荷斯坦牛DRA基因多态性及序列特征分析

为探讨荷斯坦牛DRA基因的多态性及序列特征,本研究采用基因组DNA混合池扩增并直接测序的方法对荷斯坦牛DRA基因编码区进行多态性分析,同时利用生物信息学方法预测DRA基因的理化特性及其编码蛋白的高级结构。结果表明,荷斯坦牛DRA基因编码区上有4个碱基突变,包含1个错义突变和3个同义突变。DRA基因共编码253个氨基酸,编码产物是一种稳定的不可溶蛋白,具有15个潜在的磷酸化位点,二级结构为混合型,三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成。本研究结果为荷斯坦牛的疾病相关基因筛选和抗病分子育种提供了一定的理论依据。

猪Nramp1基因多态性研究进展

Nramp1(天然抗性相关巨噬蛋白)是一种离子转运蛋白,其蛋白可抵抗多种胞内寄生病虫杆菌侵染而发挥重要免疫功能,猪Nramp1基因蛋白多态性较高,且对仔猪抗病力影响较大。本文综述了猪Nramp1基因的结构、功能特点以及调节机制与疾病的相关性,并对猪Nramp1基因的发展进行展望,以期为家畜抗病育种提供理论依据。

猪Nramp1基因内含子6的SNP多态性分析

本研究以大白猪、长白猪和杜洛克猪为研究对象,通过构建DNA混合池并利用PCR产物直接测序的方法,对Nramp1基因内含子6的SNP多态性进行分析。结果发现,3个猪种在Nramp1基因内含子6中均有4个SNP位点,分别为C^(111)A、C^(225)T、G^(296)T和T^(297)G。基因频率估算结果表明,等位基因C、C、G和T分别是4个SNP位点的优势等位基因。本研究结果可为猪免疫疾病研究和抗病分子育种提供理论基础。

荷斯坦牛BoLA-DRA基因外显子1生物信息学分析

本研究通过DNA混合池扩增测序方法对荷斯坦牛BoLA-DRA基因外显子1突变位点进行分析,并对其结构功能进行生物信息学预测。结果发现在荷斯坦牛BoLA-DRA基因外显子1在第1位和第2位之间有碱基T的插入,生物信息学预测结果表明DRA外显子1的mRNA二级结构突变前后自由能没有发生变化,蛋白质二级结构中β-折叠占比例最高,蛋白质功能预测结果显示该基因荷尔蒙和免疫应答的几率较高,表明DRA外显子1在荷斯坦牛性激素和免疫应答过程可能发挥重要作用,本研究结果为进一步研究BoLA-DRA基因抗病选育提供理论基础。

牛TLR2基因多态性研究进展

TLR2(Toll样受体2)是一种跨膜受体蛋白,可识别大多数病原微生物并激起免疫应答,牛TLR2基因多态性较高,且与多种疾病有关联,如乳腺炎、结核病、子宫内膜炎等。本文综述了牛TLR2基因的结构、功能特点以及调控机理,对研究现状进行总结分析,同时对牛TLR2基因的深入发展进行展望,为牛抗病育种提供理论参考。

荷斯坦牛BoLA-DRA基因SNPs筛选及生物信息学分析

为了探讨BoLA-DRA基因多态性,本研究利用DNA混合池扩增产物直接测序的方法对荷斯坦牛BoLA-DRA基因编码区SNPs进行筛选,并利用生物信息学软件预测该基因m RNA二级结构。结果表明:荷斯坦牛BoLA-DRA基因编码区共有4个SNPs (exon2-A82T,exon2-G116A,exon2-C197T,exon2-C233A)。生物信息学预测结果显示,exon2-A82T、exon2-G116A和exon2-C233A增大了m RNA二级结构的稳定性,而exon2-C197T降低了mRNA二级结构的稳定性。本研究结果可为荷斯坦牛抗病和抗逆性能研究积累更多的分子遗传学数据,并为经济性状相关基因筛选提供理论依据。