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野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
宋辉
赵术珍
+4 位作者
侯蕾
乔善良
赵传志
李爱芹
王兴军
《山东农业科学》
2015年第10期1-7,共7页
脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 ...
脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 AdLOX1~18和 AiLOX1~18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现,Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。
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关键词
野生花生
LOX
基因家族
抗病
系统发育
选择压力
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题名
野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
宋辉
赵术珍
侯蕾
乔善良
赵传志
李爱芹
王兴军
机构
山东省农业科学院生物技术研究中心
鱼台县林业局
出处
《山东农业科学》
2015年第10期1-7,共7页
基金
"十二五"国家"863"计划项目(2013AA102602)
山东省生物资源创新项目
文摘
脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 AdLOX1~18和 AiLOX1~18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现,Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。
关键词
野生花生
LOX
基因家族
抗病
系统发育
选择压力
Keywords
Wild peanut
LOX gene family
Disease resistance
Phylogeny
Selection pressure
分类号
S656.201 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析
宋辉
赵术珍
侯蕾
乔善良
赵传志
李爱芹
王兴军
《山东农业科学》
2015
4
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