组菌株XF0-L发酵米酒中正丙醇(268.67 mg/L)和异丁醇含量(992.33 mg/L)分别提高14.17%、52.90%,异戊醇含量(1016.33 mg/L)、异戊醇/正丙醇(3.78)、异戊醇/异丁醇(1.02)分别降低13.58%、24.40%、43.65%,说明重组菌株XF0-L能够显著降低发酵酒中的异戊醇/正丙醇、异戊醇/异丁醇从而降低醉酒度(P<0.05)。 展开更多
关键词 酿酒酵母 crispr-cas9 LEU1基因 高级醇 低醉酒度米酒
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基于CRISPR-Cas9技术建立CSE1L基因敲除C2C12细胞
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作者 李紫馨 白鸿飞 +2 位作者 谢勇 李珣 白立景 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期225-233,共9页
为研究染色体分离样蛋白1(chromosomesegregation 1-like,CSE1L)在小鼠骨骼肌发育中的作用,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建CSE1L基因敲除的C2C12细胞系。针对小鼠CSE1L的第3外显子设计3组sgRNA,构建sgRNA表达质粒(连接绿色荧光蛋白,gr... 为研究染色体分离样蛋白1(chromosomesegregation 1-like,CSE1L)在小鼠骨骼肌发育中的作用,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建CSE1L基因敲除的C2C12细胞系。针对小鼠CSE1L的第3外显子设计3组sgRNA,构建sgRNA表达质粒(连接绿色荧光蛋白,green fluorescent protein,GFP)和Cas9质粒(连接红色荧光蛋白,red fluorescent protein,RFP)共转染C2C12细胞,筛选高切割效率的sgRNA;将转染该sgRNA和Cas9的C2C12细胞进行流式细胞分选,获取共表达红、绿双色荧光蛋白的细胞,并用DNA测序进行鉴定。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和蛋白免疫印迹(Western-blot)鉴定其分子特征。最后分别利用CCK-8、细胞周期以及凋亡实验对CSE1L敲除细胞系活力和凋亡进行检测。结果显示,小鼠成肌细胞中CSE1L基因mRNA和蛋白水平表达量都显著降低(P<0.01),提示CSE1L基因敲除成功。该基因缺失导致C2C12细胞变细长、细胞活力在72 h显著下调,细胞周期停滞、凋亡增加。成功构建了CSE1L基因敲除的细胞系,并研究了小鼠骨骼肌细胞生长发育相关功能,为探索CSE1L基因功能提供细胞模型,并为后续基因编辑敲除鼠制备奠定基础。 展开更多
关键词 crispr-cas9 CSE1L 基因敲除 骨骼肌发育
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CRISPR-Cas9基因编辑技术及其在家禽中的研究进展
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作者 肖怡梦 杨雯 +1 位作者 程依依 罗刚 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期38-47,共10页
CRISPR-Cas系统是细菌或古细菌内抵御病毒再次入侵的一种适应性免疫系统,能够对靶向核酸进行切割。基于Cas9蛋白及其突变体的特性,科学家开发出多样化的基因编辑工具,能够对细胞内的基因进行敲除或敲入等基因编辑操作,实现生物的遗传变... CRISPR-Cas系统是细菌或古细菌内抵御病毒再次入侵的一种适应性免疫系统,能够对靶向核酸进行切割。基于Cas9蛋白及其突变体的特性,科学家开发出多样化的基因编辑工具,能够对细胞内的基因进行敲除或敲入等基因编辑操作,实现生物的遗传变异;或对DNA或RNA进行表观修饰,调控基因的表达,已广泛地应用于生命科学的研究。禽类是农业中的重要物种,为人类提供优质的蛋白质。在禽类的基因组编辑和修饰中,CRISPR-Cas9技术仍处于研究状态,且只在鸡和鹌鹑两种家禽上取得实质性进展。本文从CRISPR-Cas9系统的组成成分、传递方法、优化策略介绍了CRISPR-Cas9基因编辑技术及其在家禽生产和疾病防控中的应用,为进一步开发适用于家禽体系的CRISPR-Cas9提供理论基础。 展开更多
关键词 家禽 crispr-cas9 育种 诊断
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Illustrator绘图在分子生物学教学中的运用——以CRISPR-cas9作用机制为例
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作者 陈良兵 王雪芹 +3 位作者 武安全 阮先乐 李超琼 张鸿飞 《周口师范学院学报》 CAS 2024年第5期125-128,共4页
优美的示意图在分子生物学教学中具有重要作用,可引起学生的学习兴趣,有助于学生理解掌握分子生物学知识。引用媒介的示意图往往存在着清晰度低、色彩不鲜艳、与教师所要表达的知识逻辑不一致等缺点。以产脓链球菌的CRISPR-cas9作用机... 优美的示意图在分子生物学教学中具有重要作用,可引起学生的学习兴趣,有助于学生理解掌握分子生物学知识。引用媒介的示意图往往存在着清晰度低、色彩不鲜艳、与教师所要表达的知识逻辑不一致等缺点。以产脓链球菌的CRISPR-cas9作用机制为例,阐述了利用Illustrator画图软件绘制CRISPR-cas9作用机制示意图的过程。利用Illustrator绘制的CRISPR-cas9作用机制示意图分辨率高、色彩鲜艳、与课堂知识逻辑相契合。与此同时,绘制CRISPR-cas9作用机制示意图的过程也是对该机制的备课过程,从而有利于该机制的课堂教学,同时也促进了课程思政元素与课堂教学的融合。 展开更多
关键词 示意图 Illustrator软件 产脓链球菌 crispr-cas9 教学
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CRISPR-Cas9基因编辑技术在染色体结构变异构建中的应用研究
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作者 李璟瑜 朱紫娴 温栾 《张江科技评论》 2024年第4期114-116,共3页
CRISPR-Cas9基因编辑技术的发展使染色体的复杂结构变异得以有目的构建,这为相关疾病模型构建、基因功能研究以及基因治疗提供了重要的技术支撑。本文总结了CRISPR-Cas9及其衍生技术在构建染色体结构变异中的应用进展,并分别介绍了目前... CRISPR-Cas9基因编辑技术的发展使染色体的复杂结构变异得以有目的构建,这为相关疾病模型构建、基因功能研究以及基因治疗提供了重要的技术支撑。本文总结了CRISPR-Cas9及其衍生技术在构建染色体结构变异中的应用进展,并分别介绍了目前在构建染色体易位、倒位、缺失和重复中采用的技术手段及其在疾病模型构建中的重要性。此外,本文展望了该领域在未来发展中需要解决的问题。 展开更多
关键词 crispr-cas9 先导编辑 染色体易位编辑
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利用CRISPR-Cas9系统定点突变猪MSTN基因的研究 被引量:12
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作者 张冬杰 刘娣 +2 位作者 张旭 汪亮 杨国伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期207-212,共6页
为了今后能够有效的利用CRISPR-Cas9系统进行基因功能研究及转基因动物的培育,本研究将带有绿色荧光蛋白(GFP)和肌肉生长抑制素基因(Myostatin,MSTN)靶序列的CRISPR-Cas9系统转染入PK15细胞系,利用流式细胞仪分离并收集转染成功的阳性细... 为了今后能够有效的利用CRISPR-Cas9系统进行基因功能研究及转基因动物的培育,本研究将带有绿色荧光蛋白(GFP)和肌肉生长抑制素基因(Myostatin,MSTN)靶序列的CRISPR-Cas9系统转染入PK15细胞系,利用流式细胞仪分离并收集转染成功的阳性细胞,使用PCR扩增结合克隆测序的方法检测和分析CRISPR-Cas9系统的定点突变情况,以评价CRISPR-Cas9系统的作用效果。结果发现,随机挑选的100个阳性克隆中,38个发生了变异,突变效率为38%,其中32个为插入突变,6个为缺失突变。插入突变中突变1(Mutation1)所占比例最高,为47.4%。本研究中CRISPR-Cas9系统的突变效率达到了38%,是目前进行基因组编辑的一个有效工具,推测其突变类型具有一定的偏好性。 展开更多
关键词 crispr-cas9系统 基因组编辑 突变率
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T7E1检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验设计 被引量:2
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作者 王宏刚 魏远 +1 位作者 李艳君 朱玉山 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2023年第5期38-41,共4页
CRISPR-Cas9是一种现代生命科学研究中普遍使用的新型基因编辑技术。为了升级课程内容体系,使实验教学贴近科研实际,提升实验课程教学质量,设计了T7核酸内切酶1(T7E1)检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验。以CRISPR-Cas9基因编辑技术对mfn... CRISPR-Cas9是一种现代生命科学研究中普遍使用的新型基因编辑技术。为了升级课程内容体系,使实验教学贴近科研实际,提升实验课程教学质量,设计了T7核酸内切酶1(T7E1)检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验。以CRISPR-Cas9基因编辑技术对mfn1编辑过的HeLa细胞为实验材料,提取基因组DNA,PCR扩增mfn1基因片段,切胶回收后,变性,退火,使用T7E1对编辑效果进行检测。经1%琼脂糖凝胶电泳,可观察到T7E1将略大于500 bp的mfn1基因片段切成两条大小约为250 bp的DNA片段,表明CRISPR-Cas9成功地对mfn1进行了编辑。 展开更多
关键词 T7核酸内切酶1 crispr-cas9 实验教学 科研反哺教学
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CRISPR-Cas9系统在真核细胞领域内的研究进展 被引量:2
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作者 肖婧 张宗德 申阿东 《标记免疫分析与临床》 CAS 2016年第10期1218-1225,共8页
CRISPR-Cas免疫系统在天然状态下保护细菌和古生菌免受外来质粒或噬菌体的入侵。研究者们根据Ⅱ型CRISPRCas系统开发了全新的基因编辑工具——CRISPR-Cas9,它利用与靶序列互补的向导RNA引导Cas9酶定点切割DNA,该技术具有设计简单、操作... CRISPR-Cas免疫系统在天然状态下保护细菌和古生菌免受外来质粒或噬菌体的入侵。研究者们根据Ⅱ型CRISPRCas系统开发了全新的基因编辑工具——CRISPR-Cas9,它利用与靶序列互补的向导RNA引导Cas9酶定点切割DNA,该技术具有设计简单、操作方便、特异性强、效率高等优势,成为新一代基因组编辑技术。本文综述了CRISPR-Cas系统的技术发展史、最新分类和作用原理,重点介绍了近几年来CRISPR-Cas9系统应用于真核细胞领域的研究进展。 展开更多
关键词 crispr-cas9系统 真核细胞 基因编辑 基因调节
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靶向番茄SlACS2基因CRISPR-Cas9sgRNA的设计和分析 被引量:2
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作者 白云凤 张爱萍 +5 位作者 闫建俊 贺飞燕 张维锋 冯瑞云 刘江娜 张西英 《生物信息学》 2017年第1期7-15,共9页
番茄为呼吸跃变型果实,伴随呼吸跃变产生大量乙烯,即系统II乙烯,易使番茄果实过熟,导致腐烂变质。SlACS2是番茄系统II乙烯合成的限速酶,通过CRISPR-Cas9基因组编辑系统修饰该基因,调控系统Ⅱ乙烯过量表达,将迟滞番茄过熟。本研究基于RNA... 番茄为呼吸跃变型果实,伴随呼吸跃变产生大量乙烯,即系统II乙烯,易使番茄果实过熟,导致腐烂变质。SlACS2是番茄系统II乙烯合成的限速酶,通过CRISPR-Cas9基因组编辑系统修饰该基因,调控系统Ⅱ乙烯过量表达,将迟滞番茄过熟。本研究基于RNA-seq建立了SlACS2基因的数字表达谱,表明该基因呈果实特异性表达,在植株的根、茎、叶等部位不表达。SlACS2位于番茄1号染色体,含4个外显子和3个内含子。利用在线工具CRISPRdirect和CRISPR-P发现第1、2、3外显子分别具有18、9和11条sgRNA。其中,sgRNA1-14和sgRNA3-8及二者的近PAM的12 nt种子序列在番茄基因组是唯一序列,GC含量高于40%,不存在TTTT终止序列。BLAST结果表明,sgRNA1-14和sgRNA3-8与GenBank公布的8条SlACS2同源序列高度一致,位于该基因的保守区,而与SlACS4和SlACS6的同源序列存在多个SNP,预示这2条sgRNA可用于番茄不同品种SlACS2基因的靶向编辑,并可规避对SlACS家族其他同源基因的脱靶效应。 展开更多
关键词 番茄 ACC合成酶2 sgRNA crispr-cas9 基因组编辑
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CRISPR-Cas9技术在肿瘤耐药基因筛选中的研究进展 被引量:1
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作者 张洁 杨谭 卢永刚 《海南医学院学报》 CAS 2021年第11期872-875,共4页
耐药是使用肿瘤分子靶向药物治疗肿瘤面临的主要问题,目前筛选耐药基因常用策略主要为功能性基因筛选。近年来,CRISPR-Cas9基因编辑技术因具有精准、简便、高效的特点,在肿瘤相关基因的功能学研究中被广泛应用。本文就CRISPR-Cas9文库... 耐药是使用肿瘤分子靶向药物治疗肿瘤面临的主要问题,目前筛选耐药基因常用策略主要为功能性基因筛选。近年来,CRISPR-Cas9基因编辑技术因具有精准、简便、高效的特点,在肿瘤相关基因的功能学研究中被广泛应用。本文就CRISPR-Cas9文库筛选技术的原理和在功能性基因筛选方面的应用进行了综述,同时对该技术的应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 crispr-cas9技术 功能基因 筛选
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CRISPR-Cas9基因编辑的历史 被引量:2
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作者 姜奇彦 胡正 +1 位作者 孙现军 张辉 《科技传播》 2020年第20期1-5,共5页
基因编辑是指在细胞内对遗传物质进行修改,是目前应用非常广泛的一种创制变异的技术手段。目前常用的基因编辑体系主要是CRISPR/Cas9系统。从间隔重复回文序列的发现,到重复序列的追根溯源及功能解析,再到CRISPR/Cas9系统在细菌、动物... 基因编辑是指在细胞内对遗传物质进行修改,是目前应用非常广泛的一种创制变异的技术手段。目前常用的基因编辑体系主要是CRISPR/Cas9系统。从间隔重复回文序列的发现,到重复序列的追根溯源及功能解析,再到CRISPR/Cas9系统在细菌、动物及植物中基因编辑功能的实现,在短短几年内,CRISPR-Cas9基因编辑技术迅猛发展,深刻改变了生命科学研究。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因编辑 原核生物 真核生物
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CRISPR-Cas9技术在作物中研究进展 被引量:3
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作者 薛永国 刘鑫磊 +2 位作者 唐晓飞 曹旦 栾晓燕 《黑龙江农业科学》 2020年第2期125-130,共6页
基因编辑技术CRISPR-Cas9系统的出现,为基因功能研究和作物改良提供了技术支持。本文就CRISPR-Cas9技术背景、发展等做了简要说明,综述了CRISPR-Cas9技术在基因敲除、定点整合和调控转录的应用中的原理、特点与前景,同时总结了针对CRISP... 基因编辑技术CRISPR-Cas9系统的出现,为基因功能研究和作物改良提供了技术支持。本文就CRISPR-Cas9技术背景、发展等做了简要说明,综述了CRISPR-Cas9技术在基因敲除、定点整合和调控转录的应用中的原理、特点与前景,同时总结了针对CRISPR-Cas9技术缺点改进的最新研究成果,重点介绍了此技术在作物中应用情况,并对其在作物中的应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因编辑 作物 sgRNA
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通过CRISPR-Cas9系统敲减PAEC中GGTA1和CMAH基因的效果检测 被引量:1
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作者 牟丽莎 白图雅 +1 位作者 谢崇伟 蔡志明 《深圳中西医结合杂志》 2015年第22期1-3,F0003,共4页
目的:检测由短回文重复序列(CRISPR)-Cas9系统敲减猪动脉内皮细胞(PAEC)中基因α1,3半乳糖基转移酶(GGTA1)和CMP-N-乙酰神经氨酸羟化酶(CMAH)的效果。方法:通过CRISPR-Cas9系统,用已设计好的GGTA1和CMAH基因的guide RNA(g RNA)构建质粒... 目的:检测由短回文重复序列(CRISPR)-Cas9系统敲减猪动脉内皮细胞(PAEC)中基因α1,3半乳糖基转移酶(GGTA1)和CMP-N-乙酰神经氨酸羟化酶(CMAH)的效果。方法:通过CRISPR-Cas9系统,用已设计好的GGTA1和CMAH基因的guide RNA(g RNA)构建质粒,以慢病毒为载体包装病毒和感染PAEC,对成功感染的细胞进行单克隆培养并挑选收集单克隆细胞,提取细胞基因组,进行PCR,琼脂糖凝胶电泳,退火、酶切,测序等方法对GGTA1和CMAH基因敲减的效果进行检测。结果:对单克隆细胞进行选择性测序,选择V2-g-a1、V2-c-b1、V2-c-d4单克隆细胞测序结果分别为:V2-g-a1细胞基因组突变位点在第205位;V2-c-b1细胞基因组突变位点在第240位;V2-c-d4细胞基因组突变位点在第246位。结论:CRISPR-Cas9系统成功构建质粒,完成慢病毒包装和感染细胞,成功敲减目的基因。 展开更多
关键词 GGTA1 CMAH crispr-cas9 PAEC 单克隆细胞
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用CRISPR-Cas9在绵羊成纤维细胞ACTG1导入荧光标记基因
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作者 郭延华 皮文辉 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1747-1755,共9页
【目的】在绵羊成纤维细胞中,针对ACTG1基因羧基端,定点导入荧光蛋白标记基因,将外源基因定点导入绵羊基因组中,建立有效的方法。【方法】CRISPR-Cas9系统在绵羊成纤维细胞基因组特定区域引起DNA双链断裂,从而诱导细胞修复断裂的的基因... 【目的】在绵羊成纤维细胞中,针对ACTG1基因羧基端,定点导入荧光蛋白标记基因,将外源基因定点导入绵羊基因组中,建立有效的方法。【方法】CRISPR-Cas9系统在绵羊成纤维细胞基因组特定区域引起DNA双链断裂,从而诱导细胞修复断裂的的基因组。通过NHEJ修复途径,在特定位点导入外源基因,改善定点导入效率。【结果】采用CRISPaint通用供体模板,结合CRISPR-Cas9系统,在绵羊成纤维细胞ACTG1基因导入荧光标记效率达1.4%,获得了外源基因定点导入的单克隆细胞株。【结论】CRISPR-Cas9系统结合NHEJ,能够有效的将大的外源DNA序列导入绵羊成纤维细胞的预定基因组位点。 展开更多
关键词 绵羊 成纤维细胞 ACTG1 crispr-cas9
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