SNRPA1在肠癌中的表达及对于辛伐他汀抗肿瘤活性的影响

目的研究小核核糖核蛋白多肽A1(Small nuclear ribonucleoprotein A1,SNRPA1)在肠癌组织中的表达及对辛伐他汀抗肿瘤活性的影响。方法通过TCGA数据库、CPTAC及HPA数据库分析SNRPA1在肠癌中的的转录水平和蛋白表达水平,并通过组织芯片验证肿瘤组织与正常组织表达差异。利用NCI-60肿瘤细胞药物活性数据分析SNRPA1与辛伐他汀的相关性。通过qPCR筛选及WB验证SNRPA1高表达细胞株RKO及相对低表达细胞株HCT-116并采用CCK8法检测其对辛伐他汀抗肿瘤活性的影响。结果TCGA数据、CPTAC数据表明肠癌组织中SNRPA1的转录和表达水平显著高于癌旁组织(P<0.0001)。组织芯片免疫组化染色结果可见SNRPA1在肿瘤组织中表达升高。NCI-60数据表明SNRPA1的表达水平与辛伐他汀的抗肿瘤活性呈负相关性(R=-0.64,P<0.0001)。CCK8结果表明RKO细胞对辛伐他汀敏感性较低(IC 50=18.3μM),HCT-116对辛伐他汀敏感性相对较高(IC 50=9.91μM)。结论SNRPA1在肠癌组织中异常高表达,辛伐他汀的抗肿瘤活性与SNRPA1的表达呈负相关,降低SNRPA1的表达可增强辛伐他汀的抗肿瘤活性。

基于网络药理学和分子对接探讨厚朴酚治疗胆管癌的分子机制

目的:基于网络药理学和分子对接筛选厚朴酚作用胆管癌的具体靶点,探讨厚朴酚治疗胆管癌的潜在机制。方法:基于TCMSP、Swiss Target Prediction、STITCH、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出厚朴酚以及胆管癌的靶点基因,通过Venny 2.1.0平台分析得到两者的共同靶点。利用STRING数据库探索厚朴酚以及胆管癌共同靶点之间的相互作用关系,使用CytoScape3.9.1软件筛选Top10-Hub(核心)靶点。通过DAVID数据库对厚朴酚和胆管癌的共同靶点基因进行GO和KEGG富集分析,使用Auto Dock Tools-1.5.6软件进行分子对接验证结果可信性。结果:厚朴酚治疗胆管癌的交集靶点基因47个,核心靶点为AKT1、IL6、CASP3、CCND1、PTGS2、EGFR、ERBB2、MMP9、MMP2和KDR。GO生物过程富集分析中共得到230条结果,主要包括负调控凋亡过程、正向调节细胞增殖和蛋白质自身磷酸化等。KEGG信号通路分析得到120条,主要涉及癌症信号通路、内分泌耐药和膀胱癌等。分子对接结果显示核心靶点与厚朴酚的结合能均<-5.0 kcal/mol,表明整体结合情况良好。结论:厚朴酚可以通过调控PTGS2和MMP9等关键分子影响胆管癌细胞的凋亡和增殖等生物学过程,进而发挥治疗胆管癌的作用。

视黄酸受体α在肿瘤中的研究进展

视黄酸受体(RAR)家族成员包括RAR与视黄酸X受体两大类,它们由3种不同的基因α、β、γ编码,由此形成不同的受体亚型。与其他受体一样,RARα参与调控细胞分化、增殖、凋亡以及胚胎发育、视觉形成、骨骼形成、新陈代谢、造血等许多关键的生命活动过程,并且RARα的异常表达具有肿瘤相关性和组织差异性。现就RARα在肿瘤中的研究情况进行综述。

ARMS法在肺腺癌EGFR基因突变检测中的应用及意义

目的应用扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)法检测肺腺癌不同标本类型表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变及其临床意义。方法收集厦门大学附属东南医院2019年1-12月肺腺癌标本232例,包括手术切除标本16例,肺活检标本126例,恶性胸腔积液细胞块标本35例,转移病灶标本55例,采用ARMS法检测EGFR基因突变,并分析EGFR基因突变在肺腺癌的临床意义。结果肺腺癌标本EGFR基因突变率44.83%(104/232)。年龄≥60岁者突变率为44.06%(63/143),年龄<60岁者突变率为46.07%(41/89),差异无统计学意义(P>0.05)。手术切除标本突变率为43.75%(7/16),肺活检标本突变率为38.89%(49/126),转移病灶标本突变率为47.27%(26/55),恶性胸腔积液细胞块标本突变率为62.86%(22/35),不同标本类型间突变率差异无统计学意义(P>0.05)。女性患者突变率(58.24%,53/91)高于男性(36.17%,51/141),差异有统计学意义(P<0.05)。结论ARMS法可用于肺腺癌不同标本类型EGFR基因突变检测;EGFR基因突变可能与患者性别有差异,与年龄及标本类型无差异。

GS环保试剂在非小细胞肺癌EGFR基因突变检测中的应用

目的探讨GS环保试剂代替二甲苯应用于非小细胞肺癌表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变检测的效果。方法选取16例确诊为肺腺癌的标本,同一蜡块分别用GS环保脱蜡液、二甲苯进行脱蜡,提取DNA,应用实时荧光定量PCR法检测EGFR基因突变状态。结果GS环保试剂与二甲苯脱蜡同一石蜡标本,GS环保试剂对石蜡切片脱蜡效果良好,标本DNA含量、质量差异无统计学意义(P>0.05),且均符合实时荧光定量PCR要求,且应用实时荧光定量PCR法检测EGFR基因突变状态,其基因突变类型与使用二甲苯脱蜡的检测结果完全一致(符合率100%)。结论GS环保试剂可代替二甲苯应用于非小细胞肺癌EGFR基因突变检测,并符合实验室环保的要求。