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根瘤菌TtsI突变对大豆根瘤菌固氮酶活性的影响及转录组分析
1
作者
于燕雨
马胜男
+2 位作者
辛大伟
陈庆山
王锦辉
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期413-420,共8页
根瘤菌与大豆建立的共生模式为大豆提供了生长发育所必须的氮素,在共生建立时根瘤菌Ⅲ型效应因子是影响结瘤发生的重要信号分子之一。为了解析根瘤菌Ⅲ型效应因子在结瘤中的作用,进行TtsI突变根瘤菌HH103(Sinorhizobium fredii HH103)...
根瘤菌与大豆建立的共生模式为大豆提供了生长发育所必须的氮素,在共生建立时根瘤菌Ⅲ型效应因子是影响结瘤发生的重要信号分子之一。为了解析根瘤菌Ⅲ型效应因子在结瘤中的作用,进行TtsI突变根瘤菌HH103(Sinorhizobium fredii HH103)结瘤鉴定以及根瘤转录组分析,并对差异基因进行富集分析。结果显示:TtsI突变可以降低绥农14根瘤的固氮酶活性,但不影响野生豆ZYD00006的根瘤固氮酶活性。TtsI突变根瘤菌HH103(HH103ΩTtsI)使绥农14根瘤内部分编码氮转运的相关基因以及NLP7下调表达,并且接种HH103ΩTtsI与接种HH103相比,Glyma.11G235200和NLP7在ZYD00006的根瘤中的相对表达没有显著差异。通过GO富集、KEGG富集以及GSEA富集分析显示,差异基因主要涉及信号传导以及代谢进程等,差异基因主要在植物激素信号传导以及MAPK信号通路上富集。研究结果为后续Ⅲ型效应因子的功能和机制的解析以及大豆高效固氮设计提供了新的思路;同时氮转运相关基因的表达差异可为进一步选育高结瘤、高固氮效率以及高氮利用率的大豆品种提供理论支撑。
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关键词
大豆
根瘤菌
Sinorhizobium
fredii
HH103
Ⅲ型效应因子
TtsI
固氮酶活性
RNA-SEQ
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职称材料
题名
根瘤菌TtsI突变对大豆根瘤菌固氮酶活性的影响及转录组分析
1
作者
于燕雨
马胜男
辛大伟
陈庆山
王锦辉
机构
东北农业大学农学院/教育部大豆生物学重点实验室
黑龙江省农垦科学院农作物开发研究所
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期413-420,共8页
基金
国家自然科学基金(32072014,U20A2027)。
文摘
根瘤菌与大豆建立的共生模式为大豆提供了生长发育所必须的氮素,在共生建立时根瘤菌Ⅲ型效应因子是影响结瘤发生的重要信号分子之一。为了解析根瘤菌Ⅲ型效应因子在结瘤中的作用,进行TtsI突变根瘤菌HH103(Sinorhizobium fredii HH103)结瘤鉴定以及根瘤转录组分析,并对差异基因进行富集分析。结果显示:TtsI突变可以降低绥农14根瘤的固氮酶活性,但不影响野生豆ZYD00006的根瘤固氮酶活性。TtsI突变根瘤菌HH103(HH103ΩTtsI)使绥农14根瘤内部分编码氮转运的相关基因以及NLP7下调表达,并且接种HH103ΩTtsI与接种HH103相比,Glyma.11G235200和NLP7在ZYD00006的根瘤中的相对表达没有显著差异。通过GO富集、KEGG富集以及GSEA富集分析显示,差异基因主要涉及信号传导以及代谢进程等,差异基因主要在植物激素信号传导以及MAPK信号通路上富集。研究结果为后续Ⅲ型效应因子的功能和机制的解析以及大豆高效固氮设计提供了新的思路;同时氮转运相关基因的表达差异可为进一步选育高结瘤、高固氮效率以及高氮利用率的大豆品种提供理论支撑。
关键词
大豆
根瘤菌
Sinorhizobium
fredii
HH103
Ⅲ型效应因子
TtsI
固氮酶活性
RNA-SEQ
Keywords
soybean
rhizobia
Sinorhizobium fredii HH103
typeⅢeffectors
TtsI
nitrogenase activity
RNA-Seq
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
根瘤菌TtsI突变对大豆根瘤菌固氮酶活性的影响及转录组分析
于燕雨
马胜男
辛大伟
陈庆山
王锦辉
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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