白及蔗糖合酶基因结构与功能的生物信息学分析

目的蔗糖合酶(Sucrose Synthase)是植物蔗糖代谢途径中的关键酶,在植物的生长发育过程中具有重要作用。分析蔗糖合酶的核酸序列信息,预测其蛋白结构与功能,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要指导意义。方法将从白及转录组数据库中筛选得到蔗糖合酶核酸序列,采用生物信息学软件进行全长核酸序列信息与氨基酸结构分析。结果该基因全长2 957 bp,编码816氨基酸。蛋白结构预测表明分子量为93.09 k D,理论等电点(p I)为5.97。该蛋白质二级结构主要为α-螺旋结构和无规则卷曲结构,结构域分析则发现该蛋白含有蔗糖合酶功能域和糖基转移功能域。同时,该蛋白与铁皮石斛氨基酸序列高度相似,达91.54%。以其与15种近源物种的蔗糖合酶氨基酸序列构建进化树,分析表明白及与铁皮石斛在进化关系上最近。结论该基因具有典型蔗糖合酶的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守。