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平行药物系统:基于大语言模型和三类人的框架与方法 被引量:3
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作者 林飞 王飞跃 +4 位作者 田永林 丁显廷 倪清桦 王静 申乐 《智能科学与技术学报》 CSCD 2024年第1期88-99,共12页
近年来,随着物联网、大语言模型、多模态交互等新一代人工智能技术的迅猛发展,传统的药物研发、生产加工等过程面临着智能化转型的挑战。为此,以平行智能为理念,基于ACP方法和大语言模型提出了虚实交互的平行药物系统,并将三类人(数字... 近年来,随着物联网、大语言模型、多模态交互等新一代人工智能技术的迅猛发展,传统的药物研发、生产加工等过程面临着智能化转型的挑战。为此,以平行智能为理念,基于ACP方法和大语言模型提出了虚实交互的平行药物系统,并将三类人(数字人、机器人和生物人)的概念引入系统中,详细阐述了该系统的理论框架与构建方法。平行药物系统涵盖医药产业的全流程,药物研发阶段考虑了药物发现、实验室研究、临床试验等过程;药物生产加工阶段考虑了制药工厂运行、系统分析预测等方面;药物医疗保健阶段考虑了个性化用药咨询、增强现实用药指导、隐私安全等内容。平行药物系统打造了一个数字化的“药物空间”,旨在建立药物系统的新范式,推动智能化药物的革命。 展开更多
关键词 平行智能 ACP方法 大语言模型 三类人 平行药物系统 药物研发 药物生产加工 药物医疗保健
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全球化线上线下混合教学模式——iPodia全球无边界课堂创新与实践 被引量:1
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作者 丁显廷 卢志扬 +2 位作者 童蕾 张执南 孟祥琦 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2023年第9期156-162,181,共8页
为了利用新兴的多媒体教学手段和课堂教学技术的创新,使世界各地学生能够跨学科、跨空间、跨机构和跨文化界限进行协作和交互式融合学习,上海交通大学参与了由美国南加州大学发起,全球11所高校创建的iPodia联盟,旨在通过iPodia平台提供... 为了利用新兴的多媒体教学手段和课堂教学技术的创新,使世界各地学生能够跨学科、跨空间、跨机构和跨文化界限进行协作和交互式融合学习,上海交通大学参与了由美国南加州大学发起,全球11所高校创建的iPodia联盟,旨在通过iPodia平台提供的全球无边界课堂联合课程,实现共同开发共享课件,合作开设国际化课程。介绍了iPodia全球无边界课堂的教学理念与模式,以全球化创新原理与实践课程为例,介绍了课程的开发过程,并对课程开展效果进行总结与评价。 展开更多
关键词 线上线下混合教学模式 全球无边界课堂 国际化教育 工程教育
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培育国际化新工科高端人才教学模式的探索与实践
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作者 童蕾 丁显廷 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2023年第12期218-222,257,共6页
依托于上海交通大学全球无边界课堂(iPodia)《全球化创新:原理与实践》课程,通过校企合作,将企业自身经营中遇到的实际问题和困难直接反转抛给全球无边界课堂,让全球学生们针对实际问题深入开展多样化的探索实践,最终形成可推广的建设... 依托于上海交通大学全球无边界课堂(iPodia)《全球化创新:原理与实践》课程,通过校企合作,将企业自身经营中遇到的实际问题和困难直接反转抛给全球无边界课堂,让全球学生们针对实际问题深入开展多样化的探索实践,最终形成可推广的建设经验和教学改革成果。旨在创新性地探索面向当今国际形式,如何利用先进的多媒体教学手段,保持我国大学生教育的国际化和与世界纽带关系的持续深化教育模式。 展开更多
关键词 国际化 新工科 教学模式 校企合作
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基于生物信息学方法挖掘胃癌相关lncRNA
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作者 童蕾 丁显廷 《锦州医科大学学报》 CAS 2023年第4期39-46,共8页
目的本研究对4对胃癌患者癌组织及癌旁组织的lncRNA和mRNA进行表达谱定量分析,通过生物信息学方法挖掘到潜在胃癌相关的靶标分子。方法利用基因技术筛选样品得到差异lncRNA和mRNA,对差异lncRNA和mRNA构建共表达网络图,对候选lncRNA利用U... 目的本研究对4对胃癌患者癌组织及癌旁组织的lncRNA和mRNA进行表达谱定量分析,通过生物信息学方法挖掘到潜在胃癌相关的靶标分子。方法利用基因技术筛选样品得到差异lncRNA和mRNA,对差异lncRNA和mRNA构建共表达网络图,对候选lncRNA利用UCSC重新注释,预测lncRNA结合TF和蛋白,利用GO和KEGG数据库富集分析lncRNA共表达基因和结合蛋白从而推测lncRNA参与功能。结果共筛选出了543个差异lncRNA以及2705个mRNA,GO功能分析显示lncRNA共表达基因参与transferase activity、immune system process、regulation of cell differentiation、immune response、cell differentiation,KEGG通路富集分析显示lncRNA共表达基因参与transferase activity、cell differentiation、p53 signaling pathway、TGF-beta signaling pathway通路。ENST00000444102是一个保守lncRNA,胃癌中显著上调参与肿瘤通路过程。结论ENST00000444102这条lncRNA参与多种肿瘤相关通路,可能成为潜在的胃癌预后、诊断和治疗的治疗靶点。lncRNA参与多种肿瘤相关通路ENST00000444102,可能成为潜在的胃癌预后、诊断和治疗的治疗靶点。 展开更多
关键词 胃癌 基因芯片数据分析 lncRNA分子 生物信息学
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依托实验室科研团队培养本科创新人才 被引量:7
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作者 辛玉芳 丁显廷 +2 位作者 彭诚信 赵文芳 顾颖 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2022年第2期246-250,共5页
新一轮科技革命背景下,大学能教给学生的知识滞后于实际的科技发展需求已成为无法避免、不可逆转的新常态。本科人才培养模式改革是解决这一新矛盾的重要途径。通过对高校现行案例的访谈研究,发现依托实验室科研团队的本科创新人才培养... 新一轮科技革命背景下,大学能教给学生的知识滞后于实际的科技发展需求已成为无法避免、不可逆转的新常态。本科人才培养模式改革是解决这一新矛盾的重要途径。通过对高校现行案例的访谈研究,发现依托实验室科研团队的本科创新人才培养模式,符合核心素养的内涵,能够有效克服单一导师制的缺陷,拓展广泛的学术合作网络。科研团队对本科教育的反馈和修正及时、准确、针对性强,是实现一流本科教育的有效合理的路径。本科生和实验室科研团队的融合,能促进资源的交叉利用,达到事半功倍的效果,具有现实的可行性。 展开更多
关键词 实验室科研团队 科教协同育人 “双一流”建设 本科创新人才培养
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单细胞生命体的系统工作原理是什么?
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作者 丁显廷 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期14-15,共2页
世界上许多的单细胞生命体以高效率和高准确性在运行着.比如一个巨噬细胞可以实时地动态追踪一个细菌,说明这种单细胞生物的感知器和控制器都是异常精密和发达的.人类目前尚未了解单细胞生命体的运行规律.破译这一科学问题,将对仿生机... 世界上许多的单细胞生命体以高效率和高准确性在运行着.比如一个巨噬细胞可以实时地动态追踪一个细菌,说明这种单细胞生物的感知器和控制器都是异常精密和发达的.人类目前尚未了解单细胞生命体的运行规律.破译这一科学问题,将对仿生机器人、新的系统调控原理、控制理论、蛋白质网络、新药研发、细胞衰老等众多领域都具有重大的价值. 展开更多
关键词 单细胞生命体 生物医学工程 仿生机器人 复杂系统 控制理论
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基于毛细不稳定性的聚焦通道微液滴操控研究
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作者 刘丹丹 徐玉梅 +2 位作者 杨健 马志军 丁显廷 《轻工机械》 CAS 2015年第2期1-5,共5页
针对目前利用微流道产生微液滴时,存在的制作成本高、难于控制液滴大小的缺点,采用数值模拟的方法对聚焦通道进行研究。文章基于毛细不稳定性来系统研究聚焦流道液滴生成与作用规律。研究中主要采用水平集方法,探讨了连续相速度、表面... 针对目前利用微流道产生微液滴时,存在的制作成本高、难于控制液滴大小的缺点,采用数值模拟的方法对聚焦通道进行研究。文章基于毛细不稳定性来系统研究聚焦流道液滴生成与作用规律。研究中主要采用水平集方法,探讨了连续相速度、表面张力、两相黏度比、通道尺寸等因素对于液滴生成的影响,并从不稳定性角度来阐释其物理机制。研究结果表明水平集方法可以很好地模拟液滴破碎,发现连续相速度、表面张力、两相黏度比对液滴尺寸影响较大。 展开更多
关键词 微液滴 聚焦流道 毛细不稳定性 水平集
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留学生科研基地的建设与实践 被引量:2
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作者 童蕾 丁显廷 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2021年第12期241-245,共5页
近些年来,外国留学生大量进入中国的科研型高校学习和开展研究工作。这对于我国传统的大学教学模式和体制提出了新的考验。针对于中国本土学生的管理办法不完全适用于国际留学生的管理,而且以往经验不能单纯地照抄。在留学生招生、管理... 近些年来,外国留学生大量进入中国的科研型高校学习和开展研究工作。这对于我国传统的大学教学模式和体制提出了新的考验。针对于中国本土学生的管理办法不完全适用于国际留学生的管理,而且以往经验不能单纯地照抄。在留学生招生、管理和考核的机制上,需要创新的思路和机制。因此,个性化医学研究院依托学校成立“海外学生科研实习基地”探索国际化办学的新机制、新模式。促进介绍个性化医学研究院的科研基地在创新留学生培养模式的举措和实践经验,进而全力构建全面、高水准的教育对外开放格局。 展开更多
关键词 留学生 科研基地 国际化 招生 管理 考核
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基于成分配伍的中药复方研究策略
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作者 张宏 李奇璋 +7 位作者 刘爱芬 曾克武 丁显廷 王博谦 史建伍 王成牛 辛海量 张磊 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2024年第5期911-924,共14页
传统中药复方的功效已被长期临床实践所证实,但由于包含复杂的化学成分,其安全性、有效性和质量稳定性难以控制.组分中药尽管促进了中医药的发展,但仍然难以明确作用靶点及分子机制,无法清楚阐释方剂配伍理论的科学内涵.本文提出基于有... 传统中药复方的功效已被长期临床实践所证实,但由于包含复杂的化学成分,其安全性、有效性和质量稳定性难以控制.组分中药尽管促进了中医药的发展,但仍然难以明确作用靶点及分子机制,无法清楚阐释方剂配伍理论的科学内涵.本文提出基于有效成分配伍的中药复方(成分中药)研究策略,涉及的关键技术主要包括:(ⅰ)入血/组织化学成分分析;(ⅱ)三维筛选模型构建;(ⅲ)作用靶点研究;(ⅳ)数据整合分析.成分中药既具有传统方剂协同增效减毒的优势,体现了配伍特色,同时又具有现代药物成分清楚的特点,能借助多学科技术明确各成分作用靶点及协同分子机制,从而可清楚阐释方剂配伍理论的科学内涵,是今后中药复方研究的必然发展趋势.该研究策略的提出对从方法学角度解决中医药原创理论的现代科学内涵阐述等重大前沿科学问题具有示范意义. 展开更多
关键词 复方 成分 配伍 策略 科学内涵
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Numerical Study on Separation of Circulating Tumor Cell Using Dielectrophoresis in a Four-Electrode Microfluidic Device
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作者 王雨坤 丁显廷 张执南 《Journal of Shanghai Jiaotong university(Science)》 EI 2023年第4期391-400,共10页
This numerical study proposes a cell sorting technique based on dielectrophoresis(DEP)in a microfluidic chip.Under the joint effect of DEP and fluid drag,white blood cells and circulating tumor cells are separated be... This numerical study proposes a cell sorting technique based on dielectrophoresis(DEP)in a microfluidic chip.Under the joint effect of DEP and fluid drag,white blood cells and circulating tumor cells are separated because of different dielectric properties.First,the mathematical models of device geometry,single cell,DEP force,electric field,and flow field are established to simulate the cell motion.Based on the simulation model,important boundary parameters are discussed to optimize the cell sorting ability of the device.A proper matching relationship between voltage and flow rate is then provided.The inlet and outlet conditions are also investigated to control the particle motion in the flow field.The significance of this study is to verify the cell separating ability of the microfluidic chip,and to provide a logistic design for the separation of rare diseased cells. 展开更多
关键词 MICROFLUIDICS dielectrophoresis(DEP) cell sorting particle tracing
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临床(前)研究的质谱流式细胞术——流式细胞技术的“后荧光时代” 被引量:3
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作者 周琰 李琴 +2 位作者 刘皋林 丁显廷 范国荣 《中国新药与临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-6,共6页
随着生命科学的不断发展及对单细胞分析手段越来越高的需求,传统的荧光流式细胞技术已不能满足科学家们的需要。质谱流式细胞技术将传统流式细胞分析方法与质谱检测方法相结合,拥有高通量、无需补偿计算、金属标签标记以及多样化数据处... 随着生命科学的不断发展及对单细胞分析手段越来越高的需求,传统的荧光流式细胞技术已不能满足科学家们的需要。质谱流式细胞技术将传统流式细胞分析方法与质谱检测方法相结合,拥有高通量、无需补偿计算、金属标签标记以及多样化数据处理等技术优势,可对细胞群体进行精确免疫分型、全面分析细胞内信号网络等,在造血、免疫、药物筛选等领域有着广泛的应用前景,开启了流式细胞技术的"后荧光时代"。本文将对质谱流式细胞仪发展史、工作原理、技术优势及其应用进行综述。 展开更多
关键词 流式细胞术 质谱分析法 治疗应用 临床实验室技术
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