全国畜牧总站重视西藏家畜遗传资源情况

西藏地理位置和自然环境独特，拥有丰富的适应高海拔、高寒缺氧的家畜地方遗传资源。为保护家畜遗传多样性，扩充国家家畜基因库保存材料，6月中旬，全国畜牧总站畜禽遗传资源保存利用中心家畜基因库主任刘丑生、冯海永和韩旭等，对西藏羊、西藏山羊、西藏马、西藏牦牛等家畜遗传资源及保种情况进行了考察调研。

细菌人工染色体(BAC)文库在畜禽遗传资源保存中的应用

作者介绍了国际畜禽遗传资源保存的研究现状与趋势,分析了细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)文库的发展和应用状况,阐述了BAC文库应用于畜禽遗传资源保存的特有优势,提出了建立BAC文库将成为畜禽遗传资源保存的一种重要补充形式,有利于提升畜禽遗传资源保存的安全性和长久性,也为今后进一步研究畜禽品种的特定性状提供了无可替代的材料,对实现全方位保存畜禽遗传资源具有重要的实用价值和推动作用。

真抓实干 接续奋斗 为我国畜禽遗传资源保护利用贡献力量——国家级家畜基因库保种工作情况汇报

全同畜牧总站畜禽遗传资源保存利用中心（以下简称“中心”）成立于1997年2月，原名国家畜牧（畜禽、牧草）基因库，主要任务是采用现代生物学技术保存国家畜禽遗传资源。2008年被农业部列入第一批国家级畜禽遗传资源基因库。

地方猪种冷冻精液在遗传资源保护中的利用前景

冻精保种对我国地方猪种资源保护,乃至猪联合育种工作将具有积极的社会意义和经济意义,希望各相关科研单位能够加大对这方面技术的研发与改进力度,以便能很好地适应现阶段养猪业的发展进程,充分发挥优良地方猪种优良基因的作用。

应用生物技术保护我国地方牛遗传资源

相比于传统的活体保种，生物技术以其自身的省时省力优势，在畜禽遗传资源保护和开发利用中发挥着巨大的潜力。

地方牛遗传资源保种有了新方案

2013年11月6日，全国畜牧总站畜禽遗传资源保存利用中心（以下简称中心）组织相关专家，在北京召开了地方牛遗传资源新保种方案论证会。出席会议的领导有农业部畜牧业司副司长王宗礼、全国畜牧总站副站长郑友民等。参加会议的专家由杜立新、韩国才、张胜利、马月辉、王立贤、李俊雅、石挺、涣长兴、吴志勇、唐骏等10位组成。会议听取了中心主任刘丑生就中心近年来保种情况和下一步工作思路和措施的报告。会议针对家畜基因库今后遗传物质保存的新思路和新措施进行了深入讨论，并对“应用冷冻生物技术，抢救地方牛遗传资源”方案进行了可行性论证。

基因型选择和基因辅助BLUP对不同遗传力性状的选择效果

为揭示性状遗传力对基因型选择(GTS)和基因辅助BLUP(GBLUP)选择效果的影响,探讨基因辅助选择相对于常规动物模型BLUP选择方法的效率,在假定目标性状同时受1个QTL和多基因共同控制的前提下,采用随机模拟方法,研究了在一个闭锁群体内分别采用常规动物模型BLUP、GTS和GBLUP方法对不同遗传力性状实施连续选择时的效果。结果表明:在一定世代内,性状遗传力越高,3种选择方法所获得的遗传进展越大;GBLUP方法可以对QTL和多基因效应实施有效选择,可望获得优于常规BLUP方法的选择效果;GTS只考虑了QTL基因型而无法兼顾多基因效应,其选择进展反而不如常规BLUP选择。基因辅助选择的优势在于可对QTL进行更为准确的选择。当遗传力较低、选择世代数较短时,其对QTL选择的效率较高。在长期选择下,不断检测并确认"新"的QTL,是保持其持续选择优势的关键。

不同肤色山羊皮肤组织形态学及黑色素生成相关基因的表达分析

旨在阐明酉州乌羊皮肤发育的组织形态学特点以及黑色素高度沉积的可能分子机制,本研究选取渝东白山羊(白色皮肤)为对照,对100日龄酉州乌羊和渝东白山羊胎儿皮肤组织进行了组织形态学分析;并检测了成年酉州乌羊和渝东白山羊皮肤组织以及B16黑色素细胞增殖、分化阶段Pax3、Mitf与Tyr的表达变化。结果表明,在山羊胎儿皮肤快速发育阶段,两品种间皮肤黑色素沉积差异明显;Pax3与Tyr在酉州乌羊皮肤中表达量显著高于渝东白山羊(P<0.001),而Mitf则无明显差异(P>0.05);相对于细胞增殖阶段,B16细胞在分化时Pax3表达显著下调(P<0.001),Tyr的表达显著上调(P<0.01),而Mitf无明显差异(P>0.05)。研究结果提示,在皮肤发育分化的早期阶段,酉州乌羊与渝东白山羊黑色素细胞的迁移路线可能不同;Pax3下调与Tyr上调是色素细胞分化并生成黑色素的必要条件;酉州乌羊皮肤黑色素高度沉积与Pax3、Tyr的大量表达有关。

高通量测序技术的发展及其在生命科学中的应用

DNA测序技术从以Sanger法为代表的第一代测序技术到如今的高通量测序(HTS)技术,经历了漫长而曲折的发展过程,如今该技术在动植物基因组的研究中获得了很大的成功,它的问世可以使人们以更低廉的价格,更全面、更深入地对全基因组进行分析。作者阐述了几种关于HTS的测序技术平台:Roche/454测序技术、ABI/SOLID测序技术、Illumina/Solexa测序技术、单分子测序技术及Ion Torrent测序技术,并且还归纳了HTS在基因组学、转录组学及表观基因组学等方面的应用。

不同添加剂及剂型对猪冷冻精液品质的影响

试验旨在研究咖啡因、维生素E、超氧化物歧化酶(SOD)及剂型对猪冷冻精液品质的影响。采用添加了不同浓度咖啡因、维生素E、超氧化物歧化酶(SOD)的冷冻稀释液和3种剂型的冻精管进行精液冷冻。3种添加剂对冻精解冻后的精液品质都有一定的促进作用,试验中其添加最适浓度分别为:咖啡因为0.2mg/mL,维生素E为0.4mg/mL,SOD为300IU/mL;0.25mL剂型的冻精解冻后精子品质最好。咖啡因、抗氧化剂及冻精管剂型对冷冻精液的效果有一定的影响。

DLK1和MSTN基因在绵羊妊娠中后期胎儿中的表达分析

本研究以2个骨骼肌表型差异明显的特克塞尔和乌珠穆沁绵羊为试验对象,研究DLK1和MSTN基因在不同妊娠阶段胎儿不同部位骨骼肌中表达的调控机制及早期肌肉发育规律。在绵羊妊娠第85、100、120和135天时,对胎儿的半腱肌、半膜肌、背最长肌、股四头肌和股二头肌肌肉质量进行方差分析以及对DLK1和MSTN基因在5种骨骼肌中的表达量进行研究。结果表明,妊娠85天时特克塞尔羊的半膜肌、背最长肌、股四头肌和股二头肌质量显著或极显著(P<0.05或P<0.01)高于乌珠穆沁羊;妊娠100天时,5种骨骼肌组织生长发育在品种间的差异达到最大(P<0.05或P<0.01)。实时荧光定量分析表明,随着胎儿日龄的增加,DLK1基因在半腱肌、半膜肌、背最长肌、股四头肌和股二头肌骨骼肌中的表达量有增加的趋势,同时在特克塞尔羊中的表达量高于乌珠穆沁绵羊。在妊娠120天的半腱肌和半膜肌、妊娠100和135天的背最长肌、妊娠85天股四头肌和妊娠135天的股二头肌中DLK1表达量在2个品种间差异显著(P<0.05)。MSTN的表达量在特克塞尔羊中高于乌珠穆沁羊,但整体较低。妊娠135天时背最长肌和股四头肌中MSTN基因的表达量在2个品种间差异显著(P<0.05)。结果显示,DLK1和MSTN基因在不同日龄不同肌肉组织中的差异表达可能与肌肉早期发育有关。

MGISEQ-2000、HiSeq 2000与NovaSeq 6000平台全基因组重测序数据的比较分析

全基因组重测序已经成为生物信息学获取数据的最主要途径之一,但不同二代测序平台的数据质量及稳定性可能存在差异,从而对研究结果产生影响。本研究基于MGISEQ-2000、HiSeq 2000和NovaSeq 60003个测序平台分别对猪DNA样本进行全基因组重测序,分析比较3个平台的原始数据质量、比对质量和SNP变异检测情况,同时以猪50K芯片分型结果为标准评价测序数据SNP分型的准确性,以检验上述3个平台之间是否存在系统性差异。结果表明,3个平台的原始数据量及GC含量相近,测序深度均达到送测要求,平均测序深度在20X以上,HiSeq 2000和NovaSeq 6000平台Q30以上reads所占比例高于MGISEQ-2000(P<0.01),但两者的重复reads所占比例也高于MGISEQ-2000(P<0.01)。MGISEQ-2000在双端比对率、平均比对深度和覆盖度超过20X的位点所占比例方面均高于其他2个平台(P<0.05),而NovaSeq 6000在平均比对深度和覆盖度超过20X的位点占比上又高于HiSeq 2000(P<0.05)。MGISEQ-2000的SNP位点判型准确性与HiSeq 2000相似,二者平均准确性均达到97.21%且高于NovaSeq 6000。来自NovaSeq 6000平台的2个样本的SNP位点判型准确性结果远低于其他2个平台的结果,且其在测序稳定性上不如MGISEQ-2000和HiSeq 2000。综上,MGISEQ-2000、HiSeq 2000和NovaSeq 60003个平台的测序性能存在一定差异,但三者的测序数据均达到了生物信息学分析的要求,其中MGISEQ-2000平台在测序质量和稳定性上表现出色,可以为生物信息学分析提供更可靠的重测序数据。

2017年国家家畜基因库保种工作方案研讨会召开

为进一步提升全国畜牧总站畜禽遗传资源保存利用中心（以下简称“中心”）保存家畜遗传资源物质的技术和能力，更好地完成2017年的家畜遗传物质制作与分子动态监测工作，中心于2016年11月25日在顺义基地DHI会议室召开了“2017年国家家畜基因库保种工作方案研讨会”。

我国国家畜禽基因库的现状和前景

畜禽遗传资源是重要的生物资源,同时畜禽遗传多样性保护对于促进农业可持续发展、满足人类多样化需求具有重要的意义。本文从国内外基因库发展概况介绍了基因库的基本现状和发展前景,重点以我国国家畜禽基因库的建立与发展、管理模式、遗传物质保存情况、基因库保种技术和群体遗传多样性等开发利用情况为实例,详细阐述了基因库在畜禽遗传资源保护中具有重要的实用价值。因此,基因库将会在今后畜禽遗传保种中发挥越来越重要的作用。

中国地方绵羊线粒体DNAD-loop区遗传多样性研究

中国拥有大量的具有各自特点的绵羊地方品种，如高抗病性、高繁殖力和高适应性。目前，关于我国绵羊遗传多样性的文献很多，但是对于其起源一直存在较大争议。本研究对我国10个家养绵羊品种和2个引进绵羊品种的mtDNAD—loop区进行测序分析，初步分析了169只个体的遗传多样性，构建了NJ树以及网络关系图。12个绵羊品种的mtDNAD—loop区序列长度范围在1106～1182bp，发现了225个多态性位点，确定了110个单倍型，12个绵羊品种的平均核苷酸差异数k为25．44003。通过分析NJ树和UPGMA树发现中国家养绵羊分为2个支系，摩佛伦羊（登录号AY091487）与其中一个支系聚为一类，而耨羊（登录号AJ238300）和盘羊（登录号AY091490）聚为一类；亚洲型A型（AF039578）和欧洲型B型（AF039577）分别与2个支系聚为一类。研究结果说明，摩佛伦羊对中国家养绵羊起源与进化的贡献更大。