糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporter,SWEET)是一类新型的糖转运蛋白,其在植物生长发育、植物与病原体互作以及植物胁迫耐受性方面都起着重要作用。基于甜瓜中还未有该家族基因的相关报道,本研究开展CmSWEET...糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporter,SWEET)是一类新型的糖转运蛋白,其在植物生长发育、植物与病原体互作以及植物胁迫耐受性方面都起着重要作用。基于甜瓜中还未有该家族基因的相关报道,本研究开展CmSWEET的全基因组鉴定和生物信息学分析。通过同源性搜索,总共鉴定到17个甜瓜CmSWEET基因。这些基因分布于甜瓜8条染色体上,具有典型的MtN3/saliva结构域。系统发育树将拟南芥、黄瓜和甜瓜的SWEET蛋白分为4个进化分支,其中亚族Ⅲ是甜瓜和黄瓜独有的亚族。基因启动子区域的顺式作用元件显示,CmSWEET含有许多与植物激素和应激相关的调节元件,暗示了CmSWEET在参与调节甜瓜生长发育以及环境适应性方面有重要作用。基因表达量分析表明,大部分CmSWEET基因在花(雌花和雄花)和根中高表达,部分CmSWEET基因在果实发育时期表达量较高。此外,RNA-Seq结果暗示,CmSWEET基因可能参与对尖孢镰刀菌和白粉病菌侵染的抗性响应。本研究为今后探究CmSWEET蛋白在甜瓜生长发育过程以及响应生物和非生物胁迫中的分子功能奠定了坚实的基础。展开更多
利用PCR克隆技术,在番茄Micro-Tom的cDNA中分离出一个促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK),命名为SlMAPK12(GenBank登录号为JF795447)。该基因编码621个氨基酸,含有促分裂原活化蛋白激酶11个区域,磷酸化位点为...利用PCR克隆技术,在番茄Micro-Tom的cDNA中分离出一个促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK),命名为SlMAPK12(GenBank登录号为JF795447)。该基因编码621个氨基酸,含有促分裂原活化蛋白激酶11个区域,磷酸化位点为TDY(苏氨酸-天冬氨酸-酪氨酸,属于D组)。氨基酸序列比对发现,它与拟南芥、杨树、蓖麻等D组MAPK具有高度一致性。利用RT-PCR及qRT-PCR技术分析SlMAPK12的时空表达特性,发现SlMAPK12在Micro-Tom植株的多个器官中均有表达,在雄蕊中的表达量最高。对Micro-Tom幼苗进行(38±1)℃高温处理,发现SlMAPK12在雄蕊中的相对表达量增高,于12h时点达到最高,而后下降。推测SlMAPK12可能参与番茄花粉发育过程中的高温胁迫反应。展开更多
文摘糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporter,SWEET)是一类新型的糖转运蛋白,其在植物生长发育、植物与病原体互作以及植物胁迫耐受性方面都起着重要作用。基于甜瓜中还未有该家族基因的相关报道,本研究开展CmSWEET的全基因组鉴定和生物信息学分析。通过同源性搜索,总共鉴定到17个甜瓜CmSWEET基因。这些基因分布于甜瓜8条染色体上,具有典型的MtN3/saliva结构域。系统发育树将拟南芥、黄瓜和甜瓜的SWEET蛋白分为4个进化分支,其中亚族Ⅲ是甜瓜和黄瓜独有的亚族。基因启动子区域的顺式作用元件显示,CmSWEET含有许多与植物激素和应激相关的调节元件,暗示了CmSWEET在参与调节甜瓜生长发育以及环境适应性方面有重要作用。基因表达量分析表明,大部分CmSWEET基因在花(雌花和雄花)和根中高表达,部分CmSWEET基因在果实发育时期表达量较高。此外,RNA-Seq结果暗示,CmSWEET基因可能参与对尖孢镰刀菌和白粉病菌侵染的抗性响应。本研究为今后探究CmSWEET蛋白在甜瓜生长发育过程以及响应生物和非生物胁迫中的分子功能奠定了坚实的基础。
文摘利用PCR克隆技术,在番茄Micro-Tom的cDNA中分离出一个促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK),命名为SlMAPK12(GenBank登录号为JF795447)。该基因编码621个氨基酸,含有促分裂原活化蛋白激酶11个区域,磷酸化位点为TDY(苏氨酸-天冬氨酸-酪氨酸,属于D组)。氨基酸序列比对发现,它与拟南芥、杨树、蓖麻等D组MAPK具有高度一致性。利用RT-PCR及qRT-PCR技术分析SlMAPK12的时空表达特性,发现SlMAPK12在Micro-Tom植株的多个器官中均有表达,在雄蕊中的表达量最高。对Micro-Tom幼苗进行(38±1)℃高温处理,发现SlMAPK12在雄蕊中的相对表达量增高,于12h时点达到最高,而后下降。推测SlMAPK12可能参与番茄花粉发育过程中的高温胁迫反应。