探究了不同DNA提取方法对人体肠道微生物菌群研究的影响,为今后研究人体肠道微生物时选择提取方法提供参考依据。选择市面上3种商业化肠道微生物DNA提取试剂盒和1种实验室改良方法对20份人类粪便样本中微生物DNA进行提取,根据DNA浓度、...探究了不同DNA提取方法对人体肠道微生物菌群研究的影响,为今后研究人体肠道微生物时选择提取方法提供参考依据。选择市面上3种商业化肠道微生物DNA提取试剂盒和1种实验室改良方法对20份人类粪便样本中微生物DNA进行提取,根据DNA浓度、纯度和微生物多样性比较4种DNA提取方法差异。结果表明:Q-试剂盒法(QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit,Qiagen)、ET-试剂盒法(ET粪便DNA快速提取试剂盒,IDMBIO)、P-实验室改良法3种方法提取的DNA得率较高;方法 P获得的OTU数量最多;α多样性分析结果显示4种提取方法差异不显著;方法 P、方法 Q得到肠道微生物组成结构相似度较高,方法 ET、方法 Y(MolPure Stool DNA Kit,Yeasen)得到肠道微生物组成相似度较高;4种DNA提取方法所得微生物群落构成在门水平和属水平差异明显。每种DNA提取方法都有各自提取偏好性菌属,经过综合比较,方法 Q和方法 ET提取DNA的得率更高、速度更快。展开更多
文摘探究了不同DNA提取方法对人体肠道微生物菌群研究的影响,为今后研究人体肠道微生物时选择提取方法提供参考依据。选择市面上3种商业化肠道微生物DNA提取试剂盒和1种实验室改良方法对20份人类粪便样本中微生物DNA进行提取,根据DNA浓度、纯度和微生物多样性比较4种DNA提取方法差异。结果表明:Q-试剂盒法(QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit,Qiagen)、ET-试剂盒法(ET粪便DNA快速提取试剂盒,IDMBIO)、P-实验室改良法3种方法提取的DNA得率较高;方法 P获得的OTU数量最多;α多样性分析结果显示4种提取方法差异不显著;方法 P、方法 Q得到肠道微生物组成结构相似度较高,方法 ET、方法 Y(MolPure Stool DNA Kit,Yeasen)得到肠道微生物组成相似度较高;4种DNA提取方法所得微生物群落构成在门水平和属水平差异明显。每种DNA提取方法都有各自提取偏好性菌属,经过综合比较,方法 Q和方法 ET提取DNA的得率更高、速度更快。