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斑马鱼PKR剪接异构体克隆、鉴定及转录表达分析
1
作者
欧湘滢
邵敏
+3 位作者
高宗泽
代卫凯
熊嘉鸿
胡有生(指导)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期839-843,849,共6页
目的:克隆斑马鱼PKR(ZPKR)及其剪接异构体(ZPKRV)并对其进行鉴定和转录表达分析。方法:采用基因克隆法克隆ZPKR及ZPKRV;利用生物信息学方法分析其结构差异,设计定量分析引物;使用病毒双链RNA类似物(Poly I:C)刺激,提取斑马鱼组织总RNA...
目的:克隆斑马鱼PKR(ZPKR)及其剪接异构体(ZPKRV)并对其进行鉴定和转录表达分析。方法:采用基因克隆法克隆ZPKR及ZPKRV;利用生物信息学方法分析其结构差异,设计定量分析引物;使用病毒双链RNA类似物(Poly I:C)刺激,提取斑马鱼组织总RNA并反转录合成c DNA,通过q PCR检测ZPKR及ZPKRV转录表达的差异,推测ZPKR及ZPKRV的功能。结果:首次在斑马鱼组织中克隆到ZPKRV;生物信息分析显示,ZPKRV仅仅在ZPKR的双链RNA结合结构域和激酶区之间的链接区缺失了28个氨基酸残基,并且缺失的序列包括链接区的碱性区;Poly I:C刺激后的转录表达显示,在刺激后的12 h,ZPKR表达上调到第一个峰值,24 h又下调,48 h再上调;而ZPKRV仅在刺激后24 h表达上调到最高,然后下调。结论:ZPKRV碱性区的缺失,可能会导致其单链RNA结合功能的丧失,进而促进蛋白的翻译表达;ZPKR和ZPKRV同时表达,可能通过显性的负效应,降低PKR在抗病毒免疫反应中对蛋白翻译的抑制作用,促进抗病毒免疫细胞因子的翻译表达。
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关键词
斑马鱼
ZPKR
ZPKR剪接异构体
转录表达
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职称材料
联苯缩氨基胍衍生物的合成及其抗菌活性评价(英文)
被引量:
2
2
作者
余海红
周胜超
+4 位作者
郭婷婷
梁焯
陈华斌
代卫凯
宋明霞
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1497-1502,共6页
基于查尔酮缩氨基胍衍生物的结构修饰,设计合成了一系列含联苯片段的缩氨基胍衍生物.目标化合物的结构通过1H NMR、13C NMR和HRMS进行了确证,并评价了其抗菌活性.结果显示目标化合物对所选菌种显示出了较好的抑制活性,最低抑菌浓度值(M...
基于查尔酮缩氨基胍衍生物的结构修饰,设计合成了一系列含联苯片段的缩氨基胍衍生物.目标化合物的结构通过1H NMR、13C NMR和HRMS进行了确证,并评价了其抗菌活性.结果显示目标化合物对所选菌种显示出了较好的抑制活性,最低抑菌浓度值(MIC)大都在0.5~8μg/Ml.其中,2-((4'-溴[1,1'-二苯]-4-基)亚甲基)肼-1-甲脒(3j)的抗菌活性最好,对所选菌株包括耐药菌均显示出强的抑菌活性,其中对金葡菌CMCC(B)26003、粪肠球菌CMCC 29212和多药耐药金葡菌ATCC 33591尤为敏感,最低抑菌浓度值达到0.5μg/Ml.此外,化合物3j表现低的细胞毒性,对正常人体细胞HEK 293T的IC50值为60.90μmol/L.该结果表明化合物3j具有较好的选择性,在抗菌药物研究领域具有研究价值.
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关键词
缩氨基胍
联苯
抗菌活性
原文传递
题名
斑马鱼PKR剪接异构体克隆、鉴定及转录表达分析
1
作者
欧湘滢
邵敏
高宗泽
代卫凯
熊嘉鸿
胡有生(指导)
机构
井冈山大学医学部
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期839-843,849,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31560595)
江西省教育厅科技计划项目(GJJ170630)。
文摘
目的:克隆斑马鱼PKR(ZPKR)及其剪接异构体(ZPKRV)并对其进行鉴定和转录表达分析。方法:采用基因克隆法克隆ZPKR及ZPKRV;利用生物信息学方法分析其结构差异,设计定量分析引物;使用病毒双链RNA类似物(Poly I:C)刺激,提取斑马鱼组织总RNA并反转录合成c DNA,通过q PCR检测ZPKR及ZPKRV转录表达的差异,推测ZPKR及ZPKRV的功能。结果:首次在斑马鱼组织中克隆到ZPKRV;生物信息分析显示,ZPKRV仅仅在ZPKR的双链RNA结合结构域和激酶区之间的链接区缺失了28个氨基酸残基,并且缺失的序列包括链接区的碱性区;Poly I:C刺激后的转录表达显示,在刺激后的12 h,ZPKR表达上调到第一个峰值,24 h又下调,48 h再上调;而ZPKRV仅在刺激后24 h表达上调到最高,然后下调。结论:ZPKRV碱性区的缺失,可能会导致其单链RNA结合功能的丧失,进而促进蛋白的翻译表达;ZPKR和ZPKRV同时表达,可能通过显性的负效应,降低PKR在抗病毒免疫反应中对蛋白翻译的抑制作用,促进抗病毒免疫细胞因子的翻译表达。
关键词
斑马鱼
ZPKR
ZPKR剪接异构体
转录表达
Keywords
Zebrafish
ZPKR
ZPKR transcript variant
Transcriptional expression
分类号
R392.12 [医药卫生—免疫学]
下载PDF
职称材料
题名
联苯缩氨基胍衍生物的合成及其抗菌活性评价(英文)
被引量:
2
2
作者
余海红
周胜超
郭婷婷
梁焯
陈华斌
代卫凯
宋明霞
机构
井冈山大学医学部基础医学与药学学院
出处
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1497-1502,共6页
基金
Project supported by the National Natural Science Foundation of China(No.81560561)
the Doctoral Foundation of Jinggangshan University(No.JZB1317)~~
文摘
基于查尔酮缩氨基胍衍生物的结构修饰,设计合成了一系列含联苯片段的缩氨基胍衍生物.目标化合物的结构通过1H NMR、13C NMR和HRMS进行了确证,并评价了其抗菌活性.结果显示目标化合物对所选菌种显示出了较好的抑制活性,最低抑菌浓度值(MIC)大都在0.5~8μg/Ml.其中,2-((4'-溴[1,1'-二苯]-4-基)亚甲基)肼-1-甲脒(3j)的抗菌活性最好,对所选菌株包括耐药菌均显示出强的抑菌活性,其中对金葡菌CMCC(B)26003、粪肠球菌CMCC 29212和多药耐药金葡菌ATCC 33591尤为敏感,最低抑菌浓度值达到0.5μg/Ml.此外,化合物3j表现低的细胞毒性,对正常人体细胞HEK 293T的IC50值为60.90μmol/L.该结果表明化合物3j具有较好的选择性,在抗菌药物研究领域具有研究价值.
关键词
缩氨基胍
联苯
抗菌活性
Keywords
aminoguanidine
biphenyl
antimicrobial activity
分类号
TQ463 [化学工程—制药化工]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斑马鱼PKR剪接异构体克隆、鉴定及转录表达分析
欧湘滢
邵敏
高宗泽
代卫凯
熊嘉鸿
胡有生(指导)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
2
联苯缩氨基胍衍生物的合成及其抗菌活性评价(英文)
余海红
周胜超
郭婷婷
梁焯
陈华斌
代卫凯
宋明霞
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
原文传递
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引证文献
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