DNA鉴定工作中的特殊STR分型

DNA数据库是将分子遗传学技术、计算机网络技术和数据库管理技术相结合,实现DNA信息数字化存储、管理和检索的系统[1]。STR由于具有良好的多态性,现已成为法庭科学实践中所使用的重要遗传标记[2]。常染色体STR基因座是目前亲权鉴定和个体识别中运用最广泛的遗传标记,性染色体STR基因座以其独特的遗传特点在个体识别、亲子鉴定、血缘关系鉴定及族谱DNA分析等方面具有十分重要的研究和应用价值[3]。

2019-2021年宁波地区儿童13种呼吸道非细菌性病原体检出情况分析

目的探讨2019—2021年宁波地区儿童呼吸道非细菌性病原体的分布特点。方法回顾性分析2019年7月至2021年12月期间宁波市妇女儿童医院儿科就诊的23733例呼吸道感染患儿,男性13509例(56.92%),女性10224例(43.08%),年龄范围为1 d至18岁。新生儿组(年龄<1个月)981例,婴儿组(1个月≤年龄<1岁)5880例,幼儿组(1岁≤年龄<3岁)6552例,学龄前组(3岁≤年龄<7岁)7638例,学龄组(7岁≤年龄≤18岁)2682例。通过基于毛细电泳的多重聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测13种呼吸道病原体,对结果采用SPSS 23.0软件进行统计学分析,计数资料以百分比表示,组间比较采用χ^(2)检验。结果23733例患儿中13330例呼吸道病原体检测阳性,总阳性率为56.17%。阳性率前3位分别为鼻病毒(human rhinovirus,HRV)24.05%(5707/23733)、呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)10.45%(2480/23733)和肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae,Mp)7.03%(1668/23733)。病原体在男性患儿和女性患儿中的阳性率分别为57.47%(7763/13509)和54.45%(5567/10224),差异具有统计学意义(χ^(2)=21.488,P<0.001);在新生儿组、婴儿组、幼儿组、学龄前组、学龄组中的阳性率分别为31.80%(312/981)、54.71%(3217/5880)、63.23%(4143/6552)、59.83%(4570/7638)和40.57%(1088/2682),组间差异具有统计学意义(χ^(2)=681.225,P<0.001);单一感染率为47.43%(11256/23733),2种及以上病原体混合感染率为8.74%(2074/23733),其中以2种病原体混合感染多见。HRV、腺病毒(human adenovirus,HADV)、冠状病毒(human coronavirus,HCOV)、衣原体(chlamydia,Ch)全年散发,HRSV、偏肺病毒(human metapneumovirus,HMPV)、博卡病毒(human bocaviru,Boca)、副流感病毒(human parainfluenza virus,HPIV)在秋冬季高发;甲型流感病毒(influenza A virus,FluA)、乙型流感病毒(influenza B virus,FluB)、Mp在2020、2021年阳性率处于低位。相比于2019年同期,FluA、甲型流感病毒H1N1(2009)(influenza A H1N1 pdm09 virus,H1N1)、甲型流感病毒H3N2(influenza A H3N2 virus,H3N2)、FluB、HADV、Mp在2020年的阳性率显著下降(P<0.05),HPIV、HRV、HCOV、Ch则显著上升(P<0.05);相比于2020年,FluA、H1N1、H3N2、HPIV、HCOV、Mp、Ch在2021年的阳性率显著下降(P<0.05),Boca、HMPV、HRSV则显著上升(P<0.05)。结论2019—2021年宁波市儿童呼吸道非细菌性病原体检出以HRV和HRSV为主,呼吸道病原体阳性率在不同年龄阶段、季节和性别间存在一定差异。

多重PCR-毛细管电泳法的应用及HPV感染亚型分布特征分析

目的分析河北省石家庄地区人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染特征以及HPV亚型分布情况,探讨多重PCR-毛细管电泳片段分析法的应用评估。方法采用横断面调查研究,2022年5至8月期间纳入河北省人民医院434例女性(年龄范围17~74岁,就诊者260例、查体者174例)进行横断面调查,应用多重PCR-毛细管电泳片段分析法进行HPV分型检测。以多重荧光定量PCR试剂盒作为参考,采用卡方检验分析多重PCR-毛细管电泳片段分析法的诊断效果,Kappa值分析其一致性。结果总HPV感染率为45.85%(199/434),其中高危型HPV(HR-HPV)阳性率为35.48%(154/434)、低危型HPV(LR-HPV)3.92%(17/434)、HR-HPV和LR-HPV混合感染6.45%(28/434)、单一型别感染率27.88%(121/434)和多型别17.97%(78/434)。HPV52(9.68%,42/434)、HPV16(6.91%,30/434)、HPV58(6.91%,30/434)为常见HPV亚型。查体者阳性率为45.40%(79/174),接近于就诊者阳性率为54.76%(120/260),差异无统计学意义(χ^(2)=0.024,P>0.05)。17~30岁年龄组感染率最高为56.32%(46/84),各年龄组之间阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=4.123,P>0.05)。以多重荧光定量PCR为参考,多重PCR-毛细管电泳片段分析法的敏感度和特异度分别是92.96%和94.04%,Kappa值为0.870。结论HPV感染可能呈现年轻化,HR-HPV感染阳性率最高,以HPV52、16、58为主要感染亚型。多重PCR-毛细管电泳片段分析法与多重荧光定量PCR相比的检测结果具有高度一致性,适合HPV DNA分型检测。