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Comparison on Detection Results of PRV Wild Virus Antibody Provided by Different Institutions
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作者 Sun Hua Song Zhongxu +6 位作者 Zeng Defang Li Lianghua Li Mingbo Dong Binke Mei Shuqi Peng Xianwen Wu Huayu 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2015年第2期101-102,共2页
The detection results from different institutions were performed at the first stage of PRV wild virus antibody supervision in swine breeding. The serum samples were collected from 71 individuals and each individual wa... The detection results from different institutions were performed at the first stage of PRV wild virus antibody supervision in swine breeding. The serum samples were collected from 71 individuals and each individual was sampled twice at one week interval. The results showed that the positive coincidences for gE antibody between two institutions were 35.71% and 45.45 % :espectively, with the total detection coincidences of 87.32% and 91.55% correspondingly. The positive coincidences for gE antibody between the two detections of each institution were 40.00% and 75.00% respectively, with the total detection coincidences of 87.32% and 97.18% correspondingly. It indicates that it is very necessary to screen the detection institution at the first supervision stage of PRV wild vires for swine population. 展开更多
关键词 Pseudorabies virus (PRV) PRV wild virus antibody Comparative test
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Phylogenetic and Molecular Analysis of an H7N7 Avian Influenza Virus Isolated in East Dongting Lake in 2012 被引量:1
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作者 YAO Yi XU Cui Ling +12 位作者 SHI Jing Hong ZHU Yun LI Yun Fei BAI Tian LI Fang Cai CAI Tao YUAN Fan CHEN Tao YANG Hao LI Wen Chao ZHANG Heng Jiao ZHANG Hong SHU Yue Long 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2015年第7期518-526,共9页
Objective In March 2012, an H7N7 subtype avian influenza virus (AIV) named A/wild goose/Dongting/PC0360/2022 (H7N7) (DT/PC0360) was recovered from a wild goose in East Dongting Lake. We performed whole-genome se... Objective In March 2012, an H7N7 subtype avian influenza virus (AIV) named A/wild goose/Dongting/PC0360/2022 (H7N7) (DT/PC0360) was recovered from a wild goose in East Dongting Lake. We performed whole-genome sequencing of the isolate, and analyzed the phylogenetic and molecular characterization. Methods RNA was extracted from environment samples (including fecal samples from wild bird or domestic ducks, and water samples) for detecting the presence of Influenza A Virus targeting Matrix gene, using realtime RT-PCR assay. The positive samples were performed virus isolation with embryonated eggs. The subtype of the isolates were identified by RT-PCR assay with the HI-HI6 and N1-N9 primer set. The whole-genome sequencing of isolates were performed. Phylogenetic and molecular characterizations of the eight genes of the isolates were analyzed. Results Our results suggested that all the eight gene segments of DT/PC0360 belonged to the Eurasian gene pool, and the HA gene were belonged to distinct sublineage with H7N9 AIV which caused outbreaks in China's Mainland in 2013. The hemagglutinin cleavage site of HA of DT/PC0360 showed characterization of low pathogenic avian influenza virus. Conclusion Strengthening the surveillance of AlVs of wild waterfowl and poultry in this region is vita for our knowledge of the ecology and mechanism of transmission to prevent an influenza pandemic. 展开更多
关键词 Avian influenza viruses wild geese East Dongting Lake wetland H7N7 subtype
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四川省首次分离出的风疹野病毒的基因型分析 被引量:13
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作者 何吉兰 朱贞 +2 位作者 孙莉 童文彬 许文波 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2007年第9期1751-1752,共2页
[目的]为了解2006年引起一起风疹暴发疫情的风疹病毒的分子生物学特征,确定其基因型别。[方法]用Vero-Slam细胞从风疹暴发患者的标本中分离风疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和序列测定与分析鉴定其基因型。[结果]四川省首次分... [目的]为了解2006年引起一起风疹暴发疫情的风疹病毒的分子生物学特征,确定其基因型别。[方法]用Vero-Slam细胞从风疹暴发患者的标本中分离风疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和序列测定与分析鉴定其基因型。[结果]四川省首次分离出的2株风疹野病毒全部鉴定为2B基因型。与3株WHO风疹病毒2B基因型参考株(I11-IS-68、TS34-CH-00和TAN-IND-00)核苷酸同源性分别为93.6%、95.6%和97.1%;氨基酸同源性分别为99.5%,99.5%和100%。[结论]此次疫情是由2B基因型风疹病毒引起的暴发疫情,此项研究为将来四川省风疹病毒的分子流行病学研究打下了基础。 展开更多
关键词 风疹野病毒 序列分析 基因型
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重组杆状病毒杀虫剂的生物安全性 被引量:4
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作者 林同 张传溪 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期244-249,共6页
分别就重组杆状病毒杀虫剂对捕食性天敌和寄生性天敌的影响、与其它生物间的基因重组和生态效应等问题进行了综述。研究成果表明 ,重组病毒的生态适应性降低 ,因而对生态环境以及捕食性和寄生性天敌等非靶标生物种类的危险性也大大降低... 分别就重组杆状病毒杀虫剂对捕食性天敌和寄生性天敌的影响、与其它生物间的基因重组和生态效应等问题进行了综述。研究成果表明 ,重组病毒的生态适应性降低 ,因而对生态环境以及捕食性和寄生性天敌等非靶标生物种类的危险性也大大降低。但重组病毒也不是绝对安全的 ,对其生物安全性还要进行长期、深入全面地分析和研究。 展开更多
关键词 生物安全 杆状病毒 野生病毒 重组病毒 杀虫剂 生态效应
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昆明地区麻疹野病毒株基因型检测 被引量:2
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作者 尚晓丽 夏晓玲 +1 位作者 侯宗柳 杜曾庆 《生物医学工程与临床》 CAS 2012年第2期186-190,共5页
目的检测昆明地区麻疹病毒的优势基因型,为麻疹监测和防治提供依据。方法采集2008年昆明地区临床诊断为麻疹的30例患儿,其中男性18例,女性12例;年龄51天~3岁,0~1岁(≤1岁)的患儿19例,1~2岁(≤2岁)的患儿9例,2~3岁(≤3岁)的患儿2例,... 目的检测昆明地区麻疹病毒的优势基因型,为麻疹监测和防治提供依据。方法采集2008年昆明地区临床诊断为麻疹的30例患儿,其中男性18例,女性12例;年龄51天~3岁,0~1岁(≤1岁)的患儿19例,1~2岁(≤2岁)的患儿9例,2~3岁(≤3岁)的患儿2例,平均患病年龄15个月。采集急性传染期静脉血2 mL,应用酶联免疫吸附分析(ELISA)检测麻疹病毒血清IgM抗体;同时收集患儿的尿液标本,运用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中所分离到的麻疹野病毒株核蛋白(N)基因羧基末端的543个核苷酸,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并与麻疹病毒基因库中的参考株进行比较。结果从30份麻疹患儿尿液标本中分离到7份麻疹野病毒阳性;出疹后6 d的尿液标本中仍可检出麻疹野病毒;将其4株麻疹野病毒的核蛋白(N)羧基末端的543个核苷酸与Genebank中的麻疹病毒的23个参考株进行基因亲缘性关系比较,与世界卫生组织(WHO)的H1、H2基因型参考株China 93-7、China 94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.031~0.047和0.332~0.398;而与H1a的遗传距离最近,为0.010~0.033;4株麻疹野病毒N基因羧基末端543个核苷酸的同源性为96.0%~98.9%;与H1标准株China 93-7和H1a标准株China 93-2的核苷酸同源性分别为95.9%~99.7%和96.9%~99.8%。结论2008年昆明地区所检测到的麻疹野病毒的优势基因型为H1a基因型。 展开更多
关键词 麻疹病毒 基因型 昆明 序列分析 野病毒株
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一株野鸭源禽流感病毒NS基因的分子克隆和测序 被引量:2
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作者 杨思远 柴洪亮 +2 位作者 曾祥伟 孙颖 华育平 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期70-72,共3页
根据Genbank上已发表的H4N6亚型的NS基因序列,设计一对特异性引物,成功扩增出一株野鸭源禽流感病毒扎龙分离株A/mallard/ZhaLong/88(H4N6)的NS基因,并将该片段连接到PMD18-T载体上,连接产物转化至DH5α感受态细胞,对目的片段进行测序,... 根据Genbank上已发表的H4N6亚型的NS基因序列,设计一对特异性引物,成功扩增出一株野鸭源禽流感病毒扎龙分离株A/mallard/ZhaLong/88(H4N6)的NS基因,并将该片段连接到PMD18-T载体上,连接产物转化至DH5α感受态细胞,对目的片段进行测序,获得了NS基因全序列,大小为887bp。该片段的核酸序列与已知的几个毒株序列进行同源性比较,同源性为78.4%~97.6%,推导的氨基酸序列同源性为80.8%~98.6%。 展开更多
关键词 野鸭 禽流感病毒 NS基因 克隆 测序
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鉴别猪瘟野毒与疫苗毒的单一与二重RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:5
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作者 马萍 李达 +5 位作者 汤德元 张元鑫 张华 曾智勇 刘霞 韦冠东 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第9期2230-2239,共10页
为建立一种对猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)临床样本快速、简便的检测技术,以区分猪瘟(classical swine fever,CSF)野毒和疫苗毒感染,为规模化猪场CSF净化奠定基础。通过对GenBank中CSF野毒、疫苗毒及近源病毒的基因组全... 为建立一种对猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)临床样本快速、简便的检测技术,以区分猪瘟(classical swine fever,CSF)野毒和疫苗毒感染,为规模化猪场CSF净化奠定基础。通过对GenBank中CSF野毒、疫苗毒及近源病毒的基因组全序列比对,发现CSF兔化弱毒疫苗株3′-NTR独立存在富含T的插入序列,根据这一特点分别在该插入序列的上、下两端设计2对单一RT-PCR引物并选择特异保守区域设计了二重RT-PCR引物,优化筛选能够鉴别CSF野毒与兔化弱毒疫苗的PCR反应条件,建立了能鉴别CSF野毒和疫苗毒的单一与二重RT-PCR鉴别诊断方法。敏感性和特异性分析表明,单一RT-PCR检测CSFV各引物最低核酸检测量分别为2.2pg(单一RT-PCR中的1对引物)和1.7pg(单一RT-PCR中的另外1对引物);二重RT-PCR检测CSFV各引物最低核酸检测量分别为8.2pg(CSF野毒)和6.7pg(CSF疫苗毒),两种方法均检测不到PRV、PRRSV、JEV、BVDV、PCV2的DNA/RNA。采用该方法对146份可疑临床样品进行检测,结果表明CSF疫苗毒与野毒在能繁母猪、育肥猪、保育猪和哺乳仔猪中的二重感染率分别为6.3%、7.4%、8.3%、8.6%。本研究建立的单一与二重RT-PCR方法都具有敏感性强、特异性优、重复性好的特点,该研究对规模化猪场猪瘟的净化具有十分重要的参考价值。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 野毒 疫苗毒 单一RT-PCR 二重RT-PCR 鉴别诊断 净化应用
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利用弱病毒防治植物病毒病害的研究现状 被引量:4
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作者 齐秋锁 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1989年第2期137-142,共6页
植物病毒间普遍存在干扰现象。目前已能从自然感染的植物中分离选择和通过人工诱变或组建弱病毒。把弱毒株对强毒株的干扰作用应用于数种作物病毒病害的防治实践,获得了明显的增产效果。尽管还有许多问题尚待明确,但研究表明今后可能会... 植物病毒间普遍存在干扰现象。目前已能从自然感染的植物中分离选择和通过人工诱变或组建弱病毒。把弱毒株对强毒株的干扰作用应用于数种作物病毒病害的防治实践,获得了明显的增产效果。尽管还有许多问题尚待明确,但研究表明今后可能会制造出更有效的弱病毒,或将其干扰基因赋予植物而成为病毒抗性植物,显示了弱病毒研制上和利用上的广阔前景。 展开更多
关键词 植物病毒 弱病毒 植物保护
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一株H3亚型野鸟源禽流感病毒血凝素基因序列分析 被引量:1
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作者 冉隆仲 李涛 +4 位作者 马萍 唐宇 刘霞 华莹 张玲莉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第7期73-76,共4页
为了解野鸟在传播禽流感病毒中的作用,贵州省动物疫病预防控制中心定期从威宁草海采集候鸟和留鸟的新鲜粪便,用RT-PCR方法检测病原核酸。监测到1份流感病毒阳性样本,对其血凝素(HA)基因进行了克隆和测序。结果发现,该病毒属于H3亚型,所... 为了解野鸟在传播禽流感病毒中的作用,贵州省动物疫病预防控制中心定期从威宁草海采集候鸟和留鸟的新鲜粪便,用RT-PCR方法检测病原核酸。监测到1份流感病毒阳性样本,对其血凝素(HA)基因进行了克隆和测序。结果发现,该病毒属于H3亚型,所获得的HA基因1794bp,包含有完整的阅读框架,编码566个氨基酸残基,包括6个潜在的糖基化位点,遗传进化分析结果显示其属于欧亚禽源分支。另外,HA受体结合位点上的氨基酸序列具有禽源特有的保守性,分别是154A、206E、210L、241G、242Q和244G。推导的HA裂解位点有典型的低致病特征(PEKQTR/GLF)。结果表明,贵州省野鸟中存在低致病性H3亚型禽流感病毒。 展开更多
关键词 H3亚型禽流感病毒 野鸟 血凝素 序列分析
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5株野鸭源H6N1亚型禽流感病毒NA基因的克隆和进化分析 被引量:1
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作者 张玉稳 程成 +2 位作者 柴洪亮 曾祥伟 华育平 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期95-98,110,共5页
根据GenBank已知的H6N1亚型流感病毒的NA基因序列,设计扩增NA基因的特异性引物,通过RT-PCR技术扩增5株H6N1亚型禽流感病毒NA基因序列,并将其克隆到pMD18-T载体后进行了测序分析。同时通过生物学软件对5株禽流感病毒NA基因进行了分析研... 根据GenBank已知的H6N1亚型流感病毒的NA基因序列,设计扩增NA基因的特异性引物,通过RT-PCR技术扩增5株H6N1亚型禽流感病毒NA基因序列,并将其克隆到pMD18-T载体后进行了测序分析。同时通过生物学软件对5株禽流感病毒NA基因进行了分析研究。结果表明:5株禽流感病毒NA基因全长1 410 bp,编码470个氨基酸,不存在氨基酸缺失现象;抗原位点和糖基化位点与参考序列野鸭源N1亚型禽流感病毒相比变化不大。5株禽流感病毒NA基因与参考序列的同源性为79.6%~97.6%,其中与参考序列野鸭源H1N1亚型的同源性最高。结合进化树分析结果推测,5株禽感病毒与野鸭源H1N1亚型禽流感病毒的亲缘关系密切。 展开更多
关键词 野鸭 禽流感病毒 NA基因 克隆 进化
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猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法的建立 被引量:2
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作者 胡继明 杨培培 +7 位作者 王颖 孙海芳 黄娟 陈俏俏 杨瑞梅 张传美 秦晓冰 单虎 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期943-949,共7页
本研究旨在建立猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法。根据Shimen株设计1对特异性引物,建立猪瘟病毒RT-PCR-RFLP检测方法;对20份疑似猪瘟临床样品进行检测,并对检出的山东8株流行野毒株和2株疫苗株PCR产物进行克隆... 本研究旨在建立猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法。根据Shimen株设计1对特异性引物,建立猪瘟病毒RT-PCR-RFLP检测方法;对20份疑似猪瘟临床样品进行检测,并对检出的山东8株流行野毒株和2株疫苗株PCR产物进行克隆与序列分析,验证上述方法。结果RT-PCR扩增片段为825bp,产物经RFLP分析,野毒株的PCR产物能被ApaⅠ酶切为322bp和503bp 2个片段,兔化弱毒疫苗株则不能被酶切,检测出RNA的最低浓度为0.028 6μg.mL-1;8株流行野毒株都含GGGCCC序列(ApaⅠ酶切位点),2株疫苗株相应序列为GAGCCC,不能被ApaⅠ酶切;8株流行野毒株属于基因2群,2株疫苗株与HCLV遗传关系近,为基因1群。建立了可鉴别猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP检测方法,为猪瘟的防控提供有效手段。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 野毒株 兔化弱毒疫苗株 RT-PCR-RFLP
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云南省野生恒河猴病毒血清流行病学研究 被引量:6
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作者 周亚敏 李绍东 段幸生 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1999年第3期226-229,共4页
对云南省野生恒河猴作了B病毒(BV)、猴爱滋病毒(SIV)、猴T细胞白血病毒(STLV)、猴D型逆转录病毒(SRV)、轮状病毒(SAl)、腺病毒(SAV)、痘病毒(Monkeypox)、麻疹病毒(Measles)、柯... 对云南省野生恒河猴作了B病毒(BV)、猴爱滋病毒(SIV)、猴T细胞白血病毒(STLV)、猴D型逆转录病毒(SRV)、轮状病毒(SAl)、腺病毒(SAV)、痘病毒(Monkeypox)、麻疹病毒(Measles)、柯赛基病毒B-1型(CoxsackieB1)和人巨细胞病毒(HCMV)等10种病毒血清抗体及乙型肝炎病毒(HBV)检测,结果表明,云南省野生恒河猴中,抗体阳性率较高的有SA11(90%),SAV(831%),BV(446%)和Monkeypoxvirus(206%);3种逆转录病毒的抗体阳性率分别为STLV-1(88%),SRV(47%),SIV(22%);未发现Measles,和CoxsackieB-1病毒血清抗体及HBV感染,但在1只动物血清中有HCMV抗体.病毒抗体阳性率与动物的年龄有关,成年猴明显高于未成年猴.对来自思茅地区、临沧地区和文山州动物的调查表明,B病毒相关抗体和逆转录病毒抗体阳性率有地区差异,思茅地区的野生恒河猴,抗体阳性率较高. 展开更多
关键词 野生恒河猴 病毒 血清流行病学 恒河猴 云南
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运用限制性片段长度多态性分析方法鉴别麻疹疫苗株和野毒株病毒 被引量:1
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作者 刘李 何吉兰 +1 位作者 孙莉 童文彬 《中国疫苗和免疫》 CAS 2012年第4期348-350,共3页
目的应用和验证快速鉴别麻疹疫苗株与野毒株病毒的方法。方法采用逆转录-聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism,RT-PCR-RFLP)方法,对四川... 目的应用和验证快速鉴别麻疹疫苗株与野毒株病毒的方法。方法采用逆转录-聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism,RT-PCR-RFLP)方法,对四川省2009~2011年分离的麻疹疫苗株和野毒株病毒进行鉴定,同时与序列分析进行对比验证。结果 5株RT-PCR扩增阳性产物,经AflⅡ酶切后,1株麻疹疫苗株病毒被切成两个片段,分别为287碱基对(Base Pair,bp)和151bp;4株麻疹野毒株病毒均不能被AflⅡ酶切,仍呈单一条带。结论 RT-PCR-RFLP是一种快速、简便的鉴别麻疹疫苗株与野毒株病毒的方法。 展开更多
关键词 麻疹病毒 疫苗株 野毒株 逆转录-聚合酶链反应.限制性片段长度多态性分析 鉴别
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