鸡circMICAL2的鉴定、组织表达谱分析及其功能预测

【目的】验证鸡环状RNA(circMICAL2)的真实性,研究circMICAL2在鸡肌肉生长发育中的潜在功能及调控机制。【方法】基于circMICAL2环状序列设计特异性引物采用PCR扩增完成其真实性验证,并测定RNase R和放线菌素D处理检测circMICAL2的内源稳定性。采集16日龄三黄鸡(雏鸡)和180日龄三黄鸡(成年鸡)的心脏、肝脏、肺、肾脏、肠、皮肤、胸肌和腿肌等8个组织样本,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析circMICAL2在鸡不同发育时期的组织表达图谱;运用生物信息学对circMICAL2靶向miRNA和mRNA进行预测,并开展GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】鸡circMICAL2真实存在,其环化稳定性强;circMICAL2在成年鸡和雏鸡各组织中广泛表达,且circMICAL2均在成年鸡和雏鸡的胸肌和腿肌肌肉中表达量最高,circMICAL2在成年鸡腿肌和胸肌中的表达量均显著高于雏鸡(P<0.05),circMICAL2与鸡肌肉生长发育调控密切相关。circMICAL2可靶向gga-miR-103-3p和gga-miR-130b-3p,调控下游225个潜在靶基因。circMICAL2的靶基因主要富集于TGF-β信号通路、MAPK信号通路、细胞周期等相关信号通路。【结论】鸡circMICAL2真实存在,circMICAL2的表达对鸡不同生长发育时期肌肉的生长具有重要调控作用。

利用Illumina MiSeq测序平台分析沐川乌骨黑鸡空肠微生物多样性

为探索沐川乌骨鸡肠道微生物多样性,采用Illumina MiSeq测序平台对10羽沐川乌骨鸡的空肠内容物样本中微生物的16S rDNA-V4变异区进行测序,利用UPARSE等软件分析和统计样品中的操作分类单元(OTUs)数量,并进行物种注释及丰度分析,揭示样品的物种构成。结果表明,共获得667466条tags,在97%相似水平上进行OTU分类,被归类于3154个OTUs,且由稀释曲线可知此次测序结果较全面地覆盖了沐川乌骨黑鸡空肠微生物群落。门水平上,占优势的门主要有厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria),但这3种优势菌门在不同样品中所占比例均有所差异。在属水平上,在10个样品中所占比例均大于1%的菌属有乳杆菌属(Lactobacillus)和Romboutsia菌属。

黄杂鸡体重、体尺和肤色指标的测定与相关性分析

为了探究黄杂鸡体重、体尺性状与肤色性状的相关性,为黄杂鸡的遗传育种提供理论依据,试验选取120日龄的健康黄杂鸡母鸡100只进行体重、体尺和肤色等指标的测定,并采用SPSS20.0统计分析软件的双变量Pearson相关分析模型进行相关性分析。结果表明:体重与所测体尺指标间均存在极显著正相关(P<0.01),体重与体斜长和龙骨长的相关系数相对较大,分别为0.883和0.876;体重与冠亮度值(L*值)和冠红度值(a*值)呈极显著正相关(P<0.01);8项体尺指标均与冠L*值呈正相关(P<0.05),冠a*值和冠黄度值(b*值)与各体尺指标间均呈负相关。说明在黄杂鸡的培育上,应进一步加强体斜长和龙骨长两项指标的选育,在肉用性能选育上可以引入冠色指标强化选育效果。

沐川乌骨黑鸡体重与肤色性状的相关性分析

为了研究沐川乌骨黑鸡体重与肤色性状的相关性,试验选用125只成年沐川乌骨黑鸡母鸡,运用比色仪测定了背部肤色、翅下肤色、鸡冠色、胫色,并测定个体体重。结果表明：乌骨鸡背部肤色b＊值与体重相关性显著（P〈0.05）,相关系数0.198;背部肤色、翅下肤色、鸡冠色、胫色的亮度系数L＊值与体重相关性均不显著（P〉0.05）;鸡冠色的L＊值与a＊、b＊值相关性极显著（P〈0.01）,相关系数分别为0.619,0.468;鸡胫色L＊值与b＊值相关性显著（P〈0.05）,相关系数为0.281。可见在沐川乌骨黑鸡选育过程中可以将背部肤色b＊值作为一项选育指标,增加选育效果。