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林麝肺成纤维细胞线粒体全基因组结构特征及遗传变异分析
被引量:
1
1
作者
唐可欣
伍茜
+9 位作者
付文龙
程建国
吴杰
周磊
王翔
赵位
任梓薇
李依濛
刘洁
罗燕
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期534-541,共8页
林麝(Moschus berezovskii)是一种具有较高经济价值和药用价值的保护野生动物。为深入研究林麝线粒体基因组的结构特征及遗传变异,基于IlluminaNovaSeq平台对林麝肺成纤维细胞FMD-C1线粒体进行全基因组测序,并进行特征注释、结构预测、...
林麝(Moschus berezovskii)是一种具有较高经济价值和药用价值的保护野生动物。为深入研究林麝线粒体基因组的结构特征及遗传变异,基于IlluminaNovaSeq平台对林麝肺成纤维细胞FMD-C1线粒体进行全基因组测序,并进行特征注释、结构预测、序列分析和系统发育重建。结果显示,FMD-C1线粒体基因组序列全长为16351bp,共有13个蛋白编码基因(protein coding gene,PCG),22个tRNA,2个rRNA和两段非编码区,具有明显的AT偏好性。将序列上传至GenBank,登录号为MW879208。与NCBI上林麝的其余序列比对,FMD-C1的4个PCGs中检测出5个单氨基酸突变和3个插入氨基酸;D-loop区检测出19个差异碱基和2个碱基缺失。系统进化分析发现与林麝亲缘关系最近的是安徽麝。研究结果可为林麝的选育和遗传多样性保护提供参考依据,也为进一步探讨林麝肺部疾病线粒体水平的致病机制奠定基础。
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关键词
林麝
线粒体基因组
蛋白编码基因
非编码区
系统进化
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职称材料
题名
林麝肺成纤维细胞线粒体全基因组结构特征及遗传变异分析
被引量:
1
1
作者
唐可欣
伍茜
付文龙
程建国
吴杰
周磊
王翔
赵位
任梓薇
李依濛
刘洁
罗燕
机构
四川农业大学动物医学院
四川养麝研究所
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期534-541,共8页
基金
四川省科技厅四川省科研院所科技成果转化资金(2022JDZH0026)。
文摘
林麝(Moschus berezovskii)是一种具有较高经济价值和药用价值的保护野生动物。为深入研究林麝线粒体基因组的结构特征及遗传变异,基于IlluminaNovaSeq平台对林麝肺成纤维细胞FMD-C1线粒体进行全基因组测序,并进行特征注释、结构预测、序列分析和系统发育重建。结果显示,FMD-C1线粒体基因组序列全长为16351bp,共有13个蛋白编码基因(protein coding gene,PCG),22个tRNA,2个rRNA和两段非编码区,具有明显的AT偏好性。将序列上传至GenBank,登录号为MW879208。与NCBI上林麝的其余序列比对,FMD-C1的4个PCGs中检测出5个单氨基酸突变和3个插入氨基酸;D-loop区检测出19个差异碱基和2个碱基缺失。系统进化分析发现与林麝亲缘关系最近的是安徽麝。研究结果可为林麝的选育和遗传多样性保护提供参考依据,也为进一步探讨林麝肺部疾病线粒体水平的致病机制奠定基础。
关键词
林麝
线粒体基因组
蛋白编码基因
非编码区
系统进化
Keywords
Moschus berezovskii
Mitochondrial DNA
Protein coding gene
Non-coding region
Phylogeny
分类号
S865.41 [农业科学—野生动物驯养]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
林麝肺成纤维细胞线粒体全基因组结构特征及遗传变异分析
唐可欣
伍茜
付文龙
程建国
吴杰
周磊
王翔
赵位
任梓薇
李依濛
刘洁
罗燕
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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