EGFR基因突变在非小细胞肺癌胸水细胞块中的检测分析

目的分析表皮生长因子受体(epidermal growth factor,EGFR)基因突变在非小细胞肺癌阳性胸水中的表达情况。方法将胸水内查见非小细胞肺癌的病例其阳性胸水离心沉渣制作细胞块。分离细胞块样品DNA,使用实时荧光检测PCR(ARMS-PCR)检测215例非小细胞肺癌细胞块和404例非小细胞肺癌组织块中EGFR的29种突变类型,并检测细胞块同时送检组织块的患者74例的一致性。结果细胞块EGFR基因突变型102例,突变率47.44%(102/215);组织块EGFR突变型172例,突变率42.57%(172/404);74例有组织块对照的细胞块EGFR结果一致性有53例,一致率达71.62%(53/74),其中细胞块EGFR的突变率44.59%(33/74),组织块突变率70.27%(52/74)。结论可以应用非小细胞肺癌阳性胸水细胞块代替肿瘤组织检测EGFR基因突变,对指导晚期肺腺癌患者靶向药物治疗具有重要指导意义。

宫颈髓外浆细胞瘤临床病理分析并文献复习

目的探讨宫颈髓外浆细胞瘤的临床病理特点及鉴别诊断。方法对1例宫颈髓外浆细胞瘤的临床表现、影像学、病理组织学变化、免疫表型及基因检测进行分析,并结合相关文献进行讨论。结果肿瘤细胞弥漫分布,主要由成熟浆细胞构成,分裂象可见。免疫组织化学染色显示肿瘤细胞CD79α、CD38、CD138和Kappa均阳性,Lambda、MUM-1、CD3、CD5、CD20和EBV均阴性。WT1 mRNA和PRAME mRNA水平分别为0.073%和0.080%;IGH基因继裂重组阳性。结论发生于宫颈的髓外浆细胞瘤是一种非常罕见的肿瘤,其临床表现及影像学均无特征性,明确诊断主要依靠病理组织学特征、免疫表型及基因分析。

恶性淋巴瘤诊断中Ig/TCR基因重排的分子病理检测分析

目的探讨B细胞性淋巴瘤中Ig基因重排和T细胞性淋巴瘤中TCR基因重排的特点。方法回顾性分析213例恶性淋巴瘤和24例淋巴反应性增生组织样本,利用3730毛细血管电泳对提取的DNA进行PCR扩增,检测B细胞性淋巴瘤中Ig基因重排和T细胞性淋巴瘤中TCR基因重排。结果 B细胞性淋巴瘤中IgHA的总阳性率为43.21%,IgHB的总阳性率为29.63%,IgHC的总阳性率为30.25%,IgHD的总阳性率为16.67%,IgHE的总阳性率为3.09%,IgLκA的总阳性率为42.59%,IgLκB的总阳性率为23.46%,IgLλA的总阳性率为25.93%,IgH(A+B+C+D+E)+IgLκ(A+B)+IgLλA的总阳性率为88.27%;T细胞性淋巴瘤中TCRB-A的总阳性率为31.37%,TCRB-B的总阳性率为58.82%,TCRB-C的总阳性率为23.53%,TCRG-A的总阳性率为60.78%,TCRG-B的总阳性率为21.57%,TCRD的总阳性率为29.41%,TCRβ+TCRγ+TCRδ的总阳性率为78.43%。结论Ig基因重排和TCR基因重排分别对B细胞性和T细胞性淋巴瘤的诊断具有重要价值。

植物几丁质酶的基因工程与分子生物学研究进展

植物几丁质酶具有广泛的生理活性,尤其在植物的抗病性方面具有重要作用,因而植物几丁质酶基因工程成为目前抗真菌基因工程研究的热点。本文介绍了植物几丁质酶基因结构的研究进展,综述了植物几丁质酶基因工程和微生物产几丁质酶转入植物的基因工程研究成果,概述了植物几丁质酶分子比较和分子进化研究,并展望了植物几丁质酶基因工程的应用前景。

非小细胞肺癌患者组织原发灶和转移灶中ROS1融合基因的研究

目的:研究晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)原发灶和转移灶ROS1融合基因阳性率,探讨其相关性。方法:收集2013年1月至2015年5月中国人民解放军北京军区总医院、军事医学科学院附属医院、浙江省肿瘤医院、大连大学附属中山医院和山西医学科学院山西大医院原发灶384例,其中配对转移灶246例,统计得出ROS1融合基因阳性率并分析原发灶与转移灶ROS1融合基因的一致性、ROS1融合基因阳性与临床基线资料间的关系。结果:ROS1融合基因阳性率原发灶为2.60%(10/384)。ROS1融合基因阳性率配对原发灶为2.85%(7/246),配对转移灶为1.63%(4/246),配对的246对原发灶、转移灶组织中,转移灶融合基因阳性而对应的原发灶融合基因阴性1例,原发灶融合基因阳性而对应的转移灶融合基因阴性4例,转移灶较原发灶检出ROS1融合基因阳性率高,两者差别有统计学意义(χ2=52.341,P=0.000);转移灶和原发灶ROS1融合基因阳性的一致率好(κ=0.536,P=0.000),通过转移灶判断原发灶融合阳性的情况,敏感性为42.86%(3/7),特异性为99.58%(238/239)。结论:非小细胞肺癌中转移灶可以预测原发灶ROS1融合基因情况,在难以取得原发灶的情况下转移灶可以作为ROS1融合基因测的备选手段。

非小细胞肺癌患者组织原发灶和转移灶中ALK融合基因的研究

目的:研究晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)原发灶和转移灶ALK融合基因阳性率,探讨其相关性。方法:收集2013年1月至2015年5月中国人民解放军北京军区总医院、军事医学科学院附属医院、浙江省肿瘤医院和大连大学附属中山医院原发灶384例,其中配对转移灶246例,统计得出ALK融合基因阳性率并分析原发灶与转移灶ALK融合基因的一致性、ALK融合基因阳性与临床基线资料间的关系。结果:ALK融合基因阳性率原发灶为11.46%(44/384)。ALK融合基因阳性率配对原发灶为10.98%(27/246),配对转移灶为7.32%(18/246),配对的246对原发灶、转移灶组织中,转移灶融合基因阳性而对应的原发灶融合基因阴性2例,原发灶融合基因阳性而对应的转移灶融合基因阴性11例,转移灶较原发灶检出ALK融合基因阳性率高,两者差别有统计学意义(χ2=112.208,P=0.000);转移灶和原发灶ALK融合基因阳性的一致率好(κ=0.683,P=0.000),通过转移灶判断原发灶融合阳性的情况,敏感性为59.26%(16/27),特异性为99.09%(217/219)。结论:非小细胞肺癌中转移灶可以预测原发灶ALK融合基因情况,在难以取得原发灶的情况下转移灶可以作为ALK融合基因测的备选手段。

非小细胞肺癌组织RET融合基因与TYMS基因mRNA的表达及其关系

目的探讨非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)组织中RET融合基因与胸苷酸合成酶(thymidylate synthase,TYMS)基因mRNA的表达及其相关性。方法应用实时荧光定量PCR方法检测642例NSCLC组织中RET基因及TYMS基因mRNA的表达,分析二者表达与临床病理特征的关系及二者的相关性。结果NSCLC组织中RET融合基因阳性率占0.93%(6/642);TYMS基因mRNA高表达占63.55%(408/642)。二者表达与患者的性别、年龄、吸烟情况、肿瘤大小、淋巴结是否转移及临床分期等临床病理特征无关(P>0.05)。RET融合基因mRNA表达与TYMS基因mRNA表达显著相关(P<0.05)。结论非小细胞肺癌RET融合基因阳性患者TYMS基因倾向低表达,或许能从一线化疗药培美曲塞中受益。

恶性淋巴瘤诊断中荧光原位杂交分析基因状态的研究

目的探讨恶性淋巴瘤中基因重排的特点。方法回顾性分析87例恶性淋巴瘤组织样本,利用荧光原位杂交技术,分别检测弥漫大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、黏膜相关淋巴组织淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、Burkitt淋巴瘤和间变性大细胞淋巴瘤中BCL-6、BCL-2、MALT1、CCND1、C-MYC和ALK基因重排。结果弥漫大B细胞性淋巴瘤中BCL-6基因重排的阳性率为29.03%(9/31),滤泡性淋巴瘤中BCL-2基因重排的阳性率为61.11%(11/18),黏膜相关淋巴组织淋巴瘤中MALT1基因重排的阳性率为47.37%(9/19),套细胞淋巴瘤中CCND1基因重排的阳性率为88.88%(8/9),Burkitt淋巴瘤中C-MYC基因重排的阳性率为100%(2/2)和间变性大细胞淋巴瘤中ALK基因重排的阳性率为75.00%(6/8)。结论基因重排对恶性淋巴瘤的诊断具有重要的实际价值。

北京小龙门林区夏季鸟类群落物种组成及多样性变化

本文研究了小龙门林区夏季鸟类群落物种组成和多样性及其在 1999年～ 2 0 0 3年时间段内的变化。通过野外设置8块样地 ,采用网捕环志、望远镜观察、鸣叫识别三种方法统计 ,得到了以下结论 :山雀科 (Paridae)、长尾山雀科 (Aegithalidae)、翁鸟科 (Muscicapidae)为该地区的优势科 ,银喉长尾山雀 (Aegithaloscaudatus)、大山雀 (Parusmajor)、褐头山雀 (Parusmontanus)、冠纹柳莺 (Phylloscopusreguloides)为该地区的优势种 ;林区鸟类物种及生物多样性丰富 ,且在研究阶段内呈现逐渐增长的趋势 ;另外 ,通过分析也发现林区内空间距离是决定不同森林生境类型间鸟类群落相似程度的主要因素 ,这些结论对于太行山生态恢复工程如何继续实施有重要意义。

胃肠道间质瘤中c-kit和PDGFRA基因突变多态性分析

目的探讨胃肠道间质瘤(gastrointestinal stomal tumors,GIST)中c-kit基因和PDGFRA基因的突变多态性。方法对93例GIST标本采用PCR扩增和基因测序的方法检测c-kit基因9、11、13、17号外显子和PDGFRA基因12、18号外显子序列。结果在93例GIST中共检测到c-kit基因突变64例(68.82%),其中11号外显子突变56例,占全部病例的60.22%(56/93);9号外显子突变4例,占全部病例的4.30%(4/93);13号外显子突变3例,占全部病例的3.23%(3/93);17号外显子突变1例,为与11号外显子共突变,占全部病例的1.08%(1/93)。11号外显子突变方式以缺失突变最常见,占55.36%(31/56),其次是点突变(26.79%,15/56)和插入突变(串联重复)(14.29%,8/56),再次是伴点突变的缺失突变(3.57%,2/56);突变绝大多数为杂合性突变,少数为纯合性突变。突变位点多集中在5'端的经典热点,其次为3'端的框内串联重复。PDGFRA基因突变共检测到4例,其中1例为与c-kit共突变,其余3例占无c-kit突变病例的10.34%(3/29),占CD117阴性病例的37.5%(3/8),且均为18号外显子突变。结论大部分GIST中存在c-kit或PDGFRA基因的突变,少部分病例存在c-kit基因不同外显子双突变或c-kit基因和PDGFRA基因双突变共存型,其基因突变分型能指导伊马替尼的肿瘤靶向治疗。

复苏植物牛耳草引导蛋白基因的克隆与表达

复苏植物生长在干旱频繁发生的特殊生境中,具有耐极端干旱的特性,是一种宝贵的耐旱基因资源植物.前期实验从复苏植物牛耳草的叶片中得到一个干旱诱导的细胞壁蛋白基因片段,在此基础上利用5′-RACE获得全长cDNA,命名为BhDIR1,编码一个199个氨基酸的小分子量蛋白质,与松柏等植物中发现的可能参与木质素合成的引导蛋白具有20—40的序列相似性.表达分析表明BhDIR1在复苏植物牛耳草干旱复水过程中mRNA明显积累,激素、信号分子和温度胁迫都可诱导其表达.BhDIR1在N′端包含一个外泌的信号肽,GFP融合蛋白的荧光定位分析证实BhDIR1定位于细胞膜和壁上.根据牛耳草干旱后酸溶木质素含量下降这一现象及以上结果可推测,BhDIR1可能通过调控木质素的单体间的连接方式而改变木质素的物理性质来影响细胞壁的机械强度和柔韧性,减少干旱对细胞造成的机械伤害.

非小细胞肺癌组织中EML4-ALK融合基因与TYMS mRNA表达的关系

目的探讨非小细胞肺癌(nonsmall-cell lung cancer,NSCLC)组织中棘皮动物微管样蛋白4-间变淋巴瘤激酶(echinoderm microtubule associated protein like 4-anaplastic Lymphoma kinase,EML4-ALK)融合基因与胸苷酸合成酶(Thymidylate synthase,TYMS)mRNA表达的关系。方法应用实时荧光定量PCR方法检测257例NSCLC组织中EML4-ALK融合基因、TYMS mRNA的表达。结果非小细胞肺癌组织中EML4-ALK融合基因阳性率占4.28%(11/257),在不吸烟患者中较高(P<0.05);TYMS mRNA高表达占63.42%(163/257)。与未检测到EML4-ALK融合基因阳性的非小细胞肺癌患者比较,EML4-ALK融合基因阳性与TYMS mRNA表达水平相关(P<0.05)。结论非小细胞肺癌组织中EML4-ALK融合基因阳性患者TYMS倾向低表达,可能从一线化疗药的培美曲塞中受益。

非小细胞肺癌组织中表皮生长因子受体基因突变与ERCC1和RRM1mRNA表达的关系

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)组织中人表皮生长因子受体(EGFR)基因突变与切除修复交叉互补蛋白1(ERCC1)和核苷酸还原酶亚单位M1(RRM1)mRNA表达的关系。方法应用实时荧光定量PCR方法检测257例NSCLC组织中EGFR基因突变、ERCC1和RRM1mRNA的表达。结果 NSCLC组织中EGFR基因突变率占49.03%(126/257),在女性和不吸烟患者中较高(P<0.05);ERCC1mRNA高表达占47.47%(122/257),RRM1mRNA高表达占61.87%(159/257)。与未检测到EGFR基因突变的NSCLC患者比较,EGFR基因突变中ERCC1mRNA低表达者多见(P<0.05);NSCLC组织中,EGFR基因突变与RRM1mRNA表达水平无关(P>0.05);ERCC1mRNA表达水平与RRM1mRNA表达水平无关(P<0.05)。结论 NSCLC组织中EGFR基因突变患者ERCC1倾向低表达,可能受益于以铂类药物为基础的化疗。

复苏植物旋蒴苣苔C2结构域小蛋白BhC2DP1参与植物对ABA的反应

为揭示植物抗旱的调控机理,对复苏植物旋蒴苣苔(Boea hygrometrica)的一个编码C2结构域小蛋白的基因BhC2DP1进行研究。Real-time PCR和ProBhC2DP1:GUS报告基因检测显示,该基因只在干旱早期和外源Ca2+处理0.5小时时受诱导表达;分别施加Ca2+螯合剂EGTA和逆境激素ABA均抑制该基因表达,但二者同时处理则显著诱导其表达,表明ABA对该基因转录水平的调控是Ca2+依赖型的。过表达BhC2DP1的拟南芥(Arabidopsis thaliana)对ABA的敏感性增强,EGTA处理可消除其与野生型的差异,表明Ca2+是BhC2DP1蛋白参与ABA反应所必需的。综上所述,ABA和Ca2+信号途径的精细调控可能是决定干旱诱导旋蒴苣苔中BhC2DP1基因表达时间、丰度和功能的重要机制。