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数字资源语义互联研究(Ⅱ)——桥本体系统的设计与实现
被引量:
2
1
作者
牟冬梅
余鲲涛
+1 位作者
范轶
韩毅
《现代图书情报技术》
CSSCI
北大核心
2010年第9期8-12,共5页
采用静态和动态相结合的方案构建桥本体,利用Protégé3.4静态构建桥本体的类、子类和属性,在Eclipse SDKv3.4.2开发平台下,通过语义相似度计算动态构建桥本体的实例和属性值,最终形成可共享的OWL语言描述的桥本体。
关键词
本体整合
桥本体
本体
原文传递
基于转录组测序在人类全基因组内鉴定与癌症相关的polyadenylation和non-polyadenylation RNA
被引量:
3
2
作者
赵国光
焦飞
+7 位作者
廖奇
罗海涛
李慧
孙亮
卜德超
余鲲涛
赵屹
陈润生
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2013年第5期376-386,共11页
真核生物的mRNA包括2种形式的转录本,根据它们3′端是否存在poly(A)尾巴,可以分为带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)+mRNA)和不带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)mRNA).Poly(A)+mRNA的主要功能是促进蛋白质的编码,但是对poly(A)mRNA的功能却...
真核生物的mRNA包括2种形式的转录本,根据它们3′端是否存在poly(A)尾巴,可以分为带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)+mRNA)和不带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)mRNA).Poly(A)+mRNA的主要功能是促进蛋白质的编码,但是对poly(A)mRNA的功能却知之甚少.而已有的研究表明,poly(A)mRNA和双态(bimorphic)的mRNA(即包含poly(A)+mRNA又包含poly(A)mRNA)也是基因转录的一个重要部分.本研究通过建立一个综合性的数据分析流程,首先从不同细胞系中鉴定出这些不同形式的mRNA,然后比较这些poly(A)+及poly(A)mRNA在正常细胞系和对应的癌症细胞系中的表达差异,从而确定这些RNA转录物的潜在功能.通过生物信息学的分析表明,在正常和肿瘤细胞系中确实存在差异表达的poly(A)+和poly(A)mRNA.对差异表达的基因进行功能富集,结果表明,这2类mRNA都富集了包括细胞周期、细胞凋亡及细胞死亡相关的功能,而这些功能已经被证明和癌症的发生和发展是密不可分的.此外,还有一类差异表达的poly(A)mRNA富集了和翻译及翻译延长相关的功能.因此,本研究表明,poly(A)mRNA也可能在癌症的发生和发展中发挥着重要的作用.
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关键词
多聚腺苷酸化
非多聚腺苷酸化
功能注释
高通量测序
癌症生物信息学
原文传递
题名
数字资源语义互联研究(Ⅱ)——桥本体系统的设计与实现
被引量:
2
1
作者
牟冬梅
余鲲涛
范轶
韩毅
机构
吉林大学公共卫生学院
空军航空大学图书馆
出处
《现代图书情报技术》
CSSCI
北大核心
2010年第9期8-12,共5页
基金
国家自然科学基金项目“语义网格环境下数字图书馆知识组织的应用研究”(项目编号:70673029)
国家社会科学基金项目“数字资源语义互联模式研究”(项目编号:10BTQ025)的研究成果之一
文摘
采用静态和动态相结合的方案构建桥本体,利用Protégé3.4静态构建桥本体的类、子类和属性,在Eclipse SDKv3.4.2开发平台下,通过语义相似度计算动态构建桥本体的实例和属性值,最终形成可共享的OWL语言描述的桥本体。
关键词
本体整合
桥本体
本体
Keywords
Ontology integration Bridge Ontology Ontology
分类号
TP391.1 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
原文传递
题名
基于转录组测序在人类全基因组内鉴定与癌症相关的polyadenylation和non-polyadenylation RNA
被引量:
3
2
作者
赵国光
焦飞
廖奇
罗海涛
李慧
孙亮
卜德超
余鲲涛
赵屹
陈润生
机构
中国科学院计算技术研究所生物信息学研究组智能信息处理重点实验室
中国科学院大学
滨州医学院生物化学与分子生物学系
宁波大学医学院预防医学系
吉林大学计算机科学与技术学院
中国科学院生物物理研究所
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2013年第5期376-386,共11页
基金
国家自然科学基金(批准号:31000564
31071137和91229120)
+1 种基金
北京市自然科学基金(批准号:5122029)
中国科学院科学知识创新工程(批准号:KSCX2-EW-R-01)资助项目
文摘
真核生物的mRNA包括2种形式的转录本,根据它们3′端是否存在poly(A)尾巴,可以分为带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)+mRNA)和不带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)mRNA).Poly(A)+mRNA的主要功能是促进蛋白质的编码,但是对poly(A)mRNA的功能却知之甚少.而已有的研究表明,poly(A)mRNA和双态(bimorphic)的mRNA(即包含poly(A)+mRNA又包含poly(A)mRNA)也是基因转录的一个重要部分.本研究通过建立一个综合性的数据分析流程,首先从不同细胞系中鉴定出这些不同形式的mRNA,然后比较这些poly(A)+及poly(A)mRNA在正常细胞系和对应的癌症细胞系中的表达差异,从而确定这些RNA转录物的潜在功能.通过生物信息学的分析表明,在正常和肿瘤细胞系中确实存在差异表达的poly(A)+和poly(A)mRNA.对差异表达的基因进行功能富集,结果表明,这2类mRNA都富集了包括细胞周期、细胞凋亡及细胞死亡相关的功能,而这些功能已经被证明和癌症的发生和发展是密不可分的.此外,还有一类差异表达的poly(A)mRNA富集了和翻译及翻译延长相关的功能.因此,本研究表明,poly(A)mRNA也可能在癌症的发生和发展中发挥着重要的作用.
关键词
多聚腺苷酸化
非多聚腺苷酸化
功能注释
高通量测序
癌症生物信息学
分类号
R730.4 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
数字资源语义互联研究(Ⅱ)——桥本体系统的设计与实现
牟冬梅
余鲲涛
范轶
韩毅
《现代图书情报技术》
CSSCI
北大核心
2010
2
原文传递
2
基于转录组测序在人类全基因组内鉴定与癌症相关的polyadenylation和non-polyadenylation RNA
赵国光
焦飞
廖奇
罗海涛
李慧
孙亮
卜德超
余鲲涛
赵屹
陈润生
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2013
3
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