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外生菌根真菌土生空团菌种群遗传多样性与结构研究
被引量:
1
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作者
郭子轩
王永龙
+6 位作者
武彬蔚
徐颖
姚慧
李忠风
于清弋
李杏春
郭良栋
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期920-935,共16页
土生空团菌Cenococcum geophilum是生态系统中广泛分布的外生菌根真菌,具有丰富的遗传多样性和重要的生态功能。为揭示土生空团菌的种群遗传多样性和结构,本研究对采集自中国10个森林地点的桦木科Betulaceae、壳斗科Fagaceae和松科Pinac...
土生空团菌Cenococcum geophilum是生态系统中广泛分布的外生菌根真菌,具有丰富的遗传多样性和重要的生态功能。为揭示土生空团菌的种群遗传多样性和结构,本研究对采集自中国10个森林地点的桦木科Betulaceae、壳斗科Fagaceae和松科Pinaceae植物根系219份样品高通量测序的土生空团菌ITS2序列进行分析。结果表明4380条土生空团菌ITS2序列共划分为137个单倍型(Hap1-Hap137),其中Hap1是3科植物的优势单倍型并分布于所有地点,有48个单倍型分布于少数几个地点,但有88个单倍型仅分布于单个地点。非参数(Kruskal-Wallis)检验结果表明地点对土生空团菌单倍型的丰度和多样性具有显著影响,而宿主植物科对其无显著影响。分子方差分析(AMOVA)结果显示土生空团菌在10个地理种群间和3个植物科种群间的遗传分化均不明显,而遗传分化主要来自于种群内的个体差异。基于K-2P遗传距离的邻接法(NJ)树显示10个地理种群可以划分为3支,壳斗科土生空团菌种群的遗传距离比桦木科和松科远。土生空团菌单倍型组成在不同地点间和不同植物科间均有明显差异,有些土生空团菌单倍型具有地点和植物科的偏好性。研究结果为进一步揭示土生空团菌遗传多样性的生态功能提供科学依据。
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关键词
土生空团菌
ITS2序列
单倍型
遗传多样性
遗传结构
原文传递
题名
外生菌根真菌土生空团菌种群遗传多样性与结构研究
被引量:
1
1
作者
郭子轩
王永龙
武彬蔚
徐颖
姚慧
李忠风
于清弋
李杏春
郭良栋
机构
中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室
中国科学院大学生命科学学院
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期920-935,共16页
基金
中国科学院战略性先导科技专项(XDB31000000)。
文摘
土生空团菌Cenococcum geophilum是生态系统中广泛分布的外生菌根真菌,具有丰富的遗传多样性和重要的生态功能。为揭示土生空团菌的种群遗传多样性和结构,本研究对采集自中国10个森林地点的桦木科Betulaceae、壳斗科Fagaceae和松科Pinaceae植物根系219份样品高通量测序的土生空团菌ITS2序列进行分析。结果表明4380条土生空团菌ITS2序列共划分为137个单倍型(Hap1-Hap137),其中Hap1是3科植物的优势单倍型并分布于所有地点,有48个单倍型分布于少数几个地点,但有88个单倍型仅分布于单个地点。非参数(Kruskal-Wallis)检验结果表明地点对土生空团菌单倍型的丰度和多样性具有显著影响,而宿主植物科对其无显著影响。分子方差分析(AMOVA)结果显示土生空团菌在10个地理种群间和3个植物科种群间的遗传分化均不明显,而遗传分化主要来自于种群内的个体差异。基于K-2P遗传距离的邻接法(NJ)树显示10个地理种群可以划分为3支,壳斗科土生空团菌种群的遗传距离比桦木科和松科远。土生空团菌单倍型组成在不同地点间和不同植物科间均有明显差异,有些土生空团菌单倍型具有地点和植物科的偏好性。研究结果为进一步揭示土生空团菌遗传多样性的生态功能提供科学依据。
关键词
土生空团菌
ITS2序列
单倍型
遗传多样性
遗传结构
Keywords
Cenococcum geophilum
ITS2 sequence
haplotype
genetic diversity
genetic structure
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
外生菌根真菌土生空团菌种群遗传多样性与结构研究
郭子轩
王永龙
武彬蔚
徐颖
姚慧
李忠风
于清弋
李杏春
郭良栋
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
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参考文献
引证文献
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