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甘蓝型油菜BnCNGC基因家族鉴定及其在核盘菌侵染和PEG处理下的表达特性分析
1
作者
陈松余
丁一娟
+5 位作者
孙峻溟
黄登文
杨楠
代雨涵
万华方
钱伟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1357-1371,共15页
CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNG...
CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNGC蛋白保守结构域及特异基序氨基酸序列在全基因组水平鉴定了甘蓝型油菜BnCNGC家族成员,分析其基因结构、染色体定位、蛋白理化性质、蛋白保守结构域、系统进化及启动子顺式作用元件等。利用转录组数据,筛选甘蓝型油菜逆境响应候选BnCNGC成员,并采用实时荧光定量PCR分析其在核盘菌、PEG模拟干旱胁迫下的表达模式。结果显示,共鉴定到49个甘蓝型油菜BnCNGC成员,分布于除A08、C06的17对染色体上,含有5~10个内含子,其上游1500 bp包含大量逆境胁迫响应元件。BnCNGC家族成员编码的蛋白质含413~801个氨基酸,相对分子量(MW)范围47.62~110.58kD,等电点(pI)范围6.10~9.88。系统进化分析表明,BnCNGC分为Group Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ四类。转录组数据分析表明, BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均参与逆境胁迫响应。实时荧光定量PCR分析表明,甘蓝型油菜叶片中BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均在核盘菌胁迫下表达下调,下调量分别为48.2%~99.1%、79.4%~87.1%和39.7%~92.6%。PEG模拟干旱胁迫时,甘蓝油菜叶片中BnCNGC9在处理24 h后上调3.34倍, BnCNGC48在处理48 h后上调6.27倍, BnCNGC27对干旱胁迫不敏感。
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关键词
甘蓝型油菜
CNGC基因家族
核盘菌
PEG模拟干旱
表达分析
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职称材料
女性生育力保存现状
被引量:
11
2
作者
单旭东
代雨涵
+2 位作者
黎程平
代文婷
宋丽莎
《中国计划生育和妇产科》
2020年第10期49-51,55,共4页
1女性生育现状随着环境变化和社会压力增加,人类生育能力普遍下降,不孕症的发生率也逐渐升高,女性整体生育年龄的推迟使生育力的下降呈现了叠加效应。我国自2016年实施"全面二孩"政策,带来了高龄生育和婴儿潮等相关问题[1]。...
1女性生育现状随着环境变化和社会压力增加,人类生育能力普遍下降,不孕症的发生率也逐渐升高,女性整体生育年龄的推迟使生育力的下降呈现了叠加效应。我国自2016年实施"全面二孩"政策,带来了高龄生育和婴儿潮等相关问题[1]。除头胎和二胎叠加形成的出生高峰外,高龄生育是女性生育现存的主要问题。据来自于《中国妇女报》的统计显示,现阶段符合条件生育二孩的夫妇中女性年龄在35岁以上的人数占60%,40岁以上的人数占49.6%,她们大多面临着生育难的现状,同时高龄产妇更易孕育染色体异常或先天畸形的胎儿[1]。
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关键词
女性生育力保存
卵巢冷冻
卵子冷冻
胚胎冷冻
原文传递
题名
甘蓝型油菜BnCNGC基因家族鉴定及其在核盘菌侵染和PEG处理下的表达特性分析
1
作者
陈松余
丁一娟
孙峻溟
黄登文
杨楠
代雨涵
万华方
钱伟
机构
西南大学农学与生物科技学院/西南大学农业科学研究院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1357-1371,共15页
基金
重庆市自然科学基金项目(cstc2020jcyj-msxmX0957)
国家重点研发计划项目(2018YFD0100500)资助。
文摘
CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNGC蛋白保守结构域及特异基序氨基酸序列在全基因组水平鉴定了甘蓝型油菜BnCNGC家族成员,分析其基因结构、染色体定位、蛋白理化性质、蛋白保守结构域、系统进化及启动子顺式作用元件等。利用转录组数据,筛选甘蓝型油菜逆境响应候选BnCNGC成员,并采用实时荧光定量PCR分析其在核盘菌、PEG模拟干旱胁迫下的表达模式。结果显示,共鉴定到49个甘蓝型油菜BnCNGC成员,分布于除A08、C06的17对染色体上,含有5~10个内含子,其上游1500 bp包含大量逆境胁迫响应元件。BnCNGC家族成员编码的蛋白质含413~801个氨基酸,相对分子量(MW)范围47.62~110.58kD,等电点(pI)范围6.10~9.88。系统进化分析表明,BnCNGC分为Group Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ四类。转录组数据分析表明, BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均参与逆境胁迫响应。实时荧光定量PCR分析表明,甘蓝型油菜叶片中BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均在核盘菌胁迫下表达下调,下调量分别为48.2%~99.1%、79.4%~87.1%和39.7%~92.6%。PEG模拟干旱胁迫时,甘蓝油菜叶片中BnCNGC9在处理24 h后上调3.34倍, BnCNGC48在处理48 h后上调6.27倍, BnCNGC27对干旱胁迫不敏感。
关键词
甘蓝型油菜
CNGC基因家族
核盘菌
PEG模拟干旱
表达分析
Keywords
Brassica napus
CNGC gene family
Sclerotinia sclerotiorum
PEG-simulated drought
relative expression analysis
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
女性生育力保存现状
被引量:
11
2
作者
单旭东
代雨涵
黎程平
代文婷
宋丽莎
机构
成都中医药大学医学与生命科学学院/附属生殖妇幼医院
成都中医药大学医学技术学院
出处
《中国计划生育和妇产科》
2020年第10期49-51,55,共4页
基金
四川省科技厅软科学研究计划项目(项目编号:2018ZR0300)。
文摘
1女性生育现状随着环境变化和社会压力增加,人类生育能力普遍下降,不孕症的发生率也逐渐升高,女性整体生育年龄的推迟使生育力的下降呈现了叠加效应。我国自2016年实施"全面二孩"政策,带来了高龄生育和婴儿潮等相关问题[1]。除头胎和二胎叠加形成的出生高峰外,高龄生育是女性生育现存的主要问题。据来自于《中国妇女报》的统计显示,现阶段符合条件生育二孩的夫妇中女性年龄在35岁以上的人数占60%,40岁以上的人数占49.6%,她们大多面临着生育难的现状,同时高龄产妇更易孕育染色体异常或先天畸形的胎儿[1]。
关键词
女性生育力保存
卵巢冷冻
卵子冷冻
胚胎冷冻
分类号
R711.6 [医药卫生—妇产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蓝型油菜BnCNGC基因家族鉴定及其在核盘菌侵染和PEG处理下的表达特性分析
陈松余
丁一娟
孙峻溟
黄登文
杨楠
代雨涵
万华方
钱伟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
2
女性生育力保存现状
单旭东
代雨涵
黎程平
代文婷
宋丽莎
《中国计划生育和妇产科》
2020
11
原文传递
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