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阳春砂倍半萜合酶AvTPS基因的生物信息学分析和表达纯化
1
作者
张斌
印思颖
+4 位作者
付献瑶
沈良华
郑自由
周仁超
王峰
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期523-534,共12页
目的:克隆阳春砂倍半萜合酶(AvTPS)编码序列,并对其蛋白进行表达和纯化.方法:根据转录组测序获得的倍半萜合酶(TPS)核苷酸序列设计引物,以反转录生成的cDNA为模板,使用RT-PCR克隆获得AvTPS的编码(CDS)序列,并连接pMD-18T载体上,对阳性...
目的:克隆阳春砂倍半萜合酶(AvTPS)编码序列,并对其蛋白进行表达和纯化.方法:根据转录组测序获得的倍半萜合酶(TPS)核苷酸序列设计引物,以反转录生成的cDNA为模板,使用RT-PCR克隆获得AvTPS的编码(CDS)序列,并连接pMD-18T载体上,对阳性菌进行基因测序.利用ClustalX等生物信息软件对AvTPS蛋白氨基酸序列进行生物信息学分析.利用表达载体pSDS233,Ni-NTA亲和层析对蛋白表达和纯化.结果:通过RT-PCR获得了大小为1650 bp的AvTPS的CDS序列并成功连接到pMD-18T载体.生物信息分析表明,AvTPS蛋白含549个氨基酸残基,二级结构以α-螺旋为主等信息.通过蛋白的表达和纯化,获得纯度为94.22%的可溶性AvTPS蛋白.结论:从阳春砂中可成功克隆出AvTPS的编码基因,为后续研究其基因在阳春砂中的特异性表达奠定基础.
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关键词
阳春砂
倍半萜合酶
表达纯化
生物信息学分析
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题名
阳春砂倍半萜合酶AvTPS基因的生物信息学分析和表达纯化
1
作者
张斌
印思颖
付献瑶
沈良华
郑自由
周仁超
王峰
机构
暨南大学药学院基因组药物研究所
中山大学生命科学学院/广东省热带亚热带植物资源重点实验室
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期523-534,共12页
基金
广东省自然科学基金项目(2017A030313561,2018A0303130253)
广东省中医药局科研课题(20141065)
广东省热带亚热带植物资源重点实验室开放课题(PlantKF10)。
文摘
目的:克隆阳春砂倍半萜合酶(AvTPS)编码序列,并对其蛋白进行表达和纯化.方法:根据转录组测序获得的倍半萜合酶(TPS)核苷酸序列设计引物,以反转录生成的cDNA为模板,使用RT-PCR克隆获得AvTPS的编码(CDS)序列,并连接pMD-18T载体上,对阳性菌进行基因测序.利用ClustalX等生物信息软件对AvTPS蛋白氨基酸序列进行生物信息学分析.利用表达载体pSDS233,Ni-NTA亲和层析对蛋白表达和纯化.结果:通过RT-PCR获得了大小为1650 bp的AvTPS的CDS序列并成功连接到pMD-18T载体.生物信息分析表明,AvTPS蛋白含549个氨基酸残基,二级结构以α-螺旋为主等信息.通过蛋白的表达和纯化,获得纯度为94.22%的可溶性AvTPS蛋白.结论:从阳春砂中可成功克隆出AvTPS的编码基因,为后续研究其基因在阳春砂中的特异性表达奠定基础.
关键词
阳春砂
倍半萜合酶
表达纯化
生物信息学分析
Keywords
Amomum villosum
sesquiterpene synthase
expression and purification
bioinformatics analysis
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
阳春砂倍半萜合酶AvTPS基因的生物信息学分析和表达纯化
张斌
印思颖
付献瑶
沈良华
郑自由
周仁超
王峰
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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