西瓜花叶病毒辽宁臭椿分离物的鉴定与全序列分析

2015年10月,在辽宁省盖州市采集到表现花叶的臭椿样品。应用电子显微镜负染色技术检测到线状病毒粒子(800 nm×18 nm)。利用Potyvirus通用引物PVY-Legpoty-F/PVY-Legpoty-R对三株代表样品进行RTPCR扩增,得到750 bp阳性片段。经Blast搜索,与西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)高度同源。利用WMV-5NF/WMV-5NR、WMV-MNF/WMV-MNR和WMV-3NF/WMV-3NR三对引物扩增WMV全基因组,确定为10070核苷酸(MF418043)。基于cp基因进行同源性分析和系统进化关系分析,发现盖州臭椿分离物与北京臭椿分离物的关系最近。这是辽宁臭椿上WMV分子特征的首次报道。