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PGPR菌剂对攀西高原植烟土壤nifH基因群落的影响
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作者 李思思 陈玉蓝 +3 位作者 王勇 秦磊涛 陈强 辜运富 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2496-2502,共7页
为研究植物根际促生菌(PGPR)菌剂处理下攀西高原植烟土壤氮素循环的微生物调控机制,本研究以凉山州会理市不同PGPR菌剂(Lysinibacillus sp.、Streptomyces Phaeochromogenes和Aspergillus niger)处理下的植烟田为研究对象,采集烤烟成熟... 为研究植物根际促生菌(PGPR)菌剂处理下攀西高原植烟土壤氮素循环的微生物调控机制,本研究以凉山州会理市不同PGPR菌剂(Lysinibacillus sp.、Streptomyces Phaeochromogenes和Aspergillus niger)处理下的植烟田为研究对象,采集烤烟成熟期根际土壤,通过化学分析和高通量测序技术对土壤理化性质、固氮酶活性及nifH基因群落组成及多样性进行分析。结果表明,与常规施肥相比,施用PGPR菌剂会显著降低植烟土壤的pH值,同时显著提高有效磷含量和固氮酶活性(P<0.05)。总体而言,施用PGPR菌剂提高了植烟土壤nifH基因群落的多样性。植烟土壤优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝菌门(Cyanobacteria)。慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、地杆菌属(Geobacter)和固氮螺菌属(Azospirillum)等是植烟土壤优势属。冗余分析结果表明,植烟土壤pH值、碱解氮和速效钾含量与nifH基因群落结构相关性最强。综上,PGPR菌剂能改善植烟土壤养分状况,提高土壤固氮酶活性,影响植烟根际土壤nifH基因群落组成及多样性,其中以细菌PGPR菌剂Lysinibacillus sp.效果最佳。本研究结果为植烟土壤科学施肥、培肥地力提供了理论依据。 展开更多
关键词 植物根际促生菌(PGPR) nifh基因 群落多样性 固氮酶活性 土壤理化性质
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氮肥对甘蔗叶片内生固氮菌nifH基因表达的影响 被引量:4
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作者 李佳慧 袁丹 +3 位作者 陆建明 杨丽涛 李杨瑞 邢永秀 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期100-106,共7页
为了探究氮肥对甘蔗叶片内生固氮菌nifH基因表达的影响,从RNA和蛋白质水平,采用RT-PCR和Western blot等技术分析施氮和不施氮处理下3个甘蔗品种叶片中nifH基因表达的差异性及对固氮酶相对表达量的影响。结果表明,在大田生长的甘蔗,在施... 为了探究氮肥对甘蔗叶片内生固氮菌nifH基因表达的影响,从RNA和蛋白质水平,采用RT-PCR和Western blot等技术分析施氮和不施氮处理下3个甘蔗品种叶片中nifH基因表达的差异性及对固氮酶相对表达量的影响。结果表明,在大田生长的甘蔗,在施氮肥和对照处理的叶片内,都可检测到固氮菌nifH基因在基因水平和蛋白质水平的表达。施氮处理会抑制或降低叶片内固氮菌的nifH基因的表达,但有利于nifH在蛋白质水平的表达,3个甘蔗品种内生固氮菌nifH基因的相对表达量都是施氮处理下较高,尤其是甘蔗品种ROC22,处理与对照间达到了显著差异。 展开更多
关键词 甘蔗 内生固氮菌 固氮酶 nifh基因
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甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifH基因的克隆与序列分析(英文) 被引量:5
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作者 张琨琨 牛俊奇 +3 位作者 魏春燕 邢永秀 杨丽涛 李杨瑞 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1719-1725,共7页
【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiel... 【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E菌进行PCR扩增;运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其蛋白结构进行预测。【结果】甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif H基因的ORF为882bp,Gen Bank登录号为KF732646.1,与Klebsiella pneumoniae 342、Klebsiella variicola At-22等6种固氮菌的nif H基因氨基酸序列同源性高达95.0%-99.0%。DX120E nifH蛋白与Klebsiella pneumoniae 342的亲缘关系最近,与非克雷伯氏菌固氮菌的亲缘关系较远。生物信息学分析显示,菌株DX120E的nif H基因编码293个氨基酸,起特别重要的氨基酸残基非常保守。该基因在N端有11个氨基酸残基即酪氨酸—甘氨酸—赖氨酸—甘氨酸—甘氨酸—异亮氨酸—甘氨酸—赖氨酸—丝氨酸—苏氨酸—苏氨酸,其属于典型结合ATP的基序结构。nif H蛋白分子量为32.07k D,pI为4.92,为酸性蛋白;其具有2个ASN糖基化位点,1个CAMP磷酸化位点,6个CK2磷酸化位点,6个PKC磷酸化位点。疏水性预测显示该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽。【结论】变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的推导氨基酸序列与克雷伯氏菌固氮菌属具有较高的同源性,该基因在甘蔗生物固氮过程中可能起重要作用。 展开更多
关键词 甘蔗 内生固氮菌 变栖克雷伯氏菌 nifh基因 克隆
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耐除草剂转基因大豆对根际土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响 被引量:4
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作者 王丽娟 李刚 +5 位作者 赵建宁 红雨 修伟明 王慧 章秋艳 杨殿林 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期703-711,共9页
通过大田试验,以两种耐除草剂转基因大豆(PAT、ALS)及相应非转基因亲本大豆(PAT1、ALS1)和当地主栽大豆中黄13(CK)为材料,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术及扩增产物序列分析方法,探讨耐除草剂转基因大豆种植对根际... 通过大田试验,以两种耐除草剂转基因大豆(PAT、ALS)及相应非转基因亲本大豆(PAT1、ALS1)和当地主栽大豆中黄13(CK)为材料,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术及扩增产物序列分析方法,探讨耐除草剂转基因大豆种植对根际土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响。结果表明,PAT、ALS与相应亲本大豆PAT1、ALS1相比,根际土壤固氮微生物群落组成相似度均在60%左右。PAT、ALS根际土壤固氮微生物nifH基因多样性指数(H)和均匀度指数(EH)与相应亲本大豆相比差异均不显著(p>0.05)。测序结果表明,PAT、ALS与相应亲本大豆根际土壤中固氮微生物主要隶属于蓝藻门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。不同处理下nifH基因与理化因子的典范对应分析结果表明,速效磷(AP)、硝态氮(NO3--N)对固氮微生物区系的影响达到显著水平(p<0.05)。以上结论表明,与PAT1、ALS1相比,两种耐除草剂转基因大豆对根际土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响不显著。 展开更多
关键词 PCR—DGGE 耐除草剂 转基因大豆 nifh基因 群落多样性
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肺炎克氏杆菌NifA对巴西固氮螺菌nifH启动子的转录激活作用 被引量:2
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作者 阎大来 何路红 +1 位作者 马旅雁 李季伦 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第3期205-210,共6页
用PCR方法克隆了巴西固氮螺菌Yu62nifH的启动子片段,DNA序列分析表明菌株Yu62与标准菌株Sp7之间的DNA序列差异很小。利用启动子探针质粒载体pCB182,构建了3个不同的nifH::lacZ转录融合质粒,在大肠杆菌中分别测定肺炎克氏杆菌NifA对它们... 用PCR方法克隆了巴西固氮螺菌Yu62nifH的启动子片段,DNA序列分析表明菌株Yu62与标准菌株Sp7之间的DNA序列差异很小。利用启动子探针质粒载体pCB182,构建了3个不同的nifH::lacZ转录融合质粒,在大肠杆菌中分别测定肺炎克氏杆菌NifA对它们的转录激活作用。结果表明巴西固氮螺菌nifH启动子的转录是依赖于NifA的,缺失了上游激活序列的启动子不能被NifA激活转录,肺炎克氏杆菌NifA对其自身nifH及巴西固氮螺菌nifH启动子的转录激活作用并无很大差异。 展开更多
关键词 巴西固氮螺菌 nifh启动子 NIFA 肺炎克氏杆菌
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粪产碱菌nifH启动子与LacZ的融合基因构建及其表达调控 被引量:2
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作者 张海予 林敏 +1 位作者 萧凤回 朱玉贤 《生物化学杂志》 CSCD 1997年第5期499-504,共6页
在pRK290载体上将粪产碱菌固氮酶基因nifH的启动子与报告基因LacZ相融合,获得表达载体pSK6,并转导到粪产碱菌A1501菌株中,探讨了铵和氧对该启动子的表达调控.结果表明,粪产碱菌nifH启动子仍受到铵和氧... 在pRK290载体上将粪产碱菌固氮酶基因nifH的启动子与报告基因LacZ相融合,获得表达载体pSK6,并转导到粪产碱菌A1501菌株中,探讨了铵和氧对该启动子的表达调控.结果表明,粪产碱菌nifH启动子仍受到铵和氧的调节.当铵浓度大于3mmol/L时,其表达水平大幅度下降,但铵浓度高达40mmol/L,仍有很低水平表达.而且,带有巴西固氮螺菌nifH∶lacZ的粪产碱菌接合子在高铵条件下(40mmol/L)也有低水平表达.此外,氧对粪产碱菌的nifH启动子有抑制作用,这在无铵条件下表现最为明显. 展开更多
关键词 粪产碱菌 nifh启动子 表达 基因调控 固氮菌
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氮对巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因表达的影响
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作者 林标声 吕正阳 +2 位作者 罗茂春 何玉琴 林占熺 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第1期103-108,共6页
采用DNA电泳、qRT-PCR及Western blot技术分析了在无氮和含氮培养条件下,巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02菌株nifH基因序列长度、基因与蛋白表达量的差异.结果表明,GN02菌株在无氮及含氮条件下均有nifH基因表达,其克隆得到的... 采用DNA电泳、qRT-PCR及Western blot技术分析了在无氮和含氮培养条件下,巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02菌株nifH基因序列长度、基因与蛋白表达量的差异.结果表明,GN02菌株在无氮及含氮条件下均有nifH基因表达,其克隆得到的nifH基因与同属禾本科的甘蔗的nifH基因亲缘关系较近;无氮培养条件下nifH基因和蛋白表达量明显高于含氮条件下的表达量.表明无氮条件能诱导GN02菌株nifH基因表达量的增加,而氮源抑制nifH基因的表达. 展开更多
关键词 巨菌草 内生固氮菌 Klebsiella variicola nifh基因 差异表达
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巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
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作者 林标声 张浣星 +2 位作者 何玉琴 罗茂春 林占熺 《湖北农业科学》 2020年第3期147-153,共7页
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的... 研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的ORF,长度882 bp,编码293个氨基酸,NCBI GenBank登录号为MK131264。生物信息学分析表明,GN02菌株nifH基因具有高度保守性,与其他物种来源的nifH基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性均达到95%以上。nifH蛋白总相对分子量为31 970.73、理论等电点pI为4.72;跨膜模型倾向N-末端向外的由内到外的跨膜、整个多肽链表现为亲水性;有2个糖基化位点但无分泌信号肽,有可能存在螺旋卷曲结构;二级结构预测表明α-螺旋和无规则卷曲是其多肽链中的主要结构元件,延伸链散布于整个蛋白质中;在数据库中能对该蛋白进行三维同源建模。 展开更多
关键词 巨菌草(Pennisetum giganteum) 内生固氮菌 KLEBSIELLA variicola nifh基因 克隆 生物信息学
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祁连山高寒草原碱性土壤固氮微生物数量及固氮基因(nifH)群落结构研究 被引量:15
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作者 康文龙 台喜生 +3 位作者 李师翁 董康 刘光琇 张威 《冰川冻土》 CSCD 北大核心 2013年第1期208-216,共9页
对祁连山高寒草原碱性土壤可培养固氮菌数量、固氮基因(nifH)群落结构及其理化性质进行了研究.结果表明:固氮菌数量在土层0~40cm处于3.6×105~0.21×105 CFUs.g-1之间,除了海拔3 001m的土样AQ4外,其他3个土样固氮菌数量随着... 对祁连山高寒草原碱性土壤可培养固氮菌数量、固氮基因(nifH)群落结构及其理化性质进行了研究.结果表明:固氮菌数量在土层0~40cm处于3.6×105~0.21×105 CFUs.g-1之间,除了海拔3 001m的土样AQ4外,其他3个土样固氮菌数量随着土壤深度的加深而减小.固氮菌数量与地下生物量呈显著正相关性,与有机碳、可溶有机氮、速效磷和速效钾呈正相关性,而与pH值和全盐呈负相关性.通过基因测序得到的37个固氮基因nifH克隆中,蓝藻门占41%,变形菌门占8%,厚壁菌门占14%,未知菌株占37%;蓝藻门在除了AQ4外的土样中普遍存在,并且是AQ1的优势固氮菌群.此外,还发现了4个新的nifH基因,分别是AQ1-12(KC412109)、AQ4-3(KC412133)、AQ4-4(KC412133)、AQ4-5(KC412133),其中后三者是土样AQ4的优势种群. 展开更多
关键词 祁连山高寒草原 碱性土壤 固氮微生物 固氮基因 群落结构
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Toxic effects of acetochlor, methamidophos and their combination on nifH gene in soil 被引量:8
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作者 SU Zhen-cheng ZHANG Hui-wen +2 位作者 LI Xin-yu ZHANG Qin ZHANG Cheng-gang 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2007年第7期864-873,共10页
Toxic effects of two agrochemicals on nifH gene in agricultural black soil were investigated using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and sequencing approaches in a microcosm experiment. Changes of soil ... Toxic effects of two agrochemicals on nifH gene in agricultural black soil were investigated using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and sequencing approaches in a microcosm experiment. Changes of soil nifH gene diversity and composition were examined following the application of acetochlor, methamidophos and their combination. Acetochlor reduced the nifH gene diversity (both in gene richness and diversity index values) and caused changes in the nifH gene composition. The effects of acetochlor on nifH gene were strengthened as the concentration of acetochlor increased. Cluster analysis of DGGE banding patterns showed that nifH gene composition which had been affected by low concentration of acetochlor (50 mg/kg) recovered firstly. Methamidophos reduced nifH gene richness that except at 4 weeks. The medium concentration of methamidophos (150 mg/kg) caused the most apparent changes in nifH gene diversity at the first week while the high concentration of methamidophos (250 mg/kg) produced prominent effects on nifH gene diversity in the following weeks. Cluster analysis showed that minimal changes of nifH gene composition were found at 1 week and maximal changes at 4 weeks. Toxic effects of acetochlor and methamidophos combination on nifH gene were also apparent. Different nifH genes (bands) responded differently to the impact of agrochemicals: four individual bands were eliminated by the application of the agrochemicals, five bands became predominant by the stimulation of the agrochemicals, and four bands showed strong resistance to the influence of the agrochemicals. Fifteen prominent bands were partially sequenced, yielding 15 different nifH sequences, which were used for phylogenetic reconstructions. All sequences were affiliated with the alpha- and beta-proteobacteria, showing higher similarity to eight different diazotrophic genera. 展开更多
关键词 agrochemicals ACETOCHLOR methamidophos toxic effects nifh gene PCR-DGGE
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沙冬青根瘤菌固氮酶基因nifH PCR-RFLP分析 被引量:2
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作者 毕江涛 贺达汉 +2 位作者 谢瑞梅 位秀丽 韦革宏 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期315-321,共7页
利用固氮基因nifH PCR扩增,nifH PCR-RFLP及扩增产物序列分析方法对分离自宁夏和内蒙古部分地区的沙冬青根瘤菌代表菌株的nifH进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明,在80%相似水平上42株根瘤菌nifH PCR-RFLP基因图谱中有5个基... 利用固氮基因nifH PCR扩增,nifH PCR-RFLP及扩增产物序列分析方法对分离自宁夏和内蒙古部分地区的沙冬青根瘤菌代表菌株的nifH进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明,在80%相似水平上42株根瘤菌nifH PCR-RFLP基因图谱中有5个基因型聚类群。对不同基因型代表菌株的nifH PCR产物进行序列测定和系统发育关系分析,测试菌株在系统发育地位上与中慢生根瘤菌和中华根瘤菌相近,测试菌株与温带中慢生根瘤菌(Mesorhizobium temperatum isolate HAMBI 2583)序列相似性范围为95.6%-96.9%,与草木樨中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti strain CCBAU10062)基因序列相似性范围为99.8%-100%,基因序列同源性较高。本研究中nifH基因所揭示的沙冬青根瘤菌遗传多样性和系统发育关系说明沙冬青根瘤菌受染色体基因背景、地理环境以及菌株个体的进化而存在一定的差异。 展开更多
关键词 沙冬青 根瘤菌 固氮酶基因 限制性片段长度多态性分析 遗传多样性 序列分析 系统发育关系
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粪产碱菌(Alcaligenes faecalix)基因文库的构建和nifH基因同源顺序的克隆 被引量:1
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作者 海伟力 郑洪刚 +1 位作者 尤崇杓 王斌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1992年第4期369-377,共9页
采用λ噬菌体置换型载体EMBL4,构建了Alcaligenes faecalis A-15 H1菌株总DNA的基因文库。用Sau3AⅠ限制酶完成部分酶切,取13—20kb大小的片段进行克隆。载体DNA经BamHⅠ和SaiⅠ完全双酶切,左右臂“退火”形成左右臂载体分子后再与外源... 采用λ噬菌体置换型载体EMBL4,构建了Alcaligenes faecalis A-15 H1菌株总DNA的基因文库。用Sau3AⅠ限制酶完成部分酶切,取13—20kb大小的片段进行克隆。载体DNA经BamHⅠ和SaiⅠ完全双酶切,左右臂“退火”形成左右臂载体分子后再与外源片段连接。左右臂载体分子与外源片段按照1:1的分子比进行体外连接。用E.coli BHB2688和E.coli BHB2690制备的包装抽提物进行体外包装,所得基因文库效价测定为1.2×10~6 pfu,远远超过理论上所需的库容量。以nif H基因作为探针,经3轮噬菌斑原位杂交,从基因文库中筛选出含有其同源顺序的克隆,并得到了梯度点杂交的验证。对所得重组噬菌体克隆之一进行Southern转移杂交,结果证实,其3.5kb的EcoRⅠ酶切片段为nif H阳性杂交条带。将其克隆到质粒pUC19 DNA上后,转入受体菌JM101中。再次经Southern转移杂交,证明所得重组质粒克隆(pAFH)含有粪产碱菌中的与nifH基因有同源顺序的片段。 展开更多
关键词 粪产碱菌 基因文库 nif H基因
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缺失nifH的棕色固氮菌突变种固氮酶钼铁蛋白的结晶
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作者 边少敏 赵剑峰 +4 位作者 吕玉兵 赵颖 周会娜 王耀萍 黄巨富 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2004年第1期58-62,共5页
从限氨固氮培养基中培养的缺失nifH的棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii Lipmann)突变种DJ54中,分离纯化出部分纯的缺失FeMoco的钼铁蛋白(△nifH Avl)。用相同纯化方法分别从DJ35和UW45突变种中纯化的△nifE Avl和NifB^-Avl的纯度明... 从限氨固氮培养基中培养的缺失nifH的棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii Lipmann)突变种DJ54中,分离纯化出部分纯的缺失FeMoco的钼铁蛋白(△nifH Avl)。用相同纯化方法分别从DJ35和UW45突变种中纯化的△nifE Avl和NifB^-Avl的纯度明显高于△nifH Avl的纯度。在合适的结晶条件下,可得到这三种蛋白的深棕色短斜四棱柱晶体。△nifH Avl与NifB^-Avl一样,晶体形成所需的时间比△nifE Avl的长。而它结晶所需的沉淀剂和缓冲液最适浓度则与△nifE Avl的相同。SDS—PAGE鉴定表明,结晶的△nifH Avl与OP Avl的组成相似。这表明,在△nifH Avl溶液中形成的晶体可能就是该蛋白质的晶体。 展开更多
关键词 棕色固氮菌 突变种 固氮酶钼铁蛋白 nifh FeMoco 结晶 沉淀剂 缓冲液 浓度
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盐度对水稻土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响
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作者 廖洁深 何杰珩 +3 位作者 刘广超 马驿 丁月霞 周鸿凯 《安徽农业科学》 CAS 2022年第12期1-4,共4页
[目的]研究盐浓度对水稻土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响。[方法]在不同盐浓度的土壤区域采集样品,提取土壤总DNA,采用末端限制性片段长度多样性分析技术(T-RFLP)对土壤固氮微生物nifH基因进行多样性分析。[结果]随着水稻土壤盐度上... [目的]研究盐浓度对水稻土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响。[方法]在不同盐浓度的土壤区域采集样品,提取土壤总DNA,采用末端限制性片段长度多样性分析技术(T-RFLP)对土壤固氮微生物nifH基因进行多样性分析。[结果]随着水稻土壤盐度上升,土壤有机质、全氮和碱解氮含量也呈现一定程度的上升趋势;水稻土壤nifH基因的分类操作单元(OTU)总数在土壤盐度最高时达最大值,各组优势细菌数量在2.5种左右,样本丰度主要集中在4个片段内,各组相对丰度差异不显著(P>0.05);水稻组土壤与富贵竹土壤相比,多样性和均匀度均差异显著(P<0.05),水稻各组间微生物多样性呈现盐度依赖效应,但差异不显著(P>0.05)。[结论]土壤盐度影响土壤性质及固氮微生物,微生物多样性呈现一定盐度依赖效应。 展开更多
关键词 固氮微生物 盐度 水稻土壤 nifh基因 多样性
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长期定位不同施肥类型对烟田土壤nifH细菌群落结构的影响 被引量:2
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作者 蒋雨洲 陈顺辉 +5 位作者 李文卿 刘青丽 李志宏 张云贵 张燕 唐英琪 《中国烟草学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期35-45,共11页
【目的】解析长期施肥对烟田土壤中含nifH细菌群落结构和丰度的影响。【方法】通过田间定位试验,研究了长期单一施用化肥(T1)、化肥+稻草回田(T2)和化肥+稻草回田+饼肥(T3)3个处理对烟田土壤无机氮及烟株根际土壤nifH细菌多样性的影响... 【目的】解析长期施肥对烟田土壤中含nifH细菌群落结构和丰度的影响。【方法】通过田间定位试验,研究了长期单一施用化肥(T1)、化肥+稻草回田(T2)和化肥+稻草回田+饼肥(T3)3个处理对烟田土壤无机氮及烟株根际土壤nifH细菌多样性的影响。【结果】①长期采用稻草回田并施用饼肥有利于提高植烟土壤无机氮含量;②稻草回田或再增加饼肥处理的烟田土壤中细菌α多样性均高于单施化肥处理;③在细菌群落组成中变形菌门(Proteobacteria)和该菌门下物种的相对丰度最高,且稻草回田并添加饼肥处理最高;④植烟土壤微生物LEf Se进化分支图表明单施化肥、化肥+稻草回田和化肥+稻草回田+饼肥的烟田土壤的细菌优势种群主要是披毛菌目(Gallionellales)、根瘤菌目(Rhizobiales)和柄杆菌目(Caulobacterales)的物种。【结论】长期定位施肥条件下,稻草回田并增加饼肥能够改善烟田土壤无机氮含量,提高细菌群落结构组成和相对丰度。 展开更多
关键词 烟草 野生种 eIF4E基因 马铃薯Y病毒 抗性
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荒漠植物柠条根际土壤nifH基因荧光定量及固氮菌多样性分析 被引量:3
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作者 刘爽 姚佳妮 +1 位作者 沈聪 代金霞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期252-262,共11页
探索荒漠固沙植物根际土壤nif H基因丰度信息和固氮菌群落结构组成和多样性,可为丰富荒漠区微生物资源库提供基础资料。通过实时荧光定量PCR和高通量测序方法,分析了宁夏荒漠区5个柠条林地根际土壤nif H基因丰度和固氮菌群落结构组成,... 探索荒漠固沙植物根际土壤nif H基因丰度信息和固氮菌群落结构组成和多样性,可为丰富荒漠区微生物资源库提供基础资料。通过实时荧光定量PCR和高通量测序方法,分析了宁夏荒漠区5个柠条林地根际土壤nif H基因丰度和固氮菌群落结构组成,并结合分离培养方法对柠条根际固氮菌进行筛选和多样性研究。结果表明,5个柠条群落根际土壤nif H基因的拷贝数存在较大的差异,罗山林地(LS)nif H基因拷贝数最高,沙坡头林地(SPT)最低。柠条根际土壤共检测到固氮菌7门12纲26科30属。在科属水平上,沙坡头林地固氮菌群落组成差异较大,未分类的变形杆菌和叶杆菌科分别占25.54%和22.77%,红螺菌科占17.43%,中慢生根瘤菌属是其优势属,相对丰度为22.77%;其余4个林地均以红螺菌科、斯科曼氏球菌属为优势类群,相对丰度分别为23.71%-73.45%和23.19%-71.14%,在罗山林地中占比最高。分离出的固氮菌隶属于15个属,除常见的假单胞菌属、根瘤菌属和肠杆菌属等固氮类群外,还包括勒克氏菌属、金黄杆菌属和寡养单胞菌属等,多样性十分丰富。 展开更多
关键词 柠条 nif H基因 固氮菌群落 多样性
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荒漠灌木林土壤nifH基因丰度及固氮微生物群落组成特征
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作者 代金霞 姚佳妮 +2 位作者 刘爽 苏建宇 张钧杰 《北京林业大学学报》 CAS 2024年第11期43-52,共10页
【目的】从群落水平探究荒漠豆科灌木林地土壤固氮微生物多样性、群落结构组成及其环境影响因素。【方法】采用荧光定量PCR和Illumina高通量测序方法,研究宁夏荒漠草原4种典型豆科灌木林地(沙冬青、猫头刺、柠条和毛刺)土壤中nifH基因... 【目的】从群落水平探究荒漠豆科灌木林地土壤固氮微生物多样性、群落结构组成及其环境影响因素。【方法】采用荧光定量PCR和Illumina高通量测序方法,研究宁夏荒漠草原4种典型豆科灌木林地(沙冬青、猫头刺、柠条和毛刺)土壤中nifH基因丰度、固氮微生物多样性和群落结构组成,采用Pearson相关性分析和冗余分析等方法进行环境因子关联分析。【结果】(1)4种灌木林地土壤中nifH基因丰度存在差异,柠条林地土壤中nifH丰度显著高于沙冬青、猫头刺和毛刺林地(P<0.05);固氮微生物群落丰富度表现为柠条和沙冬青林地显著高于毛刺和猫头刺林地(P<0.05),群落多样性表现为柠条林地显著高于沙冬青林地(P<0.05),而毛刺、猫头刺和沙冬青林地固氮微生物群落多样性差异不显著。(2)4种林地中检测到的固氮微生物分布在5门15科19属。变形菌门为绝对优势类群,相对丰度在91.13%~97.79%之间;红螺菌科为共有优势科,占59.56%~79.68%;属水平上,斯科曼氏菌属、固氮螺菌属和固氮氢自养单胞菌属是共有优势属;沙冬青林地固氮微生物组成与其他3种林地差别较大,有大量固氮菌属分布(占25.09%)。(3)相关性分析表明,固氮微生物nifH基因丰度、丰富度指数和β多样性与土壤pH显著正相关。土壤速效磷、速效钾、pH、全氮和全磷显著影响固氮微生物群落组成。【结论】柠条林地nifH基因丰度、固氮微生物丰富度和多样性均高于其他灌木林地,其土壤微生物功能群落具备更强的氮素积累和转化能力。 展开更多
关键词 根际土壤 nifh基因 固氮微生物 群落组成
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攀西高原不同轮作制度下土壤固氮微生物nifH基因多样性与群落结构特征 被引量:3
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作者 梁锦鹏 陈玉蓝 +5 位作者 王勇 罗琳 雷善钰 杨沁閻 陈强 辜运富 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期118-130,共13页
[背景]关于高原生境轮作制度对土壤固氮微生物群落组成及多样性的影响研究尚少。[目的]深入认识攀西高原不同轮作制度对农田土壤肥力及土壤固氮微生物nifH基因群落结构与多样性的影响,以期建立合理的轮作制度。[方法]以凉山州冕宁县不... [背景]关于高原生境轮作制度对土壤固氮微生物群落组成及多样性的影响研究尚少。[目的]深入认识攀西高原不同轮作制度对农田土壤肥力及土壤固氮微生物nifH基因群落结构与多样性的影响,以期建立合理的轮作制度。[方法]以凉山州冕宁县不同作物轮作制度[包括光叶紫花苕-烤烟(分轮作15年和20年两种,分别为G1和G2)、苦荞-烤烟(KQ)、大麦-烤烟(DM)和撂荒(CK)]的土壤为研究对象,通过化学分析和Illumina MiSeq技术,对土壤理化性质、土壤固氮微生物nifH基因多样性及群落组成进行分析。[结果]撂荒土壤全氮、铵态氮、硝态氮、有机碳和含水量最显著(P<0.05)。KQ轮作下土壤有效磷和速效钾分别提高了43.0%和2.60%,而DM轮作下的土壤理化性质均下降。土壤固氮酶活以撂荒土壤最高,G2轮作最低。土壤固氮微生物nifH基因多样性以G1轮作最高、G2轮作最低,门水平上以变形菌门(Proteobacteria)是优势共有nifH基因类群,相对丰度占群落的63.0%-92.4%;属水平上,偶氮氢单胞菌属(Azohydromonas)是不同轮作制度下的优势物种,慢生根瘤属(Bradyrhizobium)是撂荒土壤中的优势物种。[结论]冗余分析发现,土壤pH和含水量是驱动土壤固氮微生物nifH基因的群落组成的关键因子。本研究表明不同轮作制度可以明显改变土壤肥力状况和固氮微生物nifH基因群落组成,其中以光叶紫花苕-烤烟轮作15年的影响最明显,可以提高土壤养分含量,增加土壤固氮微生物nifH基因多样性。 展开更多
关键词 nifh基因 高通量测序 多样性 群落结构 轮作制度
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呼伦贝尔草原土壤固氮微生物nifH基因多样性与群落结构 被引量:22
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作者 文都日乐 李刚 +2 位作者 杨殿林 张静妮 易津 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期790-797,共8页
采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术及扩增产物序列分析方法比较研究了呼伦贝尔5种草地类型(线叶菊草原、贝加尔针茅草原、羊草草原、大针茅草原、克氏针茅草原)土壤固氮微生物nifH基因多样性及群落结构特征。结果表明... 采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术及扩增产物序列分析方法比较研究了呼伦贝尔5种草地类型(线叶菊草原、贝加尔针茅草原、羊草草原、大针茅草原、克氏针茅草原)土壤固氮微生物nifH基因多样性及群落结构特征。结果表明,不同草地类型间土壤固氮微生物群落组成差异显著,羊草草原和大针茅草原相似性较高,相似度为67%,而其他3个草地类型间相似性较低,相似度均低于60%。羊草草原土壤nifH基因多样性最高,其次是克氏针茅草原、大针茅草原和贝加尔针茅草原,线叶菊草原最低。系统发育分析结果表明,呼伦贝尔草原土壤固氮微生物大部分属于变形菌门的α-变形菌纲,分别隶属于慢生根瘤菌属、中慢生根瘤菌属、红假单胞菌属、固氮螺菌属。5种草地类型中,克氏针茅草原土壤中联合固氮菌和自生固氮菌居多,而其他4个草地类型均以共生固氮菌为优势生态类型。 展开更多
关键词 呼伦贝尔草原 nifh基因 多样性 系统发育分析
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稻草还田对水稻土固氮基因(nifH)组成结构和多样性的影响 被引量:15
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作者 张苗苗 刘毅 +3 位作者 盛荣 秦红灵 伍延正 魏文学 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期2339-2344,共6页
以中国科学院桃源农业生态试验站长期定位施肥试验为平台,选取稻草还田(C)、氮磷钾(NPK)、氮磷钾加稻草还田(NPK+C)和不施肥对照(CK)4个处理,在晚稻的分蘖期、孕穗期和成熟期分别采集土样,利用实时定量PCR(Q-PCR)和末端限制性片段多态性... 以中国科学院桃源农业生态试验站长期定位施肥试验为平台,选取稻草还田(C)、氮磷钾(NPK)、氮磷钾加稻草还田(NPK+C)和不施肥对照(CK)4个处理,在晚稻的分蘖期、孕穗期和成熟期分别采集土样,利用实时定量PCR(Q-PCR)和末端限制性片段多态性(T-RFLP)等分子生物学方法研究长期稻草还田对水稻土含nifH基因固氮微生物群落丰度、组成和多样性的影响.结果表明:与对照相比,稻草还田和单施化肥处理均显著增加nifH基因的丰度(分蘖期除外),NPK+C处理中含nifH基因的微生物数量最高;nifH基因组成也受到长期施肥的影响,其中CK处理nifH基因组成与各施肥处理明显不同,C与NPK处理间nifH基因组成存在一定差异,而NPK与NPK+C处理间无显著差异.长期施肥不会引起含nifH基因微生物群落多样性的显著改变.可见,稻草还田不仅引起nifH基因群落的组成发生变化,而且导致其数量显著增加,因而可增加土壤的固氮能力. 展开更多
关键词 稻草还田 nifh基因 基因丰度 群落组成 多样性
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