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基于转录组测序的花斑裸鲤SSR、SNP和InDel位点特征分析
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作者 贺彩霞 李长忠 +8 位作者 金文杰 保长虹 简生龙 李昭楠 王丽楠 严青春 王振吉 王国杰 陈艳霞 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期48-56,共9页
为利用分子标记规模化开发与辅助花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)良种选育,以花斑裸鲤(2+龄)的鳃、肾脏和肝脏组织为材料,经总RNA提取和cDNA文库构建后采用Illumina Novaseq 2000平台进行转录组测序,并采用MISA和GATK3软件分析转录组的SS... 为利用分子标记规模化开发与辅助花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)良种选育,以花斑裸鲤(2+龄)的鳃、肾脏和肝脏组织为材料,经总RNA提取和cDNA文库构建后采用Illumina Novaseq 2000平台进行转录组测序,并采用MISA和GATK3软件分析转录组的SSR、SNP和插入缺失标记(InDel)位点特征。结果表明:在486221条Unigenes序列中共发现了128727个SSR,出现频率为26.47%,平均每3.76 kb出现1个SSR;花斑裸鲤SSR包括6个重复类型,以单碱基和二碱基重复基元类型为主,分别占总SSR位点数的46.53%和42.45%,重复基元类型共77种,其中,A/T和AC/GT两种基元的出现频率最高,是花斑裸鲤SSR的优势重复基元;所有重复次数中出现次数最多的为5~15次,占所有SSR位点的87.52%;通过GATK3软件搜索得到399080个SNP位点,转换类型多于颠换类型,分别占总SNP的56.29%和43.71%,转换类型中A/G发生频率略高于C/T,而颠换类型中A/T发生频率最高,C/G发生频率最低;InDel分析显示,从花斑裸鲤转录组Unigenes中共筛选出254065个InDel位点,平均每1903 bp出现1个InDel位点,且SNP位点和InDel位点均以含1个位点的Unigenes数最多。研究表明,花斑裸鲤转录组中SSR、SNP和InDel位点非常丰富,这些位点对花斑裸鲤种质资源鉴定、种群遗传学研究及保护管理具有重要价值。 展开更多
关键词 花斑裸鲤 转录组 分子标记 SSR SNP INDEL
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花斑裸鲤MSTN-1基因克隆及表达特性分析
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作者 贺彩霞 李长忠 +8 位作者 保长虹 王丽楠 严青春 金文杰 赵娟 王国杰 简生龙 王振吉 陈艳霞 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期228-238,共11页
花斑裸鲤是黄河上游重要的冷水性土著鱼类,其生长、发育缓慢,性成熟又较晚,故多年来其种群一直呈下降趋势。MSTN(肌肉生长抑制素)是一种对肌肉生长具有负调控作用的因子,通过克隆花斑裸鲤MSTN-1基因并检测其表达特性,为花斑裸鲤生长缓... 花斑裸鲤是黄河上游重要的冷水性土著鱼类,其生长、发育缓慢,性成熟又较晚,故多年来其种群一直呈下降趋势。MSTN(肌肉生长抑制素)是一种对肌肉生长具有负调控作用的因子,通过克隆花斑裸鲤MSTN-1基因并检测其表达特性,为花斑裸鲤生长缓慢的分子调控机理提供基础资料。采用PCR、5′-RACE和3′-RACE法获得花斑裸鲤MSTN-1基因全长cDNA序列,采用qPCR检测MSTN-1基因在花斑裸鲤不同组织的表达特征和在不同鲤科鱼类肌肉组织中的差异性表达。花斑裸鲤MSTN-1基因的cDNA序列全长为2190 bp,其中ORF长1128 bp,5′UTR长96 bp,3′UTR长966 bp,共编码375个氨基酸。该蛋白是带有一个信号肽、无跨膜结构的不稳定亲水性分泌蛋白,主要分布在细胞核、线粒体和细胞质中。MSTN-1蛋白质二级结构以无规卷曲为主,存在2个TGF-β结构域:即TGF-β前肽区域(37—268 aa)和TGF-β功能区域(281—375 aa),有1个蛋白酶水解位点RIRR和9个位于TGF-β功能区域保守的半胱氨酸残基。氨基酸序列同源性分析表明,花斑裸鲤MSTN-1氨基酸序列与其他鲤科鱼类MSTN-1具有较高的相似性,而与禽类和哺乳动物的相似性较低。系统发育分析显示,花斑裸鲤MSTN-1与其他鲤科鱼类聚于同一进化支。qPCR检测结果表明,MSTN-1在花斑裸鲤的脑、肌肉、鳃、心、肝脏和肾脏组织中均有表达,但在脑和肌肉组织中表达量较高。该基因在不同鲤科鱼类肌肉组织中均有表达,在青海湖裸鲤肌肉组织中的表达量最高,其次在花斑裸鲤和黄河鲤鱼肌肉组织中。通过克隆获得花斑裸鲤MSTN-1基因cDNA序列,进行生物信息学分析和qPCR检测,MSTN-1在这几种土著鱼类肌肉组织中的特征性表达差异有助于进一步了解高原鱼类生长缓慢的分子机理。 展开更多
关键词 花斑裸鲤 肌肉生长抑素(MSTN) 基因克隆 RACE 基因表达
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NF-κB的活性对TRAIL诱导肿瘤凋亡的影响研究进展 被引量:2
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作者 严青春 熊小亮 +1 位作者 俞薇薇 龚自力 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期239-241,共3页
关键词 NF-ΚB TRAIL 肿瘤 凋亡
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PDTC增强TRAIL对人Burkitt淋巴瘤细胞株Raji细胞凋亡的影响
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作者 严青春 熊小亮 +2 位作者 肖雯 鄢敏 况小东 《江西医学院学报》 CAS 2009年第3期11-14,共4页
目的研究肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)联合吡咯烷二硫代氨基甲酸盐(PDTC)对EBV阳性的人Burkitt淋巴瘤细胞株Raji细胞凋亡的影响,并初步探讨其作用机制。方法应用MTT法检测TRAIL(1、10、100 ng/mL)及TRAIL(1、10、100 ng/mL)+100... 目的研究肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)联合吡咯烷二硫代氨基甲酸盐(PDTC)对EBV阳性的人Burkitt淋巴瘤细胞株Raji细胞凋亡的影响,并初步探讨其作用机制。方法应用MTT法检测TRAIL(1、10、100 ng/mL)及TRAIL(1、10、100 ng/mL)+100μmol/mL PDTC时Raji细胞的生长抑制率;原位末端酶标记技术(TUNEL)检测Raji凋亡细胞。结果①TRAIL 1、10 ng/mL组12 h Raji细胞生长抑制率分别为-35.52%及-15.07%;TRAIL 100 ng/mL组12 h Raji细胞生长抑制率为6.68%,并且呈时间依赖性(P<0.05)。②TRAIL(1、10、100 ng/mL)加入PDTC后,12 h Raji细胞生长抑制率分别为1.18%、4.96%、14.63%,均显著高于TRAIL单用组(均P<0.01)。③TRAIL(100 ng/mL)联合PDTC时Raji细胞凋亡指数最高为79.49%,较TRAIL100 ng/mL(28.84%)有显著性升高,1、10 ng/mL TRAIL联合PDTC后Raji凋亡细胞也均显著高于TRAIL单用组(均P<0.01)。与MTT法检测结果具有一致性。结论TRAIL能诱导Raji细胞凋亡但作用不敏感。PDTC能显著增强TRAIL对Raji细胞的诱凋亡作用。 展开更多
关键词 PDTC TRAIL RAJI细胞 细胞凋亡
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妊娠合并先天性心血管疾病病人的临床护理 被引量:1
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作者 严青春 刘碧雯 《赣南医学院学报》 2006年第4期634-635,共2页
目的:探讨妊娠合并心血管疾病病人的临床护理。方法:对301例妊娠合并先天性心血管疾病病例进行回顾性分析。结果:孕产妇心功能越差,孕产妇和围产儿的危险系数越高。结论:加强护理与监测,可明显降低孕产妇和围产儿的死亡率,并使先天性心... 目的:探讨妊娠合并心血管疾病病人的临床护理。方法:对301例妊娠合并先天性心血管疾病病例进行回顾性分析。结果:孕产妇心功能越差,孕产妇和围产儿的危险系数越高。结论:加强护理与监测,可明显降低孕产妇和围产儿的死亡率,并使先天性心脏病孕妇顺利渡过孕产期。 展开更多
关键词 妊娠 先天性心脏病 护理
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妊娠期急性脂肪肝的护理 被引量:2
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作者 冯云 严青春 《赣南医学院学报》 2013年第5期756-758,共3页
妊娠期急性脂肪肝(acutefattyliverofpregnancy,AFLP)是临床上很罕见但可致命的一种疾病,多发生于妊娠晚期或者产后早期。AFLP的发病率为1/1万~1/1.5万,其病理特点是肝细胞内微囊泡脂肪浸润而未见炎症或者坏死,目前认为AFLP... 妊娠期急性脂肪肝(acutefattyliverofpregnancy,AFLP)是临床上很罕见但可致命的一种疾病,多发生于妊娠晚期或者产后早期。AFLP的发病率为1/1万~1/1.5万,其病理特点是肝细胞内微囊泡脂肪浸润而未见炎症或者坏死,目前认为AFLP的发病是与五种长链3一羟酰基辅酶A脱氢酶酶(chain3-hydroxyacyl—CoAdehydrogenase,LCHAD)缺陷有关。以前本病病死率很高,产妇和婴儿分别是75%和85%,近年来随着对本病诊治水平的提高已下降至18%. 展开更多
关键词 妊娠 急性脂肪肝 护理
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苏子降气丸联合多索茶碱片对支气管哮喘气道重构的影响研究 被引量:3
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作者 严青春 张莹 《中国药物与临床》 CAS 2021年第19期3320-3323,共4页
支气管哮喘是一类常见的呼吸系统疾病,临床常表现为咳嗽、气促、憋闷、肺部有音等,在长期发作状态下,该病会合并慢性阻塞性肺炎、肺源性心脏病等,对患者呼吸、心脏造成极大的影响,严重威胁了患者的身心健康^([1])。针对支气管哮喘,应秉... 支气管哮喘是一类常见的呼吸系统疾病,临床常表现为咳嗽、气促、憋闷、肺部有音等,在长期发作状态下,该病会合并慢性阻塞性肺炎、肺源性心脏病等,对患者呼吸、心脏造成极大的影响,严重威胁了患者的身心健康^([1])。针对支气管哮喘,应秉持着见效快、疗效好的目的来改善患者的呼吸状态。近年来,随着医疗技术的不断进步,该病控制效果已逐渐理想^([2])。 展开更多
关键词 肺源性心脏病 呼吸状态 支气管哮喘 气道重构 呼吸系统疾病 慢性阻塞性肺炎 多索茶碱片 苏子降气丸
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粒细胞集落刺激因子对急性白血病化疗后免疫功能的影响及感染预防价值的分析 被引量:3
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作者 姚燕琴 周芳 严青春 《贵州医药》 CAS 2021年第9期1364-1365,共2页
目的探讨G-CSF对急性白血病化疗后免疫功能影响及感染预防价值。方法90例行化疗治疗的急性白血病患者,所有患者除予以各项对症支持及抗感染治疗外,均加予G-CSF治疗。将患者按G-CSF每日用量分为A组(5μg/kg)、B组(10μg/kg)、C组(15μg/... 目的探讨G-CSF对急性白血病化疗后免疫功能影响及感染预防价值。方法90例行化疗治疗的急性白血病患者,所有患者除予以各项对症支持及抗感染治疗外,均加予G-CSF治疗。将患者按G-CSF每日用量分为A组(5μg/kg)、B组(10μg/kg)、C组(15μg/kg)各30例。观察三组患者治疗前后T细胞亚群(CD4^(+)、CD8^(+)、CD4^(+)/CD8^(+))比值变化情况,治疗前后Ig、IgG、IgM水平变化情况,并比较三组患者治疗后相关感染的预防效果。结果治疗后三组患者CD4^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)比值均升高,CD8^(+)值下降明显,且C组优于B组,B组优于A组(P<0.05)。治疗7,14 d,三组患者免疫球蛋白IgA、IgG、IgM水平均逐渐升高,且治疗14 d时,C组优于B组,B组优于A组;治疗后,C组总感染率明显低于B组,且B组的总感染率明显低于A组(P<0.05)。结论在原有各项对症及抗感染治疗的基础上,加予粒细胞集落刺激因子治疗,能显著提升患者的临床治疗效果,且可以有效调节机体的T细胞亚群,改善外周血中性粒细胞缺乏情况,增强患者免疫功能,且不会对患者造成明显不适,安全性更高。 展开更多
关键词 急性白血病 粒细胞集落刺激因子 免疫功能 感染预防价值
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小学数学课堂教学中学生思维能力培养的实效性分析
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作者 严青春 《课堂内外(小学教研)》 2022年第S01期113-115,共3页
数学作为小学阶段学习的重要课程,其不仅受到学校的普遍重视,而且数学知识的学习也是提高学生逻辑思维能力以及独立思考能力的有效途径,因此,小学时期的数学学习在学生的学习乃至未来成长过程中都发挥着不可或缺的重要作用。培养学生的... 数学作为小学阶段学习的重要课程,其不仅受到学校的普遍重视,而且数学知识的学习也是提高学生逻辑思维能力以及独立思考能力的有效途径,因此,小学时期的数学学习在学生的学习乃至未来成长过程中都发挥着不可或缺的重要作用。培养学生的数学思维能力不仅是数学教学的核心内容,也是提升学生认知水平的重要途径。所以,在新课程改革不断推进的背景下,教师应当结合学生的实际学习情况,借助数学课堂教学不断增强学生的数学思维能力。 展开更多
关键词 小学数学 课堂教学 数学思维能力
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我院抗生素的临床应用及分析
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作者 严青春 《内蒙古中医药》 2012年第3期74-74,共1页
目的:探讨抗生素使用特点,为临床合理选用提供依据。方法:收集2008年5月-2011年5月解我院内科住院病人感染性疾病种类、抗生素消耗量。结果:感染性疾病为下呼吸道感染、肺炎与上呼吸道感染,应用的抗生素为头孢菌素类、青霉素类、碳青霉... 目的:探讨抗生素使用特点,为临床合理选用提供依据。方法:收集2008年5月-2011年5月解我院内科住院病人感染性疾病种类、抗生素消耗量。结果:感染性疾病为下呼吸道感染、肺炎与上呼吸道感染,应用的抗生素为头孢菌素类、青霉素类、碳青霉烯类。结论:我院抗生素应用多,可能与感染疾病患者多有关,要尽量控制头孢菌素抗生素的应用。 展开更多
关键词 抗生素 感染 头孢菌素
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西洛他唑联合阿司匹林及氯吡格雷治疗老年脑血管疾病神经介入后抗血栓作用的疗效及安全性 被引量:4
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作者 刘云兵 严青春 《血栓与止血学》 CAS 2021年第6期956-957,共2页
目的探讨西洛他唑片联合阿司匹林片、氯吡格雷片治疗老年脑血管疾病神经介入后抗血栓作用的疗效及安全性。方法以80例接受介入治疗的老年脑血管疾病患者为对象。分为对照组与观察组,对比两组疗效及安全性。结果两组治疗后血浆黏度、全... 目的探讨西洛他唑片联合阿司匹林片、氯吡格雷片治疗老年脑血管疾病神经介入后抗血栓作用的疗效及安全性。方法以80例接受介入治疗的老年脑血管疾病患者为对象。分为对照组与观察组,对比两组疗效及安全性。结果两组治疗后血浆黏度、全血黏度切变率、相对血液黏度切变度水平降低,观察组低于对照组(P<0.05)。两组治疗后活化部分凝血活酶时间(aPTT)、凝血酶原时间(PT)水平升高,血细胞比容(HCT)、纤维蛋白原(Fbg)水平降低,观察组变化幅度高于对照组(P<0.05)。两组治疗后血小板抑制率(PIR)水平升高,血小板聚集率(PAgT)水平降低,观察组变化幅度高于对照组(P<0.05)。观察组缺血性并发症发生率低于对照组(2.50%vs 17.50%;χ^(2)=5.000,P=0.025)。结论西洛他唑、阿司匹林、氯吡格雷用于接受介入术治疗的老年脑血管疾病患者可有效改善患者的凝血功能,抑制血小板的聚集,减少缺血性并发症的发生。 展开更多
关键词 西洛他唑 阿司匹林 氯吡格雷 脑血管疾病 疗效 安全性
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类风湿性关节炎临床用药不良反应对比分析 被引量:1
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作者 严青春 《中国伤残医学》 2014年第11期151-152,共2页
目的:观察探讨类风湿性关节炎临床用药的不良反应。方法:类风湿关节炎患者56例根据随机抽签法分为治疗组与对照组各28例,治疗组给予甲氨蝶呤治疗,对照组给予布洛芬治疗,治疗3个月。结果:治疗后治疗组的压痛关节数、肿胀关节数和... 目的:观察探讨类风湿性关节炎临床用药的不良反应。方法:类风湿关节炎患者56例根据随机抽签法分为治疗组与对照组各28例,治疗组给予甲氨蝶呤治疗,对照组给予布洛芬治疗,治疗3个月。结果:治疗后治疗组的压痛关节数、肿胀关节数和晨僵时间都明显少于对照组(P〈0.05)。治疗中治疗组的头痛、眩晕、失眠、嗜睡等不良反应发生率明显少于对照组(P〈0.05)。结论:类风湿性关节炎临床用药要注重合理用药,从而改善预后与降低不良反应。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 临床用药 不良反应
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