基于基因表达谱的肝细胞癌过表达基因筛选

目的利用基因表达谱芯片技术筛选肝细胞癌(HCC)中表达上调最为明显的基因。方法利用Affymetrix U133 Plus2.0表达芯片检测93例HCC及配对癌旁肝组织的全基因表达谱。HCC与配对癌旁肝组织中基因表达的比较采用配对t检验,筛选表达上调最为明显的10个基因。各基因表达与临床病理参数的关系采用χ~2检验。结果与癌旁肝组织相比,HCC中表达上调倍数最多的10个基因分别为:CDKN3、CCL20、PTTG1、MELK、PRMT1、TOP2A、TPX2、SMYD3、TMEM106C和UCK2,上调25.2~44.6倍(均P≤2.0×10^(-22))。CCL20、PRMT1和UCK2基因表达与血清AFP有关,CCL20、PTTG1、PRMT1、TOP2A和UCK2基因表达与组织学Edmondson-Steiner分级有关,CCL20基因表达与TNM分期有关(均P<0.05)。结论筛选出HCC中表达上调最为明显的10个基因,将为HCC分子靶向治疗研究提供潜在靶点。

肝癌患者术后肝外转移相关DNA拷贝数变异分子标志初探

目的探讨肝细胞癌（HCC）患者术后肝外转移相关DNA拷贝数变异（CNA）的分子标志。方法采用微阵列比较基因组杂交技术检测66例HCC患者的全基因组CNAs。通过Cox生存模型分析CNAs与HCC术后肝外转移的相关性。结果单因素分析显示，6p21．32增益、15q11．2增益、20q12-13．13增益、4q12丢失和4q28．1—35．2丢失等5个CNAs与肝外转移风险显著相关（均P〈0．05）。多元逐步Cox回归分析显示，6p21．32增益（HR=3．65，95％CI=1．38～9．62）、4q28．1-35．2丢失（HR=0．24，95％CI=0．09～0．65）以及高血压病史和TNM分期是肝外转移风险的独立影响因素。6p21．32增益、6p21．32无增益／4q28．1—35．2丢失以及6p21．32无增益／4q28．1—35．2无丢失3组HCC患者的无转移生存期差异有统计学意义（P〈0．05）。结论6p21．32增益和4q28．1—35．2丢失是HCC患者术后肝外转移的独立预后因素，可用于肝外转移的风险预判。

肝癌术后无转移生存相关的基因拷贝数变异分析

目的探讨肝细胞癌（HCC）术后无肝外转移生存相关的基因拷贝数变异（CNA）分子标志物。方法采用微阵列比较基因组杂交技术检测66例HCC基因组DNA中的20个候选基因CNA，并与无肝外转移生存进行相关性分析。对数据采用Cox模型进行单因素、多因素及多元逐步回归生存分析。结果多因素Cox分析显示，MDM4增益[风险比（HR）=2．74，95％可信区间（CI）为1．18～6．37（P〈0．05）]、APC丢失（HR=8．43，95％口为2．48～28．66，P〈0．01）和BCL2L1增益（HR=3．45，95％CI为1．13～10．52，P〈0．05）是无转移生存的独立危险因素，而FBXW7丢失（HR=0．32，95％CI为0．12～0．89，P〈0．05）是独立保护因素。多元逐步Cox回归分析筛出MDM4增益（HR=2．71，95％CI为1．11～6．64，P〈0．05）、APC丢失（HR=7．19，95％CI为1．88～27．60，P〈0．005）和FBXW7丢失（HR=0．16，95％CI为0．05～0．46，P〈0．01）等3个无转移生存相关CNAs。MDM4增益（-）／APC丢失（-）／FBXW7丢失（＋）、MDM4增益（＋）和（或）APC丢失（＋）／FBXW7丢失（-）、其他组合等3组HCC患者术后无转移生存率差异有统计学意义P〈0．01）。结论MDM4增益、APC丢失和FBXW7丢失是HCC术后无转移生存的独立预后因素，可用于HCC术后肝外转移的风险预判。