基于SNP芯片猪早期选留的基因型填充效果研究

为探究基于SNP芯片猪早期选留基因型填充效果,本试验通过猪50K液相芯片对2 277头长白种猪进行检测,将2022年7月前出生的1 561头种猪作为50K液相芯片检测个体,从2022年7月及以后出生的716头种猪中筛选0%、5%、10%、15%、20%、30%、40%、50%、60%的种猪作为50K液相芯片检测个体,其余根据10K芯片位点信息抽取位点作为10K芯片检测个体。使用Beagle V5.4将10K芯片填充至50K芯片,重复10次。结果表明,与50K芯片相比,10K芯片各染色体标记数减少,平均间距增加,但各SNP间的连锁不平衡程度变化较小。将早期选留群体中的芯片检测比例从0%提升至60%的过程中,基因型一致性从0.942提升至0.986,相关系数从0.901提升至0.975。芯片检测比例从0%提升至5%时,基因型一致性与相关系数提升幅度最大。随着次等位基因频率(Minor Allele Frequencies,MAF)的提升,基因型一致性逐渐降低,同一MAF下不同检测比例基因型一致性变化逐渐增大。结果表明在早期选留阶段将基因芯片从10K填充至50K是可实施的,在早期选留群体中筛选部分个体进行高密度芯片检测有助于提升填充准确性。本研究可为猪早期选留10K芯片的应用及填充提供参考,降低猪早期选留芯片检测成本。

利用体细胞克隆技术扩繁超级公猪的应用价值分析

培育超级公猪用于生产优质商品猪是种猪育种企业的理想目标。常规育种技术选育种公猪时,受测定群体规模及选择强度的影响,仅能培育出少量的超级公猪。同时,少量的超级公猪受到时间、空间、公猪利用效率的限制,根本无法满足养猪业的巨大需求。利用体细胞克隆技术可以在不改变动物基因的前提下批量复制优秀个体。国内外多家单位通过体细胞克隆技术在地方猪遗传资源保护、猪育种新材料创制与新品种培育、人类疾病模型制备、人类异种器官移植、生物反应器等领域做了大量研究。本文对利用体细胞克隆技术扩繁超级公猪在养猪生产中的应用现状进行了综述,并分析和展望了其在养猪行业的巨大应用价值和广阔前景。

全自动核酸提取仪对不同类型ASFV、PEDV样品的提取效果

研究以非洲猪瘟病毒(ASFV)的各类型阳性样品以及流行性腹泻病毒(PEDV)阳性样品为检测对象,评测全自动核酸提取仪对DNA和RNA核酸的提取效果,旨在帮助动物疫病检测实验室了解如何评测全自动核酸提取仪是否满足检测需求。试验选用已经过检测结果为阳性的不同类型ASFV样本和PEDV阳性的粪便拭子样品,进行10倍梯度稀释并将检测结果与已知的检测原值进行对比。结果显示,试验使用的核酸提取仪的稳定性满足需求,但敏感性较差,可能存在环境、人员、车辆等病毒含量低的样品被漏检。在抗干扰方面,试验使用的核酸提取仪对咽喉拭子的核酸提取结果存在假阴性的情况;该仪器对肛门拭子和环境样品的抗干扰性不佳,也可能出现假阴性结果;该仪器不会受样品影响而检测出假阳性结果。

不同规格滤纸对甜菜粕中蔗糖测定结果的影响

为探究不同规格滤纸对甜菜粕中蔗糖测定结果的影响,采用同一产地、不同批次的甜菜粕1和甜菜粕2进行测定。结果表明,快速滤纸过滤的样液蔗糖峰面积会产生干扰现象,导致测量结果重复性差,结果偏大,相对标准偏差分别为20.00%、37.72%,为进一步验证快速滤纸对测定结果的影响,单独采用快速滤纸过滤进行二次测定,得到相对标准偏差分别为27.95%、23.93%,为保证实验结果的准确性,建议在测定甜菜粕蔗糖时使用中速或慢速滤纸。

面粉与竹粉在不同比例混合下间苯三酚试验及理化指标差异分析

在面粉中掺入不同比例的竹粉后,分析面粉和竹粉混合物的间苯三酚试验和理化指标差异。在纯面粉中分别掺入5%、10%、20%的不同粒度的竹粉,结合间苯三酚试验现象,对水分、粗蛋白质、粗灰分、粗纤维4个理化指标检测进行分析。结果表明:在间苯三酚试验中,面粉与竹粉混合物在不同粒度和不同视野下呈现出不同的形态。随着竹粉掺入比例的增加,混合试样中木质素含量显著增加,且与出现的红色深浅、分布疏密成正相关。在理化指标上,随着竹粉掺入比例的增加,混合试样的水分、粗蛋白含量呈下降趋势,粗灰分、粗纤维含量呈上升趋势。综上,结合间苯三酚试验及理化指标的增幅和降幅的绝对值,在面粉中掺入不同比例的竹粉对其影响程度排序为粗纤维>粗蛋白质>水分>粗灰分。

基于芯片数据估计不同方法对槐猪近交系数的影响

旨在选取适用的方法评估槐猪群体的近交情况。本试验采用“中芯一号”育种芯片分别计算Fhom1、Fhom2、Fvan1、Fvan2和Fyang来进行247头槐猪(300日龄)个体近交系数的估计,探究SNP数目对近交估计值的影响以及不同估计方法之间的相关性。结果发现,随着SNP数目增加,近交系数Fhom1、Fhom2、Fvan1和Fyang的极差逐渐减少,当SNP数目达到10000时近交系数趋于稳定,与质控后的31545个SNPs计算的近交系数接近。Fhom1、Fhom2、Fvan1、Fvan2和Fyang的值分别为-0.2165~0.3440、-0.3548~0.3217、-0.3228~0.8921、-0.2436~0.7909、-0.1894~0.5433。Froh1和Froh2的值分别为0.0087~0.4069和0.0022~0.4024。通过比较不同基因组近交系数Person相关与Spearman秩相关可知,Fhom1与Fhom2、Froh1、Froh5间有较强的正相关;Fvan2与Fvan1、Fyang间有较强的正相关;Froh1与Froh5间有较强的正相关;而Fhom2与Fvan1、Fvan2呈负相关。由于Froh的取值范围在0~1之间,与系谱近交系数相同,符合近交系数评估习惯;同时,Froh同Fhom、Fvan、Fyang等基因组近交系数评估方式有着一定的正相关,适用度高。SNP密度影响近交系数的评估,其数目与密度充足时,采用Froh进行基因组近交系数评估较为适宜,这可为评估地方猪的近交水平、防止近交衰退、优化选种选配方案提供有利的技术手段。

副干酪乳杆菌发酵液中抗菌肽的筛选及对副溶血性弧菌的抑菌作用

副溶血性弧菌是一种常见的食源性致病菌,严重威胁食品安全和人体健康。本研究利用超高效液相色谱-质谱联用技术鉴定副干酪乳杆菌发酵液中的多肽序列,并通过生物信息学筛选出可能的抗菌序列(RQQAENLAKFAKKG),命名为Yt9z。研究结果表明其对副溶血性弧菌的最低杀菌质量浓度(MBC)为125μg/mL,可在3 h内将细菌完全杀死。通过膜通透、透射电镜、DNA凝胶阻滞分析、圆二色谱等试验探究其抑菌机制,结果在不同溶液环境下,抗菌肽Yt9z能改变自身的二级结构,进而增加细菌细胞膜通透性,并穿透细胞膜与DNA结合使其死亡。这些发现为抗菌肽Yt9z应用于副溶血性弧菌污染提供了理论参考。

非洲猪瘟病毒p72重组蛋白单克隆抗体的制备及双抗体夹心ELISA方法的建立

为了建立一种快速检测非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的方法,试验利用GenBank中ASFV的p72基因(登录号为MK128995.1)序列构建原核重组表达质粒pGEX-6P-1-p72和真核重组表达质粒pCAGGS-myc-p72,通过大肠杆菌原核表达系统获得p72重组蛋白,将其纯化后免疫小鼠,获得阳性杂交瘤细胞,通过Western-blot和间接免疫荧光鉴定筛选单克隆细胞株,并用单克隆抗体亚类鉴定试剂盒鉴定各单克隆抗体的亚型。通过对p72兔源多克隆抗体包被浓度及纯化的3株单克隆抗体稀释度进行优化,初步建立检测ASFV的双抗体夹心ELISA方法,并用该方法测试纯化的3株单克隆抗体分别与p72兔源多克隆抗体两两组合后所能检测的p72重组蛋白的灵敏度。结果表明:p72重组蛋白大小为99 ku;以纯化的原核表达的p72重组蛋白作为抗原免疫3只小鼠,抗体效价均大于1∶10 000;经细胞融合、克隆和筛选共获得5株阳性杂交瘤细胞,将其分泌的单克隆抗体分别命名为2C4C8、2C4B8、5C11F11、5C11D12、7D10C9,5株单克隆抗体与真核表达的p72重组蛋白均可发生特异性反应;单克隆抗体2C4B8和2C4C8的亚型为IgG1,5C11D12和5C11F11的亚型为IgG2b,7D10C9的亚型为IgG2a,轻链亚类均为κ;单克隆抗体2C4C8、5C11D12、7D10C9所能检测的p72重组蛋白最低浓度分别为0.25,0.25,0.05μg/mL。说明以纯化的3株单克隆抗体建立的双抗体夹心ELISA方法可用于检测p72重组蛋白抗原,且该检测方法有较好的灵敏度。

利用SNP标记进行上杭槐猪群体系谱构建研究

为了对新组建的上杭槐猪保种群实施有效管理,维持群体遗传多样性,本研究通过“中芯一号”50K芯片对229头上杭槐猪DNA样本进行基因分型,并下载杜洛克猪、大白猪、长白猪等西方商业猪种60K芯片数据,合并后进行群体遗传结构分析,重构上杭槐猪保种群系谱并对上杭槐猪公猪群进行家系划分。结果显示:该上杭槐猪保种群与西方商业猪种群体在遗传结构上有明显区别,其个体种质资源纯正,是良好的保种材料。在5次重复系谱构建中,229个基因型个体亲缘关系均相同,系谱早期的22个虚拟个体及其所属亲缘关系在5次重复中均保持一致从而被保留。上杭槐猪保种群中公猪个体之间的亲缘关系较远,可划分为8个家系进行保种管理。本研究表明,通过数量丰富的SNP数据对多世代上杭槐猪群进行系谱构建与公猪家系划分以进行群体保种管理,可为上杭槐猪群体的保种工作提供科学的指导与建议。

杜洛克仔猪初生重对生长和繁殖性能的影响

本研究旨在对仔猪初生重进行表型与遗传分析,探究其对生长和繁殖性能的影响,为发挥其在选种过程中的价值奠定基础。实验选取某核心场近8年杜洛克仔猪生长和繁殖性状记录,利用DMU软件和动物模型估计了初生重的加性方差、窝效应方差、表型效应方差和残差方差,计算初生重的遗传力;并估计了杜洛克仔猪初生重与主要繁殖和生长性状之间的表型和遗传相关;此外,分析了随着初生重不断增加,其对应父系指数及各性状育种值的变化情况。结果表明:性别和年份季节效应对仔猪初生重均有极显著影响;仔猪初生重遗传力达到0.24;相关性分析表明:表型与遗传相关分析结果较为相近,初生重与达115 kg体重日龄呈中等负相关,与体长和达115 kg体重日增重呈中等正相关,与达115 kg体重背膘厚、眼肌面积、总仔数、活仔数和健仔数相关均接近于0。综上,依据仔猪初生重进行早期选择,能够对种猪生长速度起到较好的选择效果,但对其他性状影响较小,建议可通过淘汰较低初生重个体(1 kg以下)来达到初选目的。

酵母培养物在猪生产上的应用

禁抗大背景下,如何保证动物健康和提高动物的生产性能成为畜牧行业研究的热点。酵母培养物(YC)是一种营养活性物质。它具有调节肠道菌群平衡,提高动物免疫力、抗氧化能力,改善饲料适口性,促进营养物质的消化和提高动物的生长性能等优点。本文阐述了近年来国内外关于酵母培养物对猪生长性能、繁殖性能、肠道健康和免疫功能的影响,为后抗生素时代酵母培养物在猪生产上的广泛应用提供参考。

单宁的特性以及在猪上的研究进展

饲料中禁止使用除中草药外的所有促生长类药物迫使人们寻找抗生素的替代品。单宁是多酚类次级代谢物,广泛分布于植物中。因其具有抗氧化、抗炎、抗病毒、抗寄生虫和抗菌等特性而被广泛研究。本文阐述了不同来源的单宁及不同的添加剂量对猪生长性能、肠道形态和肠道菌群的影响,为单宁在养猪业上的应用提供参考。

N-氨甲酰谷氨酸对畜禽繁殖性能的影响

动物妊娠日粮中添加精氨酸可以改善胎儿发育,因为精氨酸在一氧化氮合酶的催化下产生的一氧化氮(NO)可以促进胎盘血管生成,增强从子宫到胎盘的血流,从而增加胎儿生长所需的营养和氧气。同时精氨酸也是合成多胺的原料,多胺在胚胎发生和胎盘生长中起关键作用。但精氨酸在哺乳动物中的生物半衰期相对较短,绵羊和母猪在妊娠105天时仅为45分钟左右,且其价格较高。

猪激素敏感脂肪酶(HSL)基因的研究概况

激素敏感脂肪酶（HSL）基因影响着脂肪的沉积，它在表达或活性上的轻微变异均有可能影响猪的背膘厚和瘦肉率。从激素敏感脂肪酶的功能及作用机制出发，通过候选基因策略克隆出HSL基因，将其精确定位于猪6号染色体6p1.1～1.2上；进而分析了HSL及其基因的分子结构，比较HSL基因在不同物种间的同源性。不同产肉型猪种间存在HSL基因的多态性，籍此可为了解猪脂肪沉积的基因效应、寻找与背膘厚及瘦肉率相连锁的分子标记提供通途，最终实现利用MAS、MAI等技术手段提高猪的瘦肉率。

猪前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)基因的遗传变异及其与繁殖性状相关性研究(英文)

前列腺素内过氧化物酶2是花生四烯酸合成前列腺素的限速酶,在包括排卵、受精、着床、分娩等一系列生殖过程中起着重要作用,因而编码该酶的基因是影响繁殖性状的重要候选基因。通过PCR-RFLP分析前列腺素内过氧化物酶2 基因在15个中外不同繁殖性能猪种中的遗传变异,结果表明,不同类型中国地方猪种和外来商业猪种在此基因位点上存在丰富的多态性,繁殖性能相对较好的江海型、华北型和华中型猪种中A等位基因表现为优势等位基因,卡方检验显示其基因频率分布与西方商业猪种及繁殖性能较低的高原型藏猪和华南型猪种差异均极为显著(P<0．001)。利用二花脸×杜洛克资源家系F2群体分析该基因与繁殖性状的相关性,在180头F2代母猪群体中,未能进一步证实该基因位点对总产仔数、产活仔数和死胎数3个繁殖性状存在显著影响(P=>0．05),但携带优势等位基因A的个体趋向于拥有较高的总产仔数、产活仔数和偏低的死胎数,鉴于该基因的重要作用,基于全基因序列的SNP扫捕和大样本群体的相关性分析仍很有必要。

氟烷基因对猪繁殖性能影响的研究

分析了氟烷基因型为NN 和Nn 的母猪间8 个繁殖性状指标,即窝总产仔数、窝产活仔数、初生窝重、初生个体重、28 日龄断奶窝重、28 日龄断奶头数、60 日龄成活头数以及60 日龄窝重等繁殖性状的差异。结果表明,NN 和Nn 型母猪间上述所有母性繁殖性状均无显著性差异( P> 0.05) ,但Nn 型母猪的窝总产仔数、窝产活仔数、初生窝重、60 日龄成活头数以及60 日龄窝重比NN 型要略高,而NN 型的初生个体重、28 日龄断奶窝重则比Nn 型略高。

江西省主要外来猪种氟烷基因分布频率的初步研究

从耳组织提取基因组DNA,利用PCR- RFLP技术检测了江西省三个主要外来猪种杜洛克97 头、长白102 头、大约克140 头共339 头种猪的氟烷基因型。结果表明:在所有三个品种中均没有检测到隐性纯合子nn;显性纯合子NN 和杂和子Nn 在上述三个品种中的基因型频率分别为95 .88% ,97.06 % ,91.43 % ,4.12 % ,2 .94% ,8 .57% ;等位基因n 的基因频率在上述三个品种分别为2 .06 % ,1.47% ,4 .29 % ,均显著低于国外同品种测定值,明显低于国内其他地方的报道。还分析了形成这种品种间和地域间氟烷基因分布频率差异的原因,并探讨了相应的育种策略。

乳化剂卵磷脂在猪生产应用中的研究进展

油脂是动物营养中的一类重要营养物质,在畜禽生产中,合理利用油脂可提高畜禽的生产性能以及饲料利用率。尽管油脂具有多种营养作用,但幼龄动物消化道发育不完善,胆汁酸和脂肪酶分泌不足,无法彻底消化吸收饲料中的油脂,多余的油脂则被幼龄动物排出体外。而成年动物日粮中的油脂添加比例高,消化分解油脂所需要的胆汁酸远远超过畜禽机体内能够分泌的量,无法彻底消化吸收油脂。乳化剂是一种表面活性剂,在饲料中添加乳化剂能够使油脂溶解在水中,大大提高了饲料油脂的消化和吸收。卵磷脂是动植物组织及卵黄中的一种含磷脂类物质,作为一种优质的乳化剂,卵磷脂除了广泛应用于食品行业外,还可以用于畜牧业,以显著提高动物的生长性能,增加机体对营养物质的吸收利用,提高动物生产的经济效益。本文阐述了卵磷脂在猪生产中的应用进展,为相关的研究和生产提供理论依据。

24个中外猪种(群)的AFLP多态性及其群体遗传关系

利用 12对AFLP引物组合检测了 19个中国地方猪种 (群 )、1个培育猪种和 4个欧美引进猪种混合基因组DNA的遗传变异 ,根据AFLP分析结果计算了 2 4个猪种 (群 )间的遗传相似系数 ,据此构建了UPGMA聚类关系图。结果表明 ,AFLP标记有着很高的多态检测效率 (Ai) ,平均每个引物组合检测到 17.3个多态标记 ,非常适合于猪种(群 )遗传多样性分析和品种鉴定 ;中国地方猪种与欧美引进猪种间的遗传分化十分明显 ,两类猪群间的亲缘关系较远 ;南昌白猪与大白猪、铅山黑猪与玉山黑猪有着极近的亲缘关系 ,分别与其育成历史、地理分布和RAPD分析结果相一致。另外还对部分猪种 (群 )的聚类分析结果与其形态学。