基于TCGA数据挖掘筛选肺鳞癌预后相关lncRNA分子标签

目的:通过对TCGA数据库的挖掘,筛选与肺鳞癌预后相关的lncRNA。方法:提取TCGA数据库中肺鳞癌患者临床数据以及肺鳞癌和癌旁组织中的lncRNA表达数据,采用LASSOCox回归筛选肺鳞癌预后相关的lncRNA,并构建lncRNA分子标签。采用Cox模型研究该分子标签的表达水平对肺鳞癌患者预后的影响。结果:首先筛选出322个在癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA。经LASSOCox回归分析从中筛选出6个与肺鳞癌预后相关的lncRNA,分别为KTN1-AS1、FAM83A-AS1、AF131217.1、RP11-108M12.3、CTD-2555C10.3和AC068831.16。根据这6个lncRNA构建的分子标签表达水平中位数-0.09将肺鳞癌病人分为高表达组和低表达组,高表达组病人死亡风险是低表达组的2.14倍(HR=2.14,95%CI:1.50～3.04,P<0.01)。预测模型的Harrell’sC统计量为0.69(95%CI:0.64～0.75)。结论:通过对TCGA数据库的挖掘,发现KTN1-AS1、FAM83A-AS1、AF131217.1、RP11-108M12.3、CTD-2555C10.3和AC068831.16对肺鳞癌的预后有影响,且构建的lncRNA分子标签表达水平与肺鳞癌病人的预后有显著性关联。

肠道菌群与结直肠癌发生发展的关系

结直肠癌是全球主要的恶性肿瘤之一。受到生活方式西化的影响,我国的结直肠癌发病和死亡呈上升趋势。肠道菌群是肠道内一个庞大的微生物群体,以细菌为主。肠道菌群与宿主相互作用,共同维护人体健康。当体内外因素发生改变时,肠道菌群发生变化,导致结直肠癌的发生。随着研究深入,越来越多证据表明肠道菌群与结直肠癌发生发展密切相关。其中,流行病学测序数据全面揭示了结直肠癌患者的肠道菌群特征以及肠道菌群作为结直肠癌诊断标志物的潜能,而动物实验则明确了包括具核梭杆菌在内的多种肠道菌群的致癌机制。本文通过结合国内外最新研究进展,对肠道菌群与结直肠癌发生发展的关系作一综述,为进一步推动结直肠癌相关研究和肠道菌群在结直肠癌防治中的临床应用提供思路。