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中国野生大豆的遗传多样性和生态特异性分析
被引量:
50
1
作者
丁艳来
赵团结
盖钧镒
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期133-142,共10页
野生大豆(Glycine soja)是栽培大豆的祖先,为东亚特有种,大部分分布在中国。我们采用52对SSR引物和10个植物学性状,以遗传丰富度和Simpson多样性指数为指标,对来自中国3个地理生态区域涉及24个省区的196份野生大豆所构成的代表性样本的...
野生大豆(Glycine soja)是栽培大豆的祖先,为东亚特有种,大部分分布在中国。我们采用52对SSR引物和10个植物学性状,以遗传丰富度和Simpson多样性指数为指标,对来自中国3个地理生态区域涉及24个省区的196份野生大豆所构成的代表性样本的遗传变异进行了研究,以期从分子水平和表型水平两个层面上揭示中国野生大豆遗传多样性和地理生态特异性。结果表明:中国野生大豆群体SSR位点的等位基因平均丰富度(NA)和平均Simpson多样性指数(H)分别为16.1和0.852,高于栽培大豆(NA=11.4,H=0.773),野生群体的遗传多样性明显高于栽培群体。3个地理生态群体中南方群体多样性最高(NA=12.9,H=0.842),黄淮海群体最低(NA=11.4,H=0.805),东北群体居中(NA=12.5,H=0.834)。群体间存在遗传分化,不同群体具有不同的特异等位基因,位点AW132402(A2连锁群)、Satt522(F)、satt150(M)、Sat_332(D1a)、Satt046(K)、sct_190(K)等的一些等位基因只在特定群体出现,表现出群体分化后的生态特异性。中国野生大豆植物学性状的群体变异丰富,平均Simpson多样性指数为0.710。地理群体间存在分化,最明显的是生育期性状的分化,反映了地理、光照和温度等生态因子的选择作用,其中南方地理群体多样性最高(H=0.671)。SSR分子标记和植物学性状所获结果相对一致,表明中国野生大豆地理群体间性状分化有其遗传分化的基础。
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关键词
GLYCINE
SOJA
SSR标记
植物学性状
遗传多样性
遗传分化
下载PDF
职称材料
中国野生大豆群体特征和地理分化的遗传分析
被引量:
17
2
作者
范虎
赵团结
+2 位作者
丁艳来
邢光南
盖钧镒
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期414-425,共12页
【目的】从分子标记等位变异水平上探讨中国野生大豆群体的遗传特征、连锁不平衡特点和地理生态分化的遗传机制,并以重要生态性状全生育期为代表解析性状地理分化的遗传基础。【方法】从全国24个省区不同地理生态型的野生大豆材料中抽选...
【目的】从分子标记等位变异水平上探讨中国野生大豆群体的遗传特征、连锁不平衡特点和地理生态分化的遗传机制,并以重要生态性状全生育期为代表解析性状地理分化的遗传基础。【方法】从全国24个省区不同地理生态型的野生大豆材料中抽选174份组成代表性样本,选用204个SSR标记,利用TASSEL及STRUCTURE 2.2软件进行群体连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)和群体遗传结构分析。在此基础上对群体的地理分化、亚群体特异性及全生育期位点等位变异的地理分化进行遗传分析。【结果】中国野生大豆群体蕴含丰富的遗传变异,20条连锁群中,I和C2连锁群有相对较多的位点平均等位变异和遗传分化。不论是共线性组合,还是非共线性组合,都有一定程度的LD存在,说明历史上发生过连锁群间的大量重组;野生群体D′平均值为0.34,高值多,比栽培大豆高,说明野生群体发生过更多的重组,保留下较高的LD。采用H-W平衡模型将野生群体聚成4类,模型聚类亚群划分与地理生态分类相关、有交叉,推测各地理亚群体发生过材料的迁移。各地理亚群经长期自然选择,各位点等位基因的频率发生变化,还有新生的与绝灭的,因此,各地理亚群间产生明显的等位基因分化。与地理生态性状全生育期关联的有15个位点160个等位变异,其中,亚群特有等位变异共58个,来自14个位点,同一位点可以在多个亚群体产生不同的特有等位变异,其效应从南至北逐渐下降,这说明生态区间不仅有强烈的遗传分化,而且是有规律的遗传分化。【结论】中国野生大豆群体遗传多样性高,共线、非共线位点间连锁不平衡程度高,4个生态亚群体间位点高度遗传分化,产生大量地区特有等位变异,全生育期还表现由南向北降效的规律性遗传分化。
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关键词
野生大豆(Glycine
SOJA
Sieb.et
Zucc.)
SSR
连锁不平衡(LD)
群体结构
地理分化
全生育期遗传分化
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职称材料
遗传资源经济价值评价研究
被引量:
8
3
作者
王健民
薛达元
+7 位作者
徐海根
王智
张卫明
顾龚平
史瑞松
盖钧镒
赵团结
丁艳来
《农村生态环境》
CSSCI
CSCD
北大核心
2004年第1期73-77,共5页
初步建立了比较完整的遗传资源经济价值评估的框架、体系、平台 ,初步评估了人体基因、野生大豆、BT转基因棉的经济价值 ,为遗传资源市场化和国际遗传资源惠益分享提供科学依据 ,为进一步研究提供参考。
关键词
遗传资源
经济价值
评价
人体基因
野生大豆
BT转基因棉
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职称材料
分层次教学在高中化学教学中的应用
被引量:
2
4
作者
丁艳来
《中国科教创新导刊》
2011年第27期104-104,共1页
分层次教学是学校根据学生自身素质的不同,其中包括知识积累、能力水平和潜力倾向,把学生分开、分批、分层的科学管理化教学。这种教学模式充分调动学生学习积极性,使得教师能力得到较大开发和利用,是因材施教的科学方法。化学教学中应...
分层次教学是学校根据学生自身素质的不同,其中包括知识积累、能力水平和潜力倾向,把学生分开、分批、分层的科学管理化教学。这种教学模式充分调动学生学习积极性,使得教师能力得到较大开发和利用,是因材施教的科学方法。化学教学中应用分层次教学法是现代教学很普遍的,大致从两方面展开:(1)以班级为单位展开的分层次教学;(2)以个人情况而制定分层次教学任务。
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关键词
分层次
化学教学
应用
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职称材料
中国栽培及野生大豆的遗传多样性、地理分化和演化关系研究
被引量:
25
5
作者
文自翔
赵团结
+1 位作者
丁艳来
盖钧镒
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第21期3301-3310,共10页
栽培大豆的起源和演化是大豆生物学和农学基础研究的重要命题之一.本研究选用60对细胞核SSR标记(nuSSR)和11对叶绿体SSR(cpSSR)标记,在检测由393份地方品种和196份野生材料组成的全国代表性样本的细胞核、叶绿体基因组变异的基础上,分...
栽培大豆的起源和演化是大豆生物学和农学基础研究的重要命题之一.本研究选用60对细胞核SSR标记(nuSSR)和11对叶绿体SSR(cpSSR)标记,在检测由393份地方品种和196份野生材料组成的全国代表性样本的细胞核、叶绿体基因组变异的基础上,分析了栽培、野生地理生态群体间的遗传演化关系.结果表明:(ⅰ)野生群体核、质遗传多样性都明显大于栽培群体,核、质等位变异数分别为1067:980和57:44个;栽培大豆980个核等位变异中有377个(38.5%)为驯化后新生等位变异,44个质等位变异中出现了7个(15.9%)新生等位变异.(ⅱ)栽培生态类群中,以南方3个地理生态类群(中南、华南、西南)遗传多样性较高;野生生态类群中以长江中下游野生类群遗传多样性较高.(ⅲ)从分子方差分析、遗传聚类与地理类群间关联分析及群体特有等位变异三方面证实我国栽培、野生大豆地理生态分化有其遗传分化的基础.(ⅳ)以材料为单位的聚类结果表明与栽培大豆近缘的野生材料大多来自长江中下游及西南-中南野生地理类群;进一步分析地理群体间的遗传距离,并作UPGMA聚类,发现各栽培地理类群与长江中下游野生大豆群体的遗传距离一致,小于与包括本区在内的其他野生群体的距离,结合该区野生群体特有的cpDNA等位变异NTCP10-117在所有栽培生态类群中都有分布的现象,推论在南方野生群体中的长江中下游野生祖先可能是栽培大豆共同的野生祖先.
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关键词
栽培大豆
野生大豆
地理生态型
遗传多样性
遗传特异性
遗传分化
演化关系
原文传递
题名
中国野生大豆的遗传多样性和生态特异性分析
被引量:
50
1
作者
丁艳来
赵团结
盖钧镒
机构
南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期133-142,共10页
基金
国家自然科学基金(30671266,30490250)
国家重点基础研究发展规划项目(2006CB101708)
+3 种基金
国家863项目(2006AA100104)
国家科技支撑计划项目(2006BAD13B05-7)
长江学者和创新团队发展计划资助项目(PCSIRT)
教育部高等学校创新引智计划(B08025)
文摘
野生大豆(Glycine soja)是栽培大豆的祖先,为东亚特有种,大部分分布在中国。我们采用52对SSR引物和10个植物学性状,以遗传丰富度和Simpson多样性指数为指标,对来自中国3个地理生态区域涉及24个省区的196份野生大豆所构成的代表性样本的遗传变异进行了研究,以期从分子水平和表型水平两个层面上揭示中国野生大豆遗传多样性和地理生态特异性。结果表明:中国野生大豆群体SSR位点的等位基因平均丰富度(NA)和平均Simpson多样性指数(H)分别为16.1和0.852,高于栽培大豆(NA=11.4,H=0.773),野生群体的遗传多样性明显高于栽培群体。3个地理生态群体中南方群体多样性最高(NA=12.9,H=0.842),黄淮海群体最低(NA=11.4,H=0.805),东北群体居中(NA=12.5,H=0.834)。群体间存在遗传分化,不同群体具有不同的特异等位基因,位点AW132402(A2连锁群)、Satt522(F)、satt150(M)、Sat_332(D1a)、Satt046(K)、sct_190(K)等的一些等位基因只在特定群体出现,表现出群体分化后的生态特异性。中国野生大豆植物学性状的群体变异丰富,平均Simpson多样性指数为0.710。地理群体间存在分化,最明显的是生育期性状的分化,反映了地理、光照和温度等生态因子的选择作用,其中南方地理群体多样性最高(H=0.671)。SSR分子标记和植物学性状所获结果相对一致,表明中国野生大豆地理群体间性状分化有其遗传分化的基础。
关键词
GLYCINE
SOJA
SSR标记
植物学性状
遗传多样性
遗传分化
Keywords
Glycine soja, SSR marker, botanical traits, genetic diversity, genetic differentiation
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
中国野生大豆群体特征和地理分化的遗传分析
被引量:
17
2
作者
范虎
赵团结
丁艳来
邢光南
盖钧镒
机构
南京农业大学大豆研究所/农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期414-425,共12页
基金
国家重点基础研究发展计划("973"计划)项目(2009CB1184
2010CB1259
+4 种基金
2011CB1093)
国家自然科学基金项目(32671266
31071442)
教育部高等学校创新引智计划项目(B08025)
农业部公益性行业科研专项(200803060)
文摘
【目的】从分子标记等位变异水平上探讨中国野生大豆群体的遗传特征、连锁不平衡特点和地理生态分化的遗传机制,并以重要生态性状全生育期为代表解析性状地理分化的遗传基础。【方法】从全国24个省区不同地理生态型的野生大豆材料中抽选174份组成代表性样本,选用204个SSR标记,利用TASSEL及STRUCTURE 2.2软件进行群体连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)和群体遗传结构分析。在此基础上对群体的地理分化、亚群体特异性及全生育期位点等位变异的地理分化进行遗传分析。【结果】中国野生大豆群体蕴含丰富的遗传变异,20条连锁群中,I和C2连锁群有相对较多的位点平均等位变异和遗传分化。不论是共线性组合,还是非共线性组合,都有一定程度的LD存在,说明历史上发生过连锁群间的大量重组;野生群体D′平均值为0.34,高值多,比栽培大豆高,说明野生群体发生过更多的重组,保留下较高的LD。采用H-W平衡模型将野生群体聚成4类,模型聚类亚群划分与地理生态分类相关、有交叉,推测各地理亚群体发生过材料的迁移。各地理亚群经长期自然选择,各位点等位基因的频率发生变化,还有新生的与绝灭的,因此,各地理亚群间产生明显的等位基因分化。与地理生态性状全生育期关联的有15个位点160个等位变异,其中,亚群特有等位变异共58个,来自14个位点,同一位点可以在多个亚群体产生不同的特有等位变异,其效应从南至北逐渐下降,这说明生态区间不仅有强烈的遗传分化,而且是有规律的遗传分化。【结论】中国野生大豆群体遗传多样性高,共线、非共线位点间连锁不平衡程度高,4个生态亚群体间位点高度遗传分化,产生大量地区特有等位变异,全生育期还表现由南向北降效的规律性遗传分化。
关键词
野生大豆(Glycine
SOJA
Sieb.et
Zucc.)
SSR
连锁不平衡(LD)
群体结构
地理分化
全生育期遗传分化
Keywords
wild soybean (Glycine soja Sieb. et Zucc.)
simple-sequence repeat (SSR)
linkage disequilibrium (LD)
population structure
geographic differentiation
genetic differentiation of days to maturity
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
遗传资源经济价值评价研究
被引量:
8
3
作者
王健民
薛达元
徐海根
王智
张卫明
顾龚平
史瑞松
盖钧镒
赵团结
丁艳来
机构
国家环境保护总局南京环境科学研究所
中华全国合作总社南京野生植物研究院
南京农业大学
出处
《农村生态环境》
CSSCI
CSCD
北大核心
2004年第1期73-77,共5页
基金
"十五"国家重点科技攻关项目 ( 2 0 0 1BA6 11B -0 6 -0 3 -0 1)
文摘
初步建立了比较完整的遗传资源经济价值评估的框架、体系、平台 ,初步评估了人体基因、野生大豆、BT转基因棉的经济价值 ,为遗传资源市场化和国际遗传资源惠益分享提供科学依据 ,为进一步研究提供参考。
关键词
遗传资源
经济价值
评价
人体基因
野生大豆
BT转基因棉
Keywords
genetic resources
economic value
assessment
human genes
wild soybean
BT transgenic cotton
分类号
F062.1 [经济管理—政治经济学]
Q3 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
分层次教学在高中化学教学中的应用
被引量:
2
4
作者
丁艳来
机构
辽宁省盘锦市高级中学
出处
《中国科教创新导刊》
2011年第27期104-104,共1页
文摘
分层次教学是学校根据学生自身素质的不同,其中包括知识积累、能力水平和潜力倾向,把学生分开、分批、分层的科学管理化教学。这种教学模式充分调动学生学习积极性,使得教师能力得到较大开发和利用,是因材施教的科学方法。化学教学中应用分层次教学法是现代教学很普遍的,大致从两方面展开:(1)以班级为单位展开的分层次教学;(2)以个人情况而制定分层次教学任务。
关键词
分层次
化学教学
应用
分类号
G632 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
中国栽培及野生大豆的遗传多样性、地理分化和演化关系研究
被引量:
25
5
作者
文自翔
赵团结
丁艳来
盖钧镒
机构
南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第21期3301-3310,共10页
基金
国家自然科学基金(批准号:32671266)
国家重点基础研究发展计划(批准号:2006CB101708
+3 种基金
2009CB118404)
国家科技支撑计划(批准号:2006BAD13B05-7)
农业部公益性行业专项(批准号:200803060)
教育部高等学校创新引智计划(批准号:B08025)资助
文摘
栽培大豆的起源和演化是大豆生物学和农学基础研究的重要命题之一.本研究选用60对细胞核SSR标记(nuSSR)和11对叶绿体SSR(cpSSR)标记,在检测由393份地方品种和196份野生材料组成的全国代表性样本的细胞核、叶绿体基因组变异的基础上,分析了栽培、野生地理生态群体间的遗传演化关系.结果表明:(ⅰ)野生群体核、质遗传多样性都明显大于栽培群体,核、质等位变异数分别为1067:980和57:44个;栽培大豆980个核等位变异中有377个(38.5%)为驯化后新生等位变异,44个质等位变异中出现了7个(15.9%)新生等位变异.(ⅱ)栽培生态类群中,以南方3个地理生态类群(中南、华南、西南)遗传多样性较高;野生生态类群中以长江中下游野生类群遗传多样性较高.(ⅲ)从分子方差分析、遗传聚类与地理类群间关联分析及群体特有等位变异三方面证实我国栽培、野生大豆地理生态分化有其遗传分化的基础.(ⅳ)以材料为单位的聚类结果表明与栽培大豆近缘的野生材料大多来自长江中下游及西南-中南野生地理类群;进一步分析地理群体间的遗传距离,并作UPGMA聚类,发现各栽培地理类群与长江中下游野生大豆群体的遗传距离一致,小于与包括本区在内的其他野生群体的距离,结合该区野生群体特有的cpDNA等位变异NTCP10-117在所有栽培生态类群中都有分布的现象,推论在南方野生群体中的长江中下游野生祖先可能是栽培大豆共同的野生祖先.
关键词
栽培大豆
野生大豆
地理生态型
遗传多样性
遗传特异性
遗传分化
演化关系
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
Q943 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国野生大豆的遗传多样性和生态特异性分析
丁艳来
赵团结
盖钧镒
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2008
50
下载PDF
职称材料
2
中国野生大豆群体特征和地理分化的遗传分析
范虎
赵团结
丁艳来
邢光南
盖钧镒
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
17
下载PDF
职称材料
3
遗传资源经济价值评价研究
王健民
薛达元
徐海根
王智
张卫明
顾龚平
史瑞松
盖钧镒
赵团结
丁艳来
《农村生态环境》
CSSCI
CSCD
北大核心
2004
8
下载PDF
职称材料
4
分层次教学在高中化学教学中的应用
丁艳来
《中国科教创新导刊》
2011
2
下载PDF
职称材料
5
中国栽培及野生大豆的遗传多样性、地理分化和演化关系研究
文自翔
赵团结
丁艳来
盖钧镒
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009
25
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