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油菜种子发育过程中总RNA量及线粒体nad6基因转录水平的变化 被引量:3
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作者 陈德富 陈喜文 张俊 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期1-4,共4页
以油菜为材料,在摸索出合适的种子总RNA提取技术基础上,研究其发育过程中总RNA量的变化,然后结合定量斑点杂交技术,研究种子发育过程中线粒体nad6基因转录水平的变化规律。结果表明,采用的总RNA提取方法具有操作简单... 以油菜为材料,在摸索出合适的种子总RNA提取技术基础上,研究其发育过程中总RNA量的变化,然后结合定量斑点杂交技术,研究种子发育过程中线粒体nad6基因转录水平的变化规律。结果表明,采用的总RNA提取方法具有操作简单、纯度高、降解少、电泳图谱理想等优点。角果宽度在2.80mm以下的种子总RNA量随发育而平稳地增加,角果宽度在2.80mm以上的种子总RNA量随发育而迅速降低。除3.85mm角果外,发育过程中的种子总RNA量均高于叶片的。线粒体nad6基因的RNA定量斑点杂交结果显示叶片nad6基因的转录量很低,而发育中各个阶段的种子nad6基因转录量很高,并有随发育加强的趋势。 展开更多
关键词 油菜 种子发育 RNA 线粒体nad6基因 基因转录
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陆地棉线粒体nad6基因mRNA无常规终止密码子 被引量:1
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作者 张晓 孟志刚 +5 位作者 孙国清 周焘 史计 于源华 张锐 郭三堆 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1119-1125,共7页
植物线粒体nad6基因编码NADH(还原型辅酶Ⅰ)脱氢酶第6亚基,前期研究发现,该基因可能与棉花细胞质雄性不育相关,但该基因的转录情况尚不清楚.本研究利用PCR测序、Southern印迹方法发现,陆地棉线粒体基因组(mtDNA)中nad6基因长621 bp,且... 植物线粒体nad6基因编码NADH(还原型辅酶Ⅰ)脱氢酶第6亚基,前期研究发现,该基因可能与棉花细胞质雄性不育相关,但该基因的转录情况尚不清楚.本研究利用PCR测序、Southern印迹方法发现,陆地棉线粒体基因组(mtDNA)中nad6基因长621 bp,且为单拷贝.RT-PCR及环化RT-PCR分析发现,其mRNA在终止密码子前-14或-15 nt处提前终止;虽然该基因mRNA编码区存在12处RNA编辑(C-U)位点,但并未产生新的替代的终止密码子;基因mRNAs尾端poly(A)处含有0、1、2或4个"A",也并未与前方相邻碱基凑成新的终止密码子,即:该基因mRNA无常规终止密码子(UGA,UAG,UAA).本研究结果提示,棉花线粒体nad6基因mRNA很可能有其它的终止密码子.针对这种情况对植物线粒体如何翻译无常规终止密码子的mRNA进行了讨论. 展开更多
关键词 棉花 线粒体基因组 nad6 终止密码子 环化RT-PCR
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西施舌3个群体H2A基因和nad6-nad1片段序列比较研究 被引量:1
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作者 朱明 申欣 +3 位作者 朱笑琳 屠海淼 杨婕 孟学平 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期26-32,共7页
西施舌(Coelomactra antiquata)浮游幼虫EST序列拼接获得组蛋白H2A ORF及其两翼的非编码区,在ORF两翼设计引物Can-H2AF和Can-H2AR,扩增H2A基因片段;从nad6 3′端和nad1 5′端设计引物,扩增两基因区域DNA序列,测序并进行核苷酸序列差... 西施舌(Coelomactra antiquata)浮游幼虫EST序列拼接获得组蛋白H2A ORF及其两翼的非编码区,在ORF两翼设计引物Can-H2AF和Can-H2AR,扩增H2A基因片段;从nad6 3′端和nad1 5′端设计引物,扩增两基因区域DNA序列,测序并进行核苷酸序列差异分析,研究漳州西施舌分化水平。结果:共获得西施舌3个群体H2A基因606bp或616bp基因区DNA片段23条,检测到9种基因型(Gen)。西施舌漳州群体H2A基因AT含量(51.51%)高于日照、北海群体AT含量(50.58%);序列比对分析显示,简约信息位点占4.05%。基于H2A基因的漳州群体与日照/北海混合群体间遗传距离平均为0.044,漳州群体,混合群体内遗传距离分别为0.003和0.004,群体间与群体内遗传距离之比为11-14.7;AMOVA分析结果显示,漳州群体和混合群体间发生了极显著遗传分化(FST=0.937,P〈0.01)。从nad6-nad1片段中共检出7种单倍型(Hap),漳州群体与日照群体无共享单倍型,基于nad6-nad1的漳州群体与日照群体间遗传距离为0.199-0.202,群体间与群体内遗传距离之比50-66,两个群体间nad1多肽链一级结构存在极大差异,有9个位点的氨基酸不同,日照西施舌缺失6个氨基酸。线粒体DNA显示西施舌漳州与日照群体发生了明显的遗传分化。 展开更多
关键词 西施舌(Coelomactra antiquata) 组蛋白H2A基因 nad6-nad1区域 遗传分化
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线粒体nad 6基因在油菜种子发育中的特异性表达 被引量:1
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作者 陈喜文 陈德富 《华北农学报》 CSCD 北大核心 1999年第1期53-56,共4页
以油菜为材料,研究线粒体nad6基因在种子发育中的表达。结果表明,nad6基因在叶片中的表达很低,在种子发育过程中各阶段均有较高表达,并随种子发育进程而有加强的趋势。推测线粒体nad6基因可能除与呼吸作用有关外还有其... 以油菜为材料,研究线粒体nad6基因在种子发育中的表达。结果表明,nad6基因在叶片中的表达很低,在种子发育过程中各阶段均有较高表达,并随种子发育进程而有加强的趋势。推测线粒体nad6基因可能除与呼吸作用有关外还有其他功能。 展开更多
关键词 油菜 种子发育 线粒体 nad6基因 特异性表达
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组织芯片技术检测SIRT6蛋白在结肠癌组织中的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 李婳 曹艳莎 +2 位作者 赵津平 任甫 李宁 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期893-898,I0007,共7页
目的:探讨NAD依赖性蛋白脱乙酰基酶sirtuin-6(SIRT6)蛋白在结肠癌组织中的表达及其与结肠癌患者临床病理参数之间的关系,阐明SIRT6蛋白在结肠癌发生发展中的作用。方法:选取术前均未行放化疗的100例结肠癌患者的结肠癌组织和癌旁组织,... 目的:探讨NAD依赖性蛋白脱乙酰基酶sirtuin-6(SIRT6)蛋白在结肠癌组织中的表达及其与结肠癌患者临床病理参数之间的关系,阐明SIRT6蛋白在结肠癌发生发展中的作用。方法:选取术前均未行放化疗的100例结肠癌患者的结肠癌组织和癌旁组织,采用组织芯片技术和免疫组织化学SP法检测结肠癌组织和癌旁组织中SIRT6蛋白表达水平,采用秩和检验分析SIRT6蛋白表达水平与结肠癌患者临床病理参数的关系,采用Kaplan-Meier生存曲线、单因素和多因素生存分析法分析结肠癌患者临床病理参数与预后的关系。结果: SIRT6蛋白在结肠癌组织细胞核和胞浆中的表达水平均明显高于癌旁组织(Z=-4.603,P=0.000;Z=-7.610,P=0.000)。Kaplan-Meier单因素和多因素分析,细胞核中SIRT6蛋白高表达的结肠癌患者预后更好且是其独立预后影响因子(HR=2.345,P=0.003),年龄较小及T、N分期较低的患者生存率更高(HR=0.394,P=0.004;HR=2.301,P=0.012;HR=2.423,P=0.048),细胞浆中SIRT6蛋白高表达与结肠癌患者预后无关联性(HR=1.309,P=0.333)。结论: SIRT6蛋白在结肠癌细胞核中高表达可作为结肠癌预后良好的评价指标。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 NAD依赖性蛋白脱乙酰基酶sirtuin-6 组织芯片 免疫组织化学
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