计算方法预测microRNA研究进展

microRNA(miRNA)是一类内源性、长度为19-24个碱基的非编码小分子RNA。它在调控动植物的基因表达、生长发育等方面起着重要的作用。现阶段寻找miRNA的方法主要分为实验方法和计算预测两大类,其中,实验的方法很难测定表达量偏低或者特异表达的miRNA,也不适合进行基因组范围的发现。而计算预测的方法则恰好可以弥补这些不足。总结近几年计算预测miRNA的方法,归纳为三类,分别是基于同源性比较的方法、基于机器学习的方法和基于高通量测序的方法。最后对miRNA计算预测方法未来的发展方向作出了探讨。