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禾谷镰刀菌基因组中含寄主靶向模体分泌蛋白功能的初步分析
被引量:
34
1
作者
于钦亮
马莉
+5 位作者
刘林
杨静
苏源
王云月
朱有勇
李成云
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008年第1期160-165,180,共7页
基于生物信息学的方法,以SignalP v3.0、TargetP v1.01、Big-PI Predictor和TMHMM v2.0四个分析软件对禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum Schw.)全基因组的11 640个蛋白编码基因的N-端氨基酸序列进行信号肽分析,预测出606个潜在的分泌蛋...
基于生物信息学的方法,以SignalP v3.0、TargetP v1.01、Big-PI Predictor和TMHMM v2.0四个分析软件对禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum Schw.)全基因组的11 640个蛋白编码基因的N-端氨基酸序列进行信号肽分析,预测出606个潜在的分泌蛋白编码基因。通过对这些潜在的分泌蛋白进行MEME软件分析,发现其中有157个分泌蛋白的剪切点下游120氨基酸残基范围内具有一个保守的RXLX模体,其中有79个分泌蛋白具有可预测的功能性描述,包括FG00023.1具有与草酸盐氧化酶1有关的功能,FG01588.1具有与1,4-α-葡糖苷酶葡聚糖有关的功能,这些基因可作为禾谷镰刀菌致病相关的候选基因。其中FG04097.1编码的具有与丝氨酸型蛋白酶有关的功能在致病疫霉和疟原虫真核寄生物中具有相似保守的寄主靶标模体的效应蛋白中也观察到,但FG09127.1,FG05287.1编码的蛋白尚未被证明参与致病过程的研究报道。深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用禾谷镰刀菌基因组学研究成果,结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将有助于全面掌握其致病因子的结构与功能。对于这些蛋白功能的比较研究,将有利于对禾谷镰刀菌致病性的分子机制的探索,并为设计新的防治措施提供理论依据。
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关键词
禾谷镰刀菌
分泌蛋白
生物信息学
寄主靶向模体
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职称材料
硬质聚氨酯灌封料的研制
被引量:
1
2
作者
于钦亮
李华
《工程塑料应用》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第3期16-18,共3页
以聚醚多元醇和异氰酸酯为主要原材料,制备了硬质聚氨酯灌封料。讨论了异氰酸根含量、催化剂用量,以及树脂和固化剂配比对产品性能的影响。对所研制的聚氨酯灌封料理化性能和工艺性能同进口料PU200进行了比较。结果表明,所研制的聚氨酯...
以聚醚多元醇和异氰酸酯为主要原材料,制备了硬质聚氨酯灌封料。讨论了异氰酸根含量、催化剂用量,以及树脂和固化剂配比对产品性能的影响。对所研制的聚氨酯灌封料理化性能和工艺性能同进口料PU200进行了比较。结果表明,所研制的聚氨酯灌封料性能基本达到PU200的水平。
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关键词
硬质聚氨酯
灌封料
研制
适用期
理化性能
工艺性能
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职称材料
题名
禾谷镰刀菌基因组中含寄主靶向模体分泌蛋白功能的初步分析
被引量:
34
1
作者
于钦亮
马莉
刘林
杨静
苏源
王云月
朱有勇
李成云
机构
云南农业大学教育部生物多样性与病虫害控制重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008年第1期160-165,180,共7页
基金
国家"973"项目(2006CB100202)
教育部科学研究重大项目(307025)
文摘
基于生物信息学的方法,以SignalP v3.0、TargetP v1.01、Big-PI Predictor和TMHMM v2.0四个分析软件对禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum Schw.)全基因组的11 640个蛋白编码基因的N-端氨基酸序列进行信号肽分析,预测出606个潜在的分泌蛋白编码基因。通过对这些潜在的分泌蛋白进行MEME软件分析,发现其中有157个分泌蛋白的剪切点下游120氨基酸残基范围内具有一个保守的RXLX模体,其中有79个分泌蛋白具有可预测的功能性描述,包括FG00023.1具有与草酸盐氧化酶1有关的功能,FG01588.1具有与1,4-α-葡糖苷酶葡聚糖有关的功能,这些基因可作为禾谷镰刀菌致病相关的候选基因。其中FG04097.1编码的具有与丝氨酸型蛋白酶有关的功能在致病疫霉和疟原虫真核寄生物中具有相似保守的寄主靶标模体的效应蛋白中也观察到,但FG09127.1,FG05287.1编码的蛋白尚未被证明参与致病过程的研究报道。深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用禾谷镰刀菌基因组学研究成果,结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将有助于全面掌握其致病因子的结构与功能。对于这些蛋白功能的比较研究,将有利于对禾谷镰刀菌致病性的分子机制的探索,并为设计新的防治措施提供理论依据。
关键词
禾谷镰刀菌
分泌蛋白
生物信息学
寄主靶向模体
Keywords
Fusarium graminearum
Secreted protein
Bioinformation
Host-targeting-motif
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
S432.4 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
硬质聚氨酯灌封料的研制
被引量:
1
2
作者
于钦亮
李华
机构
中国兵器工业第五三研究所
出处
《工程塑料应用》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第3期16-18,共3页
文摘
以聚醚多元醇和异氰酸酯为主要原材料,制备了硬质聚氨酯灌封料。讨论了异氰酸根含量、催化剂用量,以及树脂和固化剂配比对产品性能的影响。对所研制的聚氨酯灌封料理化性能和工艺性能同进口料PU200进行了比较。结果表明,所研制的聚氨酯灌封料性能基本达到PU200的水平。
关键词
硬质聚氨酯
灌封料
研制
适用期
理化性能
工艺性能
Keywords
polyurethane, pounng and sealing, storage life
分类号
TQ325.8 [化学工程—合成树脂塑料工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
禾谷镰刀菌基因组中含寄主靶向模体分泌蛋白功能的初步分析
于钦亮
马莉
刘林
杨静
苏源
王云月
朱有勇
李成云
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008
34
下载PDF
职称材料
2
硬质聚氨酯灌封料的研制
于钦亮
李华
《工程塑料应用》
CAS
CSCD
北大核心
2002
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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