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大蕉枯萎病菌二重PCR分子快速检测技术的建立
1
作者
曾莉莎
王芳
+6 位作者
周海琪
伍泽星
赖永超
傅长根
吕顺
梁少丽
刘丽琴
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期2352-2359,共8页
【目的】基于大蕉枯萎病菌2个不同分化谱系特有的基因序列,建立大蕉枯萎病菌的二重PCR分子快速检测技术,为该病害预测及有效防控提供理论依据。【方法】基于大蕉枯萎病菌特有的rDNA基因间隔区(IGS)序列设计得到多对PCR引物,分别以广东3...
【目的】基于大蕉枯萎病菌2个不同分化谱系特有的基因序列,建立大蕉枯萎病菌的二重PCR分子快速检测技术,为该病害预测及有效防控提供理论依据。【方法】基于大蕉枯萎病菌特有的rDNA基因间隔区(IGS)序列设计得到多对PCR引物,分别以广东3个粉蕉枯萎病菌株和8个大蕉枯萎病菌株、2个广西和海南的粉蕉枯萎病菌株、5个其他尖孢镰孢菌菌株和5个外围菌株的基因组DNA为模板进行PCR扩增,基于扩增结果从中筛选出大蕉枯萎病菌特异性引物,对其特异性和灵敏度进行检测,并确定二重PCR检测体系的含菌量检测下限。【结果】基于大蕉枯萎病菌特有的基因序列设计得到多对PCR引物,经筛选验证获得2对可用于检测大蕉枯萎病菌2个不同谱系(LineageⅠ和Ⅱ)的特异性引物,可直接应用于大蕉种植土壤和植株中的大蕉枯萎病菌检测,扩增片段分别为755和590 bp。当扩增条带为755 bp时,表明样本中含有大蕉枯萎病菌;当扩增条带为590 bp时,表明样本中含有粉蕉或大蕉枯萎病菌。建立的二重PCR检测体系检测大蕉枯萎病菌菌丝的灵敏度可达0.4μg,检测土壤的含菌量下限为每克土壤40个病原菌孢子。【结论】建立的二重PCR检测技术实现一次PCR反应同时检测并区分大蕉枯萎病菌2个谱系及广东地区的粉蕉枯萎病菌优势菌群,可用于无病大蕉和粉蕉种苗及种植土壤的检测与筛选。
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关键词
大蕉
枯萎病菌
尖孢镰孢菌古巴专化型
二重PCR检测
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职称材料
题名
大蕉枯萎病菌二重PCR分子快速检测技术的建立
1
作者
曾莉莎
王芳
周海琪
伍泽星
赖永超
傅长根
吕顺
梁少丽
刘丽琴
机构
东莞市农业科学研究中心
东莞讯禾园艺科技有限公司
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期2352-2359,共8页
基金
广东省基础与应用基础研究基金项目(2022A1515140114)
广东省现代农业产业技术体系创新团队项目(2022KJ109)
+1 种基金
东莞市2021年度省乡村振兴战略专项(20211800400052)
东莞市科技特派员项目(20221800500062)。
文摘
【目的】基于大蕉枯萎病菌2个不同分化谱系特有的基因序列,建立大蕉枯萎病菌的二重PCR分子快速检测技术,为该病害预测及有效防控提供理论依据。【方法】基于大蕉枯萎病菌特有的rDNA基因间隔区(IGS)序列设计得到多对PCR引物,分别以广东3个粉蕉枯萎病菌株和8个大蕉枯萎病菌株、2个广西和海南的粉蕉枯萎病菌株、5个其他尖孢镰孢菌菌株和5个外围菌株的基因组DNA为模板进行PCR扩增,基于扩增结果从中筛选出大蕉枯萎病菌特异性引物,对其特异性和灵敏度进行检测,并确定二重PCR检测体系的含菌量检测下限。【结果】基于大蕉枯萎病菌特有的基因序列设计得到多对PCR引物,经筛选验证获得2对可用于检测大蕉枯萎病菌2个不同谱系(LineageⅠ和Ⅱ)的特异性引物,可直接应用于大蕉种植土壤和植株中的大蕉枯萎病菌检测,扩增片段分别为755和590 bp。当扩增条带为755 bp时,表明样本中含有大蕉枯萎病菌;当扩增条带为590 bp时,表明样本中含有粉蕉或大蕉枯萎病菌。建立的二重PCR检测体系检测大蕉枯萎病菌菌丝的灵敏度可达0.4μg,检测土壤的含菌量下限为每克土壤40个病原菌孢子。【结论】建立的二重PCR检测技术实现一次PCR反应同时检测并区分大蕉枯萎病菌2个谱系及广东地区的粉蕉枯萎病菌优势菌群,可用于无病大蕉和粉蕉种苗及种植土壤的检测与筛选。
关键词
大蕉
枯萎病菌
尖孢镰孢菌古巴专化型
二重PCR检测
Keywords
Dajiao
fusarium wilt strain
Fusarium oxysporum f.sp.cubense
duplex PCR detection
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大蕉枯萎病菌二重PCR分子快速检测技术的建立
曾莉莎
王芳
周海琪
伍泽星
赖永超
傅长根
吕顺
梁少丽
刘丽琴
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
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