2013-2021年在沈阳地区持续传播的柯萨奇病毒A组6型的分子进化研究

手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD)是一种儿童常见的传染性疾病。持续的研究表明,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已经成为其主要病原。本研究为分析辽宁省沈阳地区CVA6的VP1区病原学特点及其分子进化特征,收集了2013-2021年沈阳地区手足口病患者标本,应用荧光定量PCR方法进行CVA6等肠道病毒核酸的检测,对CVA6核酸阳性标本应用RT-PCR方法针对VP1区全长进行扩增、核苷酸序列测定,使用MEGA软件进行遗传进化和氨基酸突变位点分析。结果表明2013-2021年间沈阳地区CVA6占肠道病毒阳性构成比的36.08%(1269/3517),2015年和2018年成为绝对优势流行株,分别为68.38%(240/351)和58.30%(316/542)。进化分析表明,2013-2021年间沈阳地区的CVA6均属于D3a基因型,其中2013-2014年CVA6位于D3a.1和D3a.2分支上,而2015-2021年毒株均位于D3a.2分支上。与参考株相比,沈阳地区CVA6的VP1蛋白上存在24个氨基酸突变位点。因此,CVA6为近年来沈阳地区手足口病的主要病原体之一,基于VP1区进化分析,可看出2013-2021年间沈阳地区CVA6均属于D3a基因型,且已由D3a.1分支进化到D3a.2分支,并持续流行至今。加强CVA6的持续性监测与病原特征分析,对HFMD的科学防控具有重要意义。

2020年西藏自治区0~5岁健康儿童肠道病毒的流行和分布

目的研究中国西藏自治区2020年0~5岁健康儿童中人肠道病毒的流行和分布。方法粪便标本取自2020年中国西藏自治区574名0~5岁的健康儿童。使用实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测粪便标本中的肠道病毒核酸。对肠道病毒核酸阳性的标本,采用逆转录PCR扩增肠道病毒VP1区并进行序列测定和分析,根据测定的序列进行肠道病毒分子分型。结果574例样本中检出肠道病毒(enterovirus,EV)核酸阳性89份(15.98%),EV-B检出最多,检出率为10.98%,EV-A和EV-C检出率分别为3.66%和0.87%,未发现EV-D。共鉴定出17种血清型,主要血清型为E11(7.67%),其次为EV-A71(1.74%)。各年龄组感染率存在一定的差异,呈现为随着年龄的增大感染率逐渐降低的现象,0岁和1岁组感染率分别为23.4%和25.0%,而在5岁组感染率降为最低,仅为5.8%。结论西藏自治区健康儿童粪便样本EV病原谱中以EV-B为主。序列分析提示了西藏自治区EV流行的广泛性及多样性,以EV-A71和E11为代表的几种EV型别在西藏自治区相对常见,有导致较严重疾病的潜力,需要进行更加严格的监测。

2020年西藏自治区0~5岁健康儿童携带埃可病毒11型的基因特征分析

目的本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型(echovirus11,E11)的基因特征进行研究,掌握肠道病毒的流行情况,填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康儿童的粪便标本,通过病毒分离和肠道病毒分子定型方法,对阳性病毒分离物进行肠道病毒血清型鉴定,并对鉴定结果为E11的病毒分离物进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定和分析。使用MEGA软件构建基因进化树(最大似然法),与中国其他省份E11和全球E11进行遗传进化分析。结果574份粪便标本中分离到89株肠道病毒分离株,其中E11有44株,是主要的血清型,VP1区核苷酸序列之间的相似性为96.4%~100%,在系统发育树上呈现为多个传播链,但均属于D5基因亚型,且与我国2017年后其它省份E11流行株聚为一簇。结论本研究获得了我国西藏自治区流行的E11的基因特征的基本信息,并了解了全球E11的基因型分布。