金钱鱼基因组微卫星分布特征分析及多态性标记开发

【目的】研究金钱鱼(Scatophagus argus)全基因组微卫星分布特征,筛选高多态性微卫星(SSR)标记。【方法】利用MISA软件对金钱鱼基因组中微卫星进行筛选并分析分布特征,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点。【结果与结论】金钱鱼基因组总共挖掘390967个SSR位点,相对丰度为653个/Mb。二碱基重复类型最多(52.64%),微卫星标记整体偏向A+T碱基组合。筛选出23对多态性标记位点,其中7对的等位基因数为4~11,期望杂合度为0.431~0.859,观测杂合度0.417~0.861,多态性含量为0.389~0.830。经Bonferroni校正后,5个位点符合哈德温伯格平衡,且位点间不存在连锁不平衡现象。

泰国斗鱼foxl2基因的分子克隆及组织表达模式

Foxl2 (winged helix/forkhead transcription factor gene 2)是叉头框转录因子家族成员之一,在鱼类性别决定与分化中起重要的作用。为了探讨foxl2基因在泰国斗鱼(Bettas plendens)雌雄组织中的表达差异,本研究利用分子克隆技术分离并鉴定了泰国斗鱼foxl2基因cDNA序列1 246 bp,其中开放阅读框为921 bp,共编码306个氨基酸。多重序列比对分析,泰国斗鱼Foxl2氨基酸序列与其他鱼类的Foxl2具有较高的同源性,显示出序列进化的保守性。组织表达结果显示,雌性泰国斗鱼foxl2基因在性腺中表达量最高;在雄鱼中,foxl2基因在性腺中表达量最低,结果表明foxl2基因组织表达具有显著的特异性及性别差异。本研究结果为后续开展泰国斗鱼的性别调控机理提供了参考。