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全基因组重测序筛选弓背青鳉三亚群体性别遗传标记
被引量:
1
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作者
王中铎
何传猛
+7 位作者
姚泽彬
李金蓬
陈子阳
邓爱萍
赖卓欣
李银芳
董忠典
郭昱嵩
《广东海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期69-75,共7页
【目的】开发弓背青鳉(Oryzias curvinotus)三亚群体(下称“三亚青鳉”)遗传性别鉴定分子标记,为进一步挖掘其性别决定基因奠定基础。【方法】用染色体商(Chromosome quotient,CQ)法比较雌雄两性个体的全基因组重测序覆盖度,筛选潜在的...
【目的】开发弓背青鳉(Oryzias curvinotus)三亚群体(下称“三亚青鳉”)遗传性别鉴定分子标记,为进一步挖掘其性别决定基因奠定基础。【方法】用染色体商(Chromosome quotient,CQ)法比较雌雄两性个体的全基因组重测序覆盖度,筛选潜在的性别特异性序列区域(CQ<0.1)并设计引物,通过PCR扩增验证引物区分三亚青鳉群体及其子代性别的适用性。【结果】经CQ分析筛选,CQ<0.1的特异性区域279个,设计引物279对。随机挑选的60对引物中,29对标记引物在三亚青鳉群体雄鱼中扩增得一个DNA条带,雌鱼无条带,均可鉴定三亚青鳉遗传性别。从29对引物中随机挑选2对引物(命名为Marker1和Marker2)进一步验证,引物Marker1、Marker2在雄鱼中扩增产物分别为791、556 bp,两对引物对三亚青鳉子代群体的扩增结果与亲本一致。用两对性别特异性标记对三亚群体的F2代全同胞家系94个个体进行扩增,结果发现F2群体自然性别比约1∶1。【结论】性别特异性引物Marker1和Marker2均可对三亚青鳉群体进行遗传性别鉴定,在三亚青鳉野生亲本及其子代中均有稳定性和通用性,可用于弓背青鳉三亚群体遗传性别鉴定。
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关键词
弓背青鳉
三亚群体
性别特异性标记
重测序
染色体商区域
自然性别比
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职称材料
题名
全基因组重测序筛选弓背青鳉三亚群体性别遗传标记
被引量:
1
1
作者
王中铎
何传猛
姚泽彬
李金蓬
陈子阳
邓爱萍
赖卓欣
李银芳
董忠典
郭昱嵩
机构
广东海洋大学水产学院
广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期69-75,共7页
基金
国家自然科学基金(41806195,31972794)
粤桂联合基金-面上项目(2020A1515410009)。
文摘
【目的】开发弓背青鳉(Oryzias curvinotus)三亚群体(下称“三亚青鳉”)遗传性别鉴定分子标记,为进一步挖掘其性别决定基因奠定基础。【方法】用染色体商(Chromosome quotient,CQ)法比较雌雄两性个体的全基因组重测序覆盖度,筛选潜在的性别特异性序列区域(CQ<0.1)并设计引物,通过PCR扩增验证引物区分三亚青鳉群体及其子代性别的适用性。【结果】经CQ分析筛选,CQ<0.1的特异性区域279个,设计引物279对。随机挑选的60对引物中,29对标记引物在三亚青鳉群体雄鱼中扩增得一个DNA条带,雌鱼无条带,均可鉴定三亚青鳉遗传性别。从29对引物中随机挑选2对引物(命名为Marker1和Marker2)进一步验证,引物Marker1、Marker2在雄鱼中扩增产物分别为791、556 bp,两对引物对三亚青鳉子代群体的扩增结果与亲本一致。用两对性别特异性标记对三亚群体的F2代全同胞家系94个个体进行扩增,结果发现F2群体自然性别比约1∶1。【结论】性别特异性引物Marker1和Marker2均可对三亚青鳉群体进行遗传性别鉴定,在三亚青鳉野生亲本及其子代中均有稳定性和通用性,可用于弓背青鳉三亚群体遗传性别鉴定。
关键词
弓背青鳉
三亚群体
性别特异性标记
重测序
染色体商区域
自然性别比
Keywords
Oryzias curvinotus
Sanya population
sex-specific markers
resequencing
chromosome quotient region
natural sex ratio
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
Q953.3 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组重测序筛选弓背青鳉三亚群体性别遗传标记
王中铎
何传猛
姚泽彬
李金蓬
陈子阳
邓爱萍
赖卓欣
李银芳
董忠典
郭昱嵩
《广东海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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引证文献
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