目的比较似然比(likelihood ratio,LR)法和状态一致性(identity by state,IBS)法在半同胞关系鉴定中的应用价值,为制定半同胞鉴定相关规范提供参考。方法(1)基于相同的遗传标记组合,比较实际案例与计算机模拟案例的累计状态一致性评分(c...目的比较似然比(likelihood ratio,LR)法和状态一致性(identity by state,IBS)法在半同胞关系鉴定中的应用价值,为制定半同胞鉴定相关规范提供参考。方法(1)基于相同的遗传标记组合,比较实际案例与计算机模拟案例的累计状态一致性评分(cumulated identity by state score,CIBS)与累积全同胞关系指数分布,验证计算机模拟方法的可信度;(2)模拟获得全同胞、半同胞、无关个体对各100万对在不同数量的三种类型遗传标记上的分型,分别计算CIBS和相应类型的累积LR参数;(3)比较基于不同数据、不同种类的遗传标记、应用不同准确度标准区分上述三种关系个体对时,LR法和IBS法所能提供的最佳系统效能,以比较两种方法在上述鉴定中的应用价值;(4)根据已有模拟数据,以曲线拟合的方式估计应用不同类型遗传标记鉴别半同胞与另两种关系个体对所需的最低遗传标记数目。结果(1)经秩和检验,在真实关系和检验的遗传标记组合相同的前提下,模拟方法与实际案例所得结果差异无统计学意义;(2)多数情况下,在其他条件设置相同时,LR法的系统效能大于IBS法;(3)基于现有数据,可以通过曲线拟合的方式得到全-半同胞鉴定和半同胞鉴定在系统效能达到0.95或0.99时所需遗传标记的数目。结论在进行甄别全同胞对和半同胞对或甄别半同胞对和无关个体对的鉴定时,推荐优先使用LR法,并根据拟进行的鉴定类型和基于的人群数据估计所需遗传标记数目,以保证鉴定效果。展开更多
本研究对中国河北地区汉族183个健康无关个体进行12个STR基因座遗传多态性调查。采用QIAamp DNA midi试剂盒提取样本DNA,用Investigator HDplex试剂盒进行扩增及检测。结果在12个STR基因座共检测出167个等位基因和637种基因型,其分布符...本研究对中国河北地区汉族183个健康无关个体进行12个STR基因座遗传多态性调查。采用QIAamp DNA midi试剂盒提取样本DNA,用Investigator HDplex试剂盒进行扩增及检测。结果在12个STR基因座共检测出167个等位基因和637种基因型,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。所调查的汉族人群12个STR基因座具有较好识别能力。展开更多
目的调查12个X染色体短串联重复序列(X chromosome short tandem repeat,X-STR)基因座在中国河北汉族人群中的遗传多态性。方法应用荧光标记复合扩增和毛细管电泳分型技术,对198名河北汉族无关个体(男性96名,女性102名)进行Inves...目的调查12个X染色体短串联重复序列(X chromosome short tandem repeat,X-STR)基因座在中国河北汉族人群中的遗传多态性。方法应用荧光标记复合扩增和毛细管电泳分型技术,对198名河北汉族无关个体(男性96名,女性102名)进行InvestigatorArgusX-12试剂盒中12个X-STR基因座分型,计算群体遗传学参数。结果该群体12个X-STR基因座中DXS10101与DXS10103呈连锁不平衡状态。12个X-STR基因座共检出148个等位基因,其中包括22个分型标准物外(off-ladder,OL)等位基因。12个X-STR基因座在河北汉族人群的杂合度为0.5074~0.9143,多态性信息含量为0.4377~0.9079,男性个体识别力为0.5074~0.9143,女性个体识别力为0.6876~0.9863,三联体非父排除率为0.4377~0.9079,二联体非父排除率为0.2984~0.8373。结论Investigator Argus X-12系统在河北汉族人群中具有高度多态性,适用于法医学个人识别和亲子鉴定,尤其是特殊或复杂的亲子鉴定。展开更多
目的检测经长期福尔马林固定的组织降解情况,并比较组织中SNP与STR的检出率。方法本文对24例经福尔马林固定、-20℃保存5年的组织样本,采用Quantifiler?Trio DNA定量试剂盒检测样本DNA的降解系数及浓度,运用55-SNPs SNa Pshot复合分型...目的检测经长期福尔马林固定的组织降解情况,并比较组织中SNP与STR的检出率。方法本文对24例经福尔马林固定、-20℃保存5年的组织样本,采用Quantifiler?Trio DNA定量试剂盒检测样本DNA的降解系数及浓度,运用55-SNPs SNa Pshot复合分型体系和Power Plex?21试剂盒分别进行SNP与STR检测。结果大部分样本降解系数在1~8,发生不同程度的降解。与未降解样本相比,SNP分型完全一致,检出率为100%;其中8例样本STR分型存在33个等位基因丢失,降解系数均大于2.6,且75.8%的等位基因片段长度大于300bp。当样本检测出16个STR基因座时,似然率与54个SNP相当。当样本检出大于17个STR时,似然率大于54个SNP。STR基因座片段长度与等位基因检出率之间呈负相关。除2例样本降解系数较小却发生等位基因丢失外,其余样本降解系数与等位基因检出率之间呈负相关。结论经福尔马林长期固定的组织DNA易降解,检测SNP明显优于STR,但需要更多的SNP以提高个体识别能力。展开更多
文摘目的比较似然比(likelihood ratio,LR)法和状态一致性(identity by state,IBS)法在半同胞关系鉴定中的应用价值,为制定半同胞鉴定相关规范提供参考。方法(1)基于相同的遗传标记组合,比较实际案例与计算机模拟案例的累计状态一致性评分(cumulated identity by state score,CIBS)与累积全同胞关系指数分布,验证计算机模拟方法的可信度;(2)模拟获得全同胞、半同胞、无关个体对各100万对在不同数量的三种类型遗传标记上的分型,分别计算CIBS和相应类型的累积LR参数;(3)比较基于不同数据、不同种类的遗传标记、应用不同准确度标准区分上述三种关系个体对时,LR法和IBS法所能提供的最佳系统效能,以比较两种方法在上述鉴定中的应用价值;(4)根据已有模拟数据,以曲线拟合的方式估计应用不同类型遗传标记鉴别半同胞与另两种关系个体对所需的最低遗传标记数目。结果(1)经秩和检验,在真实关系和检验的遗传标记组合相同的前提下,模拟方法与实际案例所得结果差异无统计学意义;(2)多数情况下,在其他条件设置相同时,LR法的系统效能大于IBS法;(3)基于现有数据,可以通过曲线拟合的方式得到全-半同胞鉴定和半同胞鉴定在系统效能达到0.95或0.99时所需遗传标记的数目。结论在进行甄别全同胞对和半同胞对或甄别半同胞对和无关个体对的鉴定时,推荐优先使用LR法,并根据拟进行的鉴定类型和基于的人群数据估计所需遗传标记数目,以保证鉴定效果。
文摘本研究对中国河北地区汉族183个健康无关个体进行12个STR基因座遗传多态性调查。采用QIAamp DNA midi试剂盒提取样本DNA,用Investigator HDplex试剂盒进行扩增及检测。结果在12个STR基因座共检测出167个等位基因和637种基因型,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。所调查的汉族人群12个STR基因座具有较好识别能力。
文摘目的调查12个X染色体短串联重复序列(X chromosome short tandem repeat,X-STR)基因座在中国河北汉族人群中的遗传多态性。方法应用荧光标记复合扩增和毛细管电泳分型技术,对198名河北汉族无关个体(男性96名,女性102名)进行InvestigatorArgusX-12试剂盒中12个X-STR基因座分型,计算群体遗传学参数。结果该群体12个X-STR基因座中DXS10101与DXS10103呈连锁不平衡状态。12个X-STR基因座共检出148个等位基因,其中包括22个分型标准物外(off-ladder,OL)等位基因。12个X-STR基因座在河北汉族人群的杂合度为0.5074~0.9143,多态性信息含量为0.4377~0.9079,男性个体识别力为0.5074~0.9143,女性个体识别力为0.6876~0.9863,三联体非父排除率为0.4377~0.9079,二联体非父排除率为0.2984~0.8373。结论Investigator Argus X-12系统在河北汉族人群中具有高度多态性,适用于法医学个人识别和亲子鉴定,尤其是特殊或复杂的亲子鉴定。
文摘目的检测经长期福尔马林固定的组织降解情况,并比较组织中SNP与STR的检出率。方法本文对24例经福尔马林固定、-20℃保存5年的组织样本,采用Quantifiler?Trio DNA定量试剂盒检测样本DNA的降解系数及浓度,运用55-SNPs SNa Pshot复合分型体系和Power Plex?21试剂盒分别进行SNP与STR检测。结果大部分样本降解系数在1~8,发生不同程度的降解。与未降解样本相比,SNP分型完全一致,检出率为100%;其中8例样本STR分型存在33个等位基因丢失,降解系数均大于2.6,且75.8%的等位基因片段长度大于300bp。当样本检测出16个STR基因座时,似然率与54个SNP相当。当样本检出大于17个STR时,似然率大于54个SNP。STR基因座片段长度与等位基因检出率之间呈负相关。除2例样本降解系数较小却发生等位基因丢失外,其余样本降解系数与等位基因检出率之间呈负相关。结论经福尔马林长期固定的组织DNA易降解,检测SNP明显优于STR,但需要更多的SNP以提高个体识别能力。