建议开展扬子鳄保护遗传学和开发利用研究

扬子鳄是一种人工饲养繁殖成功的濒危野生动物。 1992年获CITES成员大会批准 ,允许子二代鳄的商业性开发利用。作者分析了我国扬子鳄保护、养殖现状和扬子鳄群体的遗传特征 ,认为一方面扬子鳄野生资源仍受到威胁 ,另一方面随着饲养种群数量的增加 ,养殖费用不断增长 ,扬子鳄的潜在经济价值也未能实现。鉴于此 。

中药材蛇胆的DNA分子标记鉴定研究

目的 运用分子标记技术鉴定药材蛇胆的真伪 ,以克服目前仅依据形态、显微特征及理化性状进行鉴别的不足。方法 分别从药材蛇胆的胆衣和胆汁、原动物棕黑锦蛇的肌肉和胆汁中提取DNA ,经PCR扩增得到约 40 0bp的 12SrRNA基因片段 ,并对该基因片段进行测序研究。结果 从少量药材蛇胆的胆衣和胆汁中可提得足够用于PCR扩增的DNA模板 ,扩增产物的测序结果表明同一动物的胆衣和胆汁、肌肉和胆汁的碱基序列完全一致。结论DNA分子标记技术可用于中药材蛇胆和胆汁的鉴定 ,提示该技术也可用于其他动物分泌物类型药材的鉴别。目前市场上药材蛇胆来源较复杂 。

鹿类中药材的位点特异性PCR鉴定研究

目的 建立一种简便、准确的鹿类中药材鹿茸、鹿鞭、鹿筋、鹿胎的DNA分子标记鉴定方法。方法 在对鹿类中药材的正品原动物梅花鹿、马鹿及其混伪品原动物的Cytb基因全序列分析的基础上 ,设计了一对专用于鉴定正品鹿类药材的位点特异性鉴别引物ILu0 1 L和ILu0 1 H。结果 在 6 4℃的复性温度下 ,用鉴别引物对原动物样品进行鉴别PCR ,仅正品能得到约 36 5bp阳性扩增带 ;对鹿茸、鹿鞭及鹿筋正、伪品药材进行PCR鉴定 ,结果表明 :3批鹿茸仅一批为正品 ,2批鹿鞭皆为伪品 ,鹿筋正、伪品药材PCR鉴定与形态鉴定结果一致。随机选取 2枚鹿茸及一个原动物做Cytb基因片段序列分析 ,其结果与PCR鉴定完全一致。结论 对市售鹿类商品药材需加强质量监督和管理。所设计的鉴别引物对梅花鹿、马鹿有高度特异性 ,可应用于以其为原动物的鹿类中药材的鉴定。

中药材龟甲及原动物的高特异性PCR鉴定研究

目的:建立一种简便、实用的龟甲药材DNA 分子鉴定方法。方法:根据22 种亚洲产龟类的线粒体12SrRNA 基因片段序列,设计一对专用于鉴定中药材龟甲原动物乌龟的鉴别引物,用该对引物扩增从乌龟和其他18 种龟共48 个样品的DNA 模板。结果:在72℃的复性温度下进行PCR,4 个乌龟的模板DNA 均得到约180 bp 的阳性扩增带,而其他各龟的模板DNA,在同样条件下无扩增产物,用这对鉴别引物经一次PCR 反应便可准确地鉴定受试原动物是否为乌龟。同法对江苏省药品检验所提供的17 块样品龟甲进行了鉴定,结果表明只有4 块样品为正品,其余皆为伪品,与性状鉴定和DNA序列分析鉴定结果完全一致。结论:所设计的鉴别引物对乌龟有高度特异性。

中药材哈蟆油PCR鉴定的初步研究

从中国林蛙 (Ranachensinensis)、中华大蟾蜍 (Bufogargarizans)以及鳕鱼 (Gadusmacrocephalus)等组织材料中提取DNA ,扩增出约 340bp的 12SrRNA基因片段 ,测定其序列 ,并参考有关序列 ,设计一对哈蟆油的鉴别引物HsmL1、HsmH1,用该鉴别引物扩增蛙类原动物的模板DNA时 ,只有中国林蛙和黑龙江林蛙的模板能得到阳性扩增 ,其余样品为阴性 .因此该对引物能用于哈蟆油药材来源的鉴别 .对购自 5个不同药材商店的哈蟆油PCR鉴定结果表明 ,现市售商品哈蟆油有不同的材料来源 .图 3表 1参

中药材鳖甲的位点特异性PCR鉴定研究

目的 本研究旨在建立一种简便、实用的鳖甲 DNA分子鉴定方法。方法 根据中华鳖和鳖甲混淆品原动物的 12 S r RNA基因片段的序列数据库 ,找出中华鳖与其它鳖科动物有明显区别的位点 ,设计 1对能特异性鉴别中华鳖的引物 ,然后利用鳖甲中残存的 DNA,通过 PCR扩增 ,即可准确鉴别鳖甲。结果 用这对引物对不同来源的10块鳖甲进行鉴定结果表明 ,其中有 3块为伪品 ,结果与 DNA序列分析鉴定一致。还测定了斑鼋和鳖甲一伪品12 S r RNA基因片段序列。结论 该引物配置药材鉴定试剂盒可在鳖甲类药材鉴定使用。

国产“水山姜”的分类学研究——来自核糖体DNAITS区序列的证据

用直接测序法对国产黑果山姜Alpinianigra (Gaertn.)Burtt以及“水山姜Alpiniaaquatica(Koen.)Rosc .”的核糖体DNA中的内转录间隔区 (ITS)序列进行了测定 ,结果显示两者序列完全一致 ;ITS 1长度为 1 78bp,ITS 2长度为 2 32bp,5 8S编码区长度为 1 64bp ,GC含量为56 9%。形态学特征结合DNA分子证据 ,认为《中国植物志》

短散在元件(SINE)的研究进展

短散在元件 (SINE)广布于真核生物 ,是基因组中的可转移成分 ,长约 10 0～ 5 0 0bp ,拷贝数可达数百至数十万以上 ,根据序列变异和鉴别位点常可分为若干家族和亚家族 ,对基因组的复杂化、基因的钝化、新基因的产生、尤其是基因表达的调控都具有重要意义 .除了灵长类Alu和小鼠B1家族等少数来源于 7SLRNA ,大多为tRNA的衍生物 ,由tRNA同源区、tRNA无关区和富含AT区等组成 .在tRNA同源区含有RNA聚合酶Ⅲ内部启动子成分 .其起源和进化有“主源基因模型”、“多源基因模型”、“寄生假说 (转座子模型 )”和“平行转移假说”等 .以鲑科鱼类、鲸类及偶蹄类、高等灵长类和蛙类为例 。

鹭科鸟类分类及系统学研究进展

基于鹭科鸟类的生态学、形态学、羽毛角蛋白凝胶电泳、scnDNA杂交及线粒体Cytb序列分析等研究 ,对鹭科鸟类的分类学及系统学研究现状进行综述 。

分子遗传标记技术在中药材鉴定中的应用

目前,用于中药材鉴定的分子标记技术主要有SCAR、RFLP、RAPD、PCR-RFLP、DNA测序和位点特异性鉴别PCR等。近5年来,通过这些分子标记技术的比较,我们发现位点特异性鉴别PCR技术以其简单、快速、准确、重现性好、成本低、抗污染等优点,将有十分广阔的应用前景。本文论述了位点特异性鉴别PCR技术以PCR反应为基础,通过对正品药材及其伪、混品的某些DNA片段的序列研究,找出正品药材的特异性位点,设计出只扩增正品药材的高度特异性的鉴别引物。用此引物对样品DNA进行一次PCR反应,经电泳检测便可准确鉴别样品的真伪。并对今后进一步开展此项工作提出了相应的建议。

人类Y染色体的遗传特性

Y染色体为男性特有 ,因此其与男性特有的遗传性状密切相关。根据Y染色体特性和功能特点 ,可将Y染色体分区 ,为基因的定位打下了基础。随着人类基因组计划研究的深入 ,Y染色体基因组结构也逐渐得到认识 ,但由于Y染色体较小 ,所携带的基因也较少 ,因此至今尚无遗传图谱 ,物理图谱也不完善。已发现了 376个STS片段 ,部分STS已用于睾丸功能基因的研究。Y染色体上的主要基因有睾丸决定基因和精子发生相关基因。

白鱀豚系统发生位置的研究

白鱀豚是世界上现存的4种淡水豚之一.在20世纪初至70年代,白鱀豚曾被归属于亚河豚科或恒河豚科.新建的白鱀豚科在1978年发表以后,各国学者采用不同的方法对白鱀豚的系统发生位置进行了研究.近年的形态学、古生物学和分子系统学研究都表明淡水豚类不是一个单系群,恒河豚类比其他3类更接近系统树的基部,白鱀豚类、亚河豚类和弗西豚类代表了从进化为海豚总科的主干分出的3个早期支系,支持它们都是独立的科.在经历了将近一个世纪的研究之后,淡水豚类是并系的,淡水豚类的4个现生属分别属于4个独立的科,白鱀豚类至少是一个科级的阶元,这3点已经成为鲸类学家的共同认识.

中国野猪核DNA SANDX-2位点遗传变异分析

研究测定了89个中国野猪和1个家猪未知功能核基因SANDX-2位点的序列.在序列比对后长510bp左右,发现有2处4种类型碱基缺失,30个位点发生碱基替换,共定义了19种单元型.在野猪中共发现18种单元型,其中7种只在某一地方种群中发现,11种为地方种群间共享单元型.用邻接法基于核苷酸Kimura 2-parameter模型构建系统发生树中,19种单元型被明显分为2大枝.尽管各枝得到的Bootstrap值均较低,且各地方种群中出现的单元型散布在不同的进化枝中,但单元型在野猪亚种内的分布已出现了一定的地理分布格局.若不考虑碱基的插入/缺失,用TCS构建19种单元型网络表明,HAP2单元型为一古老单元型,其他为衍生单元型.

中药黄草石斛rDNA ITS序列分析

目的 研究黄草石斛ITS片段遗传多样性 ,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法 用一对引物进行PCR扩增 ,扩增产物纯化后用双脱氧终止法 (Sangerdideoxy)测序。结果 获得核糖体DNA中ITS和 5 8SrDNA完整序列 ,14个石斛类群的ITS 1与ITS 2序列的长度分别为 2 2 8- 2 33bp和 2 42 -2 47bp。石斛种间ITS 1序列的差异百分率为 11 79% - 31 5 8% ,ITS 2序列的差异百分率为 10 2 9% - 2 5 30 % ,金钗石斛种内ITS 1序列的差异百分率为 0 87% ,ITS 2序列无差异。石斛各类群与外类群的差异百分率ITS 1序列为2 3 5 6 % - 36 89% ,ITS 2序列为 2 6 5 2 % - 33 31%。用NJ法根据ITS 1与ITS 2序列数据重建系统发生树。结论 两段序列在石斛种内保守 ,在种间有较大的差异 ,与外类群的差异最大 ,可作为中药黄草石斛分子鉴定的标记 。

从细胞色素b基因序列探讨我国林蛙属动物的系统发生关系

对中国林蛙属动物进行了DNA水平的分子系统发生研究 ,测定了中国林蛙属 7种 15个样品、侧褶蛙属 2种 2个样品Cytb基因长约 3 60bp片段的序列。对这些序列的系统发生分析表明 :①中国林蛙甘肃种群与东北种群序列差异较大 ,但尚难根据序列差异来判断它们是不同的亚种还是不同的物种 ;② 7种林蛙中 ,中国林蛙与黑龙江林蛙的亲缘关系最近 ,与桓仁林蛙最远 ;③支持将昭觉林蛙、镇海林蛙、峨眉林蛙和长肢林蛙归入日本林蛙种组Ranajaponicagroup。

从12SrRNA基因序列探讨8种鳄类的系统学关系

测得扬子鳄 (Alligatorsinensis)和暹罗鳄 (Crocodylussiamensis)的mtDNA 12SrRNA基因片段的部分序列 ,与GenBank中的 2种鳄及文献中 4种鳄的 12SrRNA基因相应片段 ,经比对后构建系统树。其结果显示 ,现存鳄类为单系起源 ,可划分为 3个科 ,即 :鳄科、食鱼鳄科和假食鱼鳄科。食鱼鳄与假食鱼鳄亲缘关系较近 ,支持将假食鱼鳄作为食鱼鳄科的一个属 ,与以形态学为基础的研究结果不同。在钝吻鳄科中 ,扬子鳄与凯门鳄亲缘关系较远 ,而与密西西比鳄的亲缘关系虽较近 ,但它们的确存在很多差异 ,两者 12SrRNA基因序列差异达12 12 % ,碱基的颠换数为 9。在基于碱基转换和颠换的NJ系统树及仅基于碱基颠换的NJ系统树中 ,前者支持扬子鳄与密河鳄间的亲缘关系较近 ,而后者支持扬子鳄与凯门鳄间的亲缘关系较近 ,说明扬子鳄与密河鳄间亲缘关系是值得研究的问题。因本文仅根据 12SrRNA基因部分序列来进行分析的 。

从Cyt b基因序列探讨鹿亚科动物的系统发生关系

鹿亚科共有 4个属 ,各属间和属内特别是鹿属内的系统进化关系存在疑义。根据Cytb基因序列分析 ,探讨了鹿亚科及中国鹿属、马鹿亚种的进化关系。结果分析表明 :现行分类系统中 ,斑鹿属可能并非单系发生 ,暗示应将豚鹿并入鹿属 ;麋鹿属与鹿属有较近的进化关系 ,也应并入鹿属 ;鹿属的进化地位有待进一步研究 ;归并后的鹿属为单系发生。中国马鹿各亚种在系统发生上是一单系群 ,其中马鹿天山亚种和阿尔泰亚种聚为最原始的一支。

几种游蛇的Cyt b基因片段序列分析及其演化关系(英文)

分别从蛇类药材和冷冻保存的新鲜蛇类肌肉标本中提取DNA，经PCR扩增出12种蛇共25个样品的Cytb基因片段，并用银染测序的方法对DNA序列进行了分析。在此基础上用MEGA软件重建的系统发生树表明，研究的11种游蛇科蛇类可以分为3组：第一组为赤链蛇和水赤链游蛇，第二组为马梢蛇和灰鼠蛇，第三组为锦蛇属的蛇，它们与第二组较近。锦蛇属是一高度分化的属，该组至少可分为两类，一类包括百花锦蛇和黑眉锦蛇；另一类包括玉斑锦蛇、棕黑锦蛇、红点锦蛇、王锦蛇和双斑锦蛇。后一类还可进一步分为3个亚组，玉斑锦蛇和棕黑锦蛇为第一亚组，红点锦蛇单独为第二亚组，王锦蛇和双斑锦蛇为第三亚组。本研究结果还表明，多年保存的陈旧药材标本可以用DNA序列分析的方法对其进行分子系统演化关系的研究。

牛膝的rDNAITS序列分析

目的 探讨不同产地牛膝的 ITS的序列变异 ,为鉴别牛膝提供 DNA分子标记。方法 利用特异性 PCR技术对牛膝的 r DNA ITS区碱基序列进行测定 ,报道了牛膝的 r DNA ITS区的碱基序列。结果 得到核糖体 DNA中的 ITS及 5 .8S r DNA完全序列 ,18S和 2 6 S r DNA部分序列 ,共约 6 5 0 bp。牛膝与川牛膝及土牛膝碱基序列有明显差异 ,不同产地、不同栽培品种牛膝碱基序列无差异。结论 此法可用于牛膝种间及真伪品鉴别。

从12S rRNA基因序列推测鹭科13种鸟类的系统发生关系

对鹭科 12个种的线粒体 12SrRNA基因全长约 975bp的序列进行了测定 ,并从GenBank获得黄顶夜鹭12SrRNA基因全序列。比对后的序列长 993bp ,含 36 3变异位点 ,2 88个多态位点 ,187个简约信息位点。使用邻接法和最大简约法重建的分子系统树将 13种鹭聚为 2支 :第一支包括白鹭、中白鹭、大白鹭、池鹭、牛背鹭、苍鹭、草鹭、夜鹭、黄顶夜鹭 ,第二支由黄苇、黑苇、栗苇、大麻组成。结果提示将鹭科分为鹭亚科和亚科的传统观点是合理的 ,不支持Payne将鹭科分为日鹭亚科 (Ardeinae)、夜鹭亚科 (Nycticracinae)、亚科 (Botaurinae)和虎鹭亚科 (Tigrisomatinae)的观点。进一步的分析表明 :白鹭在系统演化中要早于大白鹭和中白鹭分支出来 ,大白鹭和中白鹭与苍鹭、草鹭和牛背鹭间的亲缘关系较近 ,而与白鹭较远 ,支持Sibley(1990 )将大白鹭和中白鹭作为独立的大白鹭属 (Casmerodius)和中白鹭属 (Mesophoyx)的建议 :黑、栗苇与黄苇在系统发生中构成一单系群 ,提示将黑置于苇属 (Ixobrychus)