目的:全面了解病毒和不典型病原体在儿童下呼吸道感染(LRTI)病原中的分布,探讨多重PCR技术检测呼吸道病原的临床应用价值。方法:收集2014年1月至2014年12月温州医科大学附属第二医院育英儿童医院992例因LRTI住院的5岁以下患儿的鼻咽分泌...目的:全面了解病毒和不典型病原体在儿童下呼吸道感染(LRTI)病原中的分布,探讨多重PCR技术检测呼吸道病原的临床应用价值。方法:收集2014年1月至2014年12月温州医科大学附属第二医院育英儿童医院992例因LRTI住院的5岁以下患儿的鼻咽分泌物,用直接免疫荧光法检测呼吸道合胞病毒、流感病毒A、流感病毒B、副流感病毒、腺病毒和衣原体抗原,并提取核酸,采用基于先进片段分析的多重PCR技术测定呼吸道合胞病毒、流感病毒A、流感病毒B、副流感病毒、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、偏肺病毒、冠状病毒和肺炎支原体、衣原体基因。结果:本组患者男662例,女330例,<1岁组587例,1~3岁组287例,3~5岁组118例。多重PCR技术检测结果发现,851例患儿的鼻咽分泌物标本至少存在一种病原阳性(占85.8%),224份标本(占22.6%)检测到两种或两种以上病原。呼吸道合胞病毒和鼻病毒占所有检测病原的前两位。不同年龄组的病原阳性率分别为84.8%、89.2%和82.2%,组间差异无统计学意义(χ~2=4.416,P=0.110)。但<1岁组和1~3岁组的混合感染率均明显高于3~5岁组(χ~2=3.963、9.871,P=0.047、0.002)。鼻病毒可见于各年龄段LRTI患儿,而呼吸道合胞病毒则主要见于婴幼儿。和直接免疫荧光法比较,相同病原检出的一致性较好(Kappa=0.615,P<0.01),但PCR技术病毒的检出率更高(58.37% vs. 41.53%,χ~2=56.23,P<0.001)。结论:呼吸道合胞病毒和鼻病毒占本地区5岁以下儿童LRTI主要病毒和不典型病原的前两位,博卡病毒、冠状病毒和偏肺病毒亦可见,肺炎支原体少见;和直接免疫荧光法比较,多重PCR技术有助于全面了解儿童LRTI的病原。展开更多
目的探讨DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座在AGCU Y SUPP PLUS试剂盒与Goldeneye^(TM)Y ADD试剂盒片段长度多态性分型存在差异的原因。方法用上述两个试剂盒对9948标准品进行STR检测,并用9948标准品对上述4个基因座进行Sanger测序,根据文...目的探讨DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座在AGCU Y SUPP PLUS试剂盒与Goldeneye^(TM)Y ADD试剂盒片段长度多态性分型存在差异的原因。方法用上述两个试剂盒对9948标准品进行STR检测,并用9948标准品对上述4个基因座进行Sanger测序,根据文献报道、国际法医遗传学会Y-STR命名原则,以及国家公共安全行业标准对4个基因座的测序结果进行结构分析,按照不同的基序计算分型。结果9948标准品在上述两个试剂盒中的DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座都存在分型差异。依据测序结果,根据DYS526a公认的基序(CCTT)_(a),分型应为13;根据行业标准《序列多态STR等位基因命名规则》中对DYS526b和DYS626确定的基序,分型均为25;DYS713的基序虽没有统一标准,但根据Y-STR命名指导意见,笔者认为9948的分型应为45。结论DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座作为公安机关数据库建设备选基因座,在实际检案中经常被应用,试剂盒在研制过程中的严谨性和不同基序选择会使同一样品在不同试剂盒出现多个基因座分型差异,严重影响数据库比对效能。建议行业对产品加以管理,报批生产要提供基因座基序,统一不同产品相同基因座的基序,便于实战应用。展开更多
文摘目的:全面了解病毒和不典型病原体在儿童下呼吸道感染(LRTI)病原中的分布,探讨多重PCR技术检测呼吸道病原的临床应用价值。方法:收集2014年1月至2014年12月温州医科大学附属第二医院育英儿童医院992例因LRTI住院的5岁以下患儿的鼻咽分泌物,用直接免疫荧光法检测呼吸道合胞病毒、流感病毒A、流感病毒B、副流感病毒、腺病毒和衣原体抗原,并提取核酸,采用基于先进片段分析的多重PCR技术测定呼吸道合胞病毒、流感病毒A、流感病毒B、副流感病毒、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、偏肺病毒、冠状病毒和肺炎支原体、衣原体基因。结果:本组患者男662例,女330例,<1岁组587例,1~3岁组287例,3~5岁组118例。多重PCR技术检测结果发现,851例患儿的鼻咽分泌物标本至少存在一种病原阳性(占85.8%),224份标本(占22.6%)检测到两种或两种以上病原。呼吸道合胞病毒和鼻病毒占所有检测病原的前两位。不同年龄组的病原阳性率分别为84.8%、89.2%和82.2%,组间差异无统计学意义(χ~2=4.416,P=0.110)。但<1岁组和1~3岁组的混合感染率均明显高于3~5岁组(χ~2=3.963、9.871,P=0.047、0.002)。鼻病毒可见于各年龄段LRTI患儿,而呼吸道合胞病毒则主要见于婴幼儿。和直接免疫荧光法比较,相同病原检出的一致性较好(Kappa=0.615,P<0.01),但PCR技术病毒的检出率更高(58.37% vs. 41.53%,χ~2=56.23,P<0.001)。结论:呼吸道合胞病毒和鼻病毒占本地区5岁以下儿童LRTI主要病毒和不典型病原的前两位,博卡病毒、冠状病毒和偏肺病毒亦可见,肺炎支原体少见;和直接免疫荧光法比较,多重PCR技术有助于全面了解儿童LRTI的病原。
文摘目的探讨DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座在AGCU Y SUPP PLUS试剂盒与Goldeneye^(TM)Y ADD试剂盒片段长度多态性分型存在差异的原因。方法用上述两个试剂盒对9948标准品进行STR检测,并用9948标准品对上述4个基因座进行Sanger测序,根据文献报道、国际法医遗传学会Y-STR命名原则,以及国家公共安全行业标准对4个基因座的测序结果进行结构分析,按照不同的基序计算分型。结果9948标准品在上述两个试剂盒中的DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座都存在分型差异。依据测序结果,根据DYS526a公认的基序(CCTT)_(a),分型应为13;根据行业标准《序列多态STR等位基因命名规则》中对DYS526b和DYS626确定的基序,分型均为25;DYS713的基序虽没有统一标准,但根据Y-STR命名指导意见,笔者认为9948的分型应为45。结论DYS526a/b,DYS626,DYS713基因座作为公安机关数据库建设备选基因座,在实际检案中经常被应用,试剂盒在研制过程中的严谨性和不同基序选择会使同一样品在不同试剂盒出现多个基因座分型差异,严重影响数据库比对效能。建议行业对产品加以管理,报批生产要提供基因座基序,统一不同产品相同基因座的基序,便于实战应用。
