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D-青霉胺诱导的自身免疫性疾病模型大鼠脾组织中微RNA的表达
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作者 任禹珂 姜华 +5 位作者 张頔 杨艳伟 王超 张河战 李波 林志 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2021年第5期353-359,共7页
目的建立不同剂量D-青霉胺诱导的Brown Norway(BN)大鼠自身免疫性疾病模型,通过RT-qPCR检测大鼠脾组织中4种微RNA(miRNA)miR-126a-5p,miR-146a-5p,miR-27a-3p和miR-155-5p表达的变化,探讨miRNA作为生物标志物预测药源性自身免疫毒性的... 目的建立不同剂量D-青霉胺诱导的Brown Norway(BN)大鼠自身免疫性疾病模型,通过RT-qPCR检测大鼠脾组织中4种微RNA(miRNA)miR-126a-5p,miR-146a-5p,miR-27a-3p和miR-155-5p表达的变化,探讨miRNA作为生物标志物预测药源性自身免疫毒性的意义。方法采用30只BN雄性大鼠,分为溶媒对照组(生理盐水)、D-青霉胺150和450 mg·kg^(-1)组,每组10只,分别在给药7和14 d后(各5只)解剖,ELISA检测血清抗核抗体(ANA);测体重,计算脾系数;HE染色观察脾组织病理改变;使用茎环法RT-qPCR检测脾组织中miRNA表达水平,并绘制受试者操作特征曲线(ROC),比较ANA,miR-126a-5p,miR-146a-5p,miR-27a-3p和miR-155-5p对药源性自身免疫毒性的预测价值。结果与溶媒对照组相比,D-青霉胺给药组大鼠脾系数增加(P<0.05),脾组织生发中心活跃伴易染体巨噬细胞数目增多,血清ANA水平增高(P<0.05),脾组织中miR-126a-5p,miR-146a-5p,miR-27a-3p和miR-155-5p表达水平均显著升高(P<0.01)。ANA,miR-126a-5p,miR-146a-5p,miR-27a-3p和miR-155-5p的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.783(95%CI,0.618~0.947),0.887(95%CI,0.732~1.000),0.851(95%CI,0.705~0.997),0.846(95%CI,0.701~0.991)和0.828(95%CI,0.667~0.989)。结论D-青霉胺诱导的自身免疫性疾病模型大鼠脾组织miRNA出现异常表达,并且与传统自身免疫生物标志物ANA相比具有更高的预测价值,提示miRNA有可能成为早期诊断药源性自身免疫毒性的生物标志物。 展开更多
关键词 D-青霉胺 自身免疫性疾病 微RNA
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应用深度学习卷积神经网络识别小鼠胃鳞状细胞癌
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作者 林志 任禹珂 +6 位作者 赵永田 杨艳伟 李双星 屈哲 霍桂桃 耿兴超 张頔 《药物评价研究》 CAS 北大核心 2024年第8期1687-1694,共8页
目的拟通过深度学习技术,建立小鼠胃鳞状细胞癌辅助诊断模型,以提高病理诊断的准确性和一致性。方法收集致癌性研究中小鼠胃鳞状细胞癌组织93例和正常小鼠胃组织56例,扫描成数字切片后,进行半自动化数据标注。对所有数据进行组织提取、... 目的拟通过深度学习技术,建立小鼠胃鳞状细胞癌辅助诊断模型,以提高病理诊断的准确性和一致性。方法收集致癌性研究中小鼠胃鳞状细胞癌组织93例和正常小鼠胃组织56例,扫描成数字切片后,进行半自动化数据标注。对所有数据进行组织提取、伪影去除以及良性上皮区域剔除等预处理后,按照8∶1∶1的比例随机分为训练集、验证集和测试集。基于HALO AI平台构建DenseNet算法模型用以识别胃鳞状细胞癌区域和非鳞状细胞癌区域。采用精确率(Pr)、召回率(Re)及F1-Score对构建的算法模型进行性能评估。结果构建的DenseNet算法模型在测试集中的总体Pr为0.904,召回率为0.929,F1-Score为0.916。结论建立的DenseNet算法模型对于辅助诊断小鼠胃鳞状细胞癌具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 非临床药物安全性评价 毒性病理学 人工智能 深度学习 胃鳞状细胞癌
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钩藤碱通过抑制Smad信号通路磷酸化减轻腹腔粘连发生的作用机制 被引量:6
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作者 宋宇 张慧 +5 位作者 刘瑞丽 海广范 王童 岳佳新 张炜丽 任禹珂 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期229-235,共7页
腹腔粘连是临床上术后常见的并发症,目前临床上还没有较好的针对性药物,临床防治主要依靠物理手段或激素。钩藤碱是传统中药钩藤的主要有效成分。本课题观察了钩藤碱对实验性腹腔粘连的防治效果,实验结果显示,钩藤碱可剂量依赖地减轻腹... 腹腔粘连是临床上术后常见的并发症,目前临床上还没有较好的针对性药物,临床防治主要依靠物理手段或激素。钩藤碱是传统中药钩藤的主要有效成分。本课题观察了钩藤碱对实验性腹腔粘连的防治效果,实验结果显示,钩藤碱可剂量依赖地减轻腹腔粘连的程度,显著降低大鼠血清白介素-6(interleukin-6,IL-6)、白介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)及腹腔液中转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)和结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)的蛋白含量。表明其防治腹腔粘连作用的机制可能与抑制炎症因子和TGF-β1/Smad信号通路有关。 展开更多
关键词 钩藤碱 腹腔粘连 转化生长因子Β1 结缔组织生长因子
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MicroRNA检测方法的研究进展 被引量:3
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作者 任禹珂 王超 +6 位作者 屈哲 霍桂桃 张頔 杨艳伟 王雪 李波 林志 《药物评价研究》 CAS 2021年第8期1793-1799,共7页
MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性的小分子单链非编码RNA,通过调节基因的表达在许多生命活动中起重要作用。在一些疾病(如癌症和自身免疫性疾病)发生时,miRNAs的表达谱可能发生改变,所以在药物的安全性评价中,其有望成为诊断或预后生物标... MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性的小分子单链非编码RNA,通过调节基因的表达在许多生命活动中起重要作用。在一些疾病(如癌症和自身免疫性疾病)发生时,miRNAs的表达谱可能发生改变,所以在药物的安全性评价中,其有望成为诊断或预后生物标志物。因此,准确测定miRNA的表达对于其应用十分重要。对传统的RNA印记(Northern blotting)、微阵列(microarray)和实时定量PCR(qRT-PCR)以及一些新的miRNAs检测方法(如基于纳米材料的miRNAs检测、核酸扩增等技术)进行概述,并阐述了这些方法的优缺点。 展开更多
关键词 MICRORNA RNA印记 微阵列 实时定量PCR 核酸扩增技术
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