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我国首次发现的HIV-1和HIV-2双重感染样品中病毒部分基因的序列特征分析
被引量:
4
1
作者
邢辉
潘品良
+5 位作者
冯毅
林旭东
于健石
龚新昌
戴玉琳
邵一鸣
《病毒学报》
CSCD
北大核心
2000年第2期111-115,共5页
上海市卫生检疫局送检了一例HIV - 1和HIV - 2抗体检测均呈阳性的双重感染样品 ,对其感染的HIV前病毒的 gag和env基因区进行了序列分析 ,首次阐明我国发现的HIV双重感染样品的HIV部分基因特征。从HIV感染者淋巴细胞 (peripheralbloodmon...
上海市卫生检疫局送检了一例HIV - 1和HIV - 2抗体检测均呈阳性的双重感染样品 ,对其感染的HIV前病毒的 gag和env基因区进行了序列分析 ,首次阐明我国发现的HIV双重感染样品的HIV部分基因特征。从HIV感染者淋巴细胞 (peripheralbloodmononuclearcells,PBMC)中提取前病毒DNA ,分别使用HIV 1和HIV 2特异性引物用套式PCR扩增HIV 1和HIV 2的部分基因区。PCR产物不经克隆直接测序 ,经GenBank检索并使用GCG软件包进行序列分析。结果表明 ,其中感染的HIV 2毒株中gag基因区与德国株HI2PEI2KR相似 ,基因离散率仅为8 1% ,env基因C2 -V3区与来自几内亚比绍的HIV 2U0 5 35 8株最近 ,离散率为 13 0 4% ,在其 gp36区发现与HIV 2U0 5 35 8基因离散率为 10 6 3% ,两个毒株均属HIV 2中的A亚型。而其HIV 1型毒株在 gag和env区都与从尼日利亚分离的H92NG0 83株相似 ,属HIV 1的G亚型。本文首次对我国发现的HIV 2型毒株进行了主要基因区的序列分析 ,表明在非洲较常见的HIV 2A亚型和HIV 1G亚型毒株 ,已随援外劳工传入我国。
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关键词
双重感染
序列分析
系统树分析
HIV-1
HIV-2
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职称材料
重庆市HIV-1样本的亚型分析及G亚型HIV-1毒株在我国的发现
被引量:
10
2
作者
韩梅
付宗道
+8 位作者
于友健
钱天学
贾庆良
王豫林
冯毅
邢辉
潘品良
于健石
邵一鸣
《中国性病艾滋病防治》
2000年第2期89-91,共3页
目的 分析重庆市高危人群中HIV-1亚型的流行情况。方法 对采自重庆市经性传播和静脉吸毒途径感染的3份HIV-1阳性外周血分离PBMC,扩增env基因C_2-V_3区核酸片段,并进行核苷酸序列分析。结果 在其中一孕妇体内发现一株G亚型HIV-1毒株序列...
目的 分析重庆市高危人群中HIV-1亚型的流行情况。方法 对采自重庆市经性传播和静脉吸毒途径感染的3份HIV-1阳性外周血分离PBMC,扩增env基因C_2-V_3区核酸片段,并进行核苷酸序列分析。结果 在其中一孕妇体内发现一株G亚型HIV-1毒株序列的存在,这是G亚型HIV-1毒株首次在中国被发现,同时有母婴传播的可能;另外两例被证明为E亚型和C亚型HIV-1毒株。结论 这表明HIV在重庆市高危人群中已有流行并且流行情况复杂。
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关键词
G亚型
序列分析
艾滋病
HIV-1
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职称材料
题名
我国首次发现的HIV-1和HIV-2双重感染样品中病毒部分基因的序列特征分析
被引量:
4
1
作者
邢辉
潘品良
冯毅
林旭东
于健石
龚新昌
戴玉琳
邵一鸣
机构
卫生部艾滋病预防与控制中心参比室
上海市卫生检疫局
出处
《病毒学报》
CSCD
北大核心
2000年第2期111-115,共5页
文摘
上海市卫生检疫局送检了一例HIV - 1和HIV - 2抗体检测均呈阳性的双重感染样品 ,对其感染的HIV前病毒的 gag和env基因区进行了序列分析 ,首次阐明我国发现的HIV双重感染样品的HIV部分基因特征。从HIV感染者淋巴细胞 (peripheralbloodmononuclearcells,PBMC)中提取前病毒DNA ,分别使用HIV 1和HIV 2特异性引物用套式PCR扩增HIV 1和HIV 2的部分基因区。PCR产物不经克隆直接测序 ,经GenBank检索并使用GCG软件包进行序列分析。结果表明 ,其中感染的HIV 2毒株中gag基因区与德国株HI2PEI2KR相似 ,基因离散率仅为8 1% ,env基因C2 -V3区与来自几内亚比绍的HIV 2U0 5 35 8株最近 ,离散率为 13 0 4% ,在其 gp36区发现与HIV 2U0 5 35 8基因离散率为 10 6 3% ,两个毒株均属HIV 2中的A亚型。而其HIV 1型毒株在 gag和env区都与从尼日利亚分离的H92NG0 83株相似 ,属HIV 1的G亚型。本文首次对我国发现的HIV 2型毒株进行了主要基因区的序列分析 ,表明在非洲较常见的HIV 2A亚型和HIV 1G亚型毒株 ,已随援外劳工传入我国。
关键词
双重感染
序列分析
系统树分析
HIV-1
HIV-2
Keywords
human immunodeficiency virus type 1
type 2(HIV 1
HIV 2)
dual infection
subtype
nested PCR
sequencing
phylogenetic tree
分类号
R373.9 [医药卫生—病原生物学]
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
重庆市HIV-1样本的亚型分析及G亚型HIV-1毒株在我国的发现
被引量:
10
2
作者
韩梅
付宗道
于友健
钱天学
贾庆良
王豫林
冯毅
邢辉
潘品良
于健石
邵一鸣
机构
重庆市卫生防疫站
卫生部艾滋病预防与控制中心
出处
《中国性病艾滋病防治》
2000年第2期89-91,共3页
文摘
目的 分析重庆市高危人群中HIV-1亚型的流行情况。方法 对采自重庆市经性传播和静脉吸毒途径感染的3份HIV-1阳性外周血分离PBMC,扩增env基因C_2-V_3区核酸片段,并进行核苷酸序列分析。结果 在其中一孕妇体内发现一株G亚型HIV-1毒株序列的存在,这是G亚型HIV-1毒株首次在中国被发现,同时有母婴传播的可能;另外两例被证明为E亚型和C亚型HIV-1毒株。结论 这表明HIV在重庆市高危人群中已有流行并且流行情况复杂。
关键词
G亚型
序列分析
艾滋病
HIV-1
Keywords
HIV Subtype Sequence Phylogenetic analysis
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国首次发现的HIV-1和HIV-2双重感染样品中病毒部分基因的序列特征分析
邢辉
潘品良
冯毅
林旭东
于健石
龚新昌
戴玉琳
邵一鸣
《病毒学报》
CSCD
北大核心
2000
4
下载PDF
职称材料
2
重庆市HIV-1样本的亚型分析及G亚型HIV-1毒株在我国的发现
韩梅
付宗道
于友健
钱天学
贾庆良
王豫林
冯毅
邢辉
潘品良
于健石
邵一鸣
《中国性病艾滋病防治》
2000
10
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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