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三种盐生植物与三种甜土植物HKT1生物信息学比较分析
被引量:
4
1
作者
郭晓农
柴薇薇
+3 位作者
习思羽
郭鹏辉
柏家林
马忠仁
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第16期5263-5275,共13页
为研究三种盐生植物与三种甜土植物中高亲和性钾离子转运蛋白(HKT1)在结构和功能等方面的差异,本研究运用生物信息学方法预测并分析三种盐生植物与三种甜土植物HKT1的理化特性、氨基酸组成、亲/疏水性、N-糖基化位点、信号肽、跨膜结构...
为研究三种盐生植物与三种甜土植物中高亲和性钾离子转运蛋白(HKT1)在结构和功能等方面的差异,本研究运用生物信息学方法预测并分析三种盐生植物与三种甜土植物HKT1的理化特性、氨基酸组成、亲/疏水性、N-糖基化位点、信号肽、跨膜结构域及其同源进化关系等,对预测及分析数据进行分类对比,总结共性且筛选差异性。结果表明:三种盐生植物和三种甜土植物的HKT1氨基酸组成、亲/疏水性、N-糖基化位点差异不明显,但是信号肽、同源序列分析及多重序列比对分析存在明显的差异,上述差异可为改良和育种耐盐碱性基因工程作物提供一定的理论依据。
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关键词
盐生植物
甜土植物
高亲和性钾离子转运蛋白(HKT1)
序列分析
原文传递
题名
三种盐生植物与三种甜土植物HKT1生物信息学比较分析
被引量:
4
1
作者
郭晓农
柴薇薇
习思羽
郭鹏辉
柏家林
马忠仁
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
兰州大学草地农业科技学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第16期5263-5275,共13页
基金
国家自然基金(31760242)
西北民族大学“双一流”引导专项生物工程特色学科(1001070204)
西北民族大学“一优三特”中央高校基本科研业务费(31920180132)和西北民族大学本科教学建设项目(2017XJJG-07)共同资助
文摘
为研究三种盐生植物与三种甜土植物中高亲和性钾离子转运蛋白(HKT1)在结构和功能等方面的差异,本研究运用生物信息学方法预测并分析三种盐生植物与三种甜土植物HKT1的理化特性、氨基酸组成、亲/疏水性、N-糖基化位点、信号肽、跨膜结构域及其同源进化关系等,对预测及分析数据进行分类对比,总结共性且筛选差异性。结果表明:三种盐生植物和三种甜土植物的HKT1氨基酸组成、亲/疏水性、N-糖基化位点差异不明显,但是信号肽、同源序列分析及多重序列比对分析存在明显的差异,上述差异可为改良和育种耐盐碱性基因工程作物提供一定的理论依据。
关键词
盐生植物
甜土植物
高亲和性钾离子转运蛋白(HKT1)
序列分析
Keywords
Halophytes
Glycophytes
High-affinity K+ transporter (HKT1)
Sequence analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三种盐生植物与三种甜土植物HKT1生物信息学比较分析
郭晓农
柴薇薇
习思羽
郭鹏辉
柏家林
马忠仁
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
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参考文献
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