芦花鸡IFITM3基因克隆及生物信息学分析

本研究旨在对芦花鸡的干扰素诱导的跨膜蛋白-3(interferon-induced transmembrane protein 3,IFITM3)基因进行克隆及生物信息学分析。根据GenBank中鸡IFITM3基因序列(登录号:NM_001350061.1)设计特异性引物,利用RT-PCR技术对芦花鸡IFITM3基因进行克隆、测序和生物信息学分析。结果表明,芦花鸡IFITM3基因片段大小为414bp,与GenBank中发表的鸡IFITM3基因序列(登录号:NM_001350061.1)同源性为99.9%;编码137个氨基酸。IFITM3基因理论分子质量为14.95ku,理论等电点(pI)为6.89,不稳定系数为33.98,脂肪系数为103.14,平均疏水指数为0.300,存在3个明显的疏水区,无信号肽,存在2个跨膜区,分别位于第46-68、101-123位氨基酸处;二级结构预测显示,IFITN3蛋白主要以无规则卷曲为主,存在多个α-螺旋和β-折叠区域。本研究成功克隆了芦花鸡IFITM3基因,为进一步研究IFITM3蛋白功能及阐明其抗病毒分子机制奠定了理论基础。

甲型流感病毒感染野生型和Ifitm3^-/^-小鼠的纵膈淋巴结的转录组学研究

干扰素诱导的跨膜蛋白3(Interferon-induced transmembrane protein 3,IFITM3)敲除小鼠(Ifitm3^-/^-小鼠)感染流感病毒后,表现出更为严重的病理损伤和死亡率。最近的研究发现,IFITM3蛋白表达也会影响机体针对流感病毒的适应性免疫反应效果。由于空间效应,纵膈淋巴结在机体抵抗流感病毒急性期感染的适应性免疫应答过程中发挥重要功能,本研究欲探究使用流感病毒鼠肺适应株A/PR/8/H1N1进行感染后,野生型和Ifitm3^-/^-小鼠的纵膈淋巴结中与免疫相关的差异表达基因。本研究对流感病毒PR8感染后第3d的纵膈淋巴结进行RNA-Seq测序。高通量测序共检测到有1312个差异表达基因,其中上调和下调差异表达基因分别为904和408个。这些差异表达基因主要参与炎症反应与细胞凋亡信号通路、T细胞和B细胞受体信号通路、T细胞和B细胞激活与细胞因子分泌等信号通路。采用荧光定量PCR对部分免疫相关的差异表达基因进行验证,结果与RNA-Seq测序结果一致。本研究为进一步阐明IFITM3在适应性免疫应答中拮抗流感病毒的分子机制奠定了基础。

IFITM3基因单核苷酸多态性与急性淋巴细胞白血病关系

目的探讨急性淋巴细胞白血病(ALL)患者干扰素(IFN)诱导跨膜蛋白3(IFITM3)的单核苷酸多态性(SNP)与其发病的相关性,为ALL临床预防和诊断提供依据。方法选取2018-01-06-2019-02-06本院收治的60例ALL患者为病例组,另选取同期本院健康体检者50名作为对照组,比较2组IFITM3基因的SNP,分析其与抗ALL的DNA抗体、C3和C4补体的相关性。结果病例组IFITM3表达量为6.77±2.03,高于对照组的3.02±0.59,t=12.617,P<0.001。病例组抗ALL的DNA抗体水平为(1.01±0.24)mg/L,低于对照组的(3.24±1.29)mg/L,t=13.132,P<0.001;C3补体水平为(2.68±1.27)g/L,高于对照组的(1.03±0.54)g/L,t=8.560,P<0.001;C4补体水平为(1.58±0.35)g/L,高于对照组的(0.77±0.04)g/L,t=16.264,P<0.001。病例组GA和GG例数多于对照组,AA例数少于对照组,差异有统计学意义,χ^(2)=54.797,P<0.001。病例组G等位基因频率为70.00%,大于对照组的36.00%,χ^(2)=10.897,P<0.001。结论IFITM3基因多态性与ALL有关,携带GA和GG基因型者发病风险增大。