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锰氧化细菌研究进展 被引量:7
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作者 井晓欢 杨季芳 陈吉刚 《浙江万里学院学报》 2015年第6期61-68,共8页
能够将离子存在的Mn^(2+)氧化成为可沉淀的高价锰(Mn^(3+)、Mn^(4+)等)的锰氧化细菌广泛存在于大自然中。锰氧化细菌不仅参与海洋锰结核的形成,在海洋锰元素的循环中起着举足轻重的作用,而且能够氧化游离的锰离子,吸附多种重金属,控制... 能够将离子存在的Mn^(2+)氧化成为可沉淀的高价锰(Mn^(3+)、Mn^(4+)等)的锰氧化细菌广泛存在于大自然中。锰氧化细菌不仅参与海洋锰结核的形成,在海洋锰元素的循环中起着举足轻重的作用,而且能够氧化游离的锰离子,吸附多种重金属,控制其在环境中的转化和迁移,修复环境中重金属的污染和氧化降解多种有机污染物。文章主要就国内外对锰氧化细菌的鉴定方法、分类、生物作用、氧化机制、氧化抑制剂以及相关的氧化酶等的研究进展进行了总结,同时提出了锰氧化细菌研究中存在的问题,并对进一步的研究作了展望。 展开更多
关键词 锰氧化细菌 氧化机制 生物作用 锰氧化酶
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哺乳仔猪断奶前后肠道微生物培养组学研究 被引量:5
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作者 董博 王志林 +7 位作者 魏文康 井晓欢 刘石 鄢秋龙 蒋宗勇 刘文华 胡译尹 陈庄 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期175-189,共15页
近年来国内外研究人员通过下一代测序和分离培养技术,结合宏基因组学相关的生物信息学手段证实了猪肠道微生物的组成及其代谢物活性对宿主的健康具有重要作用。受限于传统培养方法,猪肠道中大多数细菌仍无法培养,因此,为了突破研究人员... 近年来国内外研究人员通过下一代测序和分离培养技术,结合宏基因组学相关的生物信息学手段证实了猪肠道微生物的组成及其代谢物活性对宿主的健康具有重要作用。受限于传统培养方法,猪肠道中大多数细菌仍无法培养,因此,为了突破研究人员研究宿主-菌株相互关系及益生菌株开发应用的限制,本研究对仔猪断奶前后回肠和结肠内容物微生物进行高通量培养组学研究。结合需氧和厌氧条件、不同培养时间以及25种不同培养基,共筛选获得1385株厌氧、好氧和兼性厌氧菌株,并全部进行了16S rRNA全长测序鉴定和菌株保存,共计获得5个门、29个属和86个种菌,其中包含梭杆菌、拟杆菌等在以前的研究中较难分离获得的菌株,以及一些如乳酸菌等具有潜在应用价值的益生菌,更为重要的是其中包含116株疑似新菌种。本研究获得的菌株信息可以进一步完善猪肠道微生物物种数据库,为后续宿主-菌株相互关系研究垫定了基础,对猪饲用益生菌相关产品开发研究具有重要意义。 展开更多
关键词 培养组学 仔猪断奶 肠道 菌株 鉴定
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“非可培养细菌”培养策略研究进展 被引量:2
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作者 邱玉兰 井晓欢 +1 位作者 杨季芳 陈吉刚 《浙江万里学院学报》 2014年第3期78-88,共11页
近年来,研究者利用培养策略增加了环境样品中可培养细菌的数量,但培养效率仍然是研究者当前所面临的最大挑战。环境样品中存在两类"不可培养"的细菌类群是影响培养效率的主要原因。一类是:该类群中目前尚无培养代表,其合适的... 近年来,研究者利用培养策略增加了环境样品中可培养细菌的数量,但培养效率仍然是研究者当前所面临的最大挑战。环境样品中存在两类"不可培养"的细菌类群是影响培养效率的主要原因。一类是:该类群中目前尚无培养代表,其合适的培养条件尚没确定。另一类群是:该类群的细胞处于非分裂状态(也称不可培养的休眠或活细胞),需要移除或添加某些因子才能使其重新开始生长。文章综述了培养"非可培养细菌"的一系列策略以及影响培养策略的一些潜在机制,并强调:了解阻碍培养的因素是确定最佳培养策略的首要前提。 展开更多
关键词 非分裂细胞 培养效率 生长因子
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东太平洋多金属结核区两个站位深海沉积物细菌多样性 被引量:3
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作者 井晓欢 王杏 +4 位作者 熊尚凌 朱四东 陈勇 杨季芳 陈吉刚 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1434-1449,共16页
【目的】为了解东太平洋中国多金属结核勘探合同区西区2个站位(WBC1305和WBC1316A)深海沉积物细菌群多样性。【方法】直接提取环境样品总基因组,通过PCR和TA克隆策略构建了2个站位6个层次16S r RNA基因文库,对2个站位沉积物表层泥样中... 【目的】为了解东太平洋中国多金属结核勘探合同区西区2个站位(WBC1305和WBC1316A)深海沉积物细菌群多样性。【方法】直接提取环境样品总基因组,通过PCR和TA克隆策略构建了2个站位6个层次16S r RNA基因文库,对2个站位沉积物表层泥样中细菌多样性和群落结构特征进行分析,并通过构建系统发育树,进行系统发育学分析。【结果】2个站位6个文库共获得有效克隆533个,其中472个克隆包括α-变形菌纲、β-变形菌纲、γ-变形菌纲、δ-变形菌纲、浮霉菌门、酸杆菌门、硝化螺旋菌门、放线菌门、绿弯菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、迷踪菌门、芽单胞菌门、Hydrogenedentes、Chlorobi和Nitrospinae16个细菌类群,而另外61个克隆为不可分类细菌类群。【结论】结果表明γ-变形菌纲和厚壁菌门分别是WBC1305和WBC1316A站位的优势种群;WBC1316A站位细菌群落结构更加丰富和复杂。 展开更多
关键词 多金属结核区 深海沉积物 细菌多样性
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基于高通量培养组学的人体皮肤细菌多样性研究 被引量:1
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作者 井晓欢 叶玉曼 +4 位作者 黄红梅 吴柳燕 王博 赵姣 危金普 《生物资源》 CAS 2022年第2期162-178,共17页
了解中国健康人皮肤可培养细菌多样性及建立中国健康人皮肤细菌菌株资源库,能够为皮肤细菌研究及研究皮肤细菌与皮肤疾病之间的潜在关系提供菌株资源。通过高通量培养组学技术,利用9种培养基对18名健康中国人,8个部位,144份皮肤样品进... 了解中国健康人皮肤可培养细菌多样性及建立中国健康人皮肤细菌菌株资源库,能够为皮肤细菌研究及研究皮肤细菌与皮肤疾病之间的潜在关系提供菌株资源。通过高通量培养组学技术,利用9种培养基对18名健康中国人,8个部位,144份皮肤样品进行高通量分离培养,并对筛选获得的细菌进行16S rRNA测序鉴定分析。研究表明,共分离获得3580株细菌,隶属于4门33属108种;4个门包括厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其中优势门为厚壁菌门(占总菌株数的87.01%),其次为放线菌门(10.61%);优势属为葡萄球菌属(Staphylococcus)(占总菌株数的82.07%);优势种为表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)(占总菌株数的35.81%),其次为人葡萄球菌抗新霉素败血症亚种(Staphylococcus hominis subsp.novobiosepticus)(26.37%)及头状葡萄球菌(Staphylococcus capitis)(9.44%);并获得39株26种潜在的新菌种,其与最接近的16S rRNA序列相似率分布为88.26%~98.61%,潜在新属新种占总菌株的1.09%,占所有菌种的24.07%。健康中国人群皮肤细菌资源丰富,且存在大量的潜在新属新种有待分离培养鉴定;我们初步建立了健康中国人皮肤细菌资源库,以丰富现有皮肤细菌资源,为利用皮肤细菌资源提供菌株保障。 展开更多
关键词 培养组学 人体皮肤细菌 可培养细菌 16S rRNA鉴定
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锯缘青蟹呼肠孤病毒p40蛋白的体外表达与单克隆抗体制备 被引量:1
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作者 张昭 朱四东 +2 位作者 井晓欢 杨季芳 陈吉刚 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期487-491,共5页
锯缘青蟹呼肠孤病毒(Scylla serrata reovirus,SsRV)第9节段(S9)编码的p40蛋白可能为病毒的甲基转移酶(methyltransferase)。为了便于确认p40在病毒复制过程中扮演的角色,将S9片段的开放阅读框(ORF)克隆到原核表达载体pET28a(+),实现了... 锯缘青蟹呼肠孤病毒(Scylla serrata reovirus,SsRV)第9节段(S9)编码的p40蛋白可能为病毒的甲基转移酶(methyltransferase)。为了便于确认p40在病毒复制过程中扮演的角色,将S9片段的开放阅读框(ORF)克隆到原核表达载体pET28a(+),实现了在宿主表达菌E.coli BL21(DE3)中的高效表达,进而纯化了重组表达蛋白p40(rp40),并制备了抗SsRV p40蛋白的2株单克隆抗体(4B7、3E5)。经Western blot分析表明,2株单克隆抗体均可特异地识别rp40蛋白,以及识别SsRV病毒蛋白中分子量为46 ku和40 ku 2条蛋白条带。实验结果不但确认SsRV p40为SsRV的结构蛋白,也提示p40和p46蛋白可能具有相同的抗原表位。为该蛋白的后续功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 锯缘青蟹 呼肠孤病毒 p40蛋白 甲基转移酶 单克隆抗体
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