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基于trnH-psbA和matK序列的不同种油茶种苗DNA条形码分析 被引量:2
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作者 代佳妮 于靖 +5 位作者 戚华沙 郑蔚 王健 吴友根 赖杭桂 胡新文 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期611-619,共9页
为有效鉴别出不同种油茶种苗,收集101份不同种油茶种苗作为试材,其中18份越南油茶、79份普通油茶、1份博白大果油茶、3份红花油茶,利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列进行扩增并测序分析,随后对序列进行拼接及特征分析,并计算样本种... 为有效鉴别出不同种油茶种苗,收集101份不同种油茶种苗作为试材,其中18份越南油茶、79份普通油茶、1份博白大果油茶、3份红花油茶,利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列进行扩增并测序分析,随后对序列进行拼接及特征分析,并计算样本种间及种内遗传距离,构建系统发育树。结果表明:101份供试材料的trnH-psbA序列全长381 bp,有10个变异位点,可通过变异位点鉴别出越南油茶、红花油茶及部分普通油茶,系统发育树将越南油茶聚为一支,自展支持率为64%;matK序列全长797 bp,有5个变异位点,可通过变异位点鉴别出越南油茶、红花油茶及部分普通油茶,系统发育树将红花油茶聚为一支,越南油茶聚为一支,自展支持率分别为65%和64%。因此,trnH-psbA序列可对越南油茶进行有效鉴别,而matK序列可对越南油茶和红花油茶进行有效鉴别。该研究结果对避免油茶种苗混杂、规范海南油茶种苗市场有一定的指导意义。 展开更多
关键词 trnH-psbA序列 MATK序列 油茶 DNA条形码
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海南油茶2个优良单株的比较转录组学分析 被引量:3
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作者 代佳妮 于靖 +4 位作者 郑蔚 王健 吴友根 胡新文 赖杭桂 《热带生物学报》 2020年第4期426-436,共11页
选取“万海1号”和“万海4号”2个海南产油茶(Camellia vietnamensis)优良单株为试验材料,采用新一代高通量Illumina转录组测序技术,对二者进行转录组测序分析,并进行差异比较。结果表明,“万海1号”的特异性基因中,有651条被注释到与... 选取“万海1号”和“万海4号”2个海南产油茶(Camellia vietnamensis)优良单株为试验材料,采用新一代高通量Illumina转录组测序技术,对二者进行转录组测序分析,并进行差异比较。结果表明,“万海1号”的特异性基因中,有651条被注释到与植株抗病性相关的途径,约占5.26%,有510条被注释到脂肪酸代谢相关的途径,约占4.12%;“万海4号”中有169条特异性基因被注释到倍半萜和三萜生物合成、油菜素类固醇生物合成、类固醇生物合成和单萜类生物合成等植物次生代谢相关途径。2个样本的单拷贝同源基因多被富集到与抗氧化能力相关的GO条目,以及与氨基酸合成代谢相关的KEGG条目,且P值均小于0.05,显示出显著的相关性。本试验可进一步探究海南本地油茶的生理特性及代谢过程,作为海南本地油茶的优良品种选育的科学依据。 展开更多
关键词 海南油茶 比较转录组 基因表达
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基于客流流线的城市轨道车站安全可靠性评价模型 被引量:1
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作者 陈坚 李武 +1 位作者 钟异莹 代佳妮 《城市轨道交通研究》 北大核心 2016年第5期59-63,共5页
为解决城市轨道交通车站运行安全可靠性科学评估的问题,从概率论的视角,以城市轨道交通车站乘客、交通服务设施、列车构成的系统为研究对象,对城市轨道交通车站安全可靠性进行了定义。结合城市轨道交通客流流线特征,建立了城市轨道交通... 为解决城市轨道交通车站运行安全可靠性科学评估的问题,从概率论的视角,以城市轨道交通车站乘客、交通服务设施、列车构成的系统为研究对象,对城市轨道交通车站安全可靠性进行了定义。结合城市轨道交通客流流线特征,建立了城市轨道交通车站节点安全可靠性评价模型和基于权联模型下的车站系统可靠性评估方法。以重庆轨道交通3号线两路口站为例,应用评价模型与方法,计算两路口站进出站节点安全可靠性和车站整体系统的安全靠性。结果表明:重庆轨道交通3号线两路口站进出站节点的安全可靠性为92.2%,整个车站系统的安全可靠性为90.4%。 展开更多
关键词 城市轨道交通 车站节点 客流流线 安全可靠性
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响应面优化超声波辅助提取油茶花中总酚工艺研究 被引量:4
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作者 严和琴 于靖 +4 位作者 郑蔚 代佳妮 吴友根 姚广龙 胡新文 《中国食品添加剂》 CAS 北大核心 2022年第2期52-59,共8页
本研究以海南油茶花为原料,运用超声波辅助,响应面法优化提取海南油茶花中总酚,从而获得海南油茶花总酚提取的最佳条件。通过选取以料液比、提取剂乙醇体积分数、超声温度、超声时间为参数自变量,采用Box-Behnken中心组合法,以海南油茶... 本研究以海南油茶花为原料,运用超声波辅助,响应面法优化提取海南油茶花中总酚,从而获得海南油茶花总酚提取的最佳条件。通过选取以料液比、提取剂乙醇体积分数、超声温度、超声时间为参数自变量,采用Box-Behnken中心组合法,以海南油茶花总酚为响应值,探究4种参数自变量对海南油茶花中总酚提取得率的影响。结果表明,超声波辅助获取油茶花总酚的最佳工艺条件为:料液比1∶600(g/mL),乙醇溶剂体积分数30%,超声温度60℃,超声时间20min,在此最优条件下验证试验油茶花的总酚平均提取得率为(13.03±1.34)%。优化海南油茶花总酚超声波辅助提取的工艺条件,对应用于工业生产及油茶花的综合开发利用具有重要意义。 展开更多
关键词 海南油茶花 响应面法 超声波辅助 总酚
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茶皂素处理对黄皮果实贮藏品质及生理活性的影响 被引量:2
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作者 郑蔚 代佳妮 +5 位作者 严和琴 于靖 吴友根 王健 赖杭桂 曾教科 《中国南方果树》 北大核心 2022年第5期99-103,共5页
以“大鸡心”黄皮果实为材料,研究了不同浓度茶皂素处理对黄皮贮藏品质及生理活性变化的影响。结果表明,低浓度茶皂素处理能显著抑制黄皮果实贮藏后期褐变,保持果实较高的可溶性固形物含量及相对适宜的酸度,有效抑制果实多酚氧化酶、过... 以“大鸡心”黄皮果实为材料,研究了不同浓度茶皂素处理对黄皮贮藏品质及生理活性变化的影响。结果表明,低浓度茶皂素处理能显著抑制黄皮果实贮藏后期褐变,保持果实较高的可溶性固形物含量及相对适宜的酸度,有效抑制果实多酚氧化酶、过氧化物酶活性的上升,并提升超氧化物歧化酶的活性。其中,贮藏12 d时,低浓度茶皂素处理的果实多酚氧化酶活性为(0.39±0.03)U·g^(-1)·min^(-1),低于对照(空白)和高浓度茶皂素处理;贮藏6 d时,超氧化物歧化酶活性为(5.07±0.08)U·g^(-1)·min^(-1),显著高于对照(空白)和高浓度茶皂素处理。而高浓度茶皂素处理可抑制果实保护酶——过氧化氢酶的下降与脂质过氧化产物丙二醛的积累。说明适宜浓度茶皂素处理有利于减缓黄皮果实褐变并维持贮藏品质,提高其商品价值。 展开更多
关键词 油茶粕 茶皂素 黄皮 可溶性固形物 酶活性
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交通运营管理专业课程体系改革初探 被引量:3
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作者 代佳妮 赵柱文 陈柳 《知识经济》 2016年第5期179-179,共1页
本文首先分析了目前交通运营管理专业课程体系现状以及存在的问题,再从人才培养的角度出发,针对理论课程体系改革提出建议,并阐述了改变实践教学形式和加强校外实训基地建设对于实践教学改革的重要性,然后提出考试制度改革的方法,完善... 本文首先分析了目前交通运营管理专业课程体系现状以及存在的问题,再从人才培养的角度出发,针对理论课程体系改革提出建议,并阐述了改变实践教学形式和加强校外实训基地建设对于实践教学改革的重要性,然后提出考试制度改革的方法,完善交通运营管理专业课程体系改革,最终实现培养交通运营管理人才的目标。 展开更多
关键词 交通运营管理 课程体系 实践教学 考试制度 改革
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产地和果形对槟榔主要活性成分及抗氧化活性的影响 被引量:5
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作者 陈明洋 卓小垒 +3 位作者 代佳妮 于靖 戚华沙 吴友根 《热带生物学报》 2020年第1期31-41,共11页
为了系统研究海南不同产地及果形槟榔的主要活性成分及抗氧化活性,采用比色法测定成熟槟榔青皮和种子的总生物碱和总黄酮含量,采用DPPH,ABTS和FRAP法测定其抗氧化能力,利用SPSS软件进行主成分分析和聚类分析,采用TOPSIS法进行综合评价... 为了系统研究海南不同产地及果形槟榔的主要活性成分及抗氧化活性,采用比色法测定成熟槟榔青皮和种子的总生物碱和总黄酮含量,采用DPPH,ABTS和FRAP法测定其抗氧化能力,利用SPSS软件进行主成分分析和聚类分析,采用TOPSIS法进行综合评价。结果表明:不同产地的成熟槟榔,其形态指标及抗氧化能力明显不同,TOPSIS综合排序显示白石岭4(BSL4)的抗氧化能力最强;果实越饱满的槟榔,ABTS自由基清除能力越强。 展开更多
关键词 槟榔(Areca catechu L.) 抗氧化能力 主成分分析 聚类分析
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基于驾驶质量的城市轨道交通乘务排班优化研究 被引量:11
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作者 刘杰 代佳妮 《重庆交通大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期116-122,共7页
将已有乘务排班计划中的轮乘卡抽象为若干工作单元,将驾驶质量定义为由对标精度、准时度、舒适度和能耗度4个指标加权平均和,并给出各种指标计算公式;通过模拟实验测出每位驾驶员在每个工作单元的对标误差、时间误差、区间v-t曲线数据,... 将已有乘务排班计划中的轮乘卡抽象为若干工作单元,将驾驶质量定义为由对标精度、准时度、舒适度和能耗度4个指标加权平均和,并给出各种指标计算公式;通过模拟实验测出每位驾驶员在每个工作单元的对标误差、时间误差、区间v-t曲线数据,计算驾驶质量,再利用无预估模型拟合软件1stOpt,并借助微积分公式推导出驾驶质量同间休时间、出勤时刻、结束时刻的三元函数关系;然后把问题转化为以该函数最大化的一般约束非线性规划模型,分别对七种情况下乘务排班间休时间、出勤时刻、结束时刻进行优化;最后,为了验证优化模型的有效性,分别设计了对比试验,结果表明优化后平均驾驶质量分别提高14.09%、8.17%、6.41%、9.45%、6.31%、7.64%、7.57%。 展开更多
关键词 交通运输工程 城市轨道交通 乘务排班优化 无预估函数拟合 驾驶质量 约束非线性规划
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思政元素融入《高铁应急处理与安全管理》课程教学建设探究
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作者 代佳妮 李云龙 王玲玲 《中文科技期刊数据库(全文版)教育科学》 2022年第10期0114-0116,共3页
《高铁应急处理与安全管理》课程是铁道交通运营管理专业的一门专业核心课程,在铁路运输人才的培养体系中占有重要地位。课程除了需要学生掌握高铁安全管理通识、高铁客运突发事件安全管理与应急处置知识外,还应培养学生培养良好的思想... 《高铁应急处理与安全管理》课程是铁道交通运营管理专业的一门专业核心课程,在铁路运输人才的培养体系中占有重要地位。课程除了需要学生掌握高铁安全管理通识、高铁客运突发事件安全管理与应急处置知识外,还应培养学生培养良好的思想政治素质与职业道德,培养学生严谨的工作态度和良好的团队合作精神,培养学生遵纪守法的法规意识,发挥担当意识,坚持安全第一、服务第一的运营宗旨,尽心尽力服务乘客,树立良好的职业形象。 展开更多
关键词 高铁应急处理 安全管理 课程思政 创新
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重庆轨道交通换乘站效率提升研究
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作者 代佳妮 李云龙 《中文科技期刊数据库(全文版)工程技术》 2022年第7期0176-0178,共3页
近些年来,城市出行客流增长快速,为了满足居民出行需求,城市轨道交通线网的规划与建设需与之匹配,因此,城市轨道交通在国内的公交系统中起到重要作用。同时,在城市轨道交通系统中,换乘系统是其中的重要环节和关键节点,其换乘效率的高低... 近些年来,城市出行客流增长快速,为了满足居民出行需求,城市轨道交通线网的规划与建设需与之匹配,因此,城市轨道交通在国内的公交系统中起到重要作用。同时,在城市轨道交通系统中,换乘系统是其中的重要环节和关键节点,其换乘效率的高低直接影响着整个轨道线网的运营效率、经济效益、服务水平和乘客满意度。不同城市轨道交通线路间的换乘问题也逐渐显露出来,这对整个轨道交通线网的正常运营造成了巨大挑战。因此,开展针对重庆轨道公司换乘效率提升的研究,对于提升整个重庆轨道公司的运营效率、经济效益、服务水平和乘客满意度,保障居民日常出行具有极其重要的意义。本文分析重庆轨道公司各个换乘站的换乘现状及整体存在的问题,然后得出相应的结论,最后结合近年重庆轨道交通建设的实践,对如何提升重庆轨道公司换乘效率提出更有针对性的建议。 展开更多
关键词 重庆轨道交通 换乘 效率提升
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重庆市主城区公交专用道设置标准及实施效果研究
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作者 代佳妮 《市场调查信息(综合版)》 2020年第10期0081-0081,共1页
本文首先阐明主城区设置公交专用道目的,再提重庆市主城区公交专用道的设置标准,并利用“重庆市交通综合信息平 台”对公交专用道的监测数据,分析重庆公交专用道实施的正面效果和负面效果,最后针对实施效果提出合理化建议。
关键词 公交专用道 设置标准 实施效果
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以市场需求为导向的高职人才培养方案的研究——以城市交通运输专业(客车驾驶与交通安全)为例
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作者 陈柳 赵柱文 代佳妮 《城市地理》 2016年第5X期180-181,共2页
本文以我院开设城市交通运输专业(客车驾驶与交通安全)为背景,从我国当前面临较为严峻的交通安全形势下出发,结合当前我院以开展的校企合作实例,提出了符合高职院校的人才培养建设思路和专业定位。在此基础上,又重点从人才培养模式、课... 本文以我院开设城市交通运输专业(客车驾驶与交通安全)为背景,从我国当前面临较为严峻的交通安全形势下出发,结合当前我院以开展的校企合作实例,提出了符合高职院校的人才培养建设思路和专业定位。在此基础上,又重点从人才培养模式、课程设置和职业证书等三方面系统地阐述了人才培养方案的制定要素,并提出为保障人才培养方案实施可行性而需要具备的师资队伍和实训条件。最终,本文深刻指出人才培养方案的制定是实现人才培养目标和组织教学活动的基础和前提,而人才培养方案的实施才是关键。 展开更多
关键词 交通安全管理 人才培养方案 市场需求 订单培养
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交通运输规划对城市物流的影响机理分析
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作者 陈柳 代佳妮 《信息记录材料》 2018年第2期106-107,共2页
随着社会经济的快速进步,我国地区的交通运输业也得到了空前的发展。目前,国内已经初步形成较为完善的交通网络,促进了地方与城市之间的经济交流,推动社会发展的进程。国内的交通运输业发展到今天,已经初具规模,但是现代物流行业的发展... 随着社会经济的快速进步,我国地区的交通运输业也得到了空前的发展。目前,国内已经初步形成较为完善的交通网络,促进了地方与城市之间的经济交流,推动社会发展的进程。国内的交通运输业发展到今天,已经初具规模,但是现代物流行业的发展对对城市的交通运输体系提出了更高的要求。快速发展的物流行业为城市的交通发展开拓了空间,带来了新的交通问题解决思路。本文简要的分析了城市物流与城市交通体系的关联,并提出了城市交通运输规划的参考性建议。 展开更多
关键词 城市物流 交通规划 可持续发展
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槟榔花果转录组数据组装及基因功能注释 被引量:2
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作者 代佳妮 陈曦 +2 位作者 云一倩 王勇 于靖 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1814-1826,共13页
为了挖掘参与槟榔主要次生代谢产物生物合成与积累的关键酶基因,并明确其组织特异性,本研究以‘热研1号’槟榔雄花、雌花、种子、果肉为试验材料,用Illumina HiSeq TM 2000分别进行转录组测序,共获得265 505 184个Clean reads片段,组装... 为了挖掘参与槟榔主要次生代谢产物生物合成与积累的关键酶基因,并明确其组织特异性,本研究以‘热研1号’槟榔雄花、雌花、种子、果肉为试验材料,用Illumina HiSeq TM 2000分别进行转录组测序,共获得265 505 184个Clean reads片段,组装后与Nr、KOG、KEGG、Swiss-Prot四大数据库进行比对,共有78 798个Unigenes被四大数据库注释,其中NR共注释35 467个Unigenes,对比后发现槟榔与油棕、海枣等具有一定的相似性;Swiss-prot共注释23 722个Unigenes;KOG共注释20 499个Unigenes,根据功能将槟榔转录组中的Unigene分为26类;KEGG共注释20 499个Unigenes,有10 009个Unigenes被四大数据库同时注释。槟榔转录组数据库的建立,可以有效地为解决槟榔次生代谢调控方面研究空白及活性成分合成和积累的代谢途径尚未明确的问题给予强大数据支持。该研究所得结果有助于槟榔药用成分的大量生产,为槟榔药用价值的开发利用提供依据。 展开更多
关键词 槟榔 转录组 基因功能
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基于SRAP分子标记的海南油茶品种遗传多样性分析 被引量:4
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作者 严和琴 郑蔚 +3 位作者 代佳妮 严武平 于靖 吴友根 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第6期1901-1908,共8页
为了解海南油茶(Camellia oleifera)种质资源的遗传多样性,本研究采用SRAP技术分析了25份油茶材料的亲缘关系和遗传多样性。结果表明,筛选的16对多态性较高的引物组合,共扩增得到500条清晰稳定的条带,其中多态性条带465个,多态性条带百... 为了解海南油茶(Camellia oleifera)种质资源的遗传多样性,本研究采用SRAP技术分析了25份油茶材料的亲缘关系和遗传多样性。结果表明,筛选的16对多态性较高的引物组合,共扩增得到500条清晰稳定的条带,其中多态性条带465个,多态性条带百分比(PPB)为93.00%,Nei’s遗传一致度范围为0.510 0~0.868 0,遗传距离范围为0.141 6~0.673 3。遗传多样性参数等位基因数(N_(a))、有效等位基因数(N_(e))、基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)和总遗传多样性(H_(t))分别为1.930 0、1.546 8、0.319 5、0.479 0和0.319 5,表明25份油茶种质资源遗传多样性丰富。聚类结果将25份油茶材料分为三大类,未严格按照地理区域划分,说明其遗传背景复杂,一定程度上反映出了目前海南油茶资源的混乱现状。SRAP标记可以反映油茶种质资源间的遗传关系,本研究结果对油茶引种、育种、种质资源保存以及新品种开发等方面具有指导作用,可为海南油茶资源分类鉴定提供参考。 展开更多
关键词 油茶(Camellia oleifera) SRAP 遗传多样性 聚类分析
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基于trnH-psbA和matK序列的油茶种子DNA条形码鉴定 被引量:9
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作者 戚华沙 代佳妮 +7 位作者 杨英楠 李思颖 王健 石林春 吴友根 赖杭桂 胡新文 于靖 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期5057-5065,共9页
本研究利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列对不同物种的34份油茶种子进行DNA条形码鉴定,以分析这两个序列在鉴别越南油茶(Camellia vietnamensis)和普通油茶(Camellia oleifera)的效率。结果表明:34份供试材料的trnH-psbA序列全长395... 本研究利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列对不同物种的34份油茶种子进行DNA条形码鉴定,以分析这两个序列在鉴别越南油茶(Camellia vietnamensis)和普通油茶(Camellia oleifera)的效率。结果表明:34份供试材料的trnH-psbA序列全长395 bp、11个变异位点,系统发育树将普通油茶聚为一支,支持率为72%;matK序列全长837 bp、2个变异位点,系统发育树将越南油茶与高州油茶聚为一支,支持率为64%。可见,trnH-psbA序列和mat K序列结合,可对普通油茶和越南油茶与其他供试油茶物种进行有效鉴别。 展开更多
关键词 越南油茶(Camellia vietnamensis) 普通油茶(Camellia oleifera) DNA条形码 trnH-psbA序列 MATK序列
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中药材五指毛桃丛生芽增殖培养条件的优化 被引量:6
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作者 黄赛 云勇 +5 位作者 任军方 代佳妮 吕德任 王景飞 梁定民 戚华沙 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第21期7167-7173,共7页
为筛选出五指毛桃丛生芽增殖的最适培养条件,本研究以五指毛桃顶芽约1.50 cm为试验材料,采用ANOVA过程和LSD法进行分差分析及多重比较,研究蔗糖、温度、光照强度和植物激素组合对五指毛桃生长状况的影响。结果表明:适宜的培养条件为蔗... 为筛选出五指毛桃丛生芽增殖的最适培养条件,本研究以五指毛桃顶芽约1.50 cm为试验材料,采用ANOVA过程和LSD法进行分差分析及多重比较,研究蔗糖、温度、光照强度和植物激素组合对五指毛桃生长状况的影响。结果表明:适宜的培养条件为蔗糖浓度30.00 g/L、温度24℃~28℃区间和光照强度2 000 lx;在植物激素组合中,最优组合为6-BA 0.20 mg/L+NAA 0.05 mg/L,增殖系数达6.97,同时该组合处理获得较佳的主效应,6-BA主效应差异显著,NAA主效应差异不显著,且6-BA (F=3.10)对五指毛桃丛生芽增殖效果的影响高于NAA (F=2.39)。筛选出五指毛桃适宜的培养条件,为其开发利用提供技术支持。 展开更多
关键词 五指毛桃(Ficus simplicissima) 培养条件 增殖系数 激素组合
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考虑公交线路短时瘫痪的复线设计模式
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作者 罗孝羚 蒋阳升 +2 位作者 黄丹芮 姚志洪 代佳妮 《公路交通科技》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期100-106,共7页
为缓解公交线路在实际运营过程中可能出现短时瘫痪所带来的负面影响,提出了一种不同于传统公交线路设计方式的公交复线线路设计。复线模式的公交线路能够在原线路部分路段出现短时瘫痪时实现快速响应,使公交车辆转移至复线路段运营。首... 为缓解公交线路在实际运营过程中可能出现短时瘫痪所带来的负面影响,提出了一种不同于传统公交线路设计方式的公交复线线路设计。复线模式的公交线路能够在原线路部分路段出现短时瘫痪时实现快速响应,使公交车辆转移至复线路段运营。首先,构建了以乘客出行时间最小化为目标的公交线路复线设计模式,同时依据所构建的模型特征,提出了相应的启发式算法求解。为了验证所提出模型和算法的效果,选取了绵阳一条10站点的公交线路为例进行案例验证。结果表明,相比于传统模型公交线路部分路段发生瘫痪时,公交车辆只能等待路段通行缓慢恢复,导致乘客出行时间过长的问题,通过复线设计,在原公交线路部分路段发生瘫痪时,公交车辆通过绕行至复线线路,可以使乘客总的出行时间减少43.97%。最后,为了分析不同参数取值的影响,对站点到达时间以及道路瘫痪程度进行了相应的灵敏度分析,分析结果表明,当公交运行路段瘫痪越严重,使用该复线设计的效果越好,但如果复线站点与原站点距离过远时,将会导致乘客从到达复线站点以及从复线站点到达最终目的地的走行时间增长,将会降低该方法的应用效果。因此,在应用所提出的公交复线设计时,原线路站点对应的复线站点距离不宜过远。 展开更多
关键词 交通工程 复线线路模式 对比验证 公交线路 灵敏度分析
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越南油茶环阿屯醇合酶基因的克隆及表达分析
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作者 郑蔚 代佳妮 +3 位作者 严和琴 于靖 王勇 吴友根 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第7期2188-2195,共8页
为研究越南油茶(Camellia vietnamensis T.C.Huang ex Hu)中环阿屯醇合酶(cycloartenol synthase,CAS)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆的方法克隆得到环阿屯醇合酶基因全长并命名为CvCAS,对其进行生物信息学分析及表达模式研究... 为研究越南油茶(Camellia vietnamensis T.C.Huang ex Hu)中环阿屯醇合酶(cycloartenol synthase,CAS)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆的方法克隆得到环阿屯醇合酶基因全长并命名为CvCAS,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvCAS全长2411 bp,包括一个2277 bp完整的开放阅读框,编码758个氨基酸,与茶(Camellia sinensis)、中华猕猴桃(Actinidia chinensis var.chinensis),刺楸(Kalopanax septemlobus)和人参(Panax ginseng)的CAS蛋白序列相似度均在85%以上,系统发育树分析显示CvCAS与茶(Camellia sinensis)和向日葵(Helianthus annuus)的CAS蛋白序列聚为一支。预测其蛋白分子质量为86.6 kD,理论等电点为6.20,无跨膜螺旋区,属于不稳定亲水性蛋白。序列比对分析表明,CvCAS具有氧化鲨烯环化酶(OSCs)超家族典型结构位点(DCTAE),三萜合成酶高度保守结构位点(DGSWYGSWGVCFTYG)和OSCs稳定结构保守位点(QW)。CvCAS基因在种子不同成熟期及植株不同组织部位均有表达,其中种子的表达量最高,且在九月与十月的表达量显著高于其他月份。本研究结果为越南油茶三萜皂苷等活性成分合成研究提供理论依据。 展开更多
关键词 越南油茶 阿屯醇合酶基因 克隆 表达分析
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越南油茶HMGCR基因的克隆及表达分析
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作者 郑蔚 代佳妮 +3 位作者 严和琴 于靖 王勇 吴友根 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第13期4296-4304,共9页
为研究越南油茶(Camellia vietnamensis T.C.Huang ex Hu)中HMGCR(3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆得到HMGCR基因全长并命名为CvHMGCR,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvHMGCR... 为研究越南油茶(Camellia vietnamensis T.C.Huang ex Hu)中HMGCR(3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆得到HMGCR基因全长并命名为CvHMGCR,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvHMGCR全长1800 bp,包括一个1770 bp完整的开放阅读框,编码589个氨基酸,与茶树(Camellia sinensis)、毛柄连蕊茶(Camellia fraterna)、喜树(Camptotheca acuminata)、风铃辣椒(Capsicum baccatum)和三七(Panax notoginseng)的HMGCR蛋白序列相似度均在75%以上,系统发育树显示Cv HMGCR与茶树(Camellia sinensis)、毛柄连蕊茶(Camellia fraterna)和喜树(Camptotheca acuminata)的HMGCR蛋白序列聚为一支。预测其蛋白分子质量为63.1kD,理论等电点为6.37,有两个跨膜螺旋区,属于不稳定疏水性蛋白。序列比对分析表明,CvHMGCR有4个典型的HMGCR保守基序,即2个HMG-CoA结合基序和2个NADP(H)结合基序。CvHMGCR基因在种子不同成熟期及植株根叶中均有表达,其中种子在九月的表达量显著高于其他月份;而对于不同组织部位中,叶的表达量最高。本研究结果为越南油茶次生代谢产物合成研究提供理论依据。 展开更多
关键词 越南油茶 HMGCR基因 克隆 生物信息学分析
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