茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因的克隆与序列分析

以茎瘤芥幼苗叶片总RNA为模板,通过SMART RACE技术进行反转录和PCR扩增,克隆到瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因(命名为BjARPP1,GenBank登录号:JX282179),并利用ProtParam、DNAMAN等生物信息学工具对其核酸序列和蛋白序列进行分析。结果表明,茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因开放阅读框为342 bp,编码113个氨基酸,等电点为4.27,相对分子质量为11.25 ku;二级结构预测显示α-螺旋占53.98%、不规则卷曲占33.68%、延伸链占12.39%,还含有5个磷酸化位点;同源进化树预测分析其与拟南芥的同源性为96%,与其他物种同源性低。茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因为首次克隆,为进一步研究该基因的结构、功能、遗传变异规律以及其与生产性能的关系提供科学依据。

茎瘤芥AP2／EREBP转录因子基因BjABR1的克隆和表达分析

以茎瘤芥(Brassica juncea var.tumida Tsen et Lee)‘永安’为材料,通过RACE和RT-PCR技术得到1个AP2/EREBP转录因子基因的cDNA全长序列和基因组DNA(gDNA)序列,该基因与拟南芥AtABR1基因的氨基酸序列相似性高达72%,因此命名为BjABR1(GenBank登录号:JQ713825.1)。BjABR1基因gDNA序列含1个内含子;cDNA序列全长1 514 bp,含有1个1 146 bp的开放阅读框(ORF),编码381个氨基酸;其推定编码的蛋白分子量为41.674 kD,等电点为9.11,具有14个磷酸化位点,含1个典型的AP2 DNA结合域和1个CMX-1基序。洋葱表皮细胞的瞬时表达显示,BjABR1蛋白定位于细胞核。荧光定量PCR分析结果表明,该基因在茎瘤芥不同发育时期的根、茎、叶中均有表达,但在根中表达量极高;在对茎瘤芥组培幼苗进行高盐、渗透压和低温3种非生物胁迫处理后发现,3种胁迫均能诱导该基因表达,但其对高盐的响应更为迅速。

贵阳地区6种常见呼吸道病原体检测结果分析

目的:了解贵阳地区6种常见呼吸道病原体感染的流行病学特征,为当地呼吸道传染病诊疗提供科学依据。方法:收集贵州省人民医院2022年9—2023年8月住院和门诊患者2 471例,采用多重荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)方法检测6种常见呼吸道病原体感染情况,包括甲型流感病毒(influenza A virus, InfA)、乙型流感病毒(influenza B virusInfB)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)、腺病毒(adenovirus, HADV)、人鼻病毒(human rhinovirus, HRV)和肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae, Mp),并对结果进行统计分析。结果:检测的2 471例样本中,阳性样本922例,阳性率37.31%。占比排名前三病原体阳性率分别为RSV 31.87%、MP 25.35%、HRV 23.02%。单一病原体感染34.80%(860/2 471),混合感染2.51%(62/2 471),以HRV合并HADV感染例数最多。从年龄分组来看,未成年年龄段患者呼吸道6种病原体阳性率均高于另外三个年龄组(χ2=284.42,P<0.05)。不同的病原体感染率在不同季节差异具有统计学意义。结论:贵阳地区呼吸道病原体分布以RSV、MP、HRV感染为主,不同年龄、季节呼吸道病原体具有差异,其分布及流行特征可为当地临床防治提供实验资料和理论依据。