核电厂主泵轴封水系统微生态研究

核电厂的主泵轴封水系统会出现由微生物腐蚀导致的材料腐蚀、管道堵塞现象。为了系统地研究主泵轴封水系统的微生态,对多点的水样进行了微生物检测。微生物培养的结果显示来自水源点的菌落总数最高。利用最大或然数(MPN)法测量结果表明系统中主要的微生物类型为铁细菌,包括不动杆菌、假单胞菌、罗尔斯通氏菌等,及一些难培养的细菌。研究结果证实主泵轴封水系统的堵塞是多种菌共同作用的结果,要降低微生物腐蚀的副作用,必须破坏这类微生物的共生效应,定期的监控和消杀可以降低堵塞的风险。

PCR反应条件对16S rRNA基因扩增子测序准确性的影响

【背景】16S rRNA基因扩增子测序技术是一种不依赖培养而获得样本中细菌种群结构、相对丰度等信息的方法。高通量测序技术实验步骤较多,每一步骤细微的差别都可能在最终的测序结果中放大,并造成测序结果与实际情况的偏差。【目的】基于MiSeq测序平台,探讨PCR反应体系中扩增引物序列、退火温度、模板起始量、扩增循环数和变性时间等5个因素对16S rRNA基因测序结果的影响。【方法】对mock DNA的16S rRNA基因扩增子进行测序,分别分析不同的扩增引物、退火温度、模板起始量、循环数和变性时间对数据准确性的影响。【结果】不同的扩增引物对检测结果有较大的影响,采用的4组引物中,引物B(V3-V4,341F/806R)的准确性最好,引物A(V3-V4,341F/805R)次之。比较不同退火温度(52、55和60℃)对检测准确性的影响,退火温度60℃的结果最接近理论值。模板起始量(2、10和50 ng)的检测结果显示,mock DNA起始量为2ng的结果准确性最高。相较于其他3组(15+18、25+8和30+8),循环数为(20+8)的检测结果最接近mock DNA的理论值。不同变性时间(3 min和5 min)对分析结果无显著性影响。【结论】引物序列、退火温度、模板起始量和循环数是影响16S rRNA基因测序结果准确性的重要因素。