新疆克孜勒苏柯尔克孜地区帕米尔牦牛mtDNA COⅠ的遗传多样性分析

为了更好地保护和开发我国新疆的牦牛遗传资源,对新疆克孜勒苏柯尔克孜地区帕米尔牦牛的遗传多样性及群体遗传结构进行了分析。对3个帕米尔牦牛类群的线粒体COⅠ基因序列进行测定,分析其多态性,构建系统进化树。研究结果显示,帕米尔牦牛COⅠ基因序列全长为1048 bp,共检测到13个变异位点,其中单态突变位点9个,简约信息位点4个。在帕米尔牦牛类群中共检测出10种单倍型,平均单倍型多样性(haplotype diversity,H_(d))、平均核苷酸多样性(nucleotide diversity,Pi)分别为0.762和0.00164。3个类群间平均遗传距离为0.00430,且苏木塔什牦牛与布伦口牦牛的遗传距离最小(0.00372)。结果表明,帕米尔牦牛具有丰富的遗传多样性,但各类群之间遗传分化不明显,且经人工或自然选择后群体发生了扩张和基因交流的情况。研究结果为新疆帕米尔牦牛的遗传改良及新疆优良畜禽遗传资源的保护和开发提供了科学依据。

新疆帕米尔牦牛群体线粒体DNA的遗传多样性及系统进化分析

为了从分子水平上探究新疆帕米尔牦牛群体的遗传多样性、亲缘关系,为帕米尔牦牛种质资源的保护与利用提供参考依据,该研究以克孜勒陶牦牛、布伦口牦牛、吉根牦牛、哈拉峻牦牛、库兰萨日克牦牛、苏木塔什牦牛等6个帕米尔牦牛类群的111头牦牛为研究对象,测定牦牛mtDNAD-loop区序列,分析其多态性,构建系统进化树。结果表明:帕米尔牦牛mtD-NAD-loop区序列长度为895~916bp,共检测到111个变异位点,其中单态突变位点36个,简约信息位点75个;在111头个体中共检测出33种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.9206、0.02613;6个类群间平均遗传距离为0.027,哈拉峻牦牛与克孜勒陶牦牛间遗传距离最小(0.019)。以上结果表明,帕米尔牦牛具有丰富的遗传多样性,苏木塔什牦牛、哈拉峻牦牛是较纯的牦牛类群,其它牦牛类群在进化过程中出现相互交流的情况。