G蛋白偶联受体81同源建模及其与二羟基苯甲酸对接研究

G蛋白偶联受体81(GPR81)激动剂不仅可以发挥出GPR109A激动剂治疗血脂障碍的功效,还可降低副作用,但GPR81属于膜蛋白且三维结构未知,其与药物作用情况仍难以解析。本文基于已知的GPR81一级序列,采用同源模建的方法构建GPR81蛋白三维结构,运用拉氏图和Profile-3D对模型进行评估,通过分子动力学,加膜,loop环区等方法对模型进行优化,得到蛋白最优模型,模型Verify Score为130.27(预期Verify Score值区间为60.8112~135.136),并计算分析得到8个可能的活性位点。构建GPR81的苯甲酸类激动剂药物小分子,通过最陡下降法和共轭梯度法获得药物分子最低能量构象。用Libdock方法将激动剂对接至蛋白各活性位点,获得二者作用模型。我们分析各活性位点氨基酸分布情况,并以3-羟基-苯甲酸类药物作为参考分子探讨药物与各蛋白活性位点相互作用情况。本实验对设计GPR81苯甲酸类激动剂有理论指导意义。

G偶联蛋白受体142活性位点预测及其与激动剂对接研究

G偶联蛋白受体142(GPR142)主要在胰岛B细胞中表达,可通过内源性配体色氨酸或合成的GPR142激动剂来调节胰岛素分泌而治疗糖尿病,是重要靶点蛋白,但因属于膜蛋白,晶体结构难以解析.本实验对GPR142膜蛋白进行同源建模,优化评估,构建出可靠的蛋白模型;根据最优蛋白三维模型预测到6个潜在药物作用活性位点并分析其氨基酸组成;将潜在药物苯并氧氮杂类衍生物对接至活性位点并分析蛋白-药物相互作用力.本实验获得可靠的GPR142蛋白模型和蛋白-药物作用模型,从而设计苯并氧氮杂类衍生物,为获得以GPR142为靶点的更高效治疗II型糖尿病的药物提供了理论基础.