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水稻纹枯菌总DNA提取方法的比较
被引量:
9
1
作者
任衍春
张震
+5 位作者
毛雪琴
邱海萍
姜华
柴荣耀
王艳丽
孙国昌
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2011年第4期741-747,共7页
DNA的浓度,尤其是DNA的纯度严重影响后续基因组酶切等结果。为寻找一种高质量的水稻纹枯菌总DNA的提取方法,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、蜗牛酶法、蛋白酶K法5种方法分别提取水稻纹枯菌总DNA。通过紫外吸光度测定DNA的纯度和浓度、...
DNA的浓度,尤其是DNA的纯度严重影响后续基因组酶切等结果。为寻找一种高质量的水稻纹枯菌总DNA的提取方法,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、蜗牛酶法、蛋白酶K法5种方法分别提取水稻纹枯菌总DNA。通过紫外吸光度测定DNA的纯度和浓度、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增、限制性内切酶酶切反应及Southern杂交评价DNA的质量,最终得出蛋白酶K法是获取高质量水稻纹枯菌基因组DNA的最佳方法。
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关键词
水稻纹枯菌
总DNA
SOUTHERN杂交
蛋白酶K法
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职称材料
立枯丝核菌不同融合群菌株GPD基因的克隆及序列特征分析
被引量:
5
2
作者
王艳丽
任衍春
+7 位作者
张震
王教瑜
毛雪琴
姜华
邱海萍
柴荣耀
杜新法
孙国昌
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期639-646,共8页
利用同源克隆的方法对11个立枯丝核菌标准融合群菌株的GPD基因进行了分离。分析发现不同融合群立枯丝核菌GPD基因在外显子数目、编码蛋白长度及内含子剪切方式等方面存在差异,如AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因的外显子...
利用同源克隆的方法对11个立枯丝核菌标准融合群菌株的GPD基因进行了分离。分析发现不同融合群立枯丝核菌GPD基因在外显子数目、编码蛋白长度及内含子剪切方式等方面存在差异,如AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因的外显子个数为10个,其他融合群均为11个;AG-8融合群的GPD基因的编码蛋白长度为267个氨基酸,其余融合群的GPD基因的编码蛋白长度约为340个氨基酸。AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因在98、98、272氨基酸位点的内含子发生了缺失。基于蛋白序列的进化分析表明不同融合群之间GPD基因编码蛋白存在明显差异,可以有效地将不同融合群菌株区分开来;同时,不同物种之间GPD基因在进化上仍具有一定保守性,立枯丝核菌自身的GPD基因蛋白序列归为一类且与担子菌门同源性最高。这些结果表明进行保守基因序列差异分析是进行立枯丝核菌分类分群研究的新思路。
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关键词
立枯丝核菌
GPD基因
克隆
进化分析
融合群
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职称材料
题名
水稻纹枯菌总DNA提取方法的比较
被引量:
9
1
作者
任衍春
张震
毛雪琴
邱海萍
姜华
柴荣耀
王艳丽
孙国昌
机构
浙江师范大学化学与生命科学学院
浙江省植物有害生物防控重点实验室一省部共建国家莺点实验室培育基地
浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2011年第4期741-747,共7页
基金
国家自然科学基金(31071644)
浙江省农业科学院科研创新提升项目
文摘
DNA的浓度,尤其是DNA的纯度严重影响后续基因组酶切等结果。为寻找一种高质量的水稻纹枯菌总DNA的提取方法,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、蜗牛酶法、蛋白酶K法5种方法分别提取水稻纹枯菌总DNA。通过紫外吸光度测定DNA的纯度和浓度、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增、限制性内切酶酶切反应及Southern杂交评价DNA的质量,最终得出蛋白酶K法是获取高质量水稻纹枯菌基因组DNA的最佳方法。
关键词
水稻纹枯菌
总DNA
SOUTHERN杂交
蛋白酶K法
Keywords
Rhizoctonia solani
total DNA
Southern blot
protease K-extraction
分类号
S435.111.42 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
立枯丝核菌不同融合群菌株GPD基因的克隆及序列特征分析
被引量:
5
2
作者
王艳丽
任衍春
张震
王教瑜
毛雪琴
姜华
邱海萍
柴荣耀
杜新法
孙国昌
机构
浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地/浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所
出处
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期639-646,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31071644)
农业部转基因专项(2011ZX08009-003-001)
+3 种基金
浙江省公益性重大项目(2011C12901-1
2011C12901-2
2011C12022)
浙江省农科院国际合作项目(2009)
文摘
利用同源克隆的方法对11个立枯丝核菌标准融合群菌株的GPD基因进行了分离。分析发现不同融合群立枯丝核菌GPD基因在外显子数目、编码蛋白长度及内含子剪切方式等方面存在差异,如AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因的外显子个数为10个,其他融合群均为11个;AG-8融合群的GPD基因的编码蛋白长度为267个氨基酸,其余融合群的GPD基因的编码蛋白长度约为340个氨基酸。AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因在98、98、272氨基酸位点的内含子发生了缺失。基于蛋白序列的进化分析表明不同融合群之间GPD基因编码蛋白存在明显差异,可以有效地将不同融合群菌株区分开来;同时,不同物种之间GPD基因在进化上仍具有一定保守性,立枯丝核菌自身的GPD基因蛋白序列归为一类且与担子菌门同源性最高。这些结果表明进行保守基因序列差异分析是进行立枯丝核菌分类分群研究的新思路。
关键词
立枯丝核菌
GPD基因
克隆
进化分析
融合群
Keywords
Rhizoctonia solani
GPD
gene clone
phylogenetic analysis
anastomosis group
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻纹枯菌总DNA提取方法的比较
任衍春
张震
毛雪琴
邱海萍
姜华
柴荣耀
王艳丽
孙国昌
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2011
9
下载PDF
职称材料
2
立枯丝核菌不同融合群菌株GPD基因的克隆及序列特征分析
王艳丽
任衍春
张震
王教瑜
毛雪琴
姜华
邱海萍
柴荣耀
杜新法
孙国昌
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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