徐州地区21-羟化酶缺乏症患儿遗传学及临床表型分析

目的分析徐州地区21-羟化酶缺乏症(21-hydroxylasedeficiency,21-OHD)患儿的基因型及基因突变频率特点,探讨基因型与临床表型的相关性。方法回顾分析2016年6月至2019年6月于徐州市妇幼保健院就诊的16例21-OHD患儿的临床资料。采用Sanger测序和多重连接探针扩增技术,对21-羟化酶编码基因CYP21A2进行检测,并分析患儿临床表型与基因型的相关性。结果16例患儿中均检测到2个等位基因的突变,共发现8种突变位点,均为已知的致病突变,包括c.293-13C>G、c.518T>A、Exon1-7del、Exon1-3del、c.1451_1452delinsC、c.1333C>T、E6Cluster和c.1273G>A,其中突变位点c.1333C>T在国内人群中鲜见报道。所有突变均遗传自患儿父母,发生频率最高的突变为c.293-13C>G,占33.3%;其次为c.518T>A和Exon1-7del,分别占28.1%和15.6%。在16例患儿中,基因型可预测为失盐型(saltwasting,SW)的患儿8例,与患儿实际表型相符率为100%。另外8例患儿预测为单纯男性化型(simplevirilizing,SV),其中7例患儿实际表型与预测表型一致,表型一致率为87.5%。结论徐州地区发现的21-OHD患儿均为SW和SV型,最常见的变异位点为c.293-13C>G、c.518T>A和Exon1-7del,患儿的基因型预测表型与实际表型具有较好的一致性。

高胆红素血症足月儿的肠道菌群变化分析

目的探讨高胆红素血症与非高胆红素血症足月儿肠道菌群分布组成和变化。方法取2022年1月至2023年1月于徐州市妇幼保健院出生的207例足月新生儿为研究对象,其中107例非高胆红素血症健康足月新生儿作为对照组(Control组),高胆红素血症组(Jaundice组)100例。分别取两组新生儿出生后第一次胎便样本,随后采集高胆红素血症高峰期的粪便,同时取相同日龄的对照组粪便样本,对粪便样本进行16S rRNA基因测序。结果对Control组和Jaundice组粪便中肠道菌群属水平进行比较,发现两组间出生后第一次胎便中3种肠道菌群丰度具有统计学差异(P<0.05),其中Enterococcus的丰度高于Control组,Streptococcus及Lactobacillus丰度低于对照组。高胆红素血症高峰期两组间6种肠道菌群丰度差异具有统计学意义(P<0.05),与Control组进行比较,Jaundice组Klebsiella、Enterococcus、Lactobacillales丰度明显较高(P<0.05),而Bifidobacterium、Bacteroides、Escherichia-Shigella丰度明显偏低(P<0.05)。另外,Jaundice组第一次胎便与高峰期粪便中肠道菌群的构成具有差异,高胆红素血症高峰期粪便中Klebsiella丰度明显高于第一次胎便(P<0.05),而Enterococcus及Escherichia-Shigella丰度明显偏低(P<0.05)。结论高胆红素血症与健康足月新生儿儿出生后第一次胎便及高胆红素血症高峰期粪便中肠道菌群分布均存在明显差异,且高胆红素血症患儿第一次胎便与高胆红素血症高峰期粪便中肠道菌群组成具有显著差异,肠道菌群检测可能有助于高胆红素血症的风险预测及临床诊断。

徐州地区孕中期胎儿染色体非整倍体筛查-诊断的模式研究及临床应用

21-三体综合征是先天出生缺陷中最常见的疾病之一,在我国其发生率约占活产新生儿的1/800~1/1000。18-三体综合征和13-三体综合征是仅次于21-三体综合征的常见染色体三体综合征,均表现为严重智力低下,特殊面容,常合并各种先天畸形。染色体异常是导致出生缺陷、智力障碍的重要原因,目前尚无有效的治疗方法。故只能通过产前早发现、早诊断。

孕妇外周血胎儿游离DNA高通量测序在产前非整倍体核型遗传筛查中的应用

目的探讨孕妇外周血胎儿游离DNA无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)技术在评估胎儿染色体非整倍体风险中的临床应用价值。方法选取2018年4月~2019年10月于徐州市妇幼保健院进行NIPT检测的8 001例孕妇,提取其静脉血血浆中胎儿游离DNA,利用高通量基因测序平台进行测序分析,高风险者进行羊膜腔穿刺术及染色体核型分析进行确诊诊断,低风险者常规产检。结果 8 001例样本中共检出21,18和13三体高风险34例(0.425%),其中包括28例21三体综合征(21 trisomic syndrome,T21),4例18三体综合征(18 trisomic syndrome,T18),2例13三体综合征(13 trisomic syndrome,T13)。所有高风险者均行羊水染色体核型分析,确诊19例T21,3例T18,1例T13,复合阳性预测值为67.65%。所有检测者筛查指征分组中,彩超提示有与染色体异常相关的软指标异常组的阳性率最高(1.010%),其次为产筛高风险组、高龄组、产筛临界风险组,孕妇要求及其他筛查指征组阳性率最低。六组数据差异不具有统计学意义(χ~2=5.454,P> 0.05)。结论 NIPT检测技术因其具有高通量性、高检出率、无创性等优点,使其在临床具有越来越广泛的应用前景,但该技术存在的假阳性率及假阴性率不可避免,所以检出高风险者需进一步确诊,低风险者仍需常规产检避免假阴性。

高通量连接探针扩增技术联合STR分型在孕早期稽留流产中的应用

目的:探讨高通量连接探针扩增(HLPA)技术联合短串联重复序列(STR)技术在流产病因学研究中的临床应用价值。方法:收集孕7~13+6周稽留流产样本283例,先行STR检测,再分别采用HLPA或染色体微阵列芯片(CMA)技术进行遗传学检测。结果:本组样本检测总成功率为98.94%(280/283),3例STR检测不通过,未进行后续检测,共检出染色体异常159例,异常检出率为56.79%(159/280),其中染色体数目异常94.34%(150/159),染色体结构畸变5.03%(8/159),单亲二倍体0.63%(1/159)。HLPA成功检测140例,染色体异常56.43%(79/140);CMA成功检测140例,染色体异常57.14%(80/140),两者差异无统计学意义。结论:HLPA+STR技术和CMA同样具有准确度高的优点。STR分型可排除母体污染,同时对HLPA在多倍体以及单亲二倍体的检测方面起到补充作用,两者联合应用可成为孕早期胚胎停止发育遗传学检测方法。

基于超高液相色谱-串联质谱技术的子痫前期患者血清代谢组学分析

目的分析子痫前期(PE)与正常妊娠孕妇血清中代谢物的差异,寻找潜在诊断代谢分子。方法选取2022年1月至12月徐州市妇幼保健院的PE患者6例和正常妊娠孕妇10例,应用超高液相色谱-串联质谱法检测入组孕妇血清样本,筛选差异性代谢物进行分析。结果共筛选出β-烟酰胺单核苷酸、D-(+)-甘露糖、溶血磷脂酰丝氨酸(Lysops)22:6、溶血磷脂酰胆碱(LPC)18:2、氧化型磷脂酰乙醇胺(OxPE)18:0+20:4+1O(1Cyc)、溶血磷脂酰乙醇胺(LPE)18:2、LPE 20:4、肌酸、十四烷酸、1-甲基尿酸、7-甲基黄嘌呤、磷脂酰胆碱(PC)16:0/18:2及鞘磷脂(SM)d14:0/20:0等13种差异性代谢物,ROC曲线分析结果显示十四烷酸、1-甲基尿酸、PC 16:0/18:2、7-甲基黄嘌呤及SM d14:0/20:0的曲线下面积大于0.7。结论PE患者与正常孕妇相比血清中代谢成分具有差异,代谢分子对于PE具有潜在诊断价值。

徐州地区1021例遗传咨询者细胞染色体核型分析

目的探讨徐州地区遗传咨询者外周血染色体异常核型出现的类型、发生率及与先天愚型、不良孕史、不孕不育和发育异常等疾病的相关性。方法对2014年10月至2017年6月期间我院1021例遗传咨询者,抽取外周血,培养淋巴细胞,进行G显带核型分析,分析其异常核型发生率,探讨其与疾病的发生关系。结果检出染色体核型异常74例,异常率为7.25%;其中常染色体数目异常8例,性染色体数目异常16例;常染色体结构异常共48例,性染色体结构异常2例,染色体多态性24例。结论先天愚型、精子生成障碍、不孕不育和习惯性流产的患者染色体异常比率较高,临床中此类人群非常有必要做染色体核型分析。

核型分析联合BoBs及MLPA技术在产前诊断中的应用

目的:探讨新型快速产前诊断模式“核型分析+产前细菌人工染色体微球(BoBs)技术+多重链接探针扩增(MLPA)技术验证体系”的临床应用价值。方法:选取2018年6月至2019年6月在徐州市妇幼保健院遗传医学中心就诊的符合产前诊断指征的464例孕妇,对其羊水细胞进行染色体G显带核型分析和BoBs技术检测,同时对BoBs结果提示微缺失/微重复者进行MLPA检测验证。结果:464例羊水样本中,染色体核型分析检出染色体异常69例,其中染色体非整倍体59例,染色体结构异常10例,漏检了3例染色体微缺失/微重复综合征;产前BoBs技术检测染色体异常62例,其中包括4例染色体微缺失/微重复综合征。3例染色体微缺失/微重复综合征病例进行MLPA技术检测,结果均与产前BoBs技术检测结果一致,其中2例进一步对胎儿父母进行MLPA技术检测,结果显示其拷贝数变异均遗传其父母。结论:染色体核型分析在检测染色体数目异常或结构异常方面具有较高的检出率,但是在微缺失/微重复综合征的检出方面存在明显不足,而产前BoBs技术能够弥补这一不足之处。MLPA作为简便、可靠的验证方法为微缺失/微重复综合征的诊断和遗传学分析提供了有力的帮助。因此,“核型分析+产前BoBs技术+MLPA技术验证体系”是一种诊断染色体非整倍体及微缺失/微重复综合征的快捷、可靠的新型产前诊断模式。

子痫前期患者血浆D-二聚体与C-反应蛋白水平的相关性及诊断意义

目的分析子痫前期患者血浆D-二聚体、C-反应蛋白(CRP)及凝血四项水平,探讨上述指标与子痫前期的相关性,为子痫前期的临床诊断及严重程度的评估提供参考。方法回顾并分析2019年1月—2021年9月徐州市妇幼保健院收治的257例孕妇的临床资料,包括117名正常妊娠孕妇,66例轻度子痫前期孕妇以及74例重度子痫前期孕妇。检测所有孕妇血浆D-二聚体、CRP及凝血四项〔凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)、纤维蛋白原(Fib)、凝血酶时间(TT)〕;采用二元Logistic回归分析校验D-二聚体及CRP水平与疾病严重程度的相关性;采用Spearman相关性分析检验D-二聚体与CRP、新生儿出生体质量、1 min及5 min Apgar评分的相关性;绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线)并计算ROC曲线下面积(AUC),评估D-二聚体对重度子痫前期的诊断价值。结果子痫前期孕妇的PT明显少于正常妊娠孕妇,TT、CRP水平均明显高于正常妊娠孕妇〔PT(s):10.94±0.84比11.66±0.55,TT(s):16.54±1.62比15.81±0.84,CRP(mg/L):12.35±8.01比6.06±5.52,均P<0.05〕。重度子痫前期孕妇血浆中D-二聚体水平相比轻度子痫前期者明显增高(mg/L:2.98±1.97比2.27±1.56,P<0.05),CRP水平较轻度子痫前期者稍高,但差异无统计学意义(mg/L:14.96±11.81比9.74±8.13,P>0.05)。Spearman相关性分析显示,子痫前期患者血浆D-二聚体与CRP呈正相关(r=0.225,P=0.008);二元Logistic回归分析结果表明,D-二聚体与子痫前期病情严重程度呈正相关〔优势比(OR)为1.264,95%可信区间(95%CI)为1.028~1.553,P=0.026〕;ROC曲线分析显示在截断值为2.12 mg/L时,D-二聚体对重度子痫前期诊断的AUC为0.595(95%CI为0.512~0.677),敏感度为63.5%,特异度为58.5%。结论孕晚期子痫前期孕妇存在凝血-纤溶功能失衡,血浆中D-二聚体水平与子痫前期病情严重程度呈正相关,且子痫前期孕妇D-二聚体与CRP水平呈正相关,应定期对子痫前期孕妇进行凝血-纤溶功能检测,给予合理的临床管理和干预。

母血浆中游离胎儿DNA检测在染色体非整倍体筛查中的应用

目的母血浆中游离胎儿DNA检测在染色体非整倍体的无创产前诊断中的实用价值及临床意义。方法选择孕中期血清学筛查高风险、高龄妊娠等因素，孕龄在15～26周之间，且拒绝行侵入性产前诊断的孕妇。进行母血浆中游离胎儿DNA的高通量测序，阳性结果孕妇，通过羊膜腔穿刺、羊水细胞培养、染色体核型分析确定染色体非整倍体情况。结果1269例孕妇血浆样本经高通量基因测序检测到22个结果异常，羊水染色体核型分析1O例21-三体、3例18-三体、性染色体异常6例，3例性染色体误诊。无创胎儿21-三体、18-三体综合征检出正确率达100％，但胎儿性染色体检测准确率较低，约为66．7％。结论高通量基因组测序技术具有无创性，且与传统羊水染色体核型分析相比，诊断胎儿21-三体、18-三体综合征的特异性有较高的一致性。

醋酸加尼瑞克在卵巢过度刺激高风险人群中的应用效果

目的探讨醋酸加尼瑞克预防和治疗体外助孕并发卵巢过度刺激综合征(OHSS)的效果。方法选取2014年5月~2018年8月于徐州市妇幼保健院生殖医学中心接受体外受精(IVF)/卵胞浆内单精子显微注射技术(ICSI)助孕并行全胚冷冻的98例OHSS高风险患者作为研究对象,根据掷硬币法随机将其分为对照组(48例)和加尼瑞克组(50例)。对照组取卵后采用临床常规处理,加尼瑞克组取卵后在常规处理的基础上加用醋酸加尼瑞克0.25 mg,1次/d,共5 d。比较两组患者的OHSS分度情况及各项相关指标。结果加尼瑞克组患者的OHSS分度情况优于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。加尼瑞克组患者的住院时间短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组患者的血液浓缩发生率、卵巢体积、凝血异常及腹腔穿刺发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论取卵后使用醋酸加尼瑞克可以有效预防OHSS。

Y染色体微缺失检测对男性不育的临床价值研究

目的探讨Y染色体无精子症因子(azoospermia factor AZF)基因微缺失检测对男性不育的临床诊疗价值。方法选取2016年11月~2019年7月于徐州市妇幼保健院就诊的509例男性不育患者,依据临床诊断类型分为初诊为不育组(369例)、精子状态异常组(117例)和睾丸发育异常组(23例)。采用多重PCR技术进行Y染色体微缺失检测。结果509例患者中检出Y染色体微缺失24例,检出率4.72%(24/509)。其中初诊为不育组11例,精子状态异常组9例和睾丸发育异常组4例,三组数据差异均具有统计学意义(χ^2=13.004,P=0.002)。24例AZF基因微缺失患者中初诊为不育组检出AZFc区缺失10例,AZFabc区缺失1例;精子状态异常组检出AZFc区缺失7例,AZFbc区及AZFb区缺失各1例;睾丸发育异常组检出AZFc区缺失1例,AZFabc区缺失3例。三组数据差异具有统计学意义(χ^2=15.093,P=0.020)。结论Y染色体微缺失的检出有助于尽快明确部分男性不育的根本原因,从而指导临床制定出更加合理有效的诊疗方案。

滤纸干血斑用于脊髓性肌萎缩症基因筛查方法的建立

目的建立滤纸干血斑基因组DNA自动化提取方法及流程,并探索其在脊髓性肌萎缩症(SMA)基因筛查中的应用。方法收集45份干血斑标本,采用打孔钳打孔后提取DNA,使用多重PCR结合荧光探针技术进行SMN1检测,考察最低起始干血斑用量。收集103份4℃不同保存时长的新生儿干血斑和17份EDTA抗凝血制备的干血斑,使用最低起始量提取DNA并检测SMN1,考察运输与保存条件对基因检测结果稳定性的影响。结果最低1片直径4mm的干血斑所提取的DNA浓度2.54~5.71ng/μL、纯度1.676~1.984,可满足SMN1检测要求。4℃避光保存1~24个月的新生儿干血斑标本,新鲜采集并经冷链运输48~72h的EDTA抗凝血及-80℃超低温冷冻保存1~2年的EDTA抗凝血制备的干血斑标本均可稳定检出SMA基因型。结论1片直径4mm的干血斑即可满足SMN1检测要求,大大降低了样本采集、保存和运输的难度和复杂程度,有利于开展大规模人群筛查,为现有新生儿筛查体系下增加SMA筛查提供了技术基础。

胎儿超声软指标与染色体拷贝数变异的相关性研究

目的探讨胎儿超声软指标与染色体拷贝数变异(CNV)的相关性,为超声软指标胎儿的产前诊断提供可靠依据。方法选取2019年12月—2021年12月于徐州市妇幼保健院就诊,超声检查提示胎儿超声软指标但未合并明显超声结构异常的单胎妊娠孕妇580例,经羊膜腔穿刺术抽取羊水行染色体微阵列分析(CMA)。根据超声软指标数量将其分为单项超声软指标组(486例)、2项及以上超声软指标组(94例),再根据不同类型将单项超声软指标组分为10个亚组,比较各组及各亚组之间染色体CNV的发生率。结果580例样本中染色体CNV总体发生率为13.4%(78/580),其中2项及以上超声软指标组染色体CNV发生率为31.9%(30/94),明显高于单项超声软指标组(9.9%,48/486),差异有统计学意义(P<0.001)。单项超声软指标组染色体CNV检出率较高的亚组为:鼻骨缺失/骨化不全17.3%(18/104)、颈项透明层(NT)/颈后皮肤皱褶(NF)增厚13.2%(14/106)。结论在产前咨询中,对于染色体CNV检出率较高的2项及以上超声软指标和单项超声软指标中的鼻骨缺失/骨化不全、NT/NF增厚建议行介入性产前诊断CMA检测。

急性低频感音神经性聋临床特征及疗效分析

目的探讨急性低频感音神经性聋(acute low-frequency hearing loss,ALHL)的临床特征及疗效。方法回顾性分析89例ALHL患者的临床特点和治疗情况。结果ALHL患者89例,年龄13~64岁,平均年龄34.9岁;男女比例为0.71,女性明显多于男性。单耳发病多见。5例首发症状为听力下降,12例为耳闷,8例为耳鸣,64例首发症状同时出现耳闷和耳鸣。分别比较不同首发症状ALHL患者的预后痊愈率及治疗有效率,差异均无统计学意义(P均>0.05)。73例患者接受耳蜗电图检查,72例引出耳蜗电图,其中SP/AP≥0.4者23例,SP/AP<0.4者49例,SP/AP≥0.4者与SP/AP<0.4者分别比较痊愈率与有效率,差异均无统计学意义(P均>0.05)。发病7天内就诊者47例,8~21天者27例,>21天者15例,分别比较不同就诊时间患者的痊愈率及有效率,差异均有统计学意义(χ^2分别为8.039、14.544,P均<0.05)。结论ALHL多以突发性耳闷和耳鸣为首发症状,不同首发症状的ALHL患者预后比较,差异均无统计学意义。发病3周内就诊者疗效较好。

妊娠期肝内胆汁淤积症及无症状妊娠期高胆汁酸血症孕妇血清胆汁酸谱的特征及其诊断价值

目的分析正常妊娠、妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)及无症状高胆汁酸血症(AHP)孕妇血清中的胆汁酸组分,评估血清胆汁酸谱在ICP和AHP诊断中的应用价值。方法收集2022年6月至2023年5月于徐州市妇幼保健院产前检查的122例孕妇的临床资料,其中正常妊娠组54例,ICP组28例,AHP组40例。采用超高效液相色谱-串联质谱技术检测各组孕妇血清中15种胆汁酸水平,包括胆酸(CA)、鹅脱氧胆酸(CDCA)、脱氧胆酸(DCA)、石胆酸(LCA)、熊脱氧胆酸(UDCA)、甘氨胆酸(GCA)、甘氨鹅脱氧胆酸(GCDCA)、甘氨脱氧胆酸(GDCA)、甘氨石胆酸(GLCA)、甘氨熊脱氧胆酸(GUDCA)、牛磺胆酸(TCA)、牛磺鹅脱氧胆酸(TCDCA)、牛磺脱氧胆酸(TDCA)、牛磺石胆酸(TLCA)和牛磺熊脱氧胆酸(TUDCA)。应用主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)模型筛选差异胆汁酸,受试者工作特征(ROC)曲线分析组间差异胆汁酸及其联合指标的诊断效能。结果(1)与正常妊娠组比较,ICP组孕妇血清中LCA、GCA、GCDCA、GDCA、GLCA、UDCA、TCA、TCDCA、TDCA、TLCA、GUDCA及TUDCA水平的差异均有统计学意义(P均<0.05),AHP组孕妇血清中LCA、DCA、GCA、GCDCA、GDCA、GLCA、TCA、TCDCA、TDCA、TLCA、GUDCA及TUDCA水平的差异均有统计学意义(P均<0.05);与ICP组比较,AHP组孕妇血清中CDCA、DCA、UDCA、TDCA、GUDCA及TUDCA水平的差异均有统计学意义(P均<0.05)。(2)OPLS-DA模型中,ICP组与AHP组之间的差异胆汁酸为TUDCA、TCA、UDCA、GUDCA和GCA,其变量投影重要性(VIP)值分别为1.489、1.345、1.344、1.184和1.111;AHP组与正常妊娠组之间的差异胆汁酸为TCA、GCDCA、GCA、TDCA、GDCA和TCDCA,其VIP值分别为1.236、1.229、1.197、1.145、1.139和1.138。(3)ROC曲线分析结果显示,TUDCA、TCA、UDCA、GUDCA和GCA组成的联合指标对于ICP与AHP鉴别诊断的曲线下面积(AUC)为0.860,敏感度和特异度分别为67.9%、95.0%;TCA、GCDCA、GCA、TDCA、GDCA和TCDCA组成的联合指标诊断AHP的AUC为0.964,敏感度和特异度分别为95.0%、93.1%。结论正常妊娠、ICP及AHP孕妇的血清胆汁酸谱有差异,血清胆汁酸谱对ICP与AHP的鉴别诊断及AHP的诊断具有潜在应用价值。

徐州地区MTHFR基因C677T多态性与男性不育的相关性研究

目的探讨徐州地区亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T多态性与男性不育的相关性。方法选取确诊的男性不育症患者715例做为本研究实验组,以有正常生育史且精液检测正常的男性572例做为对照组,根据MTHFR C677T基因多态性的结果,分析此多态性位点在两组中分布的差异。结果MTHFRC677T位点等位基因T频率在不育症中显著高于健康对照组(P<0.05)。MTHFRC677T位点CC基因型频率在不育症组中显著低于健康对照组,TT基因型频率在不育症中显著高于健康对照组(P<0.05),CT基因型的频率在两组之间的差异无统计学意义(P>0.05)。结论MTHFR基因C677T单核苷酸多态性在徐州地区男性不育患者和健康人中,分布有显著差异,MTHFR基因C677T多态性与徐州地区男性不育有相关性。

徐州地区染色体罗伯逊易位携带者产前诊断的研究

目的研究遗传咨询患者中罗伯逊易位对优生优育的影响,降低出生缺陷率。方法罗伯逊易位携带者再次妊娠至孕中期(16-25周)进行羊膜腔穿刺、细胞培养、染色体分析,诊断胎儿是否染色体异常,并对出生儿童随访、结果进行分析研究。结果 14例妊娠至中期(18-24周),3例正常染色体核型、4例携带者,继续妊娠;7例异常染色体核型,其中易位型21-三体5例、易位型13-三体2例,建议引产。结论罗伯逊易位与流产、生育21-三体型患儿密切相关,其携带者夫妇妊娠时应做产前诊断。

新生儿遗传代谢病人工智能疾病风险评估模型的建立及验证

目的应用人工智能技术建立新生儿遗传代谢病疾病风险评估模型并验证其用于辅助新生儿串联筛查结果的判断。方法回顾性研究。收集2010年2月至2019年5月来自全国31家医院新生儿遗传代谢病筛查(串联质谱法)5907547例数据和34家医院临床确诊的3028例数据进行回顾性分析,建立新生儿遗传代谢病人工智能疾病预测模型;以2018年1至9月浙江大学医学院附属儿童医院360814例新生儿筛查数据进行遗传代谢病人工智能疾病预测模型的单盲试验验证,通过比较临床确诊病例的检出率、串联初筛阳性率和阳性预测值在人工判读和遗传代谢病人工智能预测模型中的结果,验证人工智能疾病风险预测模型的有效性。结果经数据筛选,共有3665697例新生儿串联初筛数据符合数据库建模的标准,选取所有临床确诊患儿数据3019例共构建了16种人工智能预测模型可涵盖32种遗传代谢病;在单盲试验验证入组的360814例新生儿中,临床确诊病例共45例,人工判读和遗传代谢病人工智能预测模型结果一致,所有临床确诊病例均为阳性或高风险。串联初筛阳性人工判读为2684例,遗传代谢病人工智能疾病风险预测模型判读为串联初筛高风险1694例,串联初筛阳性率分别为0.74%(2684/360814)、0.46%(1694/360814);与人工判读相比,遗传代谢病人工智能疾病风险预测模型判读阳性人数总体减少了36.89%(990/2684);人工判读和遗传代谢病人工智能疾病风险预测模型的阳性预测值分别为1.68%(45/2684)、2.66%(45/1694)。结论所建立的新生儿遗传代谢病人工智能疾病风险预测模型具有准确、快速、假阳性率低的优点,具有重要临床应用价值。

高通量测序技术用于流产物遗传学分析的价值

目的探讨高通量测序,即下一代测序(next-generation sequencing,NGS)技术在流产物遗传学分析和诊断中的应用价值。方法收集2017年1月至6月郑州大学第一附属医院的流产组织样本154例,分别采用NGS结合短串联重复序列(short tandem repeat,STR)和单核苷酸多态性芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)技术进行分析。比较2种平台的检测效果。采用χ^2检验或Fisher精确概率法对数据进行统计学分析。结果 (1)154例流产物样本中,检出染色体异常结果109例(70.7%)。109例染色体异常结果中,染色体数目异常52例(47.7%),染色体结构异常49例(45.0%),嵌合体6例(5.5%),单亲二倍体(uniparental disomy,UPD)2例(1.8%)。52例染色体数目异常样本共包括45例染色体非整倍体和7例染色体多倍体。染色体异常比例前3位依次为45,X(27.0%,14/52),22-三体(9.6%,5/52)和16-三体(7.7%,4/52)。49例染色体结构异常样本共携带67个拷贝数变异(copy number variation,CNV),其中致病性CNV13个(19.4%),临床意义不明的CNV24个(35.8%),良性CNV30个(44.8%)。在检出的致病性CNV中,2个包含微缺失/微重复综合征。(2)SNP-array技术对152例样本检测成功,2例(1.3%)因基因组DNA量<200 ng而检测失败。NGS技术对154例样本全部检测成功,且在SNP-array检测失败的2例中检出染色体异常。SNP-array和NGS技术检出的染色体异常比例差异无统计学意义[70.4%(107/152)与67.5%(104/154),χ^2=0.293,P=0.588]。(3)NGS和SNP-array技术各检出6例(均为3.9%)相同嵌合体和45例(分别为29.2%和29.6%)相同染色体非整倍体,差异均无统计学意义。SNP-array技术检出3例染色体多倍体(均为69,XXX)和UPD 2例,而NGS均未检出。但结合STR技术,NGS也成功检出了这3例染色体多倍体。(4)SNP-array检出的47例结构异常样本共携带CNV53个,NGS技术检出的49例结构异常样本共携带CNV67个。(5)当基因组长度分别为100~<500、500~<1 000和≥1 000 kb时,与SNP-array技术相比,NGS技术多检出的CNV分别为10、3和1个。结论NGS技术可以检出SNP-array技术检出的染色体非整倍体和嵌合体,对基因组DNA含量要求更低,还能够发现SNP-array技术不能检出的CNV。结合STR技术,NGS技术也可以有效检出染色体多倍体。NGS技术可以作为流产物遗传学诊断中的有效检测方法。